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牛GDF5基因启动子的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 刘永峰 昝林森 +7 位作者 赵栓平 亐开兴 李林强 张莺莺 唐中林 杨述林 牟玉莲 崔文涛 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期392-397,共6页
旨在了解生长分化因子5(GDF5)可能的调控序列。本研究通过基因组比对,扩增了牛GDF5基因5′侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,确定了2043bp的启动子序列。同时综合考虑已经证实的人GDF5基因启动子结构及应用启动子在线分析软... 旨在了解生长分化因子5(GDF5)可能的调控序列。本研究通过基因组比对,扩增了牛GDF5基因5′侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,确定了2043bp的启动子序列。同时综合考虑已经证实的人GDF5基因启动子结构及应用启动子在线分析软件,对该序列进行分析。结果发现,牛GDF5基因5′侧翼区没有CpG岛,序列比对发现,牛和人GDF5基因启动子区域同源性为78%;牛GDF5基因启动子没有TATAbox或CAATbox结构,其转录起始位点位于翻译起始密码子ATG上游-359bp位置,其潜在的转录因子有AML-la,Ap-1,AmL-la,CdxA,SRY,CdxA,TATA,AmL-la,GTATA-1,MZF1,CdxA,Nkx-2,CdxA,S8和SRY,其中Ap-1,AmL-la,SRY,Nkx-2,S8和SRY高度保守,与人的序列完全一致;推测发现牛GDF5基因启动子-457至-423bp序列中的GT重复序列可以增强启动子的活性,且最小增强子处于-458和-377bp之间。研究结果推测判定了牛GDF5基因启动子的转录起始位置、转录结合位点、活性序列及最小增强子序列,为以后深入研究GDF5基因在牛软骨细胞中的表达机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 gdf5基因 启动子 克隆 转录因子
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hGDF5基因转染对骨髓间充质干细胞增殖和分化的影响 被引量:3
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作者 任晓勇 张银刚 陈文弦 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期15-19,共5页
目的探讨人生长分化因子5(hGDF5)基因转染对骨髓间充质干细胞(BMSCs)增殖及分化的影响。方法采用脂质体介导方法将hGDF5基因转入体外培养的兔BMSCs,用逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)、间接免疫荧光检测hGDF5 mRNA和蛋白质的表达,并通过检... 目的探讨人生长分化因子5(hGDF5)基因转染对骨髓间充质干细胞(BMSCs)增殖及分化的影响。方法采用脂质体介导方法将hGDF5基因转入体外培养的兔BMSCs,用逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)、间接免疫荧光检测hGDF5 mRNA和蛋白质的表达,并通过检测碱性磷酸酶活性、细胞增殖能力(MTT法)、Ⅱ型胶原(ColⅡ)以及蛋白多糖(PG)的表达,分析转染hGDF5对BMSCs增殖、分化的影响。结果hGDF5 mRNA及蛋白在基因转染细胞内得到正确表达;hGDF5基因转染组和对照组相比,ColⅡ、PG表达水平显著增高(P<0.01,P<0.01),而碱性磷酸酶活性和细胞增殖能力无明显变化(P>0.05)。结论外源基因转染可以使BMSCs表达有生物活性的hGDF5。高表达的hGDF5可以促进BMSCs向软骨表型分化,但对细胞增殖和碱性磷酸酶活性无明显影响。 展开更多
关键词 生长分化因子5 骨髓间充质干细胞 基因转染 分化
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兴义矮脚鸡GDF5基因外显子2的克隆及与胫骨长相关性研究 被引量:3
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作者 郭发荣 陈彬 +2 位作者 张小卿 李太山 綦世金 《家畜生态学报》 北大核心 2015年第5期14-17,共4页
