期刊文献+
共找到28篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
基于FIASCO技术的合浦珠母贝微卫星标记分离与筛选研究 被引量:13
1
作者 曲妮妮 龚世园 +2 位作者 黄桂菊 童金苟 喻达辉 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期47-54,共8页
用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了合浦珠母贝Pinctada fucata基因组微卫星标记的分离与筛选研究。合浦珠母贝基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15探针与其杂... 用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了合浦珠母贝Pinctada fucata基因组微卫星标记的分离与筛选研究。合浦珠母贝基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15探针与其杂交,然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增后形成双链,最后进行克隆转化,构建微卫星富集文库。挑选克隆用探针引物(CA)15和载体引物进行第2次筛选,获得阳性克隆357个,测序结果表明,297个克隆(83.2%)含有微卫星序列,包括479个微卫星DNA结构域。其中完美型微卫星有370个(77.3%),非完美型95个(19.8%),复合型14个(2.9%)。合成引物49对,有31对(63%)扩增出目的产物,其中9对在种群中(n=32)具有扩增多态性,其多态信息含量PIC值在0.375―0.809之间,平均为0.536;等位基因数在2―9个之间,平均为4.889个;观测杂合度介于0.200―0.600之间,平均为0.415;期望杂合度的变化范围为0.454―0.844,平均为0.598。表明FIASCO技术适合于合浦珠母贝微卫星标记的分离与筛选。 展开更多
关键词 fiasco 合浦珠母贝Pinctada fucata 微卫星标记 分离与筛选
下载PDF
改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文) 被引量:1
2
作者 李磊 敖日格乐 +1 位作者 王玢琪 葛台明 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期413-420,共8页
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微... 蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微卫星位点,其中60%为完美型(Perfect)SSR。根据这些位点设计、合成了25对引物,并对江西庐山及湖北恩施两地蜈蚣草种群各20个个体进行了遗传多样性检测,结果发现:其中8个完美型及1个间断型(intermittent)SSR位点的引物能够扩增出清晰、稳定且具有多态性的条带。9对引物共扩增出41个等位基因,各位点等位基因数在2~7之间,平均等位基因数为4.56个;期望杂合度在0.0494~0.8169之间;没有连锁不平衡现象发生。采用大叶井栏边草(Pteris multifida Poir.)进行跨种扩增,结果发现其中6对引物能够进行种间扩增。这些SSR分子标记的开发有助于蜈蚣草生态适应性进化分析、揭示蜈蚣草地理分布格局以及探讨蜈蚣草遗传多样性,还可用于品种鉴定及选育等。 展开更多
关键词 蜈蚣草 微卫星 多态性 fiasco CviQI接头 pig-tail CviQI-N引物
下载PDF
利用FIASCO技术进行波纹巴非蛤微卫星DNA标记分离与筛选的研究 被引量:4
3
作者 郭昱嵩 谢子强 +1 位作者 邓岳文 刘楚吾 《中国农学通报》 CSCD 2012年第17期160-164,共5页
为揭示波纹巴非蛤种质遗传特性、开发种质库,利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了其基因组微卫星标记的分离与筛选研究。基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15... 为揭示波纹巴非蛤种质遗传特性、开发种质库,利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了其基因组微卫星标记的分离与筛选研究。基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15或(AAG)7探针与其杂交,然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增后形成双链,最后进行克隆转化,构建微卫星富集文库。挑选克隆用探针引物(CA)15或(AAG)7和载体引物进行PCR筛选,测序得到含有微卫星DNA的序列,根据序列设计和合成微卫星引物,进行引物适用性分析,并分析了湛江群体的遗传结构。结果表明:8对微卫星引物在湛江群体共检测到108个等位基因,每个位点等位基因数为5~19,期望杂合度为0.666~0.926,观测杂合度为0.400~0.882,4个位点(Pun4,Pun5,Pun6,Pun7)显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.00625);PIC介于0.62~0.92,所有位点均属于高度多态位点(PIC>0.5)。说明FIASCO技术适合于波纹巴非蛤微卫星标记的分离与筛选,筛选得到的8个微卫星位点能用于波纹巴非蛤遗传多样性分析及野生群体与养殖群体的群体结构分析。 展开更多
