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秦川牛FADS基因家族克隆、生物信息学分析及组织表达研究
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作者 尹思琦 赵刚奎 +4 位作者 高海旭 孙红红 辛怡然 昝林森 赵春平 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期903-915,共13页
【目的】试验旨在系统分析秦川牛脂肪酸去饱和酶(FADS)基因家族,阐明该家族成员在秦川牛不同组织及脂肪细胞不同分化时期的时空表达规律,为进一步探究其在牛脂肪沉积中的作用奠定基础。【方法】试验采集秦川牛不同组织样本,从肾周脂肪... 【目的】试验旨在系统分析秦川牛脂肪酸去饱和酶(FADS)基因家族,阐明该家族成员在秦川牛不同组织及脂肪细胞不同分化时期的时空表达规律,为进一步探究其在牛脂肪沉积中的作用奠定基础。【方法】试验采集秦川牛不同组织样本,从肾周脂肪中分离前体脂肪细胞,通过PCR扩增FADS基因家族CDS区序列,利用生物信息学软件分析预测其序列特征。利用实时荧光定量PCR检测FADS基因家族成员在成年牛不同组织及肾周前体脂肪细胞分化过程中的时空表达谱。【结果】试验成功扩增出FADS基因家族3个成员(FADS1、FADS2和FADS3)CDS区,大小分别为1425、1335、1332 bp。系统进化树结果显示,秦川牛FADS基因家族成员氨基酸序列与瘤牛相似性最高,与小鼠的亲缘关系较远。生物信息学预测结果显示,FADS基因家族均为较稳定的亲水性蛋白,二级结构主要由α-螺旋构成,三级结构与二级结构预测结果一致。FADS1和FADS2主要定位于内质网(44.4%、44.4%),FADS3主要定位细胞膜中(39.1%)。实时荧光定量PCR结果显示,FADS1、FADS3基因在肌肉组织表达量较高,FADS2基因在肝脏中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05)。在脂肪细胞的成脂分化过程中,与其他时间点相比,FADS1和FADS2基因在第2天时表达量最高(P<0.05),FADS3基因则在第2天时表达量最低(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆了秦川牛FADS基因家族成员FADS1、FADS2、FADS3,在瘤牛、山羊、绵羊等哺乳动物中高度保守。FADS基因家族均为较稳定的亲水性蛋白,FADS1、FADS3基因在肌肉组织中高表达,FADS2基因在肝脏组织中高表达。在脂肪细胞的成脂分化过程中,分化第2天时,FADS1、FADS2基因表达量最高,FADS3基因表达量最低。试验结果进一步揭示FADS基因家族通过调控脂肪细胞分化进而影响肉牛脂肪沉积作用机制研究奠定基础。 展开更多
关键词 秦川牛 fads基因家族 生物信息学 表达
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皖西白鹅育肥期肌肉脂肪酸组成及肝PPARα、FADS2和ME1基因表达规律的研究 被引量:11
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作者 陈兴勇 赵宁 +1 位作者 张燕 耿照玉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1912-1919,共8页
旨在探明皖西白鹅育肥期肌肉脂肪酸组成及肝脂肪酸合成相关基因的表达规律。本研究选取同批出雏的70日龄时体重相近的皖西白鹅60只,分为3个重复,每个重复20只,育肥至100日龄。育肥期每10d(70~100日龄)从各重复取5只屠宰,分离胸肌、腿肌... 旨在探明皖西白鹅育肥期肌肉脂肪酸组成及肝脂肪酸合成相关基因的表达规律。本研究选取同批出雏的70日龄时体重相近的皖西白鹅60只,分为3个重复,每个重复20只,育肥至100日龄。育肥期每10d(70~100日龄)从各重复取5只屠宰,分离胸肌、腿肌和肝。气相色谱法检测肌肉脂肪酸组成,RT-PCR分析肝PPARα、FADS2和ME1基因相对表达量。结果表明:1)胸肌饱和脂肪酸含量高于腿肌(P<0.000 1),单不饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸含量均低于腿肌(P=0.044,P=0.017);C16∶1和C18∶2含量随育肥时间增加,C18∶0含量随育肥时间下降。2)PPARα在育肥20d高表达,育肥30d低表达(P<0.000 1);FADS2育肥10d时表达量最高(P=0.009);ME1育肥30d表达量最低(P=0.010)。3)PPARα表达量上升伴随C16∶1、C18∶3、UFA/SFA含量上升,同时SFA含量下降;FADS2表达量上升伴随C16∶1、C18∶1、C18∶3、MUFA和UFA/SFA含量上升,SFA、PUFA含量下降。ME1基因的表达量上升则C16∶1、C18∶1、C18∶3、MUFA和UFA/SFA上升,同时C18∶0、C20∶3和SFA含量下降。皖西白鹅PPARα、FADS2和ME1基因相对表达量均和脂肪酸组成显著相关,可作为脂肪酸性状选育的候选基因。 展开更多
关键词 皖西白鹅 脂肪酸组成 PPARΑ fads2 ME1
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FADS测压管路动态响应特性分析 被引量:8
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作者 高隆隆 杜经民 李宝仁 《机床与液压》 北大核心 2010年第13期48-51,共4页
通过建立管路终端负载为容腔的测压管内气体压力传递数学模型,研究嵌入式大气数据传感系统(FADS)测压管路动态响应特性。压力传递数学模型的建立综合考虑管路黏性损失、热传递效应等影响,仿真分析FADS系统测压管路频率响应特性,结果表明... 通过建立管路终端负载为容腔的测压管内气体压力传递数学模型,研究嵌入式大气数据传感系统(FADS)测压管路动态响应特性。压力传递数学模型的建立综合考虑管路黏性损失、热传递效应等影响,仿真分析FADS系统测压管路频率响应特性,结果表明:增大管路内径、管路长度、容腔容积及大气高度,管内压力传递延迟时间增大。仿真结果对压力传感器的合理设计有一定的指导意义。 展开更多
关键词 fads 测压管路 动态响应特性
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中国荷斯坦牛FADS2基因c.908 C>T突变对泌乳性能和乳中脂肪酸组成的影响 被引量:2
