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致儿童咽扁桃体炎酿脓链球菌emm分型 被引量:16
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作者 梁云梅 常贺生 +6 位作者 沈叙庄 黄国英 郑跃杰 符洲 俞桑洁 袁林 杨永弘 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期382-385,共4页
目的分析导致儿童咽扁桃体炎的酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes),即A族β溶血性链球菌(group A streptococcus,GAS)的emm分型。方法 2007年1—12月共获取119株GAS,分别来自于重庆(42株)、深圳(30株)和上海(47株)3个地区。应用多聚合... 目的分析导致儿童咽扁桃体炎的酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes),即A族β溶血性链球菌(group A streptococcus,GAS)的emm分型。方法 2007年1—12月共获取119株GAS,分别来自于重庆(42株)、深圳(30株)和上海(47株)3个地区。应用多聚合酶链反应(PCR)扩增编码成熟M蛋白基因(emm基因)。对PCR扩增后的emm基因产物进行测序,并将所测得的emm基因序列提交到相关网站,获取emm分型结果。结果共有13种emm型GAS可导致儿童发生咽扁桃体炎:emm1.0(24.37%),emm3.1(0.83%),emm4.0(0.83%),emm6.5(1.68%),emm12.0(55.46%),emm22.0(10.08%),emm63.0(0.83%),emm77.0(0.83%),emm80.0(0.83%),emm102.2(1.68%),emm104.0(0.83%),st1815.0(0.83%)和stG485.0(0.83%)。重庆地区可见10种emm分型:emm1.0(11.90%),emm3.1(2.38%),emm6.5(4.76%),emm12.0(61.90%),emm22.0(4.76%),emm63.0(2.38%),emm80.0(2.38%),emm102.2(4.76%),st1815.0(2.38%)和stG485.0(2.38%)。深圳地区可见5种emm分型:emm1.0(16.67%),emm12.0(50.00%),emm22.0(26.67%),emm77.0(3.33%)和emm104.0(3.33%)。上海地区可见4种emm分型:emm1.0(40.42%),emm4.0(2.13%),emm12.0(53.19%)和emm22.0(4.26%)。结论 emm1.0、emm12.0和emm22.0克隆流行菌株是最常见的导致重庆、深圳和上海3地区儿童发生咽扁桃体炎的酿脓链球菌。3地区导致儿童发生咽扁桃体炎的克隆流行菌株存在差别。 展开更多
关键词 酿脓链球菌 咽扁桃体炎 emm基因
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猩红热患儿A族链球菌emm基因分型及地域与毒力基因分布相关研究 被引量:5
2
作者 禹定乐 梁云梅 +5 位作者 卢清华 马耀玲 沈叙庄 王传清 郑跃杰 杨永弘 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期55-61,共7页
目的探讨猩红热儿童分离来源的A族链球菌(GAS)emm分型、地域与毒力基因分布的相关性。方法采集北京和上海地区猩红热患儿标本进行GAS分离鉴定,应用聚合酶链式反应(PCR)方法检测emm基因型以及13种毒力基因(speA、speB、speC、speF、speG... 目的探讨猩红热儿童分离来源的A族链球菌(GAS)emm分型、地域与毒力基因分布的相关性。方法采集北京和上海地区猩红热患儿标本进行GAS分离鉴定,应用聚合酶链式反应(PCR)方法检测emm基因型以及13种毒力基因(speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、ssa和smeZ)携带情况,分析GAS菌株毒力基因分布与地域、emm基因型的关系。结果114株GAS分离株中,emm1.0型60株,emm12.0型54株;52株分离自北京(emm1.0型31株,emm12.0型21株),62株分离自上海(emm1.0型29株,emm12.0型33株)。speA、speC、speG、speH、speI、speJ、speK、ssa和smeZ基因携带率分别为52.6%、76.3%、80.7%、43.9%、55.3%、57.0%、75.4%、97.4%、93.0%,speB和speF携带率均为98.2%,未检出speL、speM基因。北京地区emm1.0型与emm12.0 GAS菌株speA、speH、speI和speJ基因携带率比较,上海地区emm1.0型与emm12.0 GAS菌株speA、speH、speI、speJ和speK基因携带率比较,差异均有统计学意义(均P<0.05)。emm1.0型GAS菌株speC、speH、speJ和speK基因携带率北京与上海两地区比较,差异均有统计学意义(均P<0.05),emm12.0型GAS菌株speC、speH、speI、speJ和speK基因北京与上海两地区比较,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论GAS菌株毒力基因的分布状态因emm基因分型及地域不同存在差异。 展开更多
关键词 猩红热 A族链球菌 emm基因分型 地域 超抗原
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北京地区儿童A组链球菌感染临床分离株的emm分型研究 被引量:2
3