关键词 波纹巴非蛤 微卫星DNA 磁珠富集 遗传多样性
下载PDF
基于FIASCO技术的芝麻SSR标记及其遗传多样性分析
4
作者 陶菲 童益琴 +4 位作者 赵杰 南皓 杨立春 李江浩 葛台明 《湖北农业科学》 2015年第11期2586-2593,共8页
采用FIASCO法构建了芝麻(Sesamum indicum L.)GATA/AAAG/AAAC微卫星富集文库,阳性克隆率62%,其中58%为完美型SSR。利用30个芝麻材料对其中10个扩增稳定、多态性好的SSR位点进行了多样性分析,等位基因数介于4~7之间,平均6.2个;有效... 采用FIASCO法构建了芝麻(Sesamum indicum L.)GATA/AAAG/AAAC微卫星富集文库,阳性克隆率62%,其中58%为完美型SSR。利用30个芝麻材料对其中10个扩增稳定、多态性好的SSR位点进行了多样性分析,等位基因数介于4~7之间,平均6.2个;有效等位基因数介于2.18~5.13之间,平均3.73。25个育成品种(系)遗传相似系数平均为0.740 7,遗传距离平均为0.258 9;5个地方品种间的遗传相似系数平均为0.659 3,遗传距离平均值为0.312 8,说明地方品种多样性比育成品种(系)丰富。AMOVA分析表明,品种(系)间变异大于品种(系)内变异,地方品种种内变异大于育成品种(系)。聚类分析表明,一把白与所有育成品种(系)聚为同一类。研究还鉴定出一些遗传差异较大的材料。 展开更多
关键词 芝麻(Sesamum indicum L.) SSR标记 fiasco 遗传多样性
下载PDF
A FIASCO-Based Approach for Detection and Diagnosis of Puccinia graminis f.sp.tritici in China
5
作者 LIU Tai-guo WANG Xi +3 位作者 GAO Li LIU Bo CHEN Wan-quan XIANG Wen-sheng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第11期2438-2444,共7页
Stem or black rust of wheat, caused by the fungus Puccinia graminis Pers. f. sp. tritici Eriks.&E. Henn. (Pgt), has historically caused severe losses to wheat (Triticum aestivum L.) production worldwide. In the F... Stem or black rust of wheat, caused by the fungus Puccinia graminis Pers. f. sp. tritici Eriks.&E. Henn. (Pgt), has historically caused severe losses to wheat (Triticum aestivum L.) production worldwide. In the Fujian and Guangdong provinces of China, six moderate-to-severe epidemics of wheat stem rust have occurred, which caused destructive losses of wheat between 1949 and 1966, although these were brought under control by integrated management. A rapid and reliable detection of the pathogen will contribute to the accurate forecast and seasonal control of this disease. The objective of this study was to develop a diagnostic molecular marker generated from simple sequence repeats (SSR) for the early rapid identiifcation of P. graminis. The genomic DNA of P. graminis, Puccinia striiformis, Puccinia triticina and seven other species was ampliifed by a pair of SSR primers generated by the FIASCO (fast isolation by AFLP sequences containing repeats) enrichment protocol. The