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作者 王梦琦 朱小瑞 +5 位作者 邢世宇 王文强 刘贤慧 张慧敏 杨章平 毛永江 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第3期1-6,共6页
【目的】探讨中国荷斯坦牛脂肪酸脱氢酶2(FADS2)基因编码区c.908C>T突变对泌乳性能和乳中脂肪酸组成的影响。【方法】以江苏某大型奶牛场865头中国荷斯坦牛为材料,用飞行时间质谱法对FADS2基因编码区c.908C>T突变位点进行检测,并... 【目的】探讨中国荷斯坦牛脂肪酸脱氢酶2(FADS2)基因编码区c.908C>T突变对泌乳性能和乳中脂肪酸组成的影响。【方法】以江苏某大型奶牛场865头中国荷斯坦牛为材料,用飞行时间质谱法对FADS2基因编码区c.908C>T突变位点进行检测,并用最小二乘模型分析该位点对泌乳性状和乳中脂肪酸组成的影响。【结果】FADS2基因c.908C>T位点有3种基因型:CC、CT和TT,优势基因型为CT型,C基因为优势等位基因。关联分析发现,该位点对日产奶量、体细胞评分(SCS)及乳脂、乳糖、总固体含量5个性状的影响均达到显著水平(P<0.05),对乳蛋白和乳中尿素氮含量的影响不显著(P>0.05)。多重比较表明:CC型个体日产奶量及乳糖、总固体含量均显著低于TT型个体,而SCS显著高于CT和TT型个体;该位点突变对乳中C14:1、C16:0、C16:1、C18:0、C18:3等5种脂肪酸含量和C14、C16和C18不饱和指数的影响均达到极显著水平(P<0.01),TT基因型个体乳中C16:1含量、C16和C18不饱和指数极显著高于CC和CT型个体(P<0.01)。【结论】FADS2基因编码区c.908C>T突变对中国荷斯坦牛泌乳性能和乳中脂肪酸组成有重要影响,TT基因型具有较高的日产奶量、总固体和C16:1含量及C16和C18不饱和指数。 展开更多
关键词 fads2基因 单核苷酸多态性 泌乳性能 脂肪酸组成 中国荷斯坦牛
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尖楔前体飞行器FADS系统驻点压力对神经网络算法精度的影响 被引量:7
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作者 王鹏 胡远思 金鑫 《宇航学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1072-1079,共8页
针对尖楔前体(类乘波体)飞行器用嵌入式大气数据传感(FADS)系统存在建模困难及解算模型精度低的问题,首先采用BP神经网络建模代替传统的FADS系统空气动力学建模的方法,建立含有双隐含层的四层神经网络模型,然后通过合理选择网络结构参... 针对尖楔前体(类乘波体)飞行器用嵌入式大气数据传感(FADS)系统存在建模困难及解算模型精度低的问题,首先采用BP神经网络建模代替传统的FADS系统空气动力学建模的方法,建立含有双隐含层的四层神经网络模型,然后通过合理选择网络结构参数及训练验证,对FADS系统的攻角进行解算,最后对驻点压力对算法精度的影响进行研究。结果表明,本文建立的含有双隐含层的四层神经网络模型精度较高,攻角测试误差小于0.25°;驻点压力是否作为输入参数对FADS系统神经网络算法求解精度影响较大,攻角测试误差相差达0.1°。在飞行器前缘半径允许的情况下,应尽量得到驻点压力用于解算攻角,提高解算精度。 展开更多
关键词 嵌入式大气数据传感(fads)系统 尖楔前体 BP神经网络 驻点压力 攻角
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FADS2基因 c.1571 A>G 突变对中国荷斯坦牛泌乳性状的影响
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作者 王梦琦 倪炜 +6 位作者 唐程 郭佳禾 张强 梁艳 张慧敏 李明勋 毛永江 《安徽农业科学》 CAS 2019年第10期92-93,115,共3页
[目的]探索FADS2基因c.1571A>G多态性对中国荷斯坦牛泌乳性状的影响。[方法]对866头中国荷斯坦牛FADS2基因c.1571A>G位点进行多态性分析,采用最小二乘法分析其对泌乳性状的影响。[结果]FADS2c.1571A>G对日产奶量、乳蛋白率、... [目的]探索FADS2基因c.1571A>G多态性对中国荷斯坦牛泌乳性状的影响。[方法]对866头中国荷斯坦牛FADS2基因c.1571A>G位点进行多态性分析,采用最小二乘法分析其对泌乳性状的影响。[结果]FADS2c.1571A>G对日产奶量、乳蛋白率、乳脂率、总固形物以及尿素氮含量等泌乳性状有显著影响(P<0.05)。GG基因型个体具有较高的日产奶量,而AA型个体的乳脂率、乳蛋白率及总固形物含量显著高于其他基因型个体。FADS2c.1571A>G突变对体细胞评分(SCS)无显著影响(P>0.05)。[结论]FADS2可作为优化中国荷斯坦牛泌乳性能的潜在分子标记。 展开更多
关键词 fads2 c.1571A>G 体细胞评分 泌乳性状
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中国荷斯坦牛FADS2基因3′端SNP突变对乳中脂肪酸组成的影响 被引量:7
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作者 徐晨希 王梦琦 +7 位作者 朱小瑞 张玉锋 夏海磊 刘贤慧 王小龙 张慧敏 杨章平 毛永江 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期2194-2202,共9页
