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基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义
被引量:
4
1
作者
王庆哲
张恩崇
宋永胜
《实用药物与临床》
CAS
2020年第1期14-20,共7页
目的综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因。方法BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因。对核...
目的综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因。方法BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因。对核心基因进行单基因GSEA分析以及COX回归分析。结果3类药材共同靶向基因180个,其中在TCGA数据库前列腺肿瘤组织与正常组织间差异表达的基因有11个。Cytoscape中筛选出候选差异基因PTGS2、GRIN3A、CACNA1D。生存分析显示,仅GRIN3A与患者不良预后相关。单基因GSEA提示,GRIN3A相关的生物学活动对前列腺癌的发生发展具有促进作用。单因素及多因素COX回归提示,GRIN3A为疾病的独立预后因素。结论GRIN3A在枸杞、姜黄、甘草对前列腺癌的治疗机制中发挥重要作用,该基因具有成为前列腺癌靶向治疗位点的潜能。
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关键词
grin3a
基因
前列腺癌
中药
TCGA
BATMAN-TCM
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职称材料
GRIN3A基因多态性与川崎病的相关性分析
被引量:
3
2
作者
金向群
熊志
+2 位作者
祝莹
童丽娜
王立琼
《临床儿科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期605-608,共4页
目的探讨中国中部地区汉族人群中GRIN3A基因的单核苷酸多态性(SNP)位点rs7849782多态性与川崎病(KD)临床特点的相关性。方法采取病例对照研究方法,分别选取191例KD患儿和217例同时期体检正常儿童作为研究对象。利用PCR-RFLP方法测定...
目的探讨中国中部地区汉族人群中GRIN3A基因的单核苷酸多态性(SNP)位点rs7849782多态性与川崎病(KD)临床特点的相关性。方法采取病例对照研究方法,分别选取191例KD患儿和217例同时期体检正常儿童作为研究对象。利用PCR-RFLP方法测定SNP位点多态性分布;超声心动图检测动脉损伤。结果 KD患儿与对照儿童SNP位点(rs7849782)三种基因型(CC、CG、GG)的分布差异有统计学意义(P=0.034),且C等位基因频率的差异亦存在统计学意义(P=0.007),C为风险因子(OR=1.46,95%CI:1.10-1.92)。KD患儿中该SNP位点的多态性与口腔黏膜病变以及冠状动脉损伤显著相关(P〈0.05),但与结膜充血、皮疹、手足水肿以及淋巴结肿大、触痛等无相关性(P〉0.05);该位点的多态性与患者的血沉以及C反应蛋白(CRP)水平相关(P〈0.05)。结论 GRIN3A基因SNP位点(rs7849782)多态性与KD的易感性相关,C等位基因为风险因子;且该SNP位点可能与KD患儿的口腔黏膜以及冠状动脉损伤等特征相关,并可能影响血沉以及CRP水平。
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关键词
川崎病
grin3a
基因
多态性
临床特征
儿童
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职称材料
题名
基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义
被引量:
4
1
作者
王庆哲
张恩崇
宋永胜
机构
盘锦市人民医院泌尿外科
中国医科大学附属盛京医院泌尿外科
出处
《实用药物与临床》
CAS
2020年第1期14-20,共7页
文摘
目的综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因。方法BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因。对核心基因进行单基因GSEA分析以及COX回归分析。结果3类药材共同靶向基因180个,其中在TCGA数据库前列腺肿瘤组织与正常组织间差异表达的基因有11个。Cytoscape中筛选出候选差异基因PTGS2、GRIN3A、CACNA1D。生存分析显示,仅GRIN3A与患者不良预后相关。单基因GSEA提示,GRIN3A相关的生物学活动对前列腺癌的发生发展具有促进作用。单因素及多因素COX回归提示,GRIN3A为疾病的独立预后因素。结论GRIN3A在枸杞、姜黄、甘草对前列腺癌的治疗机制中发挥重要作用,该基因具有成为前列腺癌靶向治疗位点的潜能。
关键词
grin3a
基因
前列腺癌
中药
TCGA
BATMAN-TCM
Keywords
grin3a gene
Prostate cancer
Traditional Chinese medicine(TCM)
TCGA
BATMAN-TCM
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
GRIN3A基因多态性与川崎病的相关性分析
被引量:
3
2
作者
金向群
熊志
祝莹
童丽娜
王立琼
机构
咸宁市中心医院儿内科
出处
《临床儿科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期605-608,共4页
文摘
目的探讨中国中部地区汉族人群中GRIN3A基因的单核苷酸多态性(SNP)位点rs7849782多态性与川崎病(KD)临床特点的相关性。方法采取病例对照研究方法,分别选取191例KD患儿和217例同时期体检正常儿童作为研究对象。利用PCR-RFLP方法测定SNP位点多态性分布;超声心动图检测动脉损伤。结果 KD患儿与对照儿童SNP位点(rs7849782)三种基因型(CC、CG、GG)的分布差异有统计学意义(P=0.034),且C等位基因频率的差异亦存在统计学意义(P=0.007),C为风险因子(OR=1.46,95%CI:1.10-1.92)。KD患儿中该SNP位点的多态性与口腔黏膜病变以及冠状动脉损伤显著相关(P〈0.05),但与结膜充血、皮疹、手足水肿以及淋巴结肿大、触痛等无相关性(P〉0.05);该位点的多态性与患者的血沉以及C反应蛋白(CRP)水平相关(P〈0.05)。结论 GRIN3A基因SNP位点(rs7849782)多态性与KD的易感性相关,C等位基因为风险因子;且该SNP位点可能与KD患儿的口腔黏膜以及冠状动脉损伤等特征相关,并可能影响血沉以及CRP水平。
关键词
川崎病
grin3a
基因
多态性
临床特征
儿童
Keywords
Kawasaki disease
grin3a gene
polymorphism
clinical characteristic
child
分类号
R725.4 [医药卫生—儿科]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义
王庆哲
张恩崇
宋永胜
《实用药物与临床》
CAS
2020
4
下载PDF
职称材料
2
GRIN3A基因多态性与川崎病的相关性分析
金向群
熊志
祝莹
童丽娜
王立琼
《临床儿科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
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职称材料
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