primer set Pgtw (f)/Pgtw (r) generated a polymorphic pattern displaying a 330-bp DNA fragment speciifc for P. graminis whereas no DNA fragment was obtained from other non-target wheat fungal pathogens. The detection limit of the primer was 1 ng DNA in a 25-mL PCR reaction. The SSR markers of P. graminis can also be used to detect the presence of latent hyphae in Pgt-infected wheat leaves as early as 30 h post-inoculation. A rapid approach to distinguish P. graminis from similar pathogenic fungi would be anticipated in further study. 展开更多
关键词 wheat stem rust Puccinia graminis f. sp. tritci MICROSATELLITE fiasco PCR detection
下载PDF
Development of SSR Markers for a Phytopathogenic Fungus,Blumeria graminis f.sp.tritici,Using a FIASCO Protocol
6
作者 WANG Meng XUE Fei +5 位作者 YANG Peng DUAN Xia-yu ZHOU Yi-lin SHEN Chong-yao ZHANG Guo-zhen WANG Bao-tong 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第1期100-104,共5页
Simple sequence repeats (SSR) have been widely used as molecular markers due to their abundance and high polymorphism, However, up to now, the SSR markers had not been developed in the obligate biotrophic phytopatho... Simple sequence repeats (SSR) have been widely used as molecular markers due to their abundance and high polymorphism, However, up to now, the SSR markers had not been developed in the obligate biotrophic phytopathogenic fungus, Blumeria graminis f.sp. tritici. From (AC)10 and (AG)10 enriched genomic libraries for Bgt, 25 primer pairs were designed using the FIASCO (fast isolation by AFLP of sequences containing repeats) protocol. Five primer pairs exhibited polymorphism with allelic diversity from two to seven alleles and produced 29 alleles in a survey of 90 isolates collected from six provinces (cities) in China, while the others displayed monomorphic. Levels of observed heterozygosity ranged from 0.000-0.044 (mean 0.025) and expected heterozygosity ranged from 0.297-0.816 (mean 0.538). These molecular markers provide a novel source to genetic diversity assays and to genetic and physical mapping ofBgt. SSR markers of Bgt need to be further explored. 展开更多
关键词 Blumeria graminis f.sp. tritici MICROSATELLITE SSR fiasco
下载PDF
乔治·桑德斯《骑士败北记》中的双重叙事进程
7
作者 刘泽承 《黑河学院学报》 2024年第6期110-113,共4页
