轻型颅脑损伤的Fisher确切概率法分析

目的分析轻型颅脑损伤的临床症状、影像诊断及转归。方法 2006年8月—2008年8月期间我院收治的224例格拉斯哥昏迷评分(GCS)13～15分患者,排除年龄<16岁、饮酒及患有精神性疾病病例。观察项目为GCS、呕吐、健忘症、CT、MRI影像所见。转归评价:(1)有无神经症状后遗症;(2)有无癫痫发作;(3)采用Awareness Questionnaire,评估受伤前后日常生活有无变化。利用Fisher确切概率法进行分析。结果 GCS13分的51例中,42例CT有脑挫裂伤表现,3例CT无脑挫裂伤表现,但MRI为脑挫裂伤表现,6例CT及MRI均无脑挫裂伤表现;51例中有33例存在神经后遗症。脑挫裂伤与神经后遗症经Fisher确切概率法χ2检验,χ2值为7.85,P<0.01。在173例GCS 14分以上的病例中有32例存在脑挫裂伤(18%),其中24例(75%)脑挫裂伤诊断需要MRI;GCS 14分以上脑挫裂伤病例中,GCS14分、呕吐、健忘症与脑挫裂伤有显著关系,χ2值为45.78,P<0.01;GCS 14分以上脑挫裂伤病例中,神经后遗症少见,脑挫裂伤与受伤前后日常生活变化无明确关系,χ2值为2.69,P>0.05。平均随访20个月,癫痫发作2例。结论 (1)轻型颅脑损伤中,GCS13分病例残留神经后遗症的危险因素为脑挫裂伤。(2)GCS14分以上病例脑挫裂伤诊断需要MRI。(3)GCS14分以上病例,GCS14分、呕吐、健忘症是诊断脑挫裂伤的危险因素。(4)GCS14分以上病例,脑挫裂伤的存在不是影响转归的影响因素。(5)轻型颅脑损伤,脑挫裂伤的存在不是癫痫发作的危险因素。

基于MPI的精确非参数检验之Fisher网络算法的并行算法研究

非参数检验是样本为非正态分布或未知分布情况下进行的假设检验,适应性强,稳定性好,在医学、工程、金融等各种统计场合都有广泛应用.精确非参数检验提高了计算的精度,但是直接计算精确很费时间.文中针对精确非参数检验主要使用的Fisher网络算法,基于MPI提出并行算法并予以实现.实验结果表明并行效率良好,能够大大加快计算的速度.

植物种间联结研究内容与方法评述

植物种间联结是植物群落重要的数量和结构特征之一,是植物群落结构形成和演化的基础。研究种间联结,对于植物群落的稳定与演替、植被的恢复与重建等具有重要的理论意义和应用价值。为了便于探讨种间联结的形成机制,本文评述了种间联结的研究内容、计算方法及其影响因素,同时指出了现研究存在的问题及今后的研究方向。植物种间联结受多方面因素影响,既有人为取样尺度的影响,又有环境与生物自身的因素。在群落演替的不同阶段,种间联结性往往有所不同。为此,可采用多尺度排序法分析不同尺度格局上复杂的种间联结关系,重点加强植物"利他作用"及入侵种种间联结的研究。在Fisher精确检验的基础上,结合Pearson相关系数和Spearman秩相关系数来检验种对间的相关性,并利用生态位理论或从植物生理、分子遗传的角度研究密度主导的种间联结的变化,可以准确揭示植物种间的内在关联性。

山西黄河湿地植被优势种群种间关系

在样方调查的基础上,应用2×2列联表的Fisher精确检验、Pearson相关系数和Spearman秩相关系数检验了山西黄河湿地植被优势种群的种间关系,分别测定了24个优势种,共73个种对的种间关联。结果表明:(1)2×2列联表的精确检验共有33个种对为正关联,4个种对为负关联;Pearson相关系数有16个种对呈正相关,没有种对出现负关联;Spearman秩相关系数有40个种对呈正相关,4个种对为负关联。(2)2×2列联表的精确检验不能精确反映种对间的数量变化关系,只能反映种对间关联与否;应用Pearson相关系数和Sperman秩相关检验可帮助刻划种对间的数量变化关系。(3)依Spearman秩相关系数的半矩阵图将24个优势种分为旱生、中生、湿生、水生4个生态种组,各生态种组内的种对具有相同的资源利用方式和生态要求。

