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杜仲法尼烯基焦磷酸合酶基因cDNA全长的克隆与序列分析
被引量:
5
1
作者
杜次
李菁
+2 位作者
彭清忠
汤鹏
田向荣
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2015年第2期100-105,共6页
采用RT-PCR法,从杜仲幼嫩叶片中分离法尼烯基焦磷酸基因c DNA全长序列,克隆并对该基因全长序列进行生物信息学分析。从杜仲嫩叶中共获得两个基因分别命名为Eu FPPs1和Eu FPPs2,测序结果表明两基因开放阅读框分别为1 047 bp和1 029 bp,...
采用RT-PCR法,从杜仲幼嫩叶片中分离法尼烯基焦磷酸基因c DNA全长序列,克隆并对该基因全长序列进行生物信息学分析。从杜仲嫩叶中共获得两个基因分别命名为Eu FPPs1和Eu FPPs2,测序结果表明两基因开放阅读框分别为1 047 bp和1 029 bp,推测分别可以编码348个和342个氨基酸残基,在线预测表明两个蛋白序列均存在两个聚丙烯合酶位点。系统进化分析结果表明,Eu FPPs1和Eu FPPs2分别聚集于不同的分支,它们之间的进化距离为0.352,但是在亲缘关系上均与楤木和人参最近,进化距离分别为0.281、0.287,0.175、0.184。
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关键词
杜仲
fpps
基因克隆
序列分析
生物信息学
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职称材料
题名
杜仲法尼烯基焦磷酸合酶基因cDNA全长的克隆与序列分析
被引量:
5
1
作者
杜次
李菁
彭清忠
汤鹏
田向荣
机构
吉首大学生物资源与环境科学学院
植物资源保护与利用湖南省高校重点实验室
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2015年第2期100-105,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31360062)
植物资源保护与利用湖南省高校重点实验室开放项目(2012jsk002)
文摘
采用RT-PCR法,从杜仲幼嫩叶片中分离法尼烯基焦磷酸基因c DNA全长序列,克隆并对该基因全长序列进行生物信息学分析。从杜仲嫩叶中共获得两个基因分别命名为Eu FPPs1和Eu FPPs2,测序结果表明两基因开放阅读框分别为1 047 bp和1 029 bp,推测分别可以编码348个和342个氨基酸残基,在线预测表明两个蛋白序列均存在两个聚丙烯合酶位点。系统进化分析结果表明,Eu FPPs1和Eu FPPs2分别聚集于不同的分支,它们之间的进化距离为0.352,但是在亲缘关系上均与楤木和人参最近,进化距离分别为0.281、0.287,0.175、0.184。
关键词
杜仲
fpps
基因克隆
序列分析
生物信息学
Keywords
Eucommia ulmoides
farnes yl pyrophosphate ( fpps )
gene cloning
sequence analysis
bioinfor- matics
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杜仲法尼烯基焦磷酸合酶基因cDNA全长的克隆与序列分析
杜次
李菁
彭清忠
汤鹏
田向荣
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2015
5
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