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Optimization of Multiplex PCR Systems for Gene-chip Detection of Mutations in Exons in cTnI Gene Associated with FHCM
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作者 Nongyue He Yuanying Zhang Jinan Zhang 《稀有金属材料与工程》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第A03期270-273,共4页
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is one of the diseases damaging people health most badly and some mutations of exons in cardiac troponin I (cTnI) gene are closely associated with family hypertrophic cardiomyopathy (... Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is one of the diseases damaging people health most badly and some mutations of exons in cardiac troponin I (cTnI) gene are closely associated with family hypertrophic cardiomyopathy (FHCM).A microarray was fabricated to screen mutations in exons 3,5,7,and 8 in cTnI gene.Primers were designed for the PCR (polymerase chain reaction) to amplify the target DNA fragments from fresh blood samples.In order to simplify the PCR process,multiplex PCR technology was investigated in detail.The concentration of Mg^(2+) played an important role in multiplex PCR process,a properly low concentration of Mg^(2+) submitted a better speciality of PCR products.The speciality was also favored when the annealing temperature was reasonably enhanced and 64℃is the optimal annealing temperature for the multiplex PCR systems.When applying the fabricated gene-chip to detect the target fragments from PCR mixture,the signal intensity sequence is in accordance with that from theoretic estimate. 展开更多
关键词 hypertrophic cardiomyopathy(HCM) gene-chip multiplex PCR mutation hybridization
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骨形态发生蛋白2(BMP2)基因在内蒙古绒山羊不同时期皮肤毛囊中的表达 被引量:21
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作者 苏蕊 李金泉 +3 位作者 张文广 尹俊 赵珺 常子丽 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期559-563,共5页