作者 刘医萌 杨鹏 +6 位作者 吴双胜 潘阳 卢桂兰 张代涛 石伟先 王全意 彭晓旻 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第24期3368-3370,共3页
目的了解2015年北京地区分离自呼吸道感染患儿的A组链球菌(GAS)emm型别分布情况。方法采集2015年5月至7月北京市16个区16家医院儿科门、急诊临床猩红热病例和咽部感染病例咽拭子标本分离的GAS菌株。应用PCR扩增联合基因测序技术,测定em... 目的了解2015年北京地区分离自呼吸道感染患儿的A组链球菌(GAS)emm型别分布情况。方法采集2015年5月至7月北京市16个区16家医院儿科门、急诊临床猩红热病例和咽部感染病例咽拭子标本分离的GAS菌株。应用PCR扩增联合基因测序技术,测定emm型别,并比较不同特征组间的emm基因型别差异。结果从各区医院采集的咽拭子标本中分离247株GAS菌株。其中来自猩红热患儿73株(29.6%,73/247),咽部感染患儿174株(70.4%,174/247)。共检测到6种emm基因型,emm12占53.4%(132/247),emm1占44.1%(109/247),其他型别(emm22、emm75、emm131、emm241)占2.5%(6/247)。emm型别的分布在不同年龄组间存在差异,且差异有统计学意义(P<0.05),emm1在6~12岁年龄组中的构成比较高,emm12在1~5岁组中构成比较高。emm型别在地区、性别、疾病类型间差异无统计学意义(P>0.05)。结论 2015年北京地区儿童A组链球菌的emm基因型中,主要的流行型别为emm12和emm1,其分布不同年龄组间存在差异。 展开更多
关键词 A组链球菌 emm基因 猩红热 儿童
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广州市儿童致咽炎β溶血性链球菌的流行情况及其emm基因分型 被引量:8
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作者 丁月霞 倪琼琼 刘金来 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期411-414,共4页
【目的】了解近期广州市儿童致咽炎β溶血性链球菌(BHS)的流行情况及其emm基因分型。【方法】对我院儿科门急诊1190例急性咽扁桃体炎的患儿进行咽拭子培养。鉴定为BHS者包括A、B、C和G组溶血性链球菌(groupA、B、C、Gstreptococcal,GAS... 【目的】了解近期广州市儿童致咽炎β溶血性链球菌(BHS)的流行情况及其emm基因分型。【方法】对我院儿科门急诊1190例急性咽扁桃体炎的患儿进行咽拭子培养。鉴定为BHS者包括A、B、C和G组溶血性链球菌(groupA、B、C、Gstreptococcal,GAS、GBS、GCS和GGS)进行细菌组DNA的提取;通过PCR扩增emm基因并测序;其结果与NCBI和CDCHome中已知的基因序列进行同源性比对大于95%则认为是同型菌株,藉此确定其分型。【结果】在1190例符合条件的患儿咽拭子标本中[男:678例,(6.96±2.73)岁;女:512例,(6.70±2.60)岁],鉴定为BHS的共有46例(3.87%)。其中GAS、GBS、GCS和GGS分别有4例、20例、2例和20例,分别占BHS约8.7%、43.5%、4.3%和43.5%;而GAS、GBS、GCS和GGS的阳性率分别约为0.37%、1.68%、0.17%和1.68%。男患儿BHS的阳性率约为5.01%,女患儿约为2.34%,两组比较(χ2=26.431,P<0.001)有统计学意义。除了GBS外,其他BHS(GAS、GC/GS)均有emm基因表达(1000~1500bp)。经测序共有15型emm,其中4株GAS分别表达emm1和emm12(7.69%)。【结论】致咽炎GAS阳性率低于0.5%,而GBS、GGS阳性率接近2%。但GBS无emm表达,GAS表达emm1和emm12,而GCS、GGS无明确的emm优势型。 展开更多
关键词 Β溶血性链球菌 急性咽扁桃体炎 emm基因
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儿童A群链球菌感染的耐药性分析及其emm基因分型 被引量:3
5
作者 谢永强 陈兆鸿 +1 位作者 邓秋连 万根平 《中国儿童保健杂志》 CAS 2008年第4期389-390,共2页
【目的】了解广州地区儿童感染A群链球菌(GAS)的耐药情况及emm基因分型。【方法】对所分离的GAS以K-B法进行药敏试验并分析耐药情况;采用PCR法扩增GAS的M蛋白N末端,直接进行测序确定GAS的emm基因分型。【结果】GAS对青霉素、阿莫西林/... 【目的】了解广州地区儿童感染A群链球菌(GAS)的耐药情况及emm基因分型。【方法】对所分离的GAS以K-B法进行药敏试验并分析耐药情况;采用PCR法扩增GAS的M蛋白N末端,直接进行测序确定GAS的emm基因分型。【结果】GAS对青霉素、阿莫西林/棒酸、氧氟沙星、头孢菌素和万古霉素敏感,对红霉素、克林霉素、复方新诺明、四环素和氯霉素的耐药率分别为47.1%、42.5%、33.3%、21.8%、18.4%。以emm1基因型为主(37.9%),其次为emm18(13.8%),emm12(11.5%),emm69(9.2%)等。【结论】广州地区儿童感染GAS对大环内酯类等抗菌药物耐药形势严峻,应引起重视;GAS的emm基因型主要为emm1,选择主要流行菌株,可以作为基因疫苗的基础。 展开更多
关键词 A群链球菌 耐药率 emm基因 基因分型
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广东省新兴地区儿童致病性A组链球菌emm基因测序分型的研究 被引量:7
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作者 黎国强 谭志伟 +2 位作者 李云 董太明 欧国生 《国际医药卫生导报》 2009年第24期1-3,共3页