【目的】FADS2是多不饱和脂肪酸合成中关键的限速酶之一,可催化食物中亚油酸(LNA,C18:2n6)合成γ-亚麻酸(GLA,C18:3n6)、二十碳五烯酸(EPA,C20:5n3)、二十二碳六烯酸(DHA,C22:6n3)等长链脂肪酸。试验旨在探讨中国荷斯坦牛FA... 【目的】FADS2是多不饱和脂肪酸合成中关键的限速酶之一,可催化食物中亚油酸(LNA,C18:2n6)合成γ-亚麻酸(GLA,C18:3n6)、二十碳五烯酸(EPA,C20:5n3)、二十二碳六烯酸(DHA,C22:6n3)等长链脂肪酸。试验旨在探讨中国荷斯坦牛FADS2基因3′端非编码区SNP突变对乳中脂肪酸含量的影响。【方法】随机选择20头无亲缘关系的中国荷斯坦牛样本,用直接测序列法检测FADS2基因3′端非编码区SNP突变位点。再以江苏某大型奶牛场551头中国荷斯坦牛为材料,用飞行时间质谱法对前期发现的2个SNP位点进行检测,同时利用最小二乘模型分析了SNP突变及其单倍型对乳中脂肪酸含量及其不饱和指数的影响。【结果】中国荷斯坦牛FADS2基因3′端非编码区存在3个SNP突变位点:c.1571 A〉G、c.2743 A〉G、c.2776 A〉G。c.1571 A〉G位点GG型为优势基因型,基因型频率为0.800,G为优势等位基因,基因频率为0.887。c.2776 A〉G位点AA为优势基因型,基因型频率为0.673,A为优势等位基因,基因频率为0.819。χ^2检验表明:c.2776 A〉G位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P〉0.05),而c.1571 A〉G位点基因型分布均偏离Hardy-Weinberg平衡(P〈0.05)。FADS2基因c.1571 A〉G位点与c.2776 A〉G位点间连锁不平衡系数r2为0.028,未达到显著水平(P〉0.05)。c.1571A〉G位点与c.2776 A〉G位点有3种单倍型,GA、GG和AA频率分别为0.705、0.181和0.114。多因素方差分析表明:FADS2-1571对C14:1含量、C14和C18不饱和指数的影响达到极显著水平(P〈0.01),对C18:0、SFA和MUFA含量的影响达到显著水平(P〈0.05)。GG型个体乳中C14:1含量、C14和C18不饱和指数显著高于AG型(P〈0.05)。FADS2-2776位点对C16:1含量、C16和C20不饱和指数的影响达到极显著水平(P〈0.01),对C14:1含量的影响达到显著水平(P〈0.05),GG型个体乳中C16:1含量、C16和C20不饱和指数显著高于AG型和AA型(P〈0.05)。同时,FDAS2-1571-2776单倍型对C16:1含量和C20不饱和指数的影响达到显著水平(P〈0.05),单倍型GG型个体乳中C16:1含量和C20不饱和指数显著高于GA型和AA型(P〈0.05)。【结论】FADS2基因3′端非编码区SNP突变对中国荷斯坦牛乳中脂肪酸组成有重要影响。在进一步验证其功能情况下,可作为影响中国荷斯坦奶牛乳脂肪酸组成的主效基因加以利用。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 fads2 SNPS 脂肪酸组成
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水牛FADS2基因的电子克隆及序列分析 被引量:4
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作者 马小娅 庞春英 +5 位作者 梁莎莎 陆杏蓉 朱鹏 段安琴 梁贤威 邓廷贤 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第10期2829-2836,共8页
试验旨在利用电子克隆法对水牛Δ6脂肪酸脱氢酶(Δ6-fatty acid desaturases,FADS2)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究FADS2基因对水牛泌乳性能的作用机制奠定基础。以奶牛FADS2基因序列(Gen Bank登录号:NM_001083444.1)为探针设计引... 试验旨在利用电子克隆法对水牛Δ6脂肪酸脱氢酶(Δ6-fatty acid desaturases,FADS2)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究FADS2基因对水牛泌乳性能的作用机制奠定基础。以奶牛FADS2基因序列(Gen Bank登录号:NM_001083444.1)为探针设计引物,利用电子克隆法克隆水牛FADS2基因,并通过RT-PCR验证,对FADS2基因的序列特征进行生物信息学分析。测序结果表明,水牛FADS2基因序列全长为36 600 bp,由12个外显子和11个内含子组成,包含一个长1 335 bp的开放阅读框,可编码444个氨基酸。序列同源性分析显示,水牛FADS2基因编码序列与牦牛、黄牛、人、猪、家兔、虎鲸和褐家鼠序列的同源性分别为98.88%、98.88%、89.66%、90.79%、90.85%、92.35%和87.11%。蛋白质预测分析表明,水牛FADS2蛋白分子质量为52.51 ku,理论等电点(p I)为8.75,呈弱碱性,属于亲水性蛋白,无信号肽。系统进化树分析结果表明,FADS2基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性,其中水牛与牦牛、黄牛亲缘关系较近,与褐家鼠亲缘关系较远。水牛FADS2基因的成功克隆为今后阐明水牛泌乳性能的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 水牛 fads2基因 电子克隆 生物信息学分析
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FADS2基因在奶牛乳腺细胞中的过表达和干扰研究 被引量:3
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作者 马小娅 庞春英 +4 位作者 邓廷贤 段安琴 陆杏蓉 梁莎莎 梁贤威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第3期652-660,共9页
为了研究脂肪酸脱氢酶2(fatty acid desaturases 2,FADS2)基因在奶牛乳腺细胞脂肪酸代谢中的作用,本研究在奶牛乳腺上皮细胞中对FADS2基因进行过表达和干扰,研究FADS2基因表达对脂肪酸合成相关基因的调控及对奶牛乳腺上皮细胞中甘油三... 为了研究脂肪酸脱氢酶2(fatty acid desaturases 2,FADS2)基因在奶牛乳腺细胞脂肪酸代谢中的作用,本研究在奶牛乳腺上皮细胞中对FADS2基因进行过表达和干扰,研究FADS2基因表达对脂肪酸合成相关基因的调控及对奶牛乳腺上皮细胞中甘油三酯含量的影响。针对FADS2基因的CDS序列设计siRNA和过表达载体pcDNA3.1-FADS2-EGFP,转染奶牛乳腺细胞检测FADS2基因过表达和干扰对脂肪酸代谢相关基因表达的影响及细胞中甘油三酯含量的变化。结果显示,试验成功获得过表达载体pcDNA3.1-FADS2-EGFP和干扰片段,转染细胞后具有良好的过表达和干扰效果。FADS2基因过表达后,1-酰基甘油磷酸酰基转移酶(AGPAT1)、固醇调节元件结合蛋白裂解激活蛋白(SCAP)、3-磷酸甘油转移酶(GPAM)、脂肪酸延长链5(ELOVL5)、乙酰辅酶A酰基转移酶1(ACAA1)、脂肪酸脱氢酶1(FADS1)、二酰基甘油转酰基酶1(DGAT1)和过氧化物酶体增殖激活受体α(PPARα)基因显著下调(P<0.05),脂滴蛋白2(PLIN2)基因极显著上调(P<0.01)。FADS2基因干扰过后可引起AGPAT1、GPAM、ELOVL5、ACAA1、PLIN2和FADS1基因显著上调(P<0.05),脂肪酸合成胰岛素诱导基因1(INSIG1)极显著上调(P<0.01),DGAT1和PPARα基因显著下调(P<0.05)。甘油三酯检测结果显示,FADS2基因过表达和干扰均可降低奶牛乳腺上皮细胞中甘油三酯的含量。综上所述,在奶牛乳腺上皮细胞中,FADS2基因能调控脂质合成相关基因的表达,对乳腺脂质合成具有调控作用。 展开更多