【目的】研究内蒙古绒山羊毛囊发育兴盛期和休止期BMP2基因在皮肤毛囊中的表达情况。【方法】功能分类基因芯片以及原位杂交技术。【结果】原位杂交结果表明,该基因在休止期毛囊毛干周围高表达,在兴盛期不表达;基因芯片结果显示,同兴盛... 【目的】研究内蒙古绒山羊毛囊发育兴盛期和休止期BMP2基因在皮肤毛囊中的表达情况。【方法】功能分类基因芯片以及原位杂交技术。【结果】原位杂交结果表明,该基因在休止期毛囊毛干周围高表达,在兴盛期不表达;基因芯片结果显示,同兴盛期相比,休止期BMP2基因在皮肤中表达上调24.65倍。【结论】BMP2基因抑制内蒙古绒山羊皮肤毛囊发育,与维持皮肤毛囊处于休止期有关;该基因主要在皮肤毛囊的毛干周围发挥作用,从而达到维持皮肤毛囊发育处于休止期的作用。 展开更多
关键词 BMP2 毛囊 表达 原位杂交 基因芯片
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甘肃地区女性宫颈HPV感染的现状研究 被引量:45
3
作者 杜宏 索兰草 +6 位作者 刘红贤 王强 刘斌 简启亮 黄山 张文华 王芳 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期40-45,共6页
目的:了解甘肃地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染的基因亚型、年龄及地区分布等.方法:采用凯普医用核酸分子快速导流杂交基因芯片技术,对7318名兰州女性进行生殖道21种HPV感染基因亚型筛查.结果:甘肃地区女性HPV感染率为19.9%(1 452/7 318)... 目的:了解甘肃地区女性人乳头瘤病毒(HPV)感染的基因亚型、年龄及地区分布等.方法:采用凯普医用核酸分子快速导流杂交基因芯片技术,对7318名兰州女性进行生殖道21种HPV感染基因亚型筛查.结果:甘肃地区女性HPV感染率为19.9%(1 452/7 318),其中高危型HPV感染率14.78%(1 082/7 318),低危型HPV感染率3.38%(247/7 318),高危型中HPV16为主要致病亚型,占28.59%(415/1 452),低危型中HPV6占6.30%(98/1 452).1452例感染HPV的标本中,单一感染1 188例,占81.82%(1 188/1 452),多重感染264例,占18.18%(264/1 452).按年龄分组中≥50岁组HPV感染率最高,占24.24%.按地区分析,陇南地区HPV感染率最高,达到30.97%(83/268).结论:甘肃地区为宫颈癌高发区,其中HPV16是感染最多的型别,对该地区女性进行子宫颈癌的筛查和防治已成为当务之急. 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒(HPV) 核酸分子快速导流杂交基因芯片 甘肃地区
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梨S基因芯片的试制及分子杂交条件的优化 被引量:11
4
作者 江南 谭晓风 +3 位作者 陈洪 王秀利 张琳 曾艳玲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期481-486,共6页
为研究寡核苷酸芯片在确定梨品种S基因型中的应用价值,根据梨自交不亲和基因的结构特点设计了部分S基因的检测探针,并制成寡核苷酸芯片;采用引物Cy3荧光标记法标记检测样品的PCR产物并进行杂交,以检测不同样品的S基因型。结果表明:通过... 为研究寡核苷酸芯片在确定梨品种S基因型中的应用价值,根据梨自交不亲和基因的结构特点设计了部分S基因的检测探针,并制成寡核苷酸芯片;采用引物Cy3荧光标记法标记检测样品的PCR产物并进行杂交,以检测不同样品的S基因型。结果表明:通过对不同杂交温度、杂交时间等的探索获得了较好的反应条件并用制备的芯片检测了已知S基因型的梨样品,检测结果与各品种的已知基因型相符。证明寡核苷酸芯片检测梨品种的S基因型是一种切实可行的检测方法,若对芯片进一步完善,则在今后梨自交不亲和性状的机理研究及梨自交不亲和性状的利用等方面将有着广阔的应用前景。 展开更多
关键词 自交不亲和性 S-RNASE基因 基因芯片 分子杂交
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寡核苷酸芯片探针固定化和杂交条件的优化 被引量:11
5
作者 潘继红 韩金祥 +1 位作者 黄海南 黄海燕 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期150-152,共3页
