JNK信号通路在大鼠肝再生及肝硬化的细胞增殖和凋亡中作用的比较

目的从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠肝再生(LR)和肝硬化(LC)中的作用异同。方法采用2/3部分肝切除手术制备大鼠肝再生模型,以腹腔注射CCl4中性菜籽油溶液法建立大鼠肝硬化模型,采用大鼠Genome 230 2.0芯片检测不同时间点再生肝和肝硬化组织中JNK信号通路的基因表达谱,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达谱预示的增殖和凋亡活动。结果 JNK信号通路涉及302个基因和42条途径,大鼠Genome 230 2.0芯片含上述基因中的240个基因,其中,79个基因发生有意义表达变化,涉及LR的52个基因,LC的5个基因,有22个基因与两者相关。在大鼠LR启动阶段,途径1和16促进细胞增殖及途径22～33促进细胞凋亡作用强于对照;在进展阶段,途径1～17、34和35促进细胞增殖及途径22～33促进细胞凋亡作用强于对照,途径37～41抑制细胞凋亡作用弱于对照;在终止阶段,途径37、39、41和42诱导细胞凋亡作用弱于对照,同时,尚未发现途径18～21和36参与大鼠LR。而在LC发生中,JNK信号通路中的这些途径与对照相比均无显著差异。结论 JNK信号通路的37条途径调控大鼠肝再生的细胞增殖和凋亡,对大鼠肝硬化的调控作用则不显著。

JNK信号通路调控大鼠再生肝8种细胞的增殖和凋亡

目的从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠再生肝8种细胞中的作用。方法用密度梯度离心和免疫磁珠等方法分离肝细胞(HC)、胆管上皮细胞(BEC)、卵圆细胞(OC)、肝星形细胞(HSC)、窦内皮细胞(SEC)、库普弗细胞(KC)、陷窝细胞(PC)、树突状细胞(DC)等8种肝脏细胞,用大鼠Genome 230 2.0芯片检测大鼠再生肝8种细胞的基因表达谱,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的JNK信号通路在调控大鼠再生肝8种细胞增殖、凋亡中的作用。用实时荧光定量PCR方法验证了芯片结果的可靠性。结果 JNK信号通路涉及240个基因和42条途径,其中,225个基因与大鼠肝再生相关。基因协同作用分析显示,在大鼠肝再生启动阶段,JNK信号通路启动HC和KC增殖,促进OC凋亡,启动部分PC和SEC增殖和促进部分PC和SEC凋亡;在进展阶段,JNK信号通路促进HC、BEC、KC和DC增殖,促进部分PC增殖、部分PC凋亡。在终止阶段,JNK信号通路促进HC、OC和PC凋亡,促进部分KC增殖、部分KC凋亡。结论大鼠肝再生中JNK信号通路的42条途径和225个基因参与调控大鼠再生肝8种细胞的增殖和凋亡。

哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路相关基因对大鼠再生肝8种细胞生长过程的调节作用

目的从基因转录水平了解哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路对大鼠再生肝8种细胞的生长调节作用。方法在本实验室建立大鼠2/3肝切除模型,分离和鉴定再生肝8种细胞,采用大鼠Genome230 2.0芯片检测、数据处理及实时荧光定量PCR等方法,构建mTOR的信号通路网络,分析mTOR信号通路的相关基因在以上8种细胞中的表达谱,用系统生物学方法分析基因表达谱预示的细胞生长活动。结果 mTOR信号通路涉及110个基因和25条途径,99个基因含于大鼠Genome 230 2.0芯片,82个基因与大鼠肝再生相关。其中,在启动阶段,mTOR信号通路主要参与激活、促进肝细胞、陷窝细胞、库普弗细胞、树突状细胞、肝星形细胞和窦内皮细胞的生长过程;在进展阶段,mTOR信号通路明显地促进肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、肝星形细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞的生长过程;在终止阶段,mTOR信号通路的大多数途径对肝细胞、库普弗细胞和树突状细胞的生长过程的促进作用减弱,而途径25却对肝细胞、窦内皮细胞、肝星形细胞和陷窝细胞的生长过程有明显的抑制作用。结论 mTOR信号通路的25条途径和82个基因参与大鼠再生肝8种细胞的生长调控。

PPAR-γ偶联的信号通路可能参与大鼠肝再生

目的了解PPAR-γ偶联的信号通路在大鼠肝再生(LR)中作用。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述通路相关基因,用RatGenome 230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生中表达情况,用真手术与手术对照比较方法确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中64个基因与肝再生相关。肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等4个阶段起始表达的基因数为28、4、34和2,基因总表达次数为72、41、247和90,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共分为11种表达方式,表明肝再生中这些基因表达变化多样和复杂。结论PPAR-γ偶联的信号通路在肝再生早期、前期和后期促进糖元合成;在整个肝再生中抑制炎症反应,促进细胞增殖和迁移。