目的了解新兴地区儿童感染A群链球茵(GAS)emm基因型的分布状况。方法收集本院门诊和住院的呼吸道感染、皮肤化脓感染、风湿热、猩红热患儿咽拭子和皮肤感染伤口分泌物进行培养,并采用PCR法扩增GAS的M蛋白N末端,进行测序,确定GAS的emm基... 目的了解新兴地区儿童感染A群链球茵(GAS)emm基因型的分布状况。方法收集本院门诊和住院的呼吸道感染、皮肤化脓感染、风湿热、猩红热患儿咽拭子和皮肤感染伤口分泌物进行培养,并采用PCR法扩增GAS的M蛋白N末端,进行测序,确定GAS的emm基因分型。结果共分离鉴定出GAS 98株,GAS感染引起的咽炎、扁桃体炎、脓皮病在学龄前儿童和学龄儿童中发病率较高;98株GAS的emm基因型以emml(35.7%)、emm18(13.3%)、emm12(9.2%)多见。结论学龄前儿童和学龄儿童感染GAS发病率无年龄差异(P>0.05)。新兴地区A群链球菌emm基因分型主导型为emml、emm18等菌型,可初步认定它们是主要流行菌株,作为合适本地的基因疫苗的基础。 展开更多
关键词 A组链球茵 emm基因分型 研究
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脓疱病儿童A族链球菌 emm分型、毒力基因及菌株分离部位相关性研究
7
作者 禹定乐 梁云梅 +7 位作者 卢清华 纪丽丽 常贺生 张霞 刘小荣 马琳 郑跃杰 杨永弘 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期59-64,共6页
目的探讨A族链球菌(GAS)emm基因型、毒力基因及菌株分离部位之间的关系。方法回顾性研究。采集2006年至2008年就诊首都医科大学附属北京儿童医院的脓疱病患儿标本进行GAS分离鉴定, 从16例脓疱病患儿中共分离出24株GAS菌株, 其中7对菌株... 目的探讨A族链球菌(GAS)emm基因型、毒力基因及菌株分离部位之间的关系。方法回顾性研究。采集2006年至2008年就诊首都医科大学附属北京儿童医院的脓疱病患儿标本进行GAS分离鉴定, 从16例脓疱病患儿中共分离出24株GAS菌株, 其中7对菌株分别分离自7例患儿的咽喉和皮肤, 1对菌株分离自1例患儿的外阴和皮肤, 其余8株GAS分离自8例患儿的皮肤脓液样本。应用聚合酶链反应方法检测emm基因型及携带13种毒力基因(speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、smeZ和ssa)情况, 对GAS菌株emm基因型、毒力基因及分离部位的关系进行分析。结果本研究检测出4种emm基因型[emm1.0(15/24)、emm12.0(4/24)、emm22.0(2/24)、emm160.0(1/24)]及1种亚基因型[emm12.19(2/24)]。13种毒力基因speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、smeZ及ssa的携带率分别为58.3%、100%、91.7%、100%、50.0%、12.5%、54.2%、66.7%、16.7%、25.0%、12.5%、100%和91.7%。所有菌株均携带5~11种毒力基因, 并全部携带speB、speF及smeZ。在不同emm基因型的菌株中, speA与speJ的携带率比较, 差异均有统计学意义(均P<0.05)。在皮肤来源菌株和咽喉来源菌株之间, 包含5个emm1.0型配对的菌株, 其毒力基因分布比较, 差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论脓疱病儿童GAS的毒力基因分布与emm基因型密切相关, 但与分离部位无关。 展开更多
关键词 脓疱病 A族链球菌 emm基因分型 毒力基因 超抗原
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深圳地区儿童A群致病性链球菌感染流行现状及M蛋白基因分型分析 被引量:8
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作者 肖海军 殷晓晴 +1 位作者 张慧莲 刘芹兰 《现代检验医学杂志》 CAS 2016年第6期51-54,共4页
目的:了解深圳地区儿童 A群致病性链球菌(group A streptococcus,GAS)感染流行现状及其 M蛋白基因(emm)分布状况,为该区GAS疫苗的研制提供科学依据。方法收集2014年3月~2015年12月来医院门诊和住院部就诊的急性咽炎、急性化脓... 目的:了解深圳地区儿童 A群致病性链球菌(group A streptococcus,GAS)感染流行现状及其 M蛋白基因(emm)分布状况,为该区GAS疫苗的研制提供科学依据。方法收集2014年3月~2015年12月来医院门诊和住院部就诊的急性咽炎、急性化脓性扁桃体炎、风湿热及猩红热患儿的咽拭子及皮肤化脓性感染伤口分泌物共1634例,分别对标本进行细胞培养与鉴定,分析不同年龄儿童 GAS感染流行情况,并对 GAS的 M蛋白 N末端进行 PCR扩增测序,分析 GAS的emm基因分型及其在疾病中的分布情况。结果1634例标本中共分离鉴定出61株 GAS,检出率为3.73%(61/1634),其中学龄前和学龄儿童分别检测出14株和47株,检出率分别为22.95%(14/61)和77.05%(47/61),学龄儿童 GAS感染率明显高于学龄前儿童,两者结果之间差异有统计学意义(χ2=32.035,P<0.01),但学龄儿童不同年龄段 GAS感染率之间比较差异无统计学意义(χ2=1.572,P>0.05);GAS 在急性咽炎和化脓性扁桃体炎的患儿中检出率最高,分别为34.43%(21/61)和27.87%(17/61);61株 GAS的 emm基因型以 emml 和 emm12最为多见,分别占40.98%(25/61)和29.51%(18/61)。结论深圳地区学龄儿童 GAS感染率明显高于学龄前儿童,且以急性咽炎和急性化脓性扁桃体炎患儿检出率最高。61株 GAS感染的 emm基因以emm1和emm12为主,因此,各地加强GAS的emm基因分型研究,可为该区GAS疫苗的研制提供重要的分子流行病学依据。 展开更多