乔治·桑德斯在其短篇小说《骑士败北记》中建构了双重叙事进程。隐性叙事进程作为一条与情节发展并列前行的表意轨道,提供了“戏(生活)-戏中戏(工作)”以及包蕴其中的“假我—真我”二元对立框架,并通过第三维度拓展扩充了“假我... 乔治·桑德斯在其短篇小说《骑士败北记》中建构了双重叙事进程。隐性叙事进程作为一条与情节发展并列前行的表意轨道,提供了“戏(生活)-戏中戏(工作)”以及包蕴其中的“假我—真我”二元对立框架,并通过第三维度拓展扩充了“假我”“真我”人格间的双向互动。隐性叙事进程中的二元对立框架不仅为情节发展提供了对比鲜明的参照系,其双向互动也从更深广的视域揭示了现代社会中人的普遍生存状态。 展开更多
关键词 《骑士败北记》 双重叙事进程 隐性叙事进程 二元对立框架
下载PDF
微卫星标记的制备策略 被引量:10
8
作者 常玉梅 李绍戊 +1 位作者 梁利群 孙效文 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B04期210-214,共5页
微卫星标记作为一类重要的、成熟的分子遗传标记,凭借自身的高变异性、孟德尔遗传模 式、共显性遗传方式等优点,在遗传及其它相关领域发挥了十分重要的作用,而其主要的缺点是 必须知道所研究生物的微卫星序列及其旁侧序列。随着人类及... 微卫星标记作为一类重要的、成熟的分子遗传标记,凭借自身的高变异性、孟德尔遗传模 式、共显性遗传方式等优点,在遗传及其它相关领域发挥了十分重要的作用,而其主要的缺点是 必须知道所研究生物的微卫星序列及其旁侧序列。随着人类及模式生物基因组的深入研究,微 卫星标记的制备经历了从费时、费力、低效的传统法到周期短、效率高的富集法(选择性杂交法和 FIASCO法);从基因组构建文库筛选到公共数据库ESTs发掘;从实验室自制到花钱购买。总之, 随着方法与技术的不断改进,从目标生物中获得微卫星标记变得越来越简单、经济。 展开更多
关键词 微卫星标记 PIMA 选择性杂交法 fiasco EST-SSRS
下载PDF
长江江豚微卫星DNA分离的初步研究 被引量:9
9
作者 郑劲松 廖小林 +1 位作者 童金苟 王丁 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期19-25,共7页
为了开发物种特异性微卫星标记,本文采用一种改良的快速微卫星分离法(FIASCO)从长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)的基因组中筛选得到72条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型、非完美型及复合型序列所占... 为了开发物种特异性微卫星标记,本文采用一种改良的快速微卫星分离法(FIASCO)从长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)的基因组中筛选得到72条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型、非完美型及复合型序列所占的比例分别为58.3%、22.2%和19.5%。选择其中30条序列设计PCR扩增引物,并用12个随机选择的长江江豚样品进行多态性筛选。初步结果表明其中14对引物的扩增产物稳定并且具有多态性;在每个座位上获得2-13个等位基因,平均等位基因数为5.87个;14个微卫星座位的平均观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.560和0.709。本研究获得了长江江豚的第一批物种特异性微卫星座位及其扩增引物,这些微卫星标记将在后续的保护遗传学研究中发挥重要作用。 展开更多
关键词 长江江豚 fiasco 微卫星DNA 多态性
下载PDF
花鲈微卫星标记分离及其多态性分析 被引量:5
10
作者 赵燕 季相山 +3 位作者 曾勇庆 丁雷 杨萍萍 王慧 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期515-520,共6页
该文利用FIASCO法(fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)和GenBank数据库搜索法开发花鲈微卫星标记,并对筛选的标记进行多态性检测。两种方法共获得54条能够设计引物的序列,扩增结果显示15对引物具有多态性,多态性... 该文利用FIASCO法(fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)和GenBank数据库搜索法开发花鲈微卫星标记,并对筛选的标记进行多态性检测。两种方法共获得54条能够设计引物的序列,扩增结果显示15对引物具有多态性,多态性微卫星位点的等位基因数为2~10个。15个多态性位点中,4个位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;各位点间没有连锁不平衡现象;仅位点SP52可能存在无效等位基因;除SP17和SP468外,其余引物的PIC值均在0.5以上,可用于花鲈群体遗传分析等研究。 展开更多
关键词 fiasco 数据库查询法 花鲈 微卫星
下载PDF
仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析 被引量:5
11
作者 潘传燕 臧云鹏 +5 位作者 廖梅杰 王印庚 荣小军 张正 李彬 陈贵平 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2012年第4期72-82,共11页