山西翅果油树群落种间关系的数量分析

应用 2× 2列联表的 Fisher精确检验、Pearson相关系数和 Spearm an秩相关系数检验研究了山西翅果油树群落的种间关系 ,分别测定了 42种植物 ,共 86 1个种对的种间关联 (或相关 )。结果表明 :1) 2× 2列联表的精确检验共有 2 8个种对为正关联 ,14个种对为负关联 (p <0 .0 5或 p<0 .0 1,下同 ) ;Peaorson相关系数有 5 6个种对为正相关 ,14个种对为负相关 ;Spearman秩相关系数有 96个种对呈正相关 ,46个种对呈负相关。 2 ) 2× 2列联表的Fisher精确检验不能反映两个种对间的数量变化关系 ,应用 Pearson相关系数和 Spearman秩相关检验来刻划种对间的数量变化关系 ;与 Pearson相关系数检验相比 ,Spearman秩相关系数检验具有较高的灵敏度。 3)种对间的正关联和正相关 ,主要是由于它们具有相近的生物学特性 ,对生境具有相似的生态适应性和相互分离的生态位所致 ;而种对间的负关联和负相关 ,则主要是由于它们具有不同的生物学特性 ,对生境具有不同的生态适应性和相互重叠的生态位所致。

秦岭太白红杉群落种间关系的数量分析

应用2×2列联表的Fisher精确检验,研究了太白红杉群落中44种植物 共946个种对 的种间关系.结果有33个种对正关联,12个种对负关联 P<0.05或P<0.01 .另外,用Pearson积矩相关系数和Spearman秩相关系数检验刻划了种对间的数量变化关系.Pearson相关系数显示有31个种对呈显著正协变,5个种对呈显著负协变;Spearman秩相关系数显示有30个种对呈显著正协变,5个种对呈显著负协变,并分别计算出了其相关系数.研究结果表明,太白红杉群落种间关系较为简单,但草本层物种间连接相对较为复杂,灌木层次之.乔木层中,太白红杉和巴山冷杉呈显著的负协变效应.

汾河连伯滩湿地植被生态种组

根据42个野外样方调查资料,采用Fisher精确检验、Pearson相关系数和Spearman秩相关系数,研究汾河连伯滩湿地21个优势种的种间关系,结合组平均法的聚类结果,对生态种组进行了划分。结果表明:1)在210个种对中,Fisher精确检验结果表明共有16个种对为正关联,1个种对为负关联;Pearson相关系数有20个种对为正相关,5个种对为负相关;Spearman秩相关系数有34个种对为正相关,7个种对为负相关;2)在所有的种对中,大多数种对间表现为不显著关联,种间不显著相关,说明优势种群间生态位相对分离;3)综合种间关联、种间相关和聚类分析结果,将21个优势种划分成4个生态种组,分别是芦苇生态种组、赖草生态种组、白茅生态种组和野艾蒿生态种组,这4个生态种组反映了随水分条件变化连伯滩湿地植被群落的组成特征。

塔克尔莫乎尔沙漠银沙槐群落主要植物的种间关系

根据野外调查的样地数据资料,运用2×2列联表的Fisher精确检验、Pearson相关系数和Spearman秩相关系数检验,并结合DCA排序,分析塔克尔莫乎尔沙漠银沙槐群落主要植物种群之间的种间关系。结果表明:Fisher精确检验有3个种对呈显著正关联,3个种对呈显著负关联;Pearson相关系数检验有1个种对呈显著正相关,12个种对呈显著负相关;Spearman秩相关系数检验,有14个种对存在显著相关,其中负相关13对,占所有种对数的14.29%,正相关1对,占所有种对数的1.1%。银沙槐群落种间关系相对松散,反映出植物群落随着环境变化其物种组成也发生相应变化,正向着相对稳定独立的无关联方向发展。

塔里木河中下游地区荒漠河岸林群落种间关系分析

采用 2× 2列联表 ,应用Fisher精确检验法研究了新疆塔里木河中下游荒漠河岸林群落种间关系 ,测定了16种植物、共 12 0个种对的种间联结性。研究结果表明 :1) 12 0个种对中有 17个种对分别在不同的样方尺度中表现出显著或极显著的种间联结 ,约占总数的 14 .2 % ;其中 13个种对为正关联 ,4个种对为负关联 ;2 )不同取样面积对种间联结性分析的有效性有影响 ,不同种对表现出种间联结的最小样方尺度不同 ;3)随着样方面积的增大 ,各种对自有不同的种间联结变化规律 ,可归纳为 4种类型 ;4 ) 17个具种间联结的种对以灌木_草本和草本_草本的种对居多 ,占总数的 76 .5 % ;主要乔木树种胡杨 (Populuseuphratica)与灌木之间、灌木和灌木之间趋向独立分布。