关键词 儿童 A群链球菌 流行 emm基因 分析
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化脓链球菌致中毒性休克综合征临床分析 被引量:1
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作者 宁兴旺 朱惠斌 +2 位作者 钱纯 邓兰平 谢小兵 《检验医学与临床》 CAS 2017年第23期3444-3446,共3页
目的了解化脓链球菌致中毒性休克综合征(STSS)的实验室检查特征,为临床诊治和流行病学调查提供参考依据。方法回顾性分析1例化脓链球菌感染致STSS患者的临床诊治经过和实验室检查数据,对分离株进行emm基因分型,并检测其常见超抗原基因... 目的了解化脓链球菌致中毒性休克综合征(STSS)的实验室检查特征,为临床诊治和流行病学调查提供参考依据。方法回顾性分析1例化脓链球菌感染致STSS患者的临床诊治经过和实验室检查数据,对分离株进行emm基因分型,并检测其常见超抗原基因。结果该患者因左脚趾皮肤溃破致左下肢严重感染,并伴多器官功能衰竭及STSS。伤口分泌物分离出化脓链球菌,对青霉素敏感。分离株为emm 1.1型,携带speA、speC、spek、ssa和smeZ等5种超抗原基因。临床采取清创、负压封闭引流技术(VSD)和青霉素联合克林霉素抗感染等综合治疗,患者痊愈出院。结论化脓链球菌致STSS可引起严重的临床症状,与其携带多种超抗原基因有关。外科治疗和有效抗感染是保证治疗成功的关键。 展开更多
关键词 化脓链球菌 中毒性休克综合征 emm基因 超抗原
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A组链球菌M蛋白重组多肽原核表达载体构建及融合蛋白的表达 被引量:2
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作者 丁月霞 倪琼琼 刘金来 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期29-34,共6页
目的:设计针对A组β溶血性链球菌M1和M12蛋白的复合多肽;构建含M蛋白基因(emm基因)1型和12型特异性抗原决定簇基因及其保守区J14肽基因的GST标签的重组表达载体;并诱导和优化GST融合蛋白的表达。方法:在NCBI Genebank和Oligo 6引物设计... 目的:设计针对A组β溶血性链球菌M1和M12蛋白的复合多肽;构建含M蛋白基因(emm基因)1型和12型特异性抗原决定簇基因及其保守区J14肽基因的GST标签的重组表达载体;并诱导和优化GST融合蛋白的表达。方法:在NCBI Genebank和Oligo 6引物设计软件中选择分别编码M蛋白emm基因1型和12型信号肽后35个氨基酸及其相同的保守区14肽基因序列(全长270 bp),通过重叠PCR(Overlap PCR)合成所需的核苷酸序列,经测序确定序列完全和设计的相匹配后,将该重组片段克隆到pGEX-4T-1表达载体中,阳性克隆经双酶切和测序鉴定正确后建立稳定表达该重组质粒的大肠杆菌BL21株系(pE/B);通过聚丙烯酰胺凝胶的考马斯亮蓝染色和Western blot来检测在不同时间(0、2、6、8、18和24小时)和温度(25℃、30℃和37℃)以及不同浓度(0.01、0.1、1 mmol/L)异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导GST融合蛋白(GST/emm)表达情况,并对诱导表达的GST/emm切胶进行质谱分析鉴定。结果:成功构建含有emm1和emm12抗原决定簇及M蛋白保守区J14肽基因的原核表达载体;并诱导其稳定表达,在1 mol/L IPTG诱导6~8小时达高峰,不同温度下均有过量表达;质谱检测诱导蛋白GST/emm条带结果正确。结论:成功构建A组β溶血性链球菌的emm1型和emm12型原核表达载体,并稳定诱导GST/emm表达,为下一步研究GST/emm的纯化、酶切以及免疫原性的鉴定和疫苗研制打下夯实的基础。 展开更多
关键词 A组β溶血性链球菌 emm基因 M蛋白 GST融合蛋白
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A组链球菌M蛋白二价DNA疫苗表达载体的构建与鉴定
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作者 苏健 董太明 +3 位作者 陈志红 陈剑光 吴红穗 单志新 《岭南心血管病杂志》 2006年第1期55-57,共3页
目的构建含A组链球菌M蛋白基因(emm基因)1型和3型特异性抗原决定簇基因的重组质粒。方法用PCR技术从40381137(T1)型和31281187(T3)型A组链球菌中分别扩增emm基因,插入T 载体后测序、blast后分别确定为emm1和emm3基因型,再从emm1和emm3... 目的构建含A组链球菌M蛋白基因(emm基因)1型和3型特异性抗原决定簇基因的重组质粒。方法用PCR技术从40381137(T1)型和31281187(T3)型A组链球菌中分别扩增emm基因,插入T 载体后测序、blast后分别确定为emm1和emm3基因型,再从emm1和emm3基因分别扩增105 bp目的基因,用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术将两目的片段连接起来。插入真核表达载体 pSecTaqB中,阳性质粒克隆经酶切和测序鉴定。结果从40381137(T1)和31281187(T3)A组链球菌株的基因组成功克隆emm基因,经测序及blast后分别确认为emm1型和emm3型;用pst I和BamH I酶切重组质粒pSemml-3、测序均显示插入正确。结论成功构建A组莲球菌的emm1型和emm3型二价真核表达载体,为下一步研究表达功能及表达蛋白的生物活性打下基础。 展开更多
