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小麦黄花叶病毒编码VPg蛋白N端结构是VPg与核仁蛋白Fibrillarin互作区域 被引量:1
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作者 边靓 向荣 +1 位作者 孙丽英 陈剑平 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期89-94,共6页
小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)属于马铃薯Y病毒科大麦黄花叶病毒属成员,其基因组是由两条正义单链RNA组成,共编码10个蛋白。其中,VPg(Viral protein genome-linked)作为病毒末端结合蛋白,与病毒基因组RNA 5’端共价... 小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)属于马铃薯Y病毒科大麦黄花叶病毒属成员,其基因组是由两条正义单链RNA组成,共编码10个蛋白。其中,VPg(Viral protein genome-linked)作为病毒末端结合蛋白,与病毒基因组RNA 5’端共价连接。利用软件分析WYMV VPg蛋白氨基酸序列发现其N端具有核定位信号(NLS)序列,C端具有核输出信号(NES)序列。通过激光共聚焦显微镜观察VPg与GFP融合蛋白在烟草细胞中的表达情况发现,GFP-VPg主要定位于细胞核中。利用eYFP(n)标记核仁结构蛋白Fibrillarin与VPg进行双分子荧光互补实验发现,VPg与Fibrillarin互作且定位于细胞核中。根据VPg结构特点构建一系列缺失突变体与Fibrillarin的互作实验验证了它们之间的互作区域发生在N端NLS区域。 展开更多
关键词 小麦黄花叶病毒 VPg蛋白 细胞核定位 fibrillarin蛋白 蛋白质互作
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猪流行性腹泻病毒N蛋白与Vero E6核仁蛋白Fibrillarin的亚细胞定位分析 被引量:2
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作者 石达 陈建飞 +2 位作者 时洪艳 张志榜 冯力 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期833-836,共4页
为鉴定猪流行性腹泻病毒(PEDV)核衣壳蛋白(N)与Vero E6细胞核仁fibrillarin蛋白的亚细胞定位的特征。本实验参照GenBank中人细胞fibrillarin基因(M59849.1)序列,设计并合成特异性引物,利用RT-PCR方法扩增了Vero E6细胞的fibrillarin基因... 为鉴定猪流行性腹泻病毒(PEDV)核衣壳蛋白(N)与Vero E6细胞核仁fibrillarin蛋白的亚细胞定位的特征。本实验参照GenBank中人细胞fibrillarin基因(M59849.1)序列,设计并合成特异性引物,利用RT-PCR方法扩增了Vero E6细胞的fibrillarin基因,并将其克隆于真核表达载体pDsRed2-N1中,构建重组质粒pDsRed-Fib。将pDsRed-Fib与本实验室构建的含有PEDV N基因的重组质粒pAcGFP-N,共转染Vero E6细胞。Western blot结果表明fibrillarin及N融合蛋白在转染的Vero E6细胞中均获得表达;利用共聚焦显微镜观察显示在共转染VeroE6细胞中PEDV N蛋白与Vero E6细胞核仁中的fibrillarin发生共定位。该结果为进一步研究PEDV和核仁蛋白相互作用奠定基础。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 核衣壳蛋白 纤维蛋白 共定位
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拟南芥中Fibrillarin基因的克隆·表达·纯化及与ak6蛋白相互作用研究
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作者 李然 田兆丰 张飞云 《安徽农业科学》 CAS 2014年第1期20-23,共4页
[目的]研究拟南芥中Fibdllarin基因的克隆、表达及纯化,并探索其与ak6蛋白的相互作用。[方法]利用pGEX-6P-1与Fibrilla—r流基因构建重组表达质粒,将重组质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)中进行诱导表达,运用同样方法构建PET-28a—ak6... [目的]研究拟南芥中Fibdllarin基因的克隆、表达及纯化,并探索其与ak6蛋白的相互作用。[方法]利用pGEX-6P-1与Fibrilla—r流基因构建重组表达质粒,将重组质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)中进行诱导表达,运用同样方法构建PET-28a—ak6原核表达质粒,获得His—ak6融合蛋白,并运用体外pulldown技术验证二者的相互作用。f结果l在温度为37℃、诱导时间为16~20h、IPTG浓度为0.5mmol/L时,fibrillarin蛋白的纯化浓度最高。试验成功获得了符合标准的RNA,并获得了与预期片段大小相符的清晰的目的条带;pull—down试验结果表明,拟南芥中fibrillarin蛋白与ak6蛋白具有相互作用。[结论]拟南芥ak6突变体植株可能由于ak6的缺失影响了rRNA前体的加工,从而抑制核糖体的合成,进而阻碍拟南芥茎的生长,使植株表现明显的矮小症状。 展开更多
关键词 拟南芥 fibrillarin蛋白 ak6
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Vero细胞nucleolin和fibrillarin基因的克隆及序列分析
