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基于重测序的南方高蛋白大豆品种福豆234的遗传变异
1
作者
张玉梅
萧涵
+2 位作者
蓝新隆
夏春英
林国强
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期652-661,共10页
【目的】揭示南方高蛋白大豆遗传变异提供理论参考。【方法】通过高通量测序技术对南方高蛋白大豆品种福豆234进行全基因组重测序。【结果】共获得64 757 037条Clean reads,测序深度为17×,基因组覆盖度分别达98.08%(1×)和96.2...
【目的】揭示南方高蛋白大豆遗传变异提供理论参考。【方法】通过高通量测序技术对南方高蛋白大豆品种福豆234进行全基因组重测序。【结果】共获得64 757 037条Clean reads,测序深度为17×,基因组覆盖度分别达98.08%(1×)和96.25%(5×)。共鉴定出1 478 393个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)位点和356 739个小片段插入缺失(Small insertion-deletion, Small InDel)位点。其中共鉴定出14 323个非同义SNP突变的基因,4 186个Small Indel的突变基因位于编码区(Coding sequence, CDS)。通过COG(Clusters of orthologous groups of proteins)分析发现信号传导机制、转录、碳水化合物转输和代谢等和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析发现碳代谢、淀粉和蔗糖代谢、氨基酸生物合成、植物激素信号传导、内质网蛋白质加工等通路与福豆234遗传变异相关。此外,本研究以大豆籽粒蛋白质含量数量性状基因座(Quantitative trait locus, QTL)的两个主要区段内的候选基因进行分析,发现有65个基因发生SNP或Small InDel水平的变异,其中,SNP变异类型达10种,Small InDel变异类型达7种。【结论】本研究初步揭示南方高蛋白大豆的遗传变异规律,为高蛋白大豆品种选育和分子标记的开发提供数据支持和理论依据。
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关键词
福豆
234
全基因组重测序
单核苷酸多态性
小片段插入缺失
变异
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职称材料
高蛋白大豆福豆234的选育及高产农艺措施数学模型
被引量:
12
2
作者
林国强
张轼
+2 位作者
滕振勇
陈双龙
陈志雄
《福建农业学报》
CAS
2005年第2期69-73,共5页
福豆234系以莆豆8008为母本、黄沙豆为父本进行有性杂交,经系谱法选育而成的春大豆新品种。该品种蛋白质含量高、.丰产稳产、适应性广。采用二次通用旋转组合设计研究了不同尿素、氯化钾施用量及种植密度对产量的影响,结果表明,在红黄...
福豆234系以莆豆8008为母本、黄沙豆为父本进行有性杂交,经系谱法选育而成的春大豆新品种。该品种蛋白质含量高、.丰产稳产、适应性广。采用二次通用旋转组合设计研究了不同尿素、氯化钾施用量及种植密度对产量的影响,结果表明,在红黄壤旱地,该品种最佳农艺措施是施尿素77.25-93.30 kg·hm-2、氯化钾108.15 -129.45 kg·hm-2,种植密度28.35-32.55万株·hm-2。
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关键词
大豆
选育
福豆
234
品种
高产栽培
农艺措施
数学模型
下载PDF
职称材料
不同密度和施肥量处理对福豆234的影响
3
作者
林海峰
邱春锦
+1 位作者
李清华
黄强
《安徽农学通报》
2009年第23期59-60,75,共3页
采用2因素随机区组设计对福豆234不同密度和施肥量处理研究。结果表明,在莆田生态区,福豆234春播以2.4万株/667m2种植密度和5 kg/667m2施肥量处理组合的产量为最高,达237.9kg/667m2。
关键词
福豆
234
密度
施肥量
产量
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职称材料
题名
基于重测序的南方高蛋白大豆品种福豆234的遗传变异
1
作者
张玉梅
萧涵
蓝新隆
夏春英
林国强
机构
福建省农业科学院作物研究所/福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心/福建省蔬菜遗传育种重点实验室
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期652-661,共10页