关键词 A组链球菌 emm基因 DNA 疫苗
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MALDI-TOF质谱技术在化脓性链球菌鉴定和分型中的应用
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作者 邱军岭 秦娟秀 +1 位作者 杨俊 张灏旻 《检验医学与临床》 CAS 2018年第A01期88-90,共3页
目的 以基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术用于化脓性链球菌的快速鉴定,并利用主成分聚类分析构建树状图区分不同emm分型的化脓性链球菌菌株,探索MALDI-TOF MS方法对化脓性链球菌菌株鉴定和分型的可行性。方法 复苏... 目的 以基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术用于化脓性链球菌的快速鉴定,并利用主成分聚类分析构建树状图区分不同emm分型的化脓性链球菌菌株,探索MALDI-TOF MS方法对化脓性链球菌菌株鉴定和分型的可行性。方法 复苏临床分离到的49株化脓性链球菌,使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱,用biotyper软件进行菌种鉴定,利用主成分(PCA)聚类分析构建树状图(Dendrogram)对菌株分型,同时应用PCR扩增emm基因,测序确定化脓性链球菌的emm基因型别,将主成分聚类分析结果与化脓性链球菌emm分型结果比对。结果 MALDI-TOF MS方法鉴定结果均为化脓性链球菌,与传统方法鉴定结果均符合。emm基因测序结果显示49株化脓性链球菌中emm1为13株,emm12型为36株。通过对各菌株蛋白质质量图谱进行主成分聚类分析,在相对距离为1.1的情况下,分为A组(13株emm1型)和B组(36株emm12型),与测序结果一致。通过ClinproTools软件对A组和B组化脓性链球菌质谱图分析,有5个离子峰作为其分型的主要依据,分别是在5 545.89、6 912.47、6 898.61、5 518.51和2 978.02(m/z)离子质荷比处。结论 实验室可使用已知分型的菌株使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱并构建相应分型质谱图库,将待测菌株图谱与图库进行主成分聚类分析,通过构建树状图,可快速对化脓性链球菌emm进行分型。 展开更多
关键词 化脓性链球菌 MALDI-TOF MS emm基因
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应用emm基因序列分析对104株A群链球菌分型 被引量:13
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作者 陈志红 龚守芳 +4 位作者 董太明 苏健 吴红穗 陈剑光 朱振宇 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期489-491,共3页
目的 通过emm基因序列分析对A群链球菌 (GAS)进行分型 ,探讨T型与emm型的对应关系。方法 用引物以PCR法扩增GASM蛋白的N末端并进行测序 ,确定GAS的emm型 ,并与T分型对照比较。结果  (1) 10 4株菌株中 ,emm1所占比例最大 ,为 2 9.8% ... 目的 通过emm基因序列分析对A群链球菌 (GAS)进行分型 ,探讨T型与emm型的对应关系。方法 用引物以PCR法扩增GASM蛋白的N末端并进行测序 ,确定GAS的emm型 ,并与T分型对照比较。结果  (1) 10 4株菌株中 ,emm1所占比例最大 ,为 2 9.8% ,然后依次是emm18(9.6 % ) ,emm12 (7.7% ) ,和emm6 9(5 .8% )等。 (2 )T1、T12和T14 4 9与emm基因对应关系好 ,T116株全部对应emm1型 (10 0 % ) ,T12对应emm12 ,符合率 83.3% ,T14 4 92株均对应emm4 9型 ;其它菌型对应关系差 ;同一T型可对应数个emm基因型 ,同一emm基因型可对应不同的T型。 (3)发现 1株新的emm型菌株 ,序列已递交GenBank ,注册号为AY3472 5 9。结论 emm基因分型方法具有准确、快速、分辨力高的优点 ;我国部分地区A群链球菌emm基因分型主导型为emm1、18、12、6 9、110等菌型。 展开更多
关键词 emm基因序列 A群链球菌 cmm型 基因分型 血清型
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北京地区2011-2014年致儿童猩红热A组链球菌emm基因型别变化特征分析 被引量:27
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作者 彭晓旻 杨鹏 +8 位作者 吴双胜 卢桂兰 石伟先 赵佳琛 崔淑娟 张代涛 潘阳 郭靖 王全意 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1397-1400,共4页