采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)方法构建了仿刺参基因组富集CA微卫星序列的基因组短片段文库,筛选得到118条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型共83个,占70.4%;非完美型共30个;占25.4%;... 采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)方法构建了仿刺参基因组富集CA微卫星序列的基因组短片段文库,筛选得到118条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型共83个,占70.4%;非完美型共30个;占25.4%;复合型标记5个,占4.2%。选取其中20条微卫星序列设计引物进行多态性检测,并利用这20对引物对采自中国、韩国(西海岸及东海岸)、俄罗斯和日本沿海的野生仿刺参以及美国沿海的具疣拟刺参进行遗传多样性水平和遗传结构分析。结果表明,所设计的20对引物的扩增产物均具有多态性,其中16个位点为高度多态(PIC>0.5)。遗传多样性分析结果显示,20个微卫星座位的平均观察杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.39和0.69,共检测到231个等位基因(102个有效等位基因),在每个座位上获得3~20个等位基因,平均等位基因数为11.6个,20个位点在6个群体中不同程度偏离遗传平衡(P<0.05),所有群体在整体上均表现为杂合子缺失(Fis>0);5个仿刺参群体间的遗传相似系数在0.71以上,相似性较高,而仿刺参群体与具疣拟刺参的相似性则较低。聚类分析结果表明,中国群体与韩国西海岸群体聚类成一支,而俄罗斯群体、韩国东海岸群体和日本群体聚类成另外一支,聚类的先后与它们在地理分布上的海域位置有一定的相关性。 展开更多
关键词 刺参 微卫星标记 fiasco 遗传多样性 遗传结构
下载PDF
中国鲎(Tachypleus tridentatus)微卫星标记筛选及种群遗传多样性和遗传结构分析 被引量:5
12
作者 翁朝红 谢仰杰 +1 位作者 肖志群 王志勇 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期345-353,共9页
采用FIASCO方法构建了中国鲎(Tachypleus tridentatus)(CA)_n微卫星富集文库,对214个阳性克隆进行测序,筛选获得60条含有微卫星的序列,其中可设计引物的序列共38条。38对微卫星引物在37个中国鲎个体中PCR检测发现,只有9个位点具有多态性... 采用FIASCO方法构建了中国鲎(Tachypleus tridentatus)(CA)_n微卫星富集文库,对214个阳性克隆进行测序,筛选获得60条含有微卫星的序列,其中可设计引物的序列共38条。38对微卫星引物在37个中国鲎个体中PCR检测发现,只有9个位点具有多态性,其等位基因数为5-14个,每个位点平均具有8.1个等位基因。9个位点之间不存在连锁。利用该9个具有多态性微卫星标记分析了中国沿海9个中国鲎地理群体的种群遗传多样性和遗传结构。结果表明:中国沿海的中国鲎种群遗传多态性水平仍较高,9个地方群体间无遗传差异,它们之间未见显著分化,且有着较高的基因流;推测人为的迁移是造成遗传无分化的主要原因。我们建议中国鲎已绝迹的海域可从其他海域引入中国鲎个体来恢复地方群体资源。 展开更多
关键词 中国鲎 微卫星标记 fiasco 遗传多样性 遗传结构
下载PDF
黄鳝微卫星标记筛选及其在不同性别表型群体中的遗传多态性 被引量:5
13
作者 刘臻 罗小华 +2 位作者 鲁双庆 匡刚桥 张建社 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第2期333-338,共6页
采用FIASCO(Fastisolation by AFLP sequences containing repeats)法进行黄鳝微卫星标记筛选并将其应用于黄鳝性别差异群体的遗传变异分析。黄鳝基因组DNA经酶切、微卫星核心序列探针杂交、T载体连接并转化至DH5a中,构建黄鳝基因组... 采用FIASCO(Fastisolation by AFLP sequences containing repeats)法进行黄鳝微卫星标记筛选并将其应用于黄鳝性别差异群体的遗传变异分析。黄鳝基因组DNA经酶切、微卫星核心序列探针杂交、T载体连接并转化至DH5a中,构建黄鳝基因组微卫星富集文库。随机挑选75个阳性克隆测序,结果发现其中20个含有微卫星序列,利用软件成功设计了15对微卫星引物,经过黄鳝基因组DNA的PCR扩增及电泳检测,筛选8对多态性微卫星引物并对黄鳝3种不同性别表型群体的基因组DNA进行PCR扫描,结果显示:在8个微卫星座位中,共检测到51个等位基因,平均每个座位的等位基因数为6.375个,等位基因频率分布为0.0012~0.6033;黄鳝雌性表型群体、间性表型群体、雄性表型群体的平均遗传杂合度分别为0.6371、0.6969、0.7345;平均多态信息含量分别为0.5656、0.6416、0.6858,表明这些微卫星标记在黄鳝不同性别表型群体的遗传多态性发生了改变,它们可作为黄鳝遗传背景分析的分子标记。 展开更多