构建分子标记连锁图谱的一种新方法:三点自交法

作者从数学上导出了基因作图的三点自交方法。这一方法同三点测交法一样能提供各种作图信息，但不需要选育三隐性纯合基因亲本或品系，因而能大大提高作图功效。从理论上证明，该方法也适合于小群体作图分子标记连锁图谱。同时用Ｒｓｈｅｒ单一观察信息（即Ｆ信息）量证明，三点自交法是一种有效的作图方法。应用 ＭＡＰＭＡＫＥＲ程序中所提供的老鼠 Ｆ２群体中３３３个个体的１２个ＲＦＬＰ标记位点中前６个位点的数据对三点自交法的作图功能进行了检测。结果表明，三点自交法在位点间的连锁关系检测，连锁群中位点的排序和图距计算具有与ＭＡＰＭＡＫＥＲ程序一样的功能，而且还提供了位点间的交叉干涉和位点的相引或相斥构型等信息以及紧密位点间发生负干涉作用的证据。

两种基因集分析方法的有效性比较

目的比较竞争性原假设χ2-Fisher’s精确概率法和自限性原假设SAM-GS方法作为基因集分析方法筛选富集基因集的效能,探讨两种方法的筛选效果。方法采用两种待比较的方法处理5种不同情景下的模拟数据,比较筛选结果与模拟设定的差异,计算相应的评价指标,探讨两种方法筛选富集基因集的效果。结果相同设定条件下,SAM-GS方法的筛选率均高于χ2-Fisher’s精确概率法。但推断结论相差不大,即当两组间均数相差较小(≤0.30)时,两种方法均不能较好地识别组间差异;相反,当两组均数差异足够大(>0.30)时,两种方法均能识别差异。结论SAM-GS方法略优于χ2-Fisher’s精确概率法,但两种方法均可用于基因表达谱筛选富集基因集的分析。χ2-Fisher’s精确概率法的优点是可用来分析解释变量为多分类变量的数据资料。

医学研究论文中常见统计学错误分析(6) 定性资料统计分析错误辨析与释疑

通过揭示大量的生物医学科研中出现的定性资料统计分析方面的错误案例,说明重视识别定性资料列联表的类型、检查前提条件和考虑统计分析目的,对于合理选用定性资料统计分析方法是至关重要的。

统计机器翻译中翻译模型的约简概述

统计机器翻译从诞生至今获得了长足的发展，目前已经成为机器翻译的主流。但是作为基础模块之一的翻译模型却随训练语料的增大而呈现飞速增大的趋势。为了使统计机器翻译更加实用，翻译模型的约简一直是研究热点之一。概述了统计机器翻译中翻译模型约简的研究现状，相关方法主要围绕解码过程统计分析、训练语料中的统计分析、翻译模型中的短语对自身特点分析等三个类别。结合相关分析，最后也探讨了这个方向的未来发展趋势。

探讨解决四格表确切概率计算出现大数溢出错误的方法

目的:解决Fisher确切概率计算中大数溢出的问题。方法:尝试使用Perl语言编写计算程序。结果:编写的程序运行结果正确,没有出现溢出问题。结论:通过Perl程序可以较好地实现四格表确切概率计算。

基于测试性增长的指标动态评估方法

针对现有测试性指标评估方法未能考虑装备研制阶段不同层次结构测试性水平动态增长的特性,导致测试性评估置信度不高的问题,提出一种测试性增长条件下基于层次Bayes网络模型的测试性指标动态评估方法。根据装备结构特征建立测试性指标动态评估的层次Bayes网络模型,并以测试性指标作为网络传递参数;考虑延缓纠正的测试性增长试验策略,给定测试性阶段序化增长约束条件,针对不同层次节点各阶段增长试验数据,采用单边Fisher精确检验法对测试性增长趋势进行检验,并基于检验结果确定增长阶段数;提出利用最大熵模型和改进Gompertz模型的先验参数估计方法,结合Bayes定理以及研制阶段各层次节点先验信息确定节点先验分布;进一步基于层次Bayes网络融合推理算法确定顶层节点测试性指标的后验分布,实现对装备测试性指标的动态评估,并通过案例进行验证。结果表明,该方法相较于直接运用Beta分布,具备更为准确合理的指标评估结论。