为探讨GDF5基因外显子2的SNPs以及与鸡胫骨长的关联性,以兴义矮脚鸡GDF5基因为研究对象,采用基因克隆技术得到外显子2序列,直接测序后检测SNPs,并与胫骨长进行相关性分析。结果表明,共检测到5个SNPs,前4个位点(C146A、C296T、G326A和C57... 为探讨GDF5基因外显子2的SNPs以及与鸡胫骨长的关联性,以兴义矮脚鸡GDF5基因为研究对象,采用基因克隆技术得到外显子2序列,直接测序后检测SNPs,并与胫骨长进行相关性分析。结果表明,共检测到5个SNPs,前4个位点(C146A、C296T、G326A和C578G)均为两种基因型,第5位点(C704T)为三种基因型。基因型与胫骨长性状关联分析显示,C578G位点CC基因型个体胫骨长显著高于GC型个体(P<0.05),其余SNPs均差异不显著(P>0.05)。研究表明,GDF5基因可能是影响鸡胫骨长的主效基因或与主效基因相连锁,C578G位点有望成为胫骨长性状选择的分子遗传标记,为家禽的选育提供理论依据。 展开更多
关键词 gdf5基因 克隆 SNPS 胫骨长 兴义矮脚鸡
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小尾寒羊GDF5和MC2R基因多态性与产羔数的关联分析
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作者 余平 狄冉 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2021年第5期18-22,共5页
旨在探究小尾寒羊生长分化因子5(GDF5)基因g.64245490A>G位点多态性和黑皮质素受体2(MC2R)基因g.43896005C>T位点多态性与小尾寒羊产羔数之间的关系,为绵羊高繁殖力机理研究和多羔新品系的选育提供参考。采用重测序和Sequenom Mas... 旨在探究小尾寒羊生长分化因子5(GDF5)基因g.64245490A>G位点多态性和黑皮质素受体2(MC2R)基因g.43896005C>T位点多态性与小尾寒羊产羔数之间的关系,为绵羊高繁殖力机理研究和多羔新品系的选育提供参考。采用重测序和Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术对380只小尾寒羊GDF5基因g.64245490A>G位点和MC2R基因g.43896005C>T位点进行多态性检测,并与产羔数进行关联分析。结果表明,GDF5基因g.64245490A>G位点存在AA、AG和GG三种基因型,频率分别为0.40、0.16和0.44,MC2R基因g.43896005C>T位点存在CC和CT两种基因型,频率分别为0.95和0.05;群体遗传学分析结果表明,g.64245490A>G位点为中度多态性(0.25<PIC<0.5),g.43896005C>T位点则表现为低度多态性(PIC<0.25);卡方适合性检验结果表明,g.64245490A>G位点在小尾寒羊群体中处于哈代-温伯格不平衡状态(P<0.05),g.43896005C>T位点处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05);关联分析表明,GDF5基因g.64245490A>G位点和MC2R基因g.43896005C>T位点的多态性与小尾寒羊各胎产羔数之间均无显著性关联(P>0.05)。综上可知,GDF5基因g.64245490A>G位点和MC2R基因g.43896005C>T位点与小尾寒羊产羔数性状没有显著关联,即此2个位点均不适用于小尾寒羊多羔性状的选育。 展开更多
关键词 小尾寒羊 gdf5基因 MC2R基因 SNP分型 产羔数
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转化生长因子5在发育性髋关节发育不良中的作用研究进展 被引量:2
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作者 姚佳炜 邱波 《生物技术进展》 2020年第4期345-350,共6页
发育性髋关节发育不良(developmental dysplasia of the hip,DDH)是一种主要因髋臼、股骨近端和关节囊等存在结构性畸形而导致的不稳定关节病变,进而发展成为髋关节的脱位。髋关节内软骨发育不良、骨骼及肌腱的异常均可导致髋关节结构... 发育性髋关节发育不良(developmental dysplasia of the hip,DDH)是一种主要因髋臼、股骨近端和关节囊等存在结构性畸形而导致的不稳定关节病变,进而发展成为髋关节的脱位。髋关节内软骨发育不良、骨骼及肌腱的异常均可导致髋关节结构的畸形,最终造成DDH。因此,早期预防与诊断是DDH治疗的关键。研究表明,DDH具有遗传基础,其易感基因包括GDF5、HOXD9、COL2AL、PAPPA2等,其中遗传因子转化生长因子5(growth differentiation factor 5,GDF5)对软骨细胞的增殖、分化具有重要作用,是当前研究治疗DDH的热点之一。因而,了解GDF5基因对软骨发育及分化的影响,对于DDH的发病机制和治疗具有重要意义。基于此,综述了国内外近期探讨的GDF5在基因层面上对DDH的影响,以及通过关节内注射重组人GDF5等基于GDF5的DDH治疗方案,以期为DDH的临床治疗提供新的策略。 展开更多
关键词 发育性髋关节发育不良 易感基因 软骨细胞 gdf5