关键词 fiasco 微卫星DNA 遗传多态性
下载PDF
拟穴青蟹(CA)_n微卫星DNA多态性引物筛选 被引量:2
14
作者 宋忠魁 聂振平 王芳宇 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期98-103,共6页
利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术建立拟穴青蟹Scylla paramamosain基因组文库,并与生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针杂交,联合磁珠富集法构建拟穴青蟹微卫星富集文库。测序194个阳性菌落,分析其中... 利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术建立拟穴青蟹Scylla paramamosain基因组文库,并与生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针杂交,联合磁珠富集法构建拟穴青蟹微卫星富集文库。测序194个阳性菌落,分析其中的150条序列,结果表明:两碱基重复类型占90%以上,其中重复拷贝数在30以上的占27.45%;含微卫星座位189个,其中完美型146个、非完美型28个和复合型15个。设计125对引物扩增一个拟穴青蟹野生群体(含20个个体),其中的19对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度。遗传变异分析表明,17个位点表现出高度多态性,16个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),4组两两位点间存在连锁不平衡现象(P<0.0026,经Bonferroni法校正),7个微卫星位点可能存在无效等位基因。若排除混合微卫星位点的引物对以及扩增位点PIC(polymorphism information content)值在0.5以下的引物对,则13对引物能用于拟穴青蟹群体遗传学等研究。 展开更多
关键词 fiasco(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术 磁珠富集法 拟穴青蟹Scylla paramamosain 微卫星
下载PDF
拟穴青蟹(Scylla paramamosain)微卫星位点开发-基于(AG)12探针杂交 被引量:1
15
作者 宋忠魁 聂振平 +1 位作者 谢达 王芳宇 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期171-176,共6页
采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP sequences containing repeats)技术和磁珠富集方法开发拟穴青蟹微卫星位点。结果表明,400bp以下长度的序列含微卫星的概率超过400bp以上长度的序列;从二碱基重复类型到五碱基重复类型,完美型微卫星... 采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP sequences containing repeats)技术和磁珠富集方法开发拟穴青蟹微卫星位点。结果表明,400bp以下长度的序列含微卫星的概率超过400bp以上长度的序列;从二碱基重复类型到五碱基重复类型,完美型微卫星的概率在增加。利用设计的28对引物扩增一个供试群体,其中12对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度,10个微卫星位点表现出高度多态性,9个微卫星位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),两组两两位点间存在连锁不平衡现象(P<0.0042,经Bonferroni法校正)。Micro-checker分析揭示其中的5个微卫星位点可能存在无效等位基因。排除混合微卫星位点的引物对以及扩增位点PIc值在0.5以下的引物对,8对引物能用于拟穴青蟹群体遗传学等研究。 展开更多
关键词 fiasco技术 磁珠富集法 拟穴青蟹 微卫星
下载PDF
鳜鱼基因组(AC)_n微卫星富集文库的构建与鉴定 被引量:2
16
作者 匡刚桥 刘臻 +3 位作者 鲁双庆 肖调义 刘红玉 刘峰 《长沙大学学报》 2007年第2期20-22,共3页
鳜鱼基因组DNA经MseI酶切后,与MseI接头连接,用链霉素和素磁珠亲和捕捉与生物素标记的微卫星寡核苷酸探针(CA)8杂交,杂交复合物通过变性洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增形成双链,然后克隆到pGEM-T载体上,转化至大肠杆菌DH5α中,首次成... 鳜鱼基因组DNA经MseI酶切后,与MseI接头连接,用链霉素和素磁珠亲和捕捉与生物素标记的微卫星寡核苷酸探针(CA)8杂交,杂交复合物通过变性洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增形成双链,然后克隆到pGEM-T载体上,转化至大肠杆菌DH5α中,首次成功构建鳜鱼(Siniperca chuatsi)基因组(AC)n重复类型的微卫星富集文库.测序结果表明,阳性克隆率为60%,说明构建的鳜鱼基因组微卫星富集文库是一个高质量的文库.鳜鱼富集微卫星文库的建立将为下一步进行鳜鱼微卫星标记的筛选提供了有效的工具. 展开更多