关键词 奶牛乳腺细胞 fads2基因 过表达 干扰 脂肪酸合成
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不同脂肪源饲料对斑马鱼elovl5、elovl2和fads2在高度不饱和脂肪酸合成中的作用影响 被引量:2
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作者 王玉梅 任天应 高坚 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期138-145,共8页
为探究延长酶5(elovl5)、延长酶2(elovl2)和去饱和酶2(fads2)基因在淡水鱼高度不饱和脂肪酸(HUFA)合成中的相互作用,利用CRISPR/Cas9技术,成功构建出斑马鱼elovl5^(-/-)(以下简称E5^(-/-)组)、elovl2^(-/-)×elovl5^(-/-)(以下简称E... 为探究延长酶5(elovl5)、延长酶2(elovl2)和去饱和酶2(fads2)基因在淡水鱼高度不饱和脂肪酸(HUFA)合成中的相互作用,利用CRISPR/Cas9技术,成功构建出斑马鱼elovl5^(-/-)(以下简称E5^(-/-)组)、elovl2^(-/-)×elovl5^(-/-)(以下简称E2^(-/-)×E5^(-/-)组)、elovl5^(-/-)×fads2^(-/-)(以下简称E5^(-/-)×F2^(-/-)组)、elovl2^(-/-)×elovl5^(-/-)×fads2^(-/-)(以下简称E2^(-/-)×E5^(-/-)×F2^(-/-)组)4种突变体模型,并对4种突变体进行大豆油饲料(SO)和亚麻芥油饲料(CO)的投喂试验,研究斑马鱼elovl5、elovl2和fads2在HUFA合成过程中对饲料不同脂肪源的响应。结果显示,在E5^(-/-)组和E2^(-/-)×E5^(-/-)组中,C18PUFA未出现明显累积,而E5^(-/-)×F2^(-/-)组和E2^(-/-)×E5^(-/-)×F2^(-/-)组中的C18:3n-3(ALA)和C18:2n-6(LNA)呈现显著的累积。elovl2、elovl5和fads2缺失后,肝脏elovl4a和elovl4b表达明显上升。不同脂肪源饲料投喂试验结果显示,SO饲料投喂后的E5^(-/-)组DHA含量与野生型(WT)无显著差异,E5^(-/-)×F2^(-/-)组较WT组DHA含量显著降低。然而,CO饲料投喂后的E5^(-/-)组DHA含量较WT组呈现显著升高,E5^(-/-)×F2^(-/-)组与WT无显著差异。fads2缺失斑马鱼去饱和作用受到显著影响,表明,fads2是HUFA合成过程中的必需酶。而elovl2和elovl5缺失的表型可能会被其他HUFA合成途径所弥补。以上结果表明,elovl2和elovl5在HUFA合成中存在基因间相互作用,fads2作为去饱和酶在HUFA合成中必不可少。 展开更多
关键词 elovl5 elovl2 fads2 HUFA 相互作用 斑马鱼 不同脂肪源饲料
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碱地黑牛FADS1基因克隆测序及表达分析 被引量:2
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作者 陈振鹏 刘瑞莉 +5 位作者 王胜 韩明轩 于堃 张文琦 柏学进 董雅娟 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期92-98,共7页
实验旨在研究碱地黑牛脂肪酸脱氢酶1基因(FADS1)CDS区序列和表达情况,并探讨FADS1基因理化性质及表达规律。本研究通过克隆测序构建FADS1的系统进化树并进行生物信息学分析,用免疫组化技术对FADS1蛋白进行定位分析,免疫印迹检测FADS1蛋... 实验旨在研究碱地黑牛脂肪酸脱氢酶1基因(FADS1)CDS区序列和表达情况,并探讨FADS1基因理化性质及表达规律。本研究通过克隆测序构建FADS1的系统进化树并进行生物信息学分析,用免疫组化技术对FADS1蛋白进行定位分析,免疫印迹检测FADS1蛋白在实验组织的表达情况。生物信息学结果显示碱地黑牛FADS1 CDS区长1083 bp,编码360个氨基酸。FADS1不存在信号肽。FADS1进化树显示碱地黑牛FADS1与牛的遗传距离较近(99.9%),与鸡的遗传距离较远(80.0%)。结构预测表明FADS1中α螺旋占48.61%,β折叠占3.61%,延长链占13.06%,无规则卷曲占34.72%,4个α螺旋构成四螺旋束并在螺旋肽段之间形成一个疏水性的空腔,整体呈中空的桶状。互作网络解析显示:FADS1与ACSL1、ACSL3、ELOVL2、ELOVL5、PTPLA、PTPLB、ACOX1、ACOX2、ACADM、FASN、TECR等蛋白互作,参与FADS1-ELOVL5-HSD17B12-ACADM-ACOX1、FADS1-FASN-ACADVL-ACOX2等脂肪酸合成、代谢、脂滴生成相关过程的调控网络。亚细胞定位预测表明:FADS1在内质网、线粒体及分泌系统小泡中表达。免疫组化显示FADS1于胞内细胞器表达明显,局限性的分布在胞膜一侧。荧光定量及免疫印迹显示肝中丰度最高(P<0.01),心脏次之,脂肪最低。综上推测,FADS1基因参与促进碱地黑牛肝脏脂肪酸合成过程,对调控脂质代谢、沉积发挥着重要作用。 展开更多
关键词 fads1基因 生物信息学 碱地黑牛 免疫组化 免疫印迹
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FADS2对鸡前脂肪细胞脂肪酸代谢相关基因表达的影响 被引量:1