目的 了解北京地区致儿童猩红热A组链球菌(GAS)emm基因型别分布,并探讨其型别变化与猩红热病例的关系.方法 收集2011-2014年5-7月北京市36家医院临床诊断为猩红热病例咽拭子GAS分离菌株,采用PCR联合测序方法对分离菌株进行emm分型,选... 目的 了解北京地区致儿童猩红热A组链球菌(GAS)emm基因型别分布,并探讨其型别变化与猩红热病例的关系.方法 收集2011-2014年5-7月北京市36家医院临床诊断为猩红热病例咽拭子GAS分离菌株,采用PCR联合测序方法对分离菌株进行emm分型,选取中国疾病监测信息报告管理系统中北京市猩红热病例报告数据进行分析.结果 共采集咽拭子标本2 161份,分离GAS菌株762株,阳性率为35.3%(762/2161).检测到7个emm型别,其中emm12型占69.4% (529/762),emm1型占29.8% (227/762),其他5种emm型别(11、22、75、89、128)占0.8%(6/762).分析各年份emm型别构成比:2011年emm12型82.2% (295/359),emm1型16.7% (60/359),其他型(11、22、89)1.1%(4/359);2012年emm12型77.3%(123/163),emm1型23.9%(39/163),emm75型0.6%(1/163);2013年emm12型50.7% (38/75),emm1型49.3%(37/75);2014年emm12型44.2%(73/165),emm1型55.2%(91/165),emm128型0.6%(1/165).不同年份emm型别构成比变化的差异有统计学意义(P<0.001).2011、2012年emm12为主导菌型,2014年主导型别转换为emm1型.2011-2014年报告猩红热病例分别为6 152、2 908、2 048和3 918例,以2011年报告例数最多,2014年比2013年报告病例数增加91.31%.2011年GAS分离株emm型别存在年龄差异,其中1~5岁组分离的emm12型高于>5岁组(P<0.05).2011、2013年分离GAS菌株存在地区差异,2011年emm1型分离株为城区高于郊区(P<0.05),2013年emm1型为郊区高于城区(P<0.05).结论 2011-2014年北京地区GAS菌株优势菌型为emm12和emm1型;不同年份emm12、emm1变换成为主导菌型;emm主导菌型变化与猩红热病例变化趋势有关. 展开更多
关键词 猩红热 A组链球菌 emm基因 儿童
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2011年-2013年北京市西城区儿童A组溶血性链球菌的emm基因分型 被引量:9
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作者 崔京辉 苗元 +3 位作者 胡晓芬 靳博 吉彦丽 李达 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第14期2048-2050,2056,共4页
目的了解2011年-2013年北京市西城区儿童携带A组溶血性链球菌(GAS)的M蛋白基因(emm)各基因型别分布情况。方法于2011年-2013年每年5月-7月,从北京市西城区辖区内两家医院采集猩红热或咽峡炎及扁桃体炎儿童患者的咽拭子,培养分离获得121... 目的了解2011年-2013年北京市西城区儿童携带A组溶血性链球菌(GAS)的M蛋白基因(emm)各基因型别分布情况。方法于2011年-2013年每年5月-7月,从北京市西城区辖区内两家医院采集猩红热或咽峡炎及扁桃体炎儿童患者的咽拭子,培养分离获得121株GAS,提取DNA,应用PCR扩增emm基因,进行测序,确定GAS的emm基因型别,并比较不同年度、不同人群、不同诊断病例来源标本基因型别的差异。结果 3年间121份GAS标本中共检测出了3个基因型分别为emm1、emm12、emm75,emm1为24株,emm12为96株,emm75为1株。检出了10个基因亚型,分别为emm12.0、emm12.1、emm12.19、emm12.29、emm12.30、emm12.38、emm1.0、emm1.33、emm1.76、emm75.0。结论2011年-2013年间北京市西城区儿童携带GAS的emm基因型别中,主要流行的基因型是emm12和emm1,主要流行的基因亚型是emm12.0和emm1.0,且emm1.0有逐年增多的趋势。emm基因型目前在北京西城区人群分布上在性别、年龄、病例诊断类型上无差异。仅在北京市和外省市人群中emm12和emm1的分布有差异(P<0.05)。 展开更多
关键词 猩红热 A组溶血性链球菌(GAS) emm基因
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北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌emm基因分型及耐药基因分析 被引量:7
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作者 王兆娥 封会茹 +2 位作者 余红 汤旭 董晓根 《公共卫生与预防医学》 2015年第5期22-24,共3页
目的了解北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌(GAS)的基因分型及对红霉素耐药基因谱的特点。方法用猩红热、扁桃体炎或咽峡炎患者的咽拭子进行细菌分离培养,应用PCR方法检测emm基因及耐药基因erm A、erm B、mef A、转座子基因Tn... 目的了解北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌(GAS)的基因分型及对红霉素耐药基因谱的特点。方法用猩红热、扁桃体炎或咽峡炎患者的咽拭子进行细菌分离培养,应用PCR方法检测emm基因及耐药基因erm A、erm B、mef A、转座子基因Tn 916。结果北京市丰台区2011-2014年感染GAS的emm 12.0基因型占78.33%,其次为emm 1.0基因型(20.00%)、emm 22.3基因型最少(1.67%);耐药基因erm B及转座子基因Tn916的携带率均为100.00%,所有菌株都不携带耐药基因erm A和mef A。结论北京市丰台区2011-2014年感染GAS的流行株为emm 12.0型;本地区菌株对红霉素耐药率较高,菌株间耐药基因扩散现象明显。 展开更多