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作者 石达 陈建飞 +7 位作者 时红艳 王洪峰 张鑫 刘孝珍 张莎 刘随心 王璐 冯力 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期830-832,共3页
为克隆及分析Vero细胞的nucleolin和fibrillarin基因,本研究根据人类的相关基因设计两对引物,从Vero E6细胞中扩增nucleolin和fibrillarin基因。测序结果显示nucleolin基因序列长度为2 139 bp,编码712个氨基酸;fibrillarin基因序列长度... 为克隆及分析Vero细胞的nucleolin和fibrillarin基因,本研究根据人类的相关基因设计两对引物,从Vero E6细胞中扩增nucleolin和fibrillarin基因。测序结果显示nucleolin基因序列长度为2 139 bp,编码712个氨基酸;fibrillarin基因序列长度为969 bp,编码322个氨基酸。与GenBank中登录的人类相应序列相似性高达97%,处于同一进化分支,表明该基因具有种属特异性并且保守性很高;同时利用软件对nucleolin和fibrillarin预测蛋白进行了生物信息学分析,从而为研究冠状病毒核蛋白与核仁蛋白相互作用奠定了基础。 展开更多
关键词 核仁素 纤维蛋白 克隆 序列分析
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fibrillarin在有丝分裂过程中分布于纺锤体两极
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作者 郭焱 魏朝亮 +2 位作者 胡劲松 丁明孝 陈建国 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第18期1403-1407,T003,T004,共7页
fibrillarin是核仁的一个主要蛋白成分,细胞分裂时它要经历从核仁到细胞质的重新分布过程,并且与细胞分裂后核仁的重新组装有着密切的关系.为了研究有丝分裂过程中fibrillarin的动态变化及与其他细胞结构的关系,构建了fibrillarin的真... fibrillarin是核仁的一个主要蛋白成分,细胞分裂时它要经历从核仁到细胞质的重新分布过程,并且与细胞分裂后核仁的重新组装有着密切的关系.为了研究有丝分裂过程中fibrillarin的动态变化及与其他细胞结构的关系,构建了fibrillarin的真核表达载体,采用cDNA转染、免疫荧光标记和免疫共沉淀等方法证明了处于分裂期的HeLa细胞中fibrillarin不但分布于细胞质,而且还有一部分定位于纺锤体两极的中心体部位,并且与NuMA蛋白共定位.当使用药物将分裂期细胞的微管结构解聚后,fibrillarin在两极聚集的现象消失,而后随着纺锤体的重新组装,fibrillarin又在两极重新出现.体外非细胞体系的实验也证明了fibrillarin和分裂期细胞中微管中心体结构结合在一起. 展开更多
关键词 有丝分裂过程 纺锤体 中心体 NuMA蛋白 磷酸化 真核细胞 核仁 细胞分裂 两极聚集现象 fibrillarin
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核仁骨架(核仁基质)的结构与成分——肌动蛋白与fibrillarin是核仁骨架的主要成分
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作者 陈建明 沈延 +1 位作者 焦仁杰 翟中和 《中国科学(C辑)》 CSCD 1998年第5期385-392,共8页
将分离纯化的HeLa细胞核仁经非离子去垢剂、核酸酶、低盐及高盐选择性抽提结合DGD包埋去包埋技术 ,在电镜下显示了HeLa细胞的核仁骨架呈精细网络结构 .BHK 2 1细胞及小鼠肝细胞的核仁骨架与HeLa细胞的核仁骨架结构相类似 .对HeLa细胞的... 将分离纯化的HeLa细胞核仁经非离子去垢剂、核酸酶、低盐及高盐选择性抽提结合DGD包埋去包埋技术 ,在电镜下显示了HeLa细胞的核仁骨架呈精细网络结构 .BHK 2 1细胞及小鼠肝细胞的核仁骨架与HeLa细胞的核仁骨架结构相类似 .对HeLa细胞的核仁骨架的蛋白成分进行了分析 .结果表明核仁骨架蛋白组成与核基质及染色体骨架有明显差异 .HeLa细胞核仁骨架的蛋白成分主要包括分子量为48,43,36及 33ku左右的 6~ 7种多肽 .证明分子量为 43ku的肌动蛋白与 展开更多
关键词 核仁骨架 肌动蛋白 fibrillarin 形态结构
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AGPAT5在肝癌中的功能与机制研究
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作者 陈奕君 刘雨航 +1 位作者 段海波 王雄军 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期838-847,共10页
背景与目的:肿瘤的发生、发展过程中会发生代谢重编程,1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶(1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase,AGPAT)作为三酰甘油(triacylglycerol,TAG)从头合成的关键酶,与肿瘤的进展密切相关。但目前作为亚... 背景与目的:肿瘤的发生、发展过程中会发生代谢重编程,1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶(1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase,AGPAT)作为三酰甘油(triacylglycerol,TAG)从头合成的关键酶,与肿瘤的进展密切相关。但目前作为亚型之一的AGPAT5在癌症中的研究还十分有限,本研究深入剖析AGPAT5在肝癌发生、发展中发挥的作用及潜在的分子机制,旨在为肝癌诊断和治疗策略提供新思路。