关键词 鳜鱼 微卫星 fiasco
下载PDF
小麦秆锈菌特异性SSR分子标记的开发 被引量:4
17
作者 王曦 刘太国 +1 位作者 向文胜 陈万权 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第22期4593-4599,共7页
【目的】研发简单、快速、准确的分子检测技术用于小麦秆锈菌的准确诊断和秆锈病的早期预警。【方法】采用FIASCO法构建秆锈菌基因组微卫星富集文库,分离微卫星DNA序列,设计合成小麦秆锈菌的特异性引物。【结果】根据小麦秆锈菌基因组... 【目的】研发简单、快速、准确的分子检测技术用于小麦秆锈菌的准确诊断和秆锈病的早期预警。【方法】采用FIASCO法构建秆锈菌基因组微卫星富集文库,分离微卫星DNA序列,设计合成小麦秆锈菌的特异性引物。【结果】根据小麦秆锈菌基因组微卫星富集文库,设计1对小麦秆锈菌特异性微卫星引物Pgtfssr1(f/r),可在来自中国不同麦区的20份小麦秆锈菌分离物基因组DNA中扩增出395 bp的特异性片段,而在小麦条锈菌、小麦叶锈菌和其它麦类病原真菌中未扩增出该特异性片段。病菌侵入寄主30 h后便可检测到特异性DNA片段的存在,灵敏度达到1 ng.μL-1模板DNA浓度水平。【结论】成功研发出小麦秆锈菌的特异性SSR分子标记,为小麦秆锈病早期诊断在生产上的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦秆锈菌 微卫星标记 fiasco 分子检测
下载PDF
巴东木莲核基因组微卫星位点分离的初步研究 被引量:4
18
作者 邢冲 姚小洪 黄宏文 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2010年第1期76-80,共5页
FIASCO是一种高效构建微卫星富集文库的方法。本研究采用FIASCO(fast isolation by AFLP sequences containing repeats)方法成功构建了巴东木莲(Manglietia patungensis)微卫星AC富集文库。我们对AC富集文库中的119个阳性克隆进行测序... FIASCO是一种高效构建微卫星富集文库的方法。本研究采用FIASCO(fast isolation by AFLP sequences containing repeats)方法成功构建了巴东木莲(Manglietia patungensis)微卫星AC富集文库。我们对AC富集文库中的119个阳性克隆进行测序,其中57个含有微卫星序列。设计并合成了其中40对微卫星引物进行PCR扩增检测,有6对引物扩增出目的片段,然而没有位点都呈现多态性。最后对巴东木莲微卫星位点的分离效率低下的原因进行了初步探讨。 展开更多
关键词 巴东木莲 微卫星标记 富集文库 fiasco
下载PDF
一种基于微内核虚拟化的设备驱动优化模型 被引量:4
19
作者 刘震宇 吴俊军 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2011年第12期44-51,共8页
为解决日趋复杂的嵌入式系统的效率和可靠性问题,本文比较并分析了现有的设备驱动模型,针对嵌入式设备对虚拟化的特殊要求,参考L4微内核虚拟化技术,提出了一种新的虚拟设备驱动优化模型,不仅实现了微内核架构中多虚拟机间的驱动共享,并... 为解决日趋复杂的嵌入式系统的效率和可靠性问题,本文比较并分析了现有的设备驱动模型,针对嵌入式设备对虚拟化的特殊要求,参考L4微内核虚拟化技术,提出了一种新的虚拟设备驱动优化模型,不仅实现了微内核架构中多虚拟机间的驱动共享,并且在提供系统可靠性的同时,弥补了虚拟化技术带来的性能开销,提供了一个在效率、功能和可靠性三方面取得相对均衡的虚拟化环境。 展开更多
关键词 嵌入式 虚拟化 微内核 L4 fiasco 设备驱动
下载PDF
磁珠富集法制备莲藕基因组的微卫星分子标记 被引量:7
20
作者 潘磊 郑鹏 +5 位作者 徐杰 全志武 李双梅 刘宏高 柯卫东 丁毅 《中国蔬菜》 北大核心 2007年第B08期7-13,共7页
采用磁珠富集法FIASCO,设计生物素标记的寡核苷酸Biotin-(AG)13作探针,分离莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)的微卫星分子标记,从所获得的阳性克隆中选取42个测序,结果36个克隆(85.0%)含有微卫星序列,其中23个(63.9%)... 采用磁珠富集法FIASCO,设计生物素标记的寡核苷酸Biotin-(AG)13作探针,分离莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)的微卫星分子标记,从所获得的阳性克隆中选取42个测序,结果36个克隆(85.0%)含有微卫星序列,其中23个(63.9%)重复数在10以上,19个(52.8%)为完美型。设计并且合成24对微卫星引物,经筛选其中16对为有效引物(66.7%),能扩增出多态性条带。 展开更多
关键词 莲藕 磁珠富集法 微卫星 基因组
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部