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草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析
被引量:
6
1
作者
刘小献
白俊杰
+3 位作者
徐磊
于凌云
樊佳佳
韩林强
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期753-758,共6页
根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了...
根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了多态位点在群体中的分布:C+129T位点CC型占0.69%,TC型占8.75%,TT型占80.56%;C+192T位点CC型占25.4%,TC型占48.6%,TT型占26.1%。利用一般线性模型将SNPs与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,C+129T位点TT型个体6个生长性状均值比TC型高(P>0.05);C+192T位点TT型个体体质量均值高于TC型和CC型个体(P<0.05)。双倍型关联分析表明D1型个体的体质量均值明显高于D3型和D6型(P<0.05),因而可以考虑将GSTR基因作为影响草鱼体质量等生长性状的候选基因,应用于草鱼分子辅助育种。
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关键词
草鱼
SNPS
谷胱甘肽硫转移酶
rho型谷胱甘肽硫转移酶基因
多态性
生长
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职称材料
题名
草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析
被引量:
6
1
作者
刘小献
白俊杰
徐磊
于凌云
樊佳佳
韩林强
机构
中国水产科学研究院珠江水产研究所/中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室
大连海洋大学生命科学与技术学院
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期753-758,共6页
基金
现代农业产业技术体系建设专项(Nycytx-49-07)
文摘
根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了多态位点在群体中的分布:C+129T位点CC型占0.69%,TC型占8.75%,TT型占80.56%;C+192T位点CC型占25.4%,TC型占48.6%,TT型占26.1%。利用一般线性模型将SNPs与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,C+129T位点TT型个体6个生长性状均值比TC型高(P>0.05);C+192T位点TT型个体体质量均值高于TC型和CC型个体(P<0.05)。双倍型关联分析表明D1型个体的体质量均值明显高于D3型和D6型(P<0.05),因而可以考虑将GSTR基因作为影响草鱼体质量等生长性状的候选基因,应用于草鱼分子辅助育种。
关键词
草鱼
SNPS
谷胱甘肽硫转移酶
rho型谷胱甘肽硫转移酶基因
多态性
生长
Keywords
grass carp
SNPs
gluthione S-transferase
gstr
polymorphisms
growth
分类号
Q959.468 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草鱼GSTR基因外显子1、外显子2的SNPs筛选及其与生长性状的关联分析
刘小献
白俊杰
徐磊
于凌云
樊佳佳
韩林强
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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