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作者 欧小倩 王莹 +3 位作者 何程实 李春晖 刘国庆 杨少华 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第9期1269-1275,共7页
脂肪酸的含量及比例对改善鸡肉品质和风味起着重要作用,因此探究调控脂肪酸代谢的关键基因和作用机制能够为改善鸡肉品质提供新的科学依据。基于前期RNA-seq结果,确定脂肪酸脱氢酶2(FADS2)为影响鸡不饱和脂肪酸比率的关键基因。文章构建... 脂肪酸的含量及比例对改善鸡肉品质和风味起着重要作用,因此探究调控脂肪酸代谢的关键基因和作用机制能够为改善鸡肉品质提供新的科学依据。基于前期RNA-seq结果,确定脂肪酸脱氢酶2(FADS2)为影响鸡不饱和脂肪酸比率的关键基因。文章构建FADS2基因RNA干扰慢病毒表达载体,转染鸡前脂肪细胞并鉴定干扰效率,筛选出有效干扰片段并进行正式试验,通过设置阴性对照组,转录组测序检测相关基因表达。结果表明,190个基因显著差异性表达,其中65个基因下调,125个基因上调。通过比较基因组学和基因功能分析,鉴定出STAT1、LY86、FABP5、OGFR、ACTA1、SLC5A6、NCOA7、KLF2、KLF4、ACSL5和FABP3基因可能是FADS2基因影响脂肪酸代谢的相关下游基因,为深入研究脂肪酸代谢过程提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 fads2基因 鸡前脂肪细胞 转录组测序 差异表达基因 下游基因
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应用于飞翼布局飞行器的FADS系统的设计实现
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作者 李子凌 张耿 +2 位作者 王泽坤 阚思仪 李少泽 《自动化应用》 2016年第5期72-74,共3页
设计了一种基于ARM处理器,测压孔安装于飞行器机头表面的FADS系统应用方案,测算飞翼布局飞行器姿态。
关键词 fads系统 ARM处理器 压力测试 终端显示
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黄斑蓝子鱼Δ6Δ5 Fads2蛋白重组表达和多克隆抗体的制备
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作者 陈翠英 程宇 +5 位作者 王懿 范春兰 钟文杰 陈创思 李远友 王树启 《汕头大学学报(自然科学版)》 2022年第3期50-57,共8页
黄斑蓝子鱼(Siganus canaliculatus)是首个被发现具有长链多不饱和脂肪酸(LC-PUFA)合成能力的海水鱼类,而脂肪酸去饱和酶(Fads2)是内源性合成LC-PUFA的关键限速酶.为深入研究鱼类Δ6Δ5 Fads2的生物学功能及其表达调控机制,本研究选取... 黄斑蓝子鱼(Siganus canaliculatus)是首个被发现具有长链多不饱和脂肪酸(LC-PUFA)合成能力的海水鱼类,而脂肪酸去饱和酶(Fads2)是内源性合成LC-PUFA的关键限速酶.为深入研究鱼类Δ6Δ5 Fads2的生物学功能及其表达调控机制,本研究选取黄斑蓝子鱼Δ6Δ5 fads2基因的编码区序列长255 bp,通过限制性内切酶EcoR I和BamH I双酶切,将其插入质粒pGEX-6p-1,获得Δ6Δ5 fads2基因的重组表达载体,经IPTG诱导表达获得大量重组表达蛋白.以纯化后的Δ6Δ5 Fads2重组蛋白为抗原注射免疫KM小鼠后提取血清,并进行Western blot鉴定产生多克隆抗体的特异性.结果表明,本研究成功构建了pGEX-6p-1-Δ6Δ5 Fads2原核表达载体,表达纯化后获得大小约35.4 ku的Δ6Δ5 Fads2重组表达蛋白,利用KM小鼠得到的多克隆抗体特异性好,其效价约为1∶3.2×104.该抗体可为深入研究鱼类Δ6Δ5 Fads2的生物学功能及其表达调控机制提供基础条件,从而有助于研发提高鱼体内源性LC-PUFA合成能力的方法,降低养殖鱼类饲料中鱼油添加比例,促进养殖业的健康发展. 展开更多
关键词 黄斑蓝子鱼 Δ6Δ5 fads2 诱导表达与纯化 多克隆抗体 Western blot
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Fault-tolerant FADS system development for a hypersonic vehicle via neural network algorithms
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作者 Qian Wan Minjie Zhang +1 位作者 Guang Zuo Tianbo Xie 《Theoretical & Applied Mechanics Letters》 CSCD 2023年第5期357-366,共10页
Hypersonic vehicles suffer from extreme aerodynamic heating during flights, especially around the area of leading edge due to its small curvature. Therefore, flush air data sensing(FADS) system has been developed to p... Hypersonic vehicles suffer from extreme aerodynamic heating during flights, especially around the area of leading edge due to its small curvature. Therefore, flush air data sensing(FADS) system has been developed to perform accurate measurement of the air data parameters. In the present study, the method to develop the FADS algorithms with fail-operational capability for a sharp-nosed hypersonic vehicle is provided. To be specific, the FADS system