关键词 链球菌 emm基因分型 耐药基因 Tn916
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北京市儿童A族链球菌emm基因型别及药敏特征变化分析
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作者 赵佳琛 刘医萌 +8 位作者 彭晓旻 崔淑娟 卢桂兰 石伟先 马春娜 李夫 张代涛 王全意 杨鹏 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第21期1645-1650,共6页
目的了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因(emm基因)型别及药敏特征变化。方法回顾性研究。收集2018年、2019年、2021年北京市16区猩红热病原学监测哨点医院儿童临床诊断猩红热及咽部感染病例咽拭子样本分离的GAS菌株。采用PCR扩增及... 目的了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因(emm基因)型别及药敏特征变化。方法回顾性研究。收集2018年、2019年、2021年北京市16区猩红热病原学监测哨点医院儿童临床诊断猩红热及咽部感染病例咽拭子样本分离的GAS菌株。采用PCR扩增及测序进行emm基因分型,采用微量肉汤稀释法测定10种抗生素最低抑菌浓度(MIC)。采用χ^(2)检验和Fisher′s确切概率法进行组间比较。结果共收集GAS菌株557株,检测到11种emm基因型(emm1、emm3、emm4、emm6、emm11、emm12、emm22、emm75、emm89、emm128、emm212)。其中emm1型42.73%(238/557株),emm12型48.65%(271/557株),其他emm型8.62%(48/557株)。emm1、emm12、其他emm型2018年分别为37.50%(105/280株)、57.14%(160/280株)、5.36%(15/280株);2019年分别为49.05%(129/263株)、39.54%(104/263株)、11.41%(30/263株);2021年分别为28.57%(4/14株)、50.00%(7/14株)、21.43%(3/14株)。2018年和2019年≤6岁儿童组中感染emm12型的构成比均高于>6岁儿童组(62.50%比46.88%,46.36%比30.36%),差异均有统计学意义(χ^(2)=7.182、6.973,均P<0.05)。选取225株GAS进行药敏检测,结果对青霉素、左氧氟沙星、美罗培南、利奈唑胺、头孢噻肟、头孢吡肟、万古霉素7种抗生素敏感率均为100.00%,对红霉素、四环素、克林霉素的耐药率分别为:2018年88.57%(93/105株)、87.62%(92/105株)、86.67%(91/105株);2019年94.34%(100/106株)、94.34%(100/106株)、87.74%(93/106株);2021年3种抗生素耐药率100.00%(14/14株)。2018年青霉素MIC_(50)、MIC_(90)均为0.03 mg/L;2019年分别为0.03 mg/L、0.06 mg/L;2021年均为0.06 mg/L。225株GAS中207株存在耐药,且均为联合耐药,红霉素-四环素-克林霉素三重耐药占94.69%(196/207株),红霉素-克林霉素双重耐药占4.35%(9/207株),红霉素-四环素双重耐药占0.97%(2/207株)。结论北京市2018年、2019年、2021年儿童GAS的emm基因型别多样,优势基因型为emm12与emm1,以emm12为主导流行型别。GAS菌株对红霉素、克林霉素、四环素维持较高耐药率,对青霉素等抗生素保持敏感,但青霉素MIC_(50)和MIC_(90)呈递增趋势。 展开更多
关键词 A族链球菌 emm基因 药敏试验 儿童
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2003-2008年北京儿童医院脓疱疮患儿A组β溶血性链球菌分离株耐药基因检测及emm分型研究 被引量:1
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作者 纪丽丽 俞桑洁 +4 位作者 刘盈 张霞 高薇 马琳 杨永弘 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2012年第6期456-459,共4页
目的研究北京儿童医院脓疱疮患儿临床分离A组β溶血性链球菌(GAS)及其对抗菌药物的敏感性情况。方法收集北京儿童医院2003—2008年收治的1735例脓疱疮儿童皮损部位分离出的52株GAS菌株,采用琼脂稀释法测定9种抗菌药物的最低抑菌质量浓度... 目的研究北京儿童医院脓疱疮患儿临床分离A组β溶血性链球菌(GAS)及其对抗菌药物的敏感性情况。方法收集北京儿童医院2003—2008年收治的1735例脓疱疮儿童皮损部位分离出的52株GAS菌株,采用琼脂稀释法测定9种抗菌药物的最低抑菌质量浓度(MIC)值;用聚合酶链反应方法对上述菌株进行大环内酯类抗生素耐药基因ermB、ermA和mefA检测以及emm分型情况。结果分离株对四环素及大环内酯类抗生素耐药率均为100%,MIC>256mg/L;对青霉素、头孢拉啶及氧氟沙星的敏感率高达100%。大环内酯类抗生素耐药基因ermB、ermA和mefA和阳性率分别为92.30%、7.70%和0;分离株的emm分型最常见的为emm12.0(53.85%),emm1.0(36.54%)。结论北京儿童医院收治的脓疱疮儿童GAS感染流行菌株对大环内酯类抗生素耐药率很高,主要耐药机制为ermB编码的23SrRNA甲基化酶导致靶位改变,在北京地区青霉素类和头孢菌素类抗生素仍是治疗GAS感染首选药物。 展开更多
关键词 A组β溶血性链球菌 抗生素耐药 大环内酯类抗生素耐药基因 emm基因