方法:利用慢病毒感染将多种肝癌细胞系中的AGPAT5敲减,并通过锥虫蓝计数、划痕、transwell及平板克隆等实验在体外检测AGPAT5对肝癌细胞增殖、迁移及抗失巢凋亡能力的影响。通过回复野生型或酶活性缺失型的AGPAT5,探究其作为代谢酶是否发挥经典代谢作用调控肝癌细胞迁移。构建BALB/c裸鼠尾静脉注射移植瘤模型,从体内层面验证体外的细胞表型。采用免疫沉淀质谱联用(immunoprecipitation mass spectrum,IP-MS)鉴定出与AGPAT5相互作用的蛋白,并进行免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,coIP)验证。蛋白质翻译后通过修饰鉴定分析AGPAT5潜在的修饰位点,通过体外实验探究点突变前后对肝癌细胞迁移的影响。通过coIP探究该位点突变前后AGPAT5与相互作用蛋白结合的情况。通过敲低相互作用蛋白确定其在细胞表型中的作用。通过回复实验验证AGPAT5是否通过相互作用蛋白发挥作用。检测野生型肝癌细胞系中的AGPAT5和相互作用蛋白的表达水平,检验两者之间是否具有相关性。结果:肝癌细胞敲减AGPAT5后会更加耐受无血清饥饿,并促进细胞迁移,但不会影响细胞增殖和失巢凋亡。而酶活性缺失并不影响AGPAT5对肝癌细胞迁移的抑制。敲减AGPAT5可促进肝癌细胞在裸鼠体内的肺转移和肝转移。AGPAT5可以与原纤维蛋白(fibrillarin,FBL)相互作用,并在无血清饥饿刺激下加强两者的结合。遏制FBL的表达会抑制肝癌细胞迁移,且效果与过表达AGPAT5相似。抑制FBL的表达可削弱敲低AGPAT5对肝癌细胞迁移的促进作用。在已检测的肝癌细胞系中,AGPAT5和FBL在蛋白水平上并不存在相关性。K201位点突变使AGPAT5对肝癌细胞迁移的抑制作用减弱,并使AGPAT5与FBL的结合减弱。结论:敲低AGPAT5能够显著提高肝癌细胞迁移能力。AGPAT5可以与FBL相互作用,在无血清饥饿刺激下,AGPAT5或通过K201位点的乙酰化加强与FBL的结合,从而更有效地遏制FBL,进而抑制肝癌细胞迁移。但这种抑制作用并非来自AGPAT5的代谢酶活性,而是由非代谢作用所驱动。 展开更多
关键词 1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶5 肝癌转移 原纤维蛋白 K201位点乙酰化 非代谢作用
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Fibrillarin redistributes to the spindle poles and partially colocalizes with NuMA during mitosis
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作者 Yan Guo Chaoliang Wei +2 位作者 Jinsong Hu Mingxiao Ding Jianguo Chen 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2002年第23期1995-1998,2027-2028,共6页
Fibrillann, a major protein in the nucleolus. is known to redistribute during mitosis from the nucleolus to the cytosol, and is related to the dynamics of post-mitotic reassembly of the nucleolus. To better understand... Fibrillann, a major protein in the nucleolus. is known to redistribute during mitosis from the nucleolus to the cytosol, and is related to the dynamics of post-mitotic reassembly of the nucleolus. To better understand the dynamic behavior and the relationship with other cytoplasmic structures, we have now expressed fibrillarin-pDsRedl fusion protein in HeLa cells. The results showed that a part of fibrillarin was associated with mitotic spindle poles in the mitotic cells. Nocodazole-induced microtubule depolymeri-zation resulted in fibrillarin redistribution throughout the cytoplasm, and removal of nocodazole resulted in relocaliza-tion of fibrillarin at the polar region during the mitotic spindles reassembly. In a mitotic cell free system, fibrillarin was found in the center of taxol-induced microtubule asters. Moreover, fibrillarin was found to colocalize with the nuclear mitotic apparatus protein (NuMA) at the poles of mitotic cells. Therefore, it is postulated that the polar redistribution of 展开更多
关键词 fibrillarin MITOTIC spindle POLES CENTROSOME NuMA.