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GDF5基因5′端一功能性SNP与骨性关节炎易感性相关 被引量:3
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作者 姚晨 戴进 +3 位作者 秦江辉 徐勇 史冬泉 蒋青 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1198-1199,共2页
目的评估江苏汉族人群中转化生长因子5(GDF5)非翻译区域的一个单核苷酸基因多态性(+104T/C;rs143383)与膝关节骨性关节炎相关性。方法对313例具有原发症状并有影像学证据的膝关节骨性关节炎患者及485名年龄相匹配的对照组进行+104T/C基... 目的评估江苏汉族人群中转化生长因子5(GDF5)非翻译区域的一个单核苷酸基因多态性(+104T/C;rs143383)与膝关节骨性关节炎相关性。方法对313例具有原发症状并有影像学证据的膝关节骨性关节炎患者及485名年龄相匹配的对照组进行+104T/C基因型测定,并检测+104T/C等位基因与膝关节骨性关节炎之间的关系。结果江苏汉族人群中,GDF5基因5′非翻译区域的一个单核苷酸基因多态性(+104T/C;rs143383)与膝关节骨性关节炎显著相关(P<0.01),含有+104C的等位基因转录能力下降。结论江苏汉族人群中GDF5基因5′非翻译区域+104T/C等位基因与膝关节骨性关节炎易感性呈显著相关。 展开更多
关键词 转化生长因子与基因 单核苷酸基因多态性 骨性关节炎
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非综合征性先天性关节融合的遗传学研究进展
7
作者 邓媚 谌芳 杨永佳 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第8期1001-1009,共9页
先天性关节融合(CJS)是胚胎发育过程中关节形态发生失败所导致的异常,在临床上又分为综合征性(sCJS)和非综合征性(nsCJS)。常见的sCJS包括染色体病(如克氏综合征等)和单基因病(如Apert/Pfeiffer/Crouzon综合征、Holt-Oram综合征、Ehlers... 先天性关节融合(CJS)是胚胎发育过程中关节形态发生失败所导致的异常,在临床上又分为综合征性(sCJS)和非综合征性(nsCJS)。常见的sCJS包括染色体病(如克氏综合征等)和单基因病(如Apert/Pfeiffer/Crouzon综合征、Holt-Oram综合征、Ehlers-Danlos综合征和尺桡骨融合伴血小板减少症等),可累及多个系统及器官,而nsCJS仅累及单一或多个关节。迄今为止,已发现7个基因(NOG、GDF5、FGF9、GDF6、FGF16、SMAD6和MECOM)的变异可能导致nsCJS。本文聚焦于这些基因,并对nsCJS的临床表型、遗传模式、常见变异及其作用机制进行文献回顾,同时通过对关节形态发生的相关信号通路进行分析,探讨可能导致nsCJS的其他候选基因。 展开更多
关键词 关节形态发生 非综合征性先天性关节融合 NOG基因 gdf5基因 GDF6基因 FGF9基因 FGF16基因 SMAD6基因 MECOM基因
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鸡GDF5基因遗传多样性及生物信息学分析
8
作者 郭发荣 陈彬 +2 位作者 李太山 张小卿 綦世金 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期955-961,共7页
为分析鸡GDF5基因的遗传多样性及结构与功能,本试验采用DNA池结合PCR产物直接测序法和生物信息学对9个鸡品种11种样品的GDF5基因进行研究。试验共检测出10个SNPs,且全为同义突变,突变后RNA二级结构发生变化,自由能变小,稳定性随之增强;G... 为分析鸡GDF5基因的遗传多样性及结构与功能,本试验采用DNA池结合PCR产物直接测序法和生物信息学对9个鸡品种11种样品的GDF5基因进行研究。试验共检测出10个SNPs,且全为同义突变,突变后RNA二级结构发生变化,自由能变小,稳定性随之增强;GDF5蛋白存在信号肽,成熟肽始于第19位氨基酸;同源模建预测得到的蛋白结构模型理想可靠。结果表明GDF5基因具有丰富的多态性,生物信息学结果可为进一步研究GDF5基因的作用机制和GDF5蛋白功能提供理论基础。 展开更多
关键词 gdf5基因 遗传多样性 生物信息学
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生长分化因子5 rs143383基因多态性与膝关节骨关节炎相关性的Meta分析
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作者 王月鹏 徐云峰 《中华老年骨科与康复电子杂志》 2023年第1期51-58,共8页