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北京地区2014年儿童A组链球菌emm基因型别分布及药敏特征 被引量:3
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作者 王斌 杨鹏 +5 位作者 彭晓旻 张代涛 崔淑娟 赵佳琛 卢桂兰 石伟先 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2015年第22期1697-1700,共4页
目的了解北京地区儿童A组链球菌(GAS)emm基因型别分布及药敏特征。方法采用PCR扩增联合测序对2014年5月至7月收集的北京地区16个区县36家医院儿童GAS菌株371株进行emm分型;采用VITEK-2全自动微生物分析系统及GPS-67药敏检测卡检测菌... 目的了解北京地区儿童A组链球菌(GAS)emm基因型别分布及药敏特征。方法采用PCR扩增联合测序对2014年5月至7月收集的北京地区16个区县36家医院儿童GAS菌株371株进行emm分型;采用VITEK-2全自动微生物分析系统及GPS-67药敏检测卡检测菌株对10种抗生素(青霉素、氨苄西林、红霉素、克林霉素、四环素、左氧氟沙星、替加环素、万古霉素、利奈唑胺和链阳霉素)的最小抑菌浓度(MIC),依据临床实验室标准化协会(CLSI)2012年M100-S22判定标准判断其对相关抗菌药物敏感性,计算敏感率(S%)、中介率(I%)、耐药率(R%)。结果共收集371株GAS,测定出5种emm基因型及15种亚型。emm1型为主[54.7%(203/371株)],其次emm12型占44.2%(164/371株),其他型别占1.1%(4/371株)。选取其中207株GAS进行药敏试验,结果对青霉素、氨苄西林、左氧氟沙星、替加环素、万古霉素、链阳霉素、利奈唑胺敏感率均为100.0%(207/207株);对克林霉素、红霉素和四环素耐药率分别为98.5%(204/207株)、98.1%(203/207株)和92.8%(192/207株);菌株对红霉素、克林霉素和四环素耐药率在不同地区、年龄和临床诊断间的分布差异无统计学意义(P〉0.05)。结论北京地区2014年儿童GAS菌株emm基因型别分布较为集中,呈现以emm1和emm12型为主,emm1型稍高的分布特点。药敏检测结果显示对青霉素等β-内酰胺类和左氧氟沙星等喹诺酮类药物具有较高敏感性。对克林霉素和红霉素等大环内酯类抗菌药物的耐药水平较高,提示临床应合理选择用药。 展开更多
关键词 A组链球菌 emm基因 药敏试验 儿童
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2011年北京市儿童携带A组链球菌的M蛋白基因分型研究 被引量:11
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作者 李静 刘爽 +8 位作者 彭晓曼 杨鹏 张代涛 吴双胜 梁慧洁 崔淑娟 段玮 卢桂兰 王全意 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1107-1111,共5页
目的了解2011年北京市儿童携带A组链球菌(GAS)的M蛋白基因(emm)各基因型别分布情况。方法于2011年5—7月,从北京市36家医院儿科门、急诊中选取猩红热和咽部感染患者作为调查对象,共3315例。采集调查对象咽拭子标本,分离GAS菌株... 目的了解2011年北京市儿童携带A组链球菌(GAS)的M蛋白基因(emm)各基因型别分布情况。方法于2011年5—7月,从北京市36家医院儿科门、急诊中选取猩红热和咽部感染患者作为调查对象,共3315例。采集调查对象咽拭子标本,分离GAS菌株。应用PCR法扩增emm基因,进行测序,确定GAS的emm基因型别,并比较不同人群、不同疾病间的emm基因型别的差异。结果3315份咽拭子标本中,分离出633株GAS菌株,其中emm基因阳性菌株共610株,故最终有610例患者纳入研究,其中,猩红热患者448例(73.4%),咽部感染患者162例(26.6%);城区397例(65.1%),郊区213例(34.9%);1~5岁儿童240例(39.4%),6~18岁儿童369例(60.6%)。共鉴定出8种emm基因型(猩红热患者:6种,咽部感染患者:4种)和21种emm基因亚型(猩红热患者:16种,咽部感染患者:10种),包括3种新的emm亚型,分别是emml.63、emml2.62和st5144.20,其中,emml.63在猩红热和咽部感染患者中均存在,而emml2.62和st5144.20仅见于咽部感染患者。emml2基因型所占比例最高,为80.5%(491/610),其次是emml,占18.0%(110/610);基因亚型中,emml2.00所占比例最高,为69.0%(421/610),其次是emml.00[16.9%(103/610)]和emml2.19[6.1%(37/610)],均是猩红热和咽部感染患者的主要流行菌株。流行菌株的分布在分离地区和宿主年龄上存在差异,郊区患者emml、emml.00和emml2.19构成比[分别为22.1%(47/213)、19.2%(40/213)、8.0%(17/213)]高于城区患者[分别为15.9%(63/397)、15.6%(62/397)、5.0%(20/397)],差异有统计学意义(P〈0.05)]。emml.00在6—18岁年龄组构成比[19.2%(71/369)]高于1~5岁年龄组[13.3%(32/240)],差异有统计学意义(X^2=8.45,P〈0.05)。结论2011年北京市儿童携带GAS的emm基因型别中,主要流行的基因型是emml2和emml,主要流行的基因亚型是emml2.00、emml.00和emml2.19,其分布在分离地区和宿主年龄上存在差异。 展开更多
关键词 链球菌 酿脓 猩红热 疫苗 emm基因
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