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大豆GmMP基因的功能预测及表达分析
被引量:
3
1
作者
李冬梅
张可欣
李文滨
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期28-32,共5页
通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtMP(ARF5)在大豆中的同源基因,获得了GmMP基因序列。对GmMP基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:GmMP基因CDS序列全长2 802 bp,编码933个氨基酸。GmMP编码的蛋白为疏水性...
通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtMP(ARF5)在大豆中的同源基因,获得了GmMP基因序列。对GmMP基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:GmMP基因CDS序列全长2 802 bp,编码933个氨基酸。GmMP编码的蛋白为疏水性蛋白。结构域分析表明:GmMP含有B3和AUXIN RESPONSE FACTOR结构域,同时该基因是ARF家族的成员。GmMP预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析表明MP在豆科植物进化过程中比较保守。组织特异性表达分析结果显示GmMP在叶片中表达量最低,在茎尖中表达量最高,推测其可能参与生长素的代谢途径。
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关键词
大豆
gmmp
基因
生长素
生物信息学
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职称材料
题名
大豆GmMP基因的功能预测及表达分析
被引量:
3
1
作者
李冬梅
张可欣
李文滨
机构
东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期28-32,共5页
基金
抗逆转基因大豆新品种培育专项(2016ZX08004-002)
文摘
通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtMP(ARF5)在大豆中的同源基因,获得了GmMP基因序列。对GmMP基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,结果表明:GmMP基因CDS序列全长2 802 bp,编码933个氨基酸。GmMP编码的蛋白为疏水性蛋白。结构域分析表明:GmMP含有B3和AUXIN RESPONSE FACTOR结构域,同时该基因是ARF家族的成员。GmMP预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析表明MP在豆科植物进化过程中比较保守。组织特异性表达分析结果显示GmMP在叶片中表达量最低,在茎尖中表达量最高,推测其可能参与生长素的代谢途径。
关键词
大豆
gmmp
基因
生长素
生物信息学
Keywords
Soybean
gmmp gene
Auxin
Bioinformatics
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆GmMP基因的功能预测及表达分析
李冬梅
张可欣
李文滨
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
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