目的探究生长分化因子5(GDF5)rs143383基因多态性与膝关节骨性关节炎发生的相关性。方法检索建库至2022年1月1日已经发表的关于GDF5 rs143383基因多态性与膝关节骨性关节炎之间相关性的文献,检索数据库包括PubMed、Embase、Web of Scie... 目的探究生长分化因子5(GDF5)rs143383基因多态性与膝关节骨性关节炎发生的相关性。方法检索建库至2022年1月1日已经发表的关于GDF5 rs143383基因多态性与膝关节骨性关节炎之间相关性的文献,检索数据库包括PubMed、Embase、Web of Science、中国知网、万方和维普数据库等。依据检索策略检索,16篇文献(17项数据)符合纳入排除标准,从所需研究中提取数据后,确定优势比(OR)及其95%置信区间(CI)以评估。通过漏斗图评估发表偏差。结果GDF5(rs143383)基因多态性与膝关节骨性关节炎发生之间具有明显相关性。在总体的等位基因模型(T vs C:OR=1.20,95%CI:1.14,1.26,P<0.01)、共显基因模型(TT vs CC:OR=1.45,95%CI:1.30,1.62,P<0.01)和显性基因模型(TT+TC vs CC:OR=1.29,95%CI:1.17,1.43,P<0.01),均提示GDF5基因多态性与膝关节骨性关节炎的发生有明显相关性。此外,我们还根据种族进行亚组分型,通过亚组分析在亚洲人群以及高加索人群的等位基因模型(亚洲人群:T vs C:OR=1.22,95%CI:1.13,1.30,P<0.01;高加索人群:T vs C:OR=1.18,95%CI:1.10,1.26,P<0.01)、共显基因模型(亚洲人群:TT vs CC:OR=1.58,95%CI:1.33,1.88,P<0.01;高加索人群:TT vs CC:OR=1.37,95%CI:1.19,1.59,P<0.01)和显性基因模型(亚洲人群:TT+TC vs CC:OR=1.40,95%CI:1.18,1.65,P<0.01;高加索人群:TT+TC vs CC:OR=1.24,95%CI:1.08,1.42,P<0.01)中均观察到了GDF5 rs143383基因多态性与膝关节骨性关节炎发生显著的关联,然而在非洲人群中无明显关联。结论GDF5 rs143383基因多态性与膝关节骨性关节炎发生具有显著联系,尤其在亚洲人群和高加索人群中具有相关性。 展开更多
关键词 生长分化因子5 rs143383 基因多态性 膝关节骨性关节炎 META分析
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遗传因素和机械因素与膝骨性关节炎发病年龄的关系 被引量:7
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作者 季锦飞 戴进 +1 位作者 史冬泉 蒋青 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期672-674,共3页
目的 研究中国汉族人群膝骨性关节炎发病年龄与相关的易感基因和体重指数(body mass index,BMI)的关系.方法 临床选择膝骨性关节炎患者863例,年龄匹配的对照组999人,临床资料完整.应用TaqMan探针法和聚丙烯酰胺凝胶电泳法对转化生长因... 目的 研究中国汉族人群膝骨性关节炎发病年龄与相关的易感基因和体重指数(body mass index,BMI)的关系.方法 临床选择膝骨性关节炎患者863例,年龄匹配的对照组999人,临床资料完整.应用TaqMan探针法和聚丙烯酰胺凝胶电泳法对转化生长因子-5(growth differentiation factor 5,GDF5)5'非翻译区域的单核苷酸基因多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)(+104T/C;rs143383)、ASPN基因天冬氨酸(D)重复序列多态性进行基因分型,采用SPSS17.0统计软件进行计算,分析骨性关节炎患者发病年龄与易致病等位基因和BMI之间的关系.结果 膝骨性关节炎患者与年龄匹配对照组之间BMI差异有统计学意义(P<0.01),肥胖(BMI≥25)是膝骨性关节炎发病的高危因素(P<0.01);骨关节炎组随年龄增大BMI有增大的趋势,Pearson相关系数为0.15,P<0.01;为分析不同发病年龄阶段BMI分布的情况,膝骨性关节炎组及对照组按年龄35~70岁(5岁为一组)分组,发现骨关节炎组发病年龄早的患者BMI较发病年龄较晚者小,差异有统计学意义(F=2.497,P=0.011),而对照组内差异无统计学意义(F=0.786,P=0.56);TT(GDF5)和D14(ASPN)致病易感等位基因在膝骨性关节炎患者中年龄分布不同,较年轻发病患者易致病等位基因人群携带率明显高于较年长发病患者(P<0.05).结论 发病年龄较小的膝骨性关节炎患者受遗传因素作用更大,而发病年龄较大的患者机械因素起更重要作用. 展开更多
关键词 转化生长因子5基因 ASPN基因 发病年龄 体重指数 汉族人群
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