基金
福建省科技厅区域发展项目(2023N3001)
福建省科技计划公益类专项(2022R1031006)
福建省财政专项(CXTD2021011-2)。
文摘
【目的】揭示南方高蛋白大豆遗传变异提供理论参考。【方法】通过高通量测序技术对南方高蛋白大豆品种福豆234进行全基因组重测序。【结果】共获得64 757 037条Clean reads,测序深度为17×,基因组覆盖度分别达98.08%(1×)和96.25%(5×)。共鉴定出1 478 393个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)位点和356 739个小片段插入缺失(Small insertion-deletion, Small InDel)位点。其中共鉴定出14 323个非同义SNP突变的基因,4 186个Small Indel的突变基因位于编码区(Coding sequence, CDS)。通过COG(Clusters of orthologous groups of proteins)分析发现信号传导机制、转录、碳水化合物转输和代谢等和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析发现碳代谢、淀粉和蔗糖代谢、氨基酸生物合成、植物激素信号传导、内质网蛋白质加工等通路与福豆234遗传变异相关。此外,本研究以大豆籽粒蛋白质含量数量性状基因座(Quantitative trait locus, QTL)的两个主要区段内的候选基因进行分析,发现有65个基因发生SNP或Small InDel水平的变异,其中,SNP变异类型达10种,Small InDel变异类型达7种。【结论】本研究初步揭示南方高蛋白大豆的遗传变异规律,为高蛋白大豆品种选育和分子标记的开发提供数据支持和理论依据。
关键词
福豆
234
全基因组重测序
单核苷酸多态性
小片段插入缺失
变异
Keywords
fudou 234
whole genome re-sequencing
single nucleotide polymorphism
small InDel
variation
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
高蛋白大豆福豆234的选育及高产农艺措施数学模型
被引量:
12
2
作者
林国强
张轼
滕振勇
陈双龙
陈志雄
机构
福建省农业科学院耕作轮作研究所
福建省种子总站
出处
《福建农业学报》
CAS
2005年第2期69-73,共5页
基金
福建省科技厅资助项目(2003N042)
文摘
福豆234系以莆豆8008为母本、黄沙豆为父本进行有性杂交,经系谱法选育而成的春大豆新品种。该品种蛋白质含量高、.丰产稳产、适应性广。采用二次通用旋转组合设计研究了不同尿素、氯化钾施用量及种植密度对产量的影响,结果表明,在红黄壤旱地,该品种最佳农艺措施是施尿素77.25-93.30 kg·hm-2、氯化钾108.15 -129.45 kg·hm-2,种植密度28.35-32.55万株·hm-2。
关键词
大豆
选育
福豆
234
品种
高产栽培
农艺措施
数学模型
Keywords
Soybean
Breeding
fudou 234
Agronomic measures
Mathematical model
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
不同密度和施肥量处理对福豆234的影响
3
作者
林海峰
邱春锦
李清华
黄强
机构
莆田市农业科学研究所
出处
《安徽农学通报》
2009年第23期59-60,75,共3页
文摘
采用2因素随机区组设计对福豆234不同密度和施肥量处理研究。结果表明,在莆田生态区,福豆234春播以2.4万株/667m2种植密度和5 kg/667m2施肥量处理组合的产量为最高,达237.9kg/667m2。
关键词
福豆
234
密度
施肥量
产量
Keywords
fudou 234
planting density
fertilizer amount
yield
分类号
S643.7 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于重测序的南方高蛋白大豆品种福豆234的遗传变异
张玉梅
萧涵
蓝新隆
夏春英
林国强
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
高蛋白大豆福豆234的选育及高产农艺措施数学模型
林国强
张轼
滕振勇
陈双龙
陈志雄
《福建农业学报》
CAS
2005
12
下载PDF
职称材料
3
不同密度和施肥量处理对福豆234的影响
林海峰
邱春锦
李清华
黄强
《安徽农学通报》
2009
0
下载PDF
职称材料
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