implemented with 16 airframe-integrated pressure ports is used as a case study. Numerical simulations of different freestream conditions have been conducted to generate the database for the FADS targeting in 2 ≤ Ma ≤ 5 and 0 km ≤ H ≤ 30 km. Four groups of neural network algorithms have been developed based on four different pressure port configurations, and the accuracy has been validated by 280 groups of simulations. Particularly, the algorithms based on the 16-port configuration show an excellent ability to serve as the main solver of the FADS, where 99. 5% of the angle-of-attack estimations are within the error band ±0. 2°. The accuracy of the algorithms is discussed in terms of port configuration. Furthermore, diagnosis of the system health is present in the paper. A fault-tolerant FADS system architecture has been designed, which is capable of continuously sensing the air data in the case that multi-port failure occurs, with a reduction in the system accuracy. 展开更多
关键词 fads System Hypersonic vehicle Neural network Numerical simulation Fault detection Redundancy management
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Associations of Single Nucleotide Polymorphisms in the Bovine <i>FADS</i>6 Gene with Fatty Acid Composition in Hanwoo (Korean Cattle)
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作者 Krishnamoorthy Srikanth Anam Kwan +3 位作者 Eunjin Lee Seonkwan Kim Youngjo Lim Hoyoung Chung 《Open Journal of Genetics》 2015年第4期137-144,共8页
The bovine fatty acid desaturase (FADS) gene cluster consists of FADS1, FADS2, FADS3, and FADS6, which acts as key enzymes in fatty acid metabolism. Of these, the genetics effects of variants in FADS1, FADS2 and FADS3... The bovine fatty acid desaturase (FADS) gene cluster consists of FADS1, FADS2, FADS3, and FADS6, which acts as key enzymes in fatty acid metabolism. Of these, the genetics effects of variants in FADS1, FADS2 and FADS3 have been previously studied. However, the genetic effects of variants of FADS6 gene have not been studied. The aim of this study was to identify genetic variants in the bovine fatty acid desaturase 6 (FADS6) gene and study their association with fatty acid composition in Hanwoo cattle. Six genetic variants were observed, three each in intron 2 and exon 6 by DNA sequencing analyses. The association of genetic variants with fatty acid composition was evaluated in 90 Hanwoo steers. The variants were confirmed and the animals were genotyped by RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) and AS-PCR (Allele Specific PCR) analyses. The analysis revealed that palmitoleic acid (C16:1n7) was associated with g.3391G > A, g.3660A > C and g.15657C > T, and stearic acid (C18:0) showed highly significant association with g.3660A > C segments. Both g.3391G > A, g.3660A > C also had strong additive and dominance effect for Palmitoleic acid, while g.3660A > C also had a strong dominance effect for stearic acid. These results could be useful for modulating fatty acid composition in beef and produce meat with higher monounsaturated fatty acid to saturated fatty acid ratio (MUFA/SFA), which had been shown to have positive health effect in humans. 展开更多
