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题名GR6基因的结构特征以及在结直肠肿瘤中的表达
被引量:1
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作者
林洁
朱益民
来茂德
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机构
浙江大学医学院病理学与病理生理学系
浙江大学医学院公共卫生系
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出处
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
2004年第2期102-107,128,共7页
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基金
国家自然科学基金 (30 0 70 343)资助项目
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文摘
目的 :了解 GR6基因及其蛋白质产物 GR6假设蛋白的结构特征 ,以及 GR6基因在结直肠肿瘤中的表达改变。方法 :采用生物信息学的软件和数据库 ,分析 GR6基因的结构特点及其蛋白质产物 GR6假设蛋白的二级结构特征和功能特点等 ,并采用半定量逆转录 -聚合酶链反应 (RT- PCR)法 ,检测 39例结直肠癌组织和配对的远端切缘正常组织 ,以及 19例癌旁组织和 14例腺瘤组织中 GR6的转录表达水平。结果 :序列分析表明 ,GR6基因由 3个外显子组成 ,含有 4个 Cp G岛 ,编码产物为 14 9个氨基酸组成的 GR6假设蛋白。用生物信息学分析发现 ,GR6假设蛋白含有 1个蛋白激酶 C磷酸化位点 ,1个酪蛋白激酶 II磷酸化位点和 3个 N-肉豆蔻酸化位点及核定位信号 ,提示 GR6基因的表达产物可能是细胞核内的一种信号分子。m RNA水平上 ,GR6的转录表达水平从正常 -癌旁 -腺瘤 -腺癌逐步递减 ,其中 ,正常与腺瘤 (P<0 .0 5 )、正常与腺癌 (P<0 .0 1)的表达差异具有显著意义。结论 :GR6基因的表达产物即 GR6假设蛋白可能是细胞核内的一种信号分子。GR6基因在结直肠肿瘤中低表达 ,在结直肠肿瘤的发生、发展过程中可能起着重要的作用。
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关键词
结肠直肠肿瘤/病理学
基因表达
信息科学
gr6基因
生物信息学
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Keywords
Colorectal neoplasms/pathol
gene expression
Information science
gr6 gene
Bioinformatics
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分类号
R735.3
[医药卫生—肿瘤]
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