云顶山草本植物功能群研究

植物功能群是植被生态学研究的重要领域之一。通过对植物功能群的研究有助于揭示植物群落的结构和功能,了解植物群落的物种多样性、功能多样性、谱系多样性和演替规律,同时,可为植被恢复和重建提供科学依据。根据野外样方的调查资料,采用Fisher精确检验和Spearman秩相关系数检验,并结合聚类分析对山西云顶山自然保护区草本植物优势种的植物功能群进行了研究。结果表明:1)Fisher's精确检验结果表明,有46个种对正关联极显著(P<0.01),有5个种对负关联极显著(P<0.01);有24种对正关联显著(P<0.05),有10个种对负关联显著(P<0.05);有996个种对关联不显著(P>0.05)。2)Spearman秩相关系数检验有72个种对正相关极显著(P<0.01),有9个种对负相关极显著(P<0.01);有33种对正关联显著(P<0.05),有8个种对负关联显著(P<0.05);有959个种对相关不显著(P>0.05)。3)经Fisher精确检验关联不显著(P>0.05)的种对(996)占总种对的92.14%,而经Spearman秩相关系数检验相关不显著(P>0.05)的种对(959)占总种对的88.71%,这意味着草本植物优势种间的生态位存在较为明显的分化。4)综合Fisher精确检验和Spearman秩相关系和聚类分析的结果,将云顶山自然保护区草本植物划分为5个功能群:亚高山草甸植物功能群、中山草丛植物功能群、低山草丛植物功能群、森林和灌丛植物功能群和森林植物功能群。云顶山植物功能群与植物群落类型、生境、植物生活型和生态位等有密切关系。

SuperLLEC:全新的链读和长读测序组装纠错算法

为了解决第三代测序数据较高的错误率和提高基因组组装精度,基于10X Genomics链读测序数据设计了一种针对PacBio长读数据的组装和纠错算法SuperLLEC。该算法使用Wtdbg2算法将PacBio长读测序数据拼接成支架序列,运用Bowtie2比对工具将链读序列比对到支架序列,并根据链读条码进一步组装支架序列;对不匹配的比对位点采用Fisher精确检验预测该位点为单核酸多态性或是PacBio测序错误的碱基。通过三组人类细胞的长读数据和链读数据的算法比较实验,证明该方法能够较明显地提高基因组组装的准确度、NG50长度和单核酸多态性位点预测精度。

基于会话语料库的日语性别角色语言自动提取方法论

本文对基于语料库挖掘的日语性别角色语言提取方法加以概述。该方法首先从日语口语语料库中抽取异性会话的文本,其次统计在异性的会话参与者中各种词汇的使用频度,最后引入特征选择方法之一的fisher精确检验的思想来抽取异性的会话中使用差异性较大的词汇。本研究将这种方法应用于日语自然会话语料库来提取性别角色语言。本研究的结果表明,除了已经被广泛接受的人称代词和终助词以外,日语中的「うん/(嗯)」「ええ/(嗯)」「ああ/(啊)」「ねー/ねえ/(表示确认)」「なあ/(啊)」「さ/(吧)」「よー/(哟)」「どー/(怎样)」「という/(表示说话,思考的内容)」等词汇可以被视为日语的性别角色语言。

颈部血管破裂伤及其人体损伤程度鉴定256例分析

目的探讨依据《人体损伤程度鉴定标准》进行颈部血管破裂伤伤情鉴定时的条款适用。方法收集本鉴定中心于1986—2020年期间受理的256例涉及颈部血管破裂的伤情鉴定案例(219例行法医病理解剖,37例行法医临床检验),解剖案例采用SPSS22.0软件进行统计学分析,验伤案例则严格依据《人体损伤程度鉴定标准》重新确定条款适用。结果颈部血管破裂致死类型及其破裂部位(单、双侧)、破裂程度(完全或部分)的差异具有统计学意义,静脉破裂与动脉破裂之间的差异具有统计学意义,而性别、年龄的差异则无统计学意义。结论综合临床救治、案例实证、应用实践分析,建议颈内动脉、颈内静脉破裂评定为重伤二级,颈外动脉破裂评定为轻伤一级,颈外静脉、椎动脉破裂评定为轻伤二级。

Enrich＿analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。