目的 探讨寡核苷酸芯片探针固定化的方法 ,优化杂交条件。方法 设计spacer为poly(dT) 10~ 2 0 的长度为 15~ 30mer的探针 ,与 12 2~ 10 6 7bp的荧光标记靶序列杂交 ,杂交温度选择 4 2℃~ 6 5℃ ,杂交时间选择 1~ 3h。扫描分析杂... 目的 探讨寡核苷酸芯片探针固定化的方法 ,优化杂交条件。方法 设计spacer为poly(dT) 10~ 2 0 的长度为 15~ 30mer的探针 ,与 12 2~ 10 6 7bp的荧光标记靶序列杂交 ,杂交温度选择 4 2℃~ 6 5℃ ,杂交时间选择 1~ 3h。扫描分析杂交结果 ,通过Quantarray定量分析软件进行定量。结果 较短的如 10 0bp左右的靶序列 ,spacer为poly(dT) 10 、探针为 2 0mer左右即可获得非常理想的杂交结果。较长的如 75 0bp左右的靶序列 ,较短的spacer不能获得理想的杂交结果 ,可以选择poly(dT) 15或poly(dT) 2 0 ,探针应为 2 0mer以上 ,2 5mer和 30mer均能获得较好的杂交结果。 1k以上的靶序列与 15~ 30mer的探针杂交信号较弱。 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 探针 固定化 杂交条件 优化 荧光定量
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基因芯片对人乳头瘤病毒的快速检测和分型 被引量:50
6
作者 黄庆 府伟灵 +3 位作者 周玉 张雪 黄君富 陈斌 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期476-478,共3页
目的 针对HPV DNA亚型的异质性,建立HPV DNA亚型的基因芯片快速检测方法,为HPV感染病例提供诊断依据。方法 18 种HPV DNA亚型(HPV6、16、18、31、33、35、39、11、45、51、52、53、56、58、42、59、66、68)特异性探针,固定于硝酸纤维... 目的 针对HPV DNA亚型的异质性,建立HPV DNA亚型的基因芯片快速检测方法,为HPV感染病例提供诊断依据。方法 18 种HPV DNA亚型(HPV6、16、18、31、33、35、39、11、45、51、52、53、56、58、42、59、66、68)特异性探针,固定于硝酸纤维素膜制备成基因芯片,生物素标记引物经通用引物介导PCR(GD PCR)扩增HPV DNA, PCR产物与基因芯片经反向点杂交检测HPV亚型;同时采用荧光定量PCR检测HPV6、11、16 和18亚型。结果 31 例标本中,基因芯片的阳性检出率为74.2%,其中HPV6/18、HPV11/16、HPV33/58 和HPV6/11/33多重感染各1 例(3.2%);荧光定量PCR 阳性检出率为67.7%,与前种方法相比较,漏诊率为6.5%。结论 HPV分型基因芯片可1次检测HPV多种亚型,灵敏度高和特异性强,有利于对HPV多重感染的诊断。 展开更多
关键词 HPV 基因芯片 GD-PCR 反向点杂交
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应用基因芯片检测烟草脆裂病毒 被引量:6
7
作者 马新颖 汪琳 +4 位作者 任鲁风 邓丛良 高文娜 汪万春 周琦 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期352-355,共4页
Total RNA in tulips was extracted by Trizol method.Primers were designed according to the sequences of Tobacco rattle virus and 18S rRNA gene of plant.The corresponding sections were amplified by RT-PCR and the PCR pr... Total RNA in tulips was extracted by Trizol method.Primers were designed according to the sequences of Tobacco rattle virus and 18S rRNA gene of plant.The corresponding sections were amplified by RT-PCR and the PCR products were labeled by Cy3-dCTP.The probes of plant virus,18S rRNA gene and comparisons were designed and immobilized on chips.Labeled PCR products were hybridized with the probes and the signals were scanned by scanner and analyzed by GenePix Pro 4.0 software.Tobacco rattle virus was detected from tulips which were imported from Holand.The accuracy and sensitivity of the plant virus gene chip were proved. 展开更多