关键词 Fatty Acid Composition BEEF fads6 Genetic Association SNP
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Preliminary Assessment of Fish Aggregating Devices (FADs) in the North and South Coast of Kenya
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作者 Fatuma Mzingirwa Muhammed Najya +2 位作者 Mueni Elizabeth Charles Muthama Peter Musembi 《Open Journal of Marine Science》 2016年第2期323-333,共11页
Marine fisheries in Kenya mainly comprise of the artisanal fishermen who use non-motorized boats. Competition of these dwindling resources has led to overfishing and degradation of coral reef ecosystems. One of the me... Marine fisheries in Kenya mainly comprise of the artisanal fishermen who use non-motorized boats. Competition of these dwindling resources has led to overfishing and degradation of coral reef ecosystems. One of the methods which have been used to enhance sustainable exploitation of fisheries resources is the use of Fish Aggregating Devices (FADs). The study was conducted in two areas along the Kenyan coast which are: Msambweni in the southern part and Kuruwitu (Vipingo) in the northern part of the Kenyan coast. A combination of systematic site surveys: structured and semi structured interviews with key informants (community leaders and resource users);participant observations;descriptions of daily and seasonal time use;and analyses of secondary sources, such as fisheries records, was used to gather information and triangulate results. The perception of the community about FADs was determined by conducting a socio-economic survey before and after deploying FADs. Colonization and biomass survey around the deployed FADs was undertaken and fish associated with FADs was recorded. Results indicate that nine families of fish aggregated around FADs and at different distances. Catch and effort at FADs have been evaluated by monitoring catch data from fishers on daily basis after deployments. 展开更多
关键词 Fish Aggregating Devices (fads) Artisanal Fishermen Kenyan Coast Msambweni Kuruwitu (Vipingo)
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FADS1、FADS2基因多态性与中国汉族孤独症谱系障碍的关联研究 被引量:2
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作者 康晶 邹明扬 +5 位作者 马永娟 宋小欢 孙彩虹 郝艳秋 夏薇 武丽杰 《中国儿童保健杂志》 CAS 2017年第12期1196-1199,1214,共5页
目的分析参与多不饱和脂肪酸代谢的FADS1和FADS2基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族孤独症谱系障碍(ASD)患儿的相关性。方法采用病例对照的研究方法,收集病例和对照各243例,采集外周血并提取DNA。利用人类基因库数据和Haploview 4.2软... 目的分析参与多不饱和脂肪酸代谢的FADS1和FADS2基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族孤独症谱系障碍(ASD)患儿的相关性。方法采用病例对照的研究方法,收集病例和对照各243例,采集外周血并提取DNA。利用人类基因库数据和Haploview 4.2软件筛选FADS1和FADS2基因的标签SNPs,采用Sequenom Mass ARRAY系统对SNPs进行基因分型,采用Logistic回归分析标签SNPs与ASD发病风险之间的关联。结果病例组和对照组儿童FADS2基因的rs526126等位基因频率和基因型频率差异有统计学意义[G等位基因OR=0.54(0.41~0.72),G/G基因型OR=0.05(0.02~0.19),P均<0.001]。结论 FADS2基因可能与中国汉族儿童ASD发病风险存在关联性。 展开更多
