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PRRSV SX-1株的分离与NSP2和ORF5基因的克隆及变异分析
被引量:
5
1
作者
张金强
吴家强
+6 位作者
朱向福
于美芳
白华
孟斌
任素芳
王文志
王金宝
《家畜生态学报》
2009年第5期24-28,共5页
从山东莘县恒顺猪场发病猪群中分离到PRRSV病毒(SX-1株)。用RT-PCR法对该分离株的NSP2和ORF5基因进行了扩增和克隆,并对其进行核苷酸序列测定和分析。结果表明,PRRSV SX-1株的NSP2发生30个氨基酸的不连续缺失,缺失位置与JXA1毒株相同;O...
从山东莘县恒顺猪场发病猪群中分离到PRRSV病毒(SX-1株)。用RT-PCR法对该分离株的NSP2和ORF5基因进行了扩增和克隆,并对其进行核苷酸序列测定和分析。结果表明,PRRSV SX-1株的NSP2发生30个氨基酸的不连续缺失,缺失位置与JXA1毒株相同;ORF5基因与JXA1、CH-1a、VR2332核苷酸同源性分别为98.8%、94.9%、88.9%,氨基酸同源性分别为99.0%、93%、87.5%。基因系统发育树分析结果显示,SX-1与JXA1、HUN株的亲缘关系很近,与CH-1a亲缘关系较近,与VR2332、CC-1、RespPRRS/ReproMLV等毒株处于不同分支。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
分离
NSP2基因
ORF5基因
变异分析
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职称材料
子宫内膜癌中PTEN突变研究
被引量:
2
2
作者
薛菊辉
刘曼华
+1 位作者
陶潜
鲁小燕
《南通大学学报(医学版)》
2007年第2期90-91,94,共3页
目的:研究抑癌基因PTEN在子宫内膜癌中的表达,探讨其临床意义。方法:采用免疫组化法,检测对正常子宫内膜、子宫内膜增生过长、子宫内膜不典型增生各20例,子宫内膜癌50例及子宫内膜癌旁组织50例中PTEN的表达情况。结果:PTEN在正常子宫内...
目的:研究抑癌基因PTEN在子宫内膜癌中的表达,探讨其临床意义。方法:采用免疫组化法,检测对正常子宫内膜、子宫内膜增生过长、子宫内膜不典型增生各20例,子宫内膜癌50例及子宫内膜癌旁组织50例中PTEN的表达情况。结果:PTEN在正常子宫内膜、子宫内膜增生过长、子宫内膜不典型增生、子宫内膜癌旁组织及子宫内膜癌中表达缺失率逐渐上升,P<0.05,差异有统计学意义。表达缺失率与组织学类型、组织学分级有关,P<0.05,与子宫内膜腺癌肌层浸润深度、临床分期、淋巴结转移无关,P>0.05。结论:PTEN表达缺失是早期诊断子宫内膜腺癌的较好的生物标志,参与子宫内膜腺癌的发生、发展。
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关键词
子宫内膜癌
PTEN
基因突变
免疫组织化学染色SP法
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职称材料
p53基因突变在胃癌组织中的检测及临床意义
3
作者
翟晴晴
季万胜
+2 位作者
贾飞飞
曹玉
高志星
《潍坊医学院学报》
2013年第2期136-137,I0001,共3页
目的探讨p53基因突变在胃癌组织中的检测及临床意义。方法收集20例胃癌标本和25例胃良性疾病标本,分别提取其DNA,用PCR法扩增p53基因,基因测序后进行突变分析。结果 20例胃癌患者中,p53基因的突变率为40.0%,25例胃良性疾病中,p53基因的...
目的探讨p53基因突变在胃癌组织中的检测及临床意义。方法收集20例胃癌标本和25例胃良性疾病标本,分别提取其DNA,用PCR法扩增p53基因,基因测序后进行突变分析。结果 20例胃癌患者中,p53基因的突变率为40.0%,25例胃良性疾病中,p53基因的突变率为8.0%(P<0.05)。结论 p53基因突变在胃癌的发生过程中起重要作用,检测该基因的突变对胃癌的早期诊断、治疗及预后有重要临床意义。
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关键词
胃肿瘤
P53基因
基因突变
聚合酶链反应
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职称材料
一个非综合征型聋家系MITF基因致病性新突变
4
作者
高玲丽
潘春晨
+1 位作者
鲍坚强
孙敬武
《听力学及言语疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期154-159,共6页
目的研究一个非综合征型聋家系的致病基因突变。方法通过家系调查、临床检查和遗传学特征分析,对一个非综合征型聋家系的临床表型及致病原因进行分析,提取家系成员的外周血DNA,应用遗传性耳聋基因芯片结合耳聋基因靶向测序筛选致病基因...