关键词 基因芯片 检测 烟草脆裂病毒 有害生物 检疫
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肿瘤转移相关新基因MAG-1和MAG-2的克隆 被引量:8
8
作者 张金强 孟宇宏 +4 位作者 杜芝燕 陈泽建 凌贤龙 徐元基 陆应麟 《中国肺癌杂志》 CAS 2003年第6期460-463,共4页
目的 从两株人肺巨细胞癌细胞株中分离并鉴定人肺癌转移相关基因 ,为探讨肿瘤转移的分子机制奠定基础。方法 以细胞系PLA 80 1的两个具有不同转移潜力的亚克隆为模型 ,利用抑制消减杂交(suppressionsubtractivehybridization ,SSH)技... 目的 从两株人肺巨细胞癌细胞株中分离并鉴定人肺癌转移相关基因 ,为探讨肿瘤转移的分子机制奠定基础。方法 以细胞系PLA 80 1的两个具有不同转移潜力的亚克隆为模型 ,利用抑制消减杂交(suppressionsubtractivehybridization ,SSH)技术克隆差异片段 ,对得到的片段经基因芯片筛选后测序并与GenBank数据库进行同源性比较 ,然后用Northern杂交和RT PCR对其中的两条序列进行验证 ,并进行详细的生物信息学分析。结果 获得了 79条在高转移细胞中高表达而在低转移细胞中低表达的序列 ,在与这些序列同源的己知基因中包括两条功能未知的全长cDNA序列BC0 0 62 3 6和BC0 0 2 42 0 ,分别命名为MAG 1和MAG 2。MAG 1定位于 4q2 1,由 4个外显子组成 ,MAG 2定位于 2 q3 5 ,由 9个外显子组成 ,基因长度分别为8.5kb和 5 .2kb。二条序列均有开放阅读框架 (ORF) ,编码产物以α螺旋为主并含有部分片层结构和无规卷曲。结论 MAG 1和MAG 2在高低转移性肺巨细胞癌细胞株中的表达具有显著差异 ,二者的表达与高转移潜能具有相关性 ,提示MAG 1和MAG 2可能参与肿瘤转移过程。 展开更多
关键词 肿瘤 基因 克隆 肺癌 抑制消减杂交技术 SSH
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基因表达谱芯片杂交影响因素的初步研究 被引量:5
9
作者 祝骥 马文丽 +2 位作者 李凌 毛向明 郑文岭 《生命科学研究》 CAS CSCD 2004年第2期133-139,共7页
通过对K562细胞基因表达谱芯片杂交影响因素的研究表明,用限制性显示技术[1]制备的cDNA探针长度较均一,适合基因芯片杂交;在42℃条件下含甲酰胺的杂交液中杂交16~20h,可保证样品的有效杂交,并表现出很好的杂交特异性;用RD-PCR或线性PC... 通过对K562细胞基因表达谱芯片杂交影响因素的研究表明,用限制性显示技术[1]制备的cDNA探针长度较均一,适合基因芯片杂交;在42℃条件下含甲酰胺的杂交液中杂交16~20h,可保证样品的有效杂交,并表现出很好的杂交特异性;用RD-PCR或线性PCR对少量样品进行扩增,并用荧光(Cy3或Cy5)标记的通用引物对样品进行标记,可提高芯片检测的灵敏度;一次杂交反应总RNA的用量仅需0.5~10μg,在每cm2约含1000~1500个点的阵列中杂交时,标记样品用量1~2μg为宜;用PCR产物纯化柱对荧光标记产物进行纯化,可大大减小背景荧光,提高信噪比;同一批芯片经同一样品杂交结果的重复性很好,相关系数高达97.8%. 展开更多
关键词 K562细胞 基因芯片 基因表达谱 杂交 限制性显示
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7种动物冠状病毒基因芯片同步检测的研究 被引量:3
10
作者 李健 熊炜 +5 位作者 陈沁 张建武 王权 王巧全 胡永强 李树清 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期557-562,共6页
根据发布的7种动物冠状病毒相关基因的序列,给每种病毒设计了4~17对引物,同时依据RNA聚合酶基因序列合成了l对兼并引物,利用TCV原毒和纯化浓缩的CCV、FCV、FIPV、TGEV、PRCV、BCV细胞毒,构建了89个基因片段的克隆.采用煮沸裂解法制备质... 根据发布的7种动物冠状病毒相关基因的序列,给每种病毒设计了4~17对引物,同时依据RNA聚合酶基因序列合成了l对兼并引物,利用TCV原毒和纯化浓缩的CCV、FCV、FIPV、TGEV、PRCV、BCV细胞毒,构建了89个基因片段的克隆.采用煮沸裂解法制备质粒DNA,进行特异引物PCR扩增,回收纯化产物,点制冠状病毒基因芯片.抽提病毒总RNA,利用Cy3-dCTP随机渗入反转录PCR标记,同时对BCV、CCV利用Cy3-dCTP随机渗入反转录标记,与芯片进行杂交检测.结果显示,BCV和TCV基因克隆间未见交叉,CCV、FCV、FIPV、TGEV、PRCV则存在广泛交叉.选择无交叉的特异克隆片段点制最终基因芯片,并与病毒多重PCR扩增产物杂交,芯片信号未见交叉,结果判断明确.表明,基因芯片检测法比传统PCR法敏感1000倍. 展开更多