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Composition and structure of nucleolar skeleton (nucleolar matrix)——Actin and fibrillarin are two main protein components of nucleolar skeleton
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作者 陈建明 沈延 +1 位作者 焦仁杰 翟中和 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 1999年第1期34-42,共9页
Purified nucleoli of HeLa cells were treated sequentially with nonionic detergent, nucleic acid enzyme, low salt and high salt. The residual nucleolar structure termed nucleolar skeleton (nucleolar matrix) was shown a... Purified nucleoli of HeLa cells were treated sequentially with nonionic detergent, nucleic acid enzyme, low salt and high salt. The residual nucleolar structure termed nucleolar skeleton (nucleolar matrix) was shown as a fine network under electron microscope with DGD embedding-unembedding technique. Such structures of BHK-21 cell and mouse liver cell are similar to that of HeLa cell. The protein composition of the nucleolar skeleton of HeLa cells was analyzed. The protein composition of such nucleolar residual shows obvious difference from the compositions of nuclear matrix and chromosome scaffold. The major protein composition of the nucleolar skeleton of HeLa cells contains 6-7 polypeptides. Their molecular weights are about 48, 43, 36 and 33 ku. Further studies show that actin and fib-rillarin are two major protein components of nucleolar skeleton of HeLa cells. 展开更多
关键词 NUCLEOLAR SKELETON (nucleolar matrix) protein COMPOSITION ACTIN fibrillarin.
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利用邻近生物素标记技术结合质谱分析鉴定核仁相关蛋白 被引量:1
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作者 臧春燕 姚礼萍 +1 位作者 邢鸣 张军 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1750-1755,共6页
目的:在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)中,基于抗坏血酸过氧化物酶(engineered ascorbate peroxidase,APEX2)的邻近标记技术和质谱鉴定核仁相关蛋白。方法:构建稳定过表达APEX2-FBL细胞系,通过APEX2邻近标记技术获得... 目的:在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)中,基于抗坏血酸过氧化物酶(engineered ascorbate peroxidase,APEX2)的邻近标记技术和质谱鉴定核仁相关蛋白。方法:构建稳定过表达APEX2-FBL细胞系,通过APEX2邻近标记技术获得生物素标记蛋白,用链酶亲和素包裹的磁珠对生物素标记的蛋白进行富集,随后运用液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)鉴定,并对数据进行生物信息学分析,筛选差异蛋白。结果:成功构建稳定高表达APEX2-FBL细胞系;Western blot结果显示,通过APEX2邻近标记技术获得大量生物素标记蛋白;质谱鉴定出837个差异蛋白,且生物学过程多与核仁相关。结论:利用邻近生物素标记技术结合质谱分析是一种可行的鉴定核仁相关蛋白的方法。 展开更多
关键词 邻近生物素标记 核仁蛋白 核仁纤维蛋白
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PHF8 is a histone H3K9me2 demethylase regulating rRNA synthesis 被引量:7
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作者 Ziqi Zhu Yanru Wang +11 位作者 Xia Li Yiqin Wang Longyong Xu Xiang Wang Tianliang Sun Xiaobin Dong Lulu Chen Hailei Mao Yi Yu Jingsong Li Pin Adele Chen Charlie Degui Chen 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2010年第7期794-801,共8页