目的研究一个非综合征型聋家系的致病基因突变。方法通过家系调查、临床检查和遗传学特征分析,对一个非综合征型聋家系的临床表型及致病原因进行分析,提取家系成员的外周血DNA,应用遗传性耳聋基因芯片结合耳聋基因靶向测序筛选致病基因,然后利用Sanger测序对发现的致病基因位点进行验证,分析该突变位点在各物种中的保守性及该突变位点所在的结构域;通过Swiss model工具进行同源建模模拟蛋白质的三维结构,观察MITF基因突变前后对蛋白功能的影响;利用蛋白功能预测软件REVEL进行变异致病性的预测。结果该家系包含3代15人,先证者(Ⅲ-4)、姐姐(Ⅲ-3)、母亲(Ⅱ-4)及外婆(Ⅰ-4)4人被诊断为先天性双侧感音神经性聋,未发现皮肤毛发色素改变、虹膜异色、内眦间距异常、上肢异常、巨结肠等;父亲(Ⅱ-3)及其他家属(Ⅱ-5)表型正常。9项遗传性耳聋基因芯片筛查未发现致病突变;耳聋基因靶向测序结果显示先证者携带MITF基因的一个单杂合变异MITFc.730G>A(p.Gly244Arg,NM_000248),Sanger测序结果验证了先证者(Ⅲ-4)、患者Ⅰ-4、Ⅱ-4、Ⅲ-3的MITF基因c.730G>A(p.Gly244Arg,NM_000248)突变,变异来源于母亲,父亲未发现该位点的变异;该变异为杂合错义突变,在各物种中高度保守并位于bHLH-Zip结构域。Swiss model预测的蛋白质三维结构图显示,该位点突变可能通过影响MITF基因与非特异性DNA的结合从而影响该蛋白质的功能。REVEL分析结果为D(预测为有害),提示可能为一个潜在的致病位点。结论MITF基因c.730G>A(p.Gly244Arg,NM_000248)位点可能为该非综合征型聋家系的致病突变。
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关键词
非综合征型聋
MITF基因
基因突变
Sanger测序
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职称材料
题名
PRRSV SX-1株的分离与NSP2和ORF5基因的克隆及变异分析
被引量:
5
1
作者
张金强
吴家强
朱向福
于美芳
白华
孟斌
任素芳
王文志
王金宝
机构
山东省农业科学院畜牧兽医研究所
山东农业大学
新泰市青云街道办事处兽医站
出处
《家畜生态学报》
2009年第5期24-28,共5页
基金
山东省自然科学基金重点项目(Z2007D06)
山东省重大科技专项(2007ZHZX11103)
山东省农科院青年基金项目(2005YQ039)
文摘
从山东莘县恒顺猪场发病猪群中分离到PRRSV病毒(SX-1株)。用RT-PCR法对该分离株的NSP2和ORF5基因进行了扩增和克隆,并对其进行核苷酸序列测定和分析。结果表明,PRRSV SX-1株的NSP2发生30个氨基酸的不连续缺失,缺失位置与JXA1毒株相同;ORF5基因与JXA1、CH-1a、VR2332核苷酸同源性分别为98.8%、94.9%、88.9%,氨基酸同源性分别为99.0%、93%、87.5%。基因系统发育树分析结果显示,SX-1与JXA1、HUN株的亲缘关系很近,与CH-1a亲缘关系较近,与VR2332、CC-1、RespPRRS/ReproMLV等毒株处于不同分支。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
分离
NSP2基因
ORF5基因
变异分析
Keywords
highly pathogenic PRRSV
isolation
NSP2
gene
ORF5
gene
mutalion
analysis
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
子宫内膜癌中PTEN突变研究
被引量:
2
2
作者
薛菊辉
刘曼华
陶潜
鲁小燕
机构
南通大学第二附属医院妇产科
出处
《南通大学学报(医学版)》
2007年第2期90-91,94,共3页
文摘
目的:研究抑癌基因PTEN在子宫内膜癌中的表达,探讨其临床意义。方法:采用免疫组化法,检测对正常子宫内膜、子宫内膜增生过长、子宫内膜不典型增生各20例,子宫内膜癌50例及子宫内膜癌旁组织50例中PTEN的表达情况。结果:PTEN在正常子宫内膜、子宫内膜增生过长、子宫内膜不典型增生、子宫内膜癌旁组织及子宫内膜癌中表达缺失率逐渐上升,P<0.05,差异有统计学意义。表达缺失率与组织学类型、组织学分级有关,P<0.05,与子宫内膜腺癌肌层浸润深度、临床分期、淋巴结转移无关,P>0.05。结论:PTEN表达缺失是早期诊断子宫内膜腺癌的较好的生物标志,参与子宫内膜腺癌的发生、发展。
关键词
子宫内膜癌
PTEN
基因突变
免疫组织化学染色SP法
Keywords
Endometrial carcinoma
PTEN
gene mutalion
Inmunohistochemical s-p assay
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
p53基因突变在胃癌组织中的检测及临床意义
3