关键词 冠状病毒 基因芯片 杂交 检测
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62例特纳综合征患者染色体核型分析 被引量:8
11
作者 张文玲 鲍布和 +3 位作者 张晨晰 王晓菲 张立文 王成彬 《解放军医学院学报》 CAS 2016年第10期1038-1042,共5页
目的分析特纳综合征(Turner Syndrome)不同核型的细胞遗传学特征、分布情况及复杂核型的异常来源。方法对2010-2015年就诊于解放军总医院妇产科门诊或儿科门诊的62例Turner综合征患者进行外周血淋巴细胞培养及染色体核型分析,部分患... 目的分析特纳综合征(Turner Syndrome)不同核型的细胞遗传学特征、分布情况及复杂核型的异常来源。方法对2010-2015年就诊于解放军总医院妇产科门诊或儿科门诊的62例Turner综合征患者进行外周血淋巴细胞培养及染色体核型分析,部分患者结合荧光原位杂交检测或染色体基因芯片分析。结果 62例Turner综合征患者表现为女性,年龄5~25岁,共检出12种核型,其中1例含复杂标记染色体嵌合核型,经荧光原位杂交检测证实标记染色体为Y染色体部分缺失或Y染色体假双着丝粒;1例环染色体嵌合核型,经基因芯片分析证实环染色体来源于Xp11q28。结论 Turner综合征核型复杂多样,其中以XO及i(Xq)较为常见,在常规G显带的基础上,应用荧光原位杂交技术或基因芯片技术可准确识别疑难异常染色体,对明确诊断及后续治疗有指导意义。 展开更多
关键词 特纳综合征 染色体核型分析 荧光原位杂交 染色体基因芯片
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弓形虫病分子诊断技术研究进展 被引量:5
12
作者 任庆娥 周春香 +2 位作者 菅复春 冯超 张龙现 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第5期66-71,共6页
弓形虫病是一种呈世界性分布的人兽共患寄生虫病,严重危害人类健康并给世界各国的畜牧业造成巨大的经济损失,但弓形虫病缺乏特异性临床症状,给该病的诊断带来很大困难。分子诊断技术的迅速发展为弓形虫病的诊断提供了快速、灵敏、特异... 弓形虫病是一种呈世界性分布的人兽共患寄生虫病,严重危害人类健康并给世界各国的畜牧业造成巨大的经济损失,但弓形虫病缺乏特异性临床症状,给该病的诊断带来很大困难。分子诊断技术的迅速发展为弓形虫病的诊断提供了快速、灵敏、特异及稳定的检测方法。笔者从核酸分子杂交技术、聚合酶链反应(PCR)、单克隆抗体(McAb)技术及生物芯片技术几个方面介绍了用于诊断弓形虫病的分子诊断技术的研究进展。 展开更多
关键词 弓形虫 核酸分子杂交技术 PCR McAb技术 基因芯片
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21种HPV亚型检测在宫颈病变诊断及预测中的价值 被引量:37
13
作者 何君梅 尹格平 《山东医药》 CAS 北大核心 2010年第15期35-36,共2页
目的探讨HPV亚型感染与宫颈病变的关系。方法360例宫颈病变患者组织病理学检查诊断为宫颈炎/宫颈尖锐湿疣254例,宫颈上皮内瘤变(CIN)52例(其中CINⅠ12例、CINⅡ16例、CINⅢ24例),宫颈癌54例,采用导流杂交基因芯片技术检测宫颈脱落细胞中... 目的探讨HPV亚型感染与宫颈病变的关系。方法360例宫颈病变患者组织病理学检查诊断为宫颈炎/宫颈尖锐湿疣254例,宫颈上皮内瘤变(CIN)52例(其中CINⅠ12例、CINⅡ16例、CINⅢ24例),宫颈癌54例,采用导流杂交基因芯片技术检测宫颈脱落细胞中HPV亚型,分析不同病变的HPV感染情况。结果本组HPV感染率为83.3%(300/360);宫颈炎/宫颈尖锐湿疣、CIN、宫颈癌高危型感染率明显高于低危型(P<0.01);高危型HPV感染率随宫颈病变程度加重而升高;不同宫颈病变中单一型感染率明显高于多重型感染率(P<0.01),多重型感染率随宫颈病变程度加重而升高。不同HPV亚型致病性不同。结论HPV亚型检测可用于宫颈病变的筛查病情判断。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 导流杂交基因芯片技术 宫颈病变