关键词 孤独症谱系障碍 fads1基因 fads2基因 多不饱和脂肪酸 单核苷酸多态性
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APOA5及FADS1基因多态性以及单倍体型与血脂水平的关系 被引量:2
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作者 狄春红 谭晓华 +3 位作者 王小波 吴茵茵 兰满 杨磊 《浙江预防医学》 2015年第11期1097-1102,共6页
目的分析载脂蛋白5(APOA5)基因的rs662799和rs964184位点,脂肪酸去饱和酶1(FADS1)基因的rs174547和rs174537位点在中国汉族人群中的分布频率及其对血脂水平和血脂异常发病风险的影响,并分析该4个位点构成的单倍体型与血脂异常发病... 目的分析载脂蛋白5(APOA5)基因的rs662799和rs964184位点,脂肪酸去饱和酶1(FADS1)基因的rs174547和rs174537位点在中国汉族人群中的分布频率及其对血脂水平和血脂异常发病风险的影响,并分析该4个位点构成的单倍体型与血脂异常发病风险相关性.方法收集汉族人群标本1275人.采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测该4个位点基因型.采用单因素方差分析比较各位点不同基因型血脂指标差异,二分类Logistic回归比较各型血脂异常发病风险的大小.采用基于R软件运行的Haplo-stats1.4.3.软件分析APOA5和FADS1基因单倍体型及其对血脂异常发病的相对危险度.结果rs662799的AG和GG基因型与AA基因型相比,rs964184的CG和GG相对于CC基因型的HDL-C水平明显降低.rs174547CC基因型相对于TC和TT基因型的HDL-C水平均明显降低,且rs174547CC基因型与低HDL-C血症的发生存在统计关联.rs662799GG基因型及rs964184GG基因型与高TG血症、混合型高脂血症和低HDL-C血症发生存在统计关联;rs662799AG基因型明显增加高TG血症的发生.与rs174547- rs174537-rs662799- rs964184位点TGAC单倍体型相比,TGGG单倍体型与高TG血症发生存在统计关联(OR=1.770,95%CI:1.033~3.035),CTGG单倍体型与混合型高脂血症(OR=2.239,95%CI:1.055~4.752)和低HDL血症(OR=1.823,95%CI:1.058~3.142)发生存在统计关联,CGAC单倍体型与低HDL血症发生存在统计关联(OR=1.702,95%CI:1.125~2.573).结论FADS1基因的rs174547与APOA5基因的rs662799和rs964184以及这两个基因多态性的单倍体型对中国汉族人群血脂水平均有显著影响. 展开更多
关键词 APOA5 fads1 单倍体型 血脂水平 血脂异常
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miR-335靶定ENPP4和FADS1基因介导高脂性小鼠肥胖
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作者 邵芳 潘洁 戚春建 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期806-814,共9页
目的研究高脂饮食小鼠腹脂微小RNA(miRNA)的差异表达,探讨高表达miR-335在脂类代谢过程中作用。方法对高脂饮食的小鼠腹脂进行miRNA芯片分析,检测小鼠腹脂miRNA的差异表达;采用生物信息学方法预测miR-335靶基因,双荧光素酶报告系统及点... 目的研究高脂饮食小鼠腹脂微小RNA(miRNA)的差异表达,探讨高表达miR-335在脂类代谢过程中作用。方法对高脂饮食的小鼠腹脂进行miRNA芯片分析,检测小鼠腹脂miRNA的差异表达;采用生物信息学方法预测miR-335靶基因,双荧光素酶报告系统及点突变实验验证靶基因外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶4(ectonucleotide pyrophosphatase/phosphordiester-ase4,ENPP4)和脂肪酸去饱和酶1(fatty acid desaturase1,FADS1);3T3L1细胞中转染miR-335模拟体,检测靶基因mRNA和蛋白表达量;实时荧光定量PCR检测miR-335和靶基因在高脂饮食小鼠不同组织中的表达量。结果高脂饮食后,模型组小鼠体型明显大于对照组,小鼠血清总胆固醇(P=0.016)和三酰甘油(P=0.014)水平显著上升。高脂饮食的小鼠脂肪组织中多种miRNA发生差异表达,其中miR-335表达上升尤为明显(P=0.024)。通过Targetscan预测miR-335靶基因,结合其功能,筛选出ENPP4和FADS1。报告基因试验显示miR-335通过"种子区"与ENPP4和FADS1预测靶位点结合从而抑制ENPP4和FADS1基因的表达,点突变实验证实了结合的靶位点;设计合成miR-335模拟体转染3T3L1细胞,培养48 h后,FADS1 mRNA表达水平显著下降(P=0.038),ENPP4和FADS1蛋白水平均显著下降(P=0.033,P=0.007)。与对照组相比,高脂饮食后miR-335在肝脏、白棕脂肪组织和脑中显著性高表达(P=0.017,P=0.002,P=0.003,P=0.031);而ENPP4和FADS1在脑(P=0.006,P=0.034)和棕色脂肪组织(P=0.014,P=0.037)中表达量显著下降,同时ENPP4在肝脏中的表达量也极显著下降(P<0.001)。结论miR-335是与脂类代谢和脂肪沉积相关的miRNA,ENPP4和FADS1基因是miR-335的靶基因。 展开更多
关键词 miR-335 ENPP4基因 fads1基因 差异表达 脂类代谢
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