作者
翟晴晴
季万胜
贾飞飞
曹玉
高志星
机构
潍坊医学院内科学教研室
潍坊医学院附属医院消化内科
出处
《潍坊医学院学报》
2013年第2期136-137,I0001,共3页
基金
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金计划(项目编号:BS2010SW034)
文摘
目的探讨p53基因突变在胃癌组织中的检测及临床意义。方法收集20例胃癌标本和25例胃良性疾病标本,分别提取其DNA,用PCR法扩增p53基因,基因测序后进行突变分析。结果 20例胃癌患者中,p53基因的突变率为40.0%,25例胃良性疾病中,p53基因的突变率为8.0%(P<0.05)。结论 p53基因突变在胃癌的发生过程中起重要作用,检测该基因的突变对胃癌的早期诊断、治疗及预后有重要临床意义。
关键词
胃肿瘤
P53基因
基因突变
聚合酶链反应
Keywords
Gastric cancer
p53
gene
gene mutalion
Polymerase chain reaction
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
一个非综合征型聋家系MITF基因致病性新突变
4
作者
高玲丽
潘春晨
鲍坚强
孙敬武
机构
中国科学技术大学生命科学与医学部附属第一医院耳鼻咽喉头颈外科
中国科学技术大学生命科学与医学部附属第一医院生殖医学中心
出处
《听力学及言语疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期154-159,共6页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(81800911)
安徽省自然科学基金面上项目(1808085QH248)
科大新医学培育项目(WK9110000053)。
文摘
目的研究一个非综合征型聋家系的致病基因突变。方法通过家系调查、临床检查和遗传学特征分析,对一个非综合征型聋家系的临床表型及致病原因进行分析,提取家系成员的外周血DNA,应用遗传性耳聋基因芯片结合耳聋基因靶向测序筛选致病基因,然后利用Sanger测序对发现的致病基因位点进行验证,分析该突变位点在各物种中的保守性及该突变位点所在的结构域;通过Swiss model工具进行同源建模模拟蛋白质的三维结构,观察MITF基因突变前后对蛋白功能的影响;利用蛋白功能预测软件REVEL进行变异致病性的预测。结果该家系包含3代15人,先证者(Ⅲ-4)、姐姐(Ⅲ-3)、母亲(Ⅱ-4)及外婆(Ⅰ-4)4人被诊断为先天性双侧感音神经性聋,未发现皮肤毛发色素改变、虹膜异色、内眦间距异常、上肢异常、巨结肠等;父亲(Ⅱ-3)及其他家属(Ⅱ-5)表型正常。9项遗传性耳聋基因芯片筛查未发现致病突变;耳聋基因靶向测序结果显示先证者携带MITF基因的一个单杂合变异MITFc.730G>A(p.Gly244Arg,NM_000248),Sanger测序结果验证了先证者(Ⅲ-4)、患者Ⅰ-4、Ⅱ-4、Ⅲ-3的MITF基因c.730G>A(p.Gly244Arg,NM_000248)突变,变异来源于母亲,父亲未发现该位点的变异;该变异为杂合错义突变,在各物种中高度保守并位于bHLH-Zip结构域。Swiss model预测的蛋白质三维结构图显示,该位点突变可能通过影响MITF基因与非特异性DNA的结合从而影响该蛋白质的功能。REVEL分析结果为D(预测为有害),提示可能为一个潜在的致病位点。结论MITF基因c.730G>A(p.Gly244Arg,NM_000248)位点可能为该非综合征型聋家系的致病突变。
关键词
非综合征型聋
MITF基因
基因突变
Sanger测序
Keywords
Nonsyndromic hearing loss,NSHL
MITF
gene
gene mutalion
Sanger sequencing
分类号
R764.431 [医药卫生—耳鼻咽喉科]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PRRSV SX-1株的分离与NSP2和ORF5基因的克隆及变异分析
张金强
吴家强
朱向福
于美芳
白华
孟斌
任素芳
王文志
王金宝
《家畜生态学报》
2009
5
下载PDF
职称材料
2
子宫内膜癌中PTEN突变研究
薛菊辉
刘曼华
陶潜
鲁小燕
《南通大学学报(医学版)》
2007
2
下载PDF
职称材料
3
p53基因突变在胃癌组织中的检测及临床意义
翟晴晴
季万胜
贾飞飞
曹玉
高志星
《潍坊医学院学报》
2013
0
下载PDF
职称材料
4
一个非综合征型聋家系MITF基因致病性新突变
高玲丽
潘春晨
鲍坚强
孙敬武
《听力学及言语疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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职称材料
已选择
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