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功能基因组学及其研究方法 被引量:6
14
作者 张祖新 张方东 郑用琏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期194-201,共8页
功能基因组学是在结构基因组学丰富信息资源的基础上 ,应用大通量的实验分析方法并结合统计和计算机分析研究基因的表达、调控与功能以及生物的生长、发育规律的新型交叉学科。基因功能研究采用从基因到表型和从表型到基因两种策略 ,使... 功能基因组学是在结构基因组学丰富信息资源的基础上 ,应用大通量的实验分析方法并结合统计和计算机分析研究基因的表达、调控与功能以及生物的生长、发育规律的新型交叉学科。基因功能研究采用从基因到表型和从表型到基因两种策略 ,使用多种方法创造大量变异及大通量识别并克隆基因和研究基因表达模式的技术。如基因陷阱、基于差异杂交的基因表达差异研究技术、 DNA芯片和蛋白质芯片等。随着研究技术不断改进和创新 ,功能基因组研究将成为生命科学研究的重点和热点。 展开更多
关键词 蛋白质组 差异杂交 DNA芯片 功能基因组
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肝细胞癌中microRNA-375调控的基因网络分析 被引量:3
15
作者 黄波 肖影群 +5 位作者 罗达亚 章萍 杨仙荷 钟青梅 王武 姚迪 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期363-370,共8页
目的:探讨肝细胞癌中miR-375的表达及其调控的相关靶基因和信号通路。方法:采用原位杂交检测miR-375在人肝癌组织芯片的表达情况;人全基因组表达谱芯片检测4株肝癌细胞株;MAS生物信息学软件筛选miR-375调控靶基因及相关信号通路。结果:... 目的:探讨肝细胞癌中miR-375的表达及其调控的相关靶基因和信号通路。方法:采用原位杂交检测miR-375在人肝癌组织芯片的表达情况;人全基因组表达谱芯片检测4株肝癌细胞株;MAS生物信息学软件筛选miR-375调控靶基因及相关信号通路。结果:原位杂交结果显示miR-375在肝癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P<0.05);人全基因组表达谱芯片结果分析显示4株转染miR-375的肝癌细胞的共上调基因有20个,共下调基因有17个;MAS生物信息学软件分析显示4株转染miR-375的肝癌细胞共有的上调信号通路有54条,下调信号通路有48条。结论:miR-375与肝细胞癌有密切的关系。对miR-375调控的肝细胞癌相关靶基因与信号通路进行多元化筛选,为后续全面深入的研究肝细胞癌发生发展的机制提供了便利。 展开更多
关键词 肝细胞癌 MicroRNA-375 原位杂交 基因芯片
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乙型脑炎病毒与黄热病病毒联合诊断基因芯片的初步实验研究 被引量:3
16
作者 张海燕 马文丽 +2 位作者 李凌 吴清华 郑文岭 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第15期1811-1813,共3页
目的制备乙型脑炎病毒(JEV)与黄热病病毒(YFV)联合诊断基因芯片。方法基于早期实验室研究挑选出28条寡核苷酸探针制备检测芯片。克隆于质粒上的乙型脑炎病毒和黄热病病毒基因片段用于检测探针特异性,经限制性显示技术扩增并标记,与芯片... 目的制备乙型脑炎病毒(JEV)与黄热病病毒(YFV)联合诊断基因芯片。方法基于早期实验室研究挑选出28条寡核苷酸探针制备检测芯片。克隆于质粒上的乙型脑炎病毒和黄热病病毒基因片段用于检测探针特异性,经限制性显示技术扩增并标记,与芯片杂交后完成扫描和数据分析。结果JEV、YFV探针与相应的荧光标记样本杂交后,均能检测出阳性荧光信号,而空白对照则检出阴性信号。结论基因芯片技术为病毒检测提供了一种早期、可靠的方法,具有应用于多病毒临床鉴别诊断的前景。 展开更多
关键词 乙型脑炎病毒 黄热病病毒 基因芯片 杂交
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植物基因差异表达的研究方法及进展 被引量:17
17
作者 汤华 帅爱华 向福英 《海南大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第3期309-316,共8页
对目前在植物基因差异表达研究领域主要采用的消减杂交,DDRT-PCR,cDNA-RDA,cDNA-AFLP,SSH,基因芯片和SAGE等研究方法的原理、特点、研究进展以及发展趋势进行了综述.这些方法各有特点,可根据研究工作的需要选择合适的研究方法.