Dimethylation of histone H3 lysine 9 (H3K9me2) is an important epigenetic mark associated with transcription repression. Here, we identified PHF8, a JmjC-domain-containing protein, as a histone demethylase specific ... Dimethylation of histone H3 lysine 9 (H3K9me2) is an important epigenetic mark associated with transcription repression. Here, we identified PHF8, a JmjC-domain-containing protein, as a histone demethylase specific for this repressing mark. Recombinant full-length wild type protein could remove methylation from H3K9me2, but mutation of a conserved histidine to alanine H247A abolished the demethylase activity. Overexpressed exogenous PHF8 was colocalized with B23 staining. Endogenous PHF8 was also colocalized with B23 and fibrillarin, two well-established nucleolus proteins, suggesting that PHF8 is localized in the nucleolus and may regulate rRNA transcription. Indeed, PHF8 bound to the promoter region of the rDNA gene. Knockdown of PHF8 reduced the expression of rRNA, and overexpression of the gene resulted in upregulation of rRNA transcript. Concomitantly, H3K9me2 level was elevated in the promoter region of the rDNA gene in PHF8 knockdown cells and reduced significantly when the wild type but not the catalytically inactive H247A mutant PHF8 was overexpressed. Thus, our study identified a histone demethylase for H3K9me2 that regulates rRNA transcription. 展开更多
关键词 PHFS histone demethylase H3K9me2 rRNA synthesis
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一个可指示核仁定位和柯浩体定位信号Marker的构建 被引量:1
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作者 郑璐平 毛倩卓 +3 位作者 林辰 谢荔岩 吴祖建 谢联辉 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1002-1007,共6页
通过RT-PCR获得本氏烟纤维蛋白Fibrillarin2的cDNA,并将其重组到表达载体pEarley101(黄色荧光蛋白,YFP)和pEarley102(青色荧光蛋白,CFP)上。在本氏烟叶片表皮细胞中瞬时表达融合蛋白,激光共聚焦显微镜下观察,发现蛋白定位在细胞核仁和... 通过RT-PCR获得本氏烟纤维蛋白Fibrillarin2的cDNA,并将其重组到表达载体pEarley101(黄色荧光蛋白,YFP)和pEarley102(青色荧光蛋白,CFP)上。在本氏烟叶片表皮细胞中瞬时表达融合蛋白,激光共聚焦显微镜下观察,发现蛋白定位在细胞核仁和柯浩体上,可以作为这两种细胞器的指示Marker,并通过Western blot检测融合蛋白的表达。该Marker对明确蛋白特别是病毒编码的蛋白在细胞核中的定位以及功能推测具有重要意义。 展开更多
关键词 细胞定位 纤维蛋白 核仁 柯浩体
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纤维蛋白基因对大鼠早期胚胎发育的影响
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作者 何金英 任宇 +2 位作者 刘慧 黄翔华 马玉珍 《中国计划生育和妇产科》 2019年第11期81-84,I0002,共5页
目的研究纤维蛋白(fibrillarin,FBL)基因对大鼠早期胚胎发育的影响。方法选取健康、性成熟的大鼠30只,按照1:1的比例将雌鼠放置于雄鼠笼子里,同笼交配。采集大鼠胚胎,构建FBL上调、下调慢病毒载体,免疫荧光技术检测FBL在胚胎细胞中的表... 目的研究纤维蛋白(fibrillarin,FBL)基因对大鼠早期胚胎发育的影响。方法选取健康、性成熟的大鼠30只,按照1:1的比例将雌鼠放置于雄鼠笼子里,同笼交配。采集大鼠胚胎,构建FBL上调、下调慢病毒载体,免疫荧光技术检测FBL在胚胎细胞中的表达,使用荧光定量RT-PCR技术检测FBL mRNA、Oct 4、Sox 2、FGF 4表达量,并作组间比较。结果 FBL在卵裂期胚胎中特异性染色不明显,而在囊胚中可被检测到有表达。上调组大鼠囊胚期FBL mRNA表达量、FBL表达量高于对照组,8-细胞阶段卵裂率、囊胚孵化率、Oct 4、Sox 2、FGF 4表达量低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);下调组大鼠囊胚期FBL mRNA表达量、FBL表达量低于对照组,8-细胞阶段卵裂率、囊胚孵化率、Oct 4、Sox 2、FGF 4表达量高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);下调组大鼠囊胚期FBL mRNA表达量、FBL表达量低于上调组,8-细胞阶段卵裂率、囊胚孵化率、Oct 4、Sox 2、FGF 4表达量高于上调组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论下调FBL基因通过促进Oct 4、Sox 2的结合,调控FGF 4基因的表达,最终促进早期胚胎的分化。 展开更多
关键词 fibrillarin基因 早期胚胎发育 囊胚
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