关键词 基因差异表达 消减杂交 差异显示PCR cDNA代表性差异分析 CDNA-AFLP 抑制消减杂交 基因芯片 基因表达系列分析
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探针的修饰与浓度杂交温度及时间对基因芯片杂交信号的影响 被引量:3
18
作者 刘玲玲 唐桂芬 +3 位作者 李文刚 饶宝 张永涛 程亚楼 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2012年第11期17-19,I0002,共4页
本研究以猪链球菌2型的cps2J基因为试验材料,研究了两种探针在不同杂交条件下对基因芯片杂交信号的影响,试验结果表明,寡核苷酸探针的浓度在5~20μm/L之间对杂交信号的影响不大,寡核苷酸探针的氨基化端加上Poly(dT),42℃杂交1h可以获... 本研究以猪链球菌2型的cps2J基因为试验材料,研究了两种探针在不同杂交条件下对基因芯片杂交信号的影响,试验结果表明,寡核苷酸探针的浓度在5~20μm/L之间对杂交信号的影响不大,寡核苷酸探针的氨基化端加上Poly(dT),42℃杂交1h可以获得较好的杂交信号。 展开更多
关键词 基因芯片 探针 Poly(dT) 杂交
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应用导流杂交基因芯片技术对HPV感染基因分型检测的研究 被引量:14
19
作者 黄冰玉 邹颖刚 +2 位作者 徐耀宏 路英丽 郭雪华 《中国实验诊断学》 北大核心 2009年第8期1065-1067,共3页
目的探讨核酸分子快速导流杂交基因芯片技术(flow-through hybridization and gene chip,Hybri Max)对人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染分型检测中的应用。方法对558例临床患者进行液基细胞学检测(LPT),异常者做组织病理... 目的探讨核酸分子快速导流杂交基因芯片技术(flow-through hybridization and gene chip,Hybri Max)对人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染分型检测中的应用。方法对558例临床患者进行液基细胞学检测(LPT),异常者做组织病理学诊断,同时采用Hybri Max技术,对558例患者的宫颈细胞进行HPV DNA检测和分型。结果558例患者中,细胞学异常的370例,并对异常者做病理学诊断,结果为:慢性炎症80例,CINI70例,CINII76例、CINIII82例、宫颈癌62例。②全部患者均进行HPVDNA的检测与分型,其HPVDNA阳性的是:细胞学正常的188例中有40例(21.3%),慢性炎症有48例(60.0%),CINI有52例(74.3%),CINII有68例(89.5%),CINIII有76例(92.7%),宫颈癌有62例(100%)。结论对HPV感染的检查以及通过Hybri Max技术对HPVDNA基因分型检测的研究,对宫颈癌早期发现,判断预后及指导治疗有重要价值。 展开更多
关键词 人乳头状瘤病毒 基因分型 导流杂交基因芯片技术 宫颈上皮内瘤变(CIN)
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深圳市女性医务人员HPV感染现状及HPV基因分型的研究 被引量:6
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作者 刘秀卿 李卓成 李延武 《国际检验医学杂志》 CAS 2015年第9期1207-1209,共3页
目的了解健康女性医务人员HPV感染的阳性率与各年龄段的关系及各亚型的分布情况以及自然清除率,为该人群宫颈癌的早期防治及流行病学研究提供理论依据。方法采用PCR扩增-反向点杂交法检测23种HPV基因型,包括18种高危型和5种低危型HPV,... 目的了解健康女性医务人员HPV感染的阳性率与各年龄段的关系及各亚型的分布情况以及自然清除率,为该人群宫颈癌的早期防治及流行病学研究提供理论依据。方法采用PCR扩增-反向点杂交法检测23种HPV基因型,包括18种高危型和5种低危型HPV,分析受检者HPV感染率和基因型分布情况,比对各年龄段的感染率并对比1年后HPV复查情况计算自然清除率。结果 1 366例标本中阳性176例,阳性率为12.88%,21∽〈30岁与60岁及以上的感染率出现两个弱高峰;检测出22种HPV基因型,HPV83型未被检出,高危型主要以HPV52、53、16为主,低危型以HPV81、42较为常见;1年后HPV的自然清除率为32.95%。结论对健康人群进行HPV基因分型筛查能较好地指导宫颈癌的早期防治,同时要加强对青年和中老年女性医务人员的HPV感染防控。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 反向点杂交-基因芯片 自然清除率
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