微囊藻气囊尺寸与gvpA/gvpC基因的关系

我国是世界上湖泊富营养化最严重的国家之一。太湖、巢湖、滇池等大型浅水湖泊由于富营养化导致蓝藻水华连年爆发,水质日趋恶化,丧失了原有的功能,制约着地区经济发展。水华一般是指藻类过量繁殖形成的水体表面聚集物[1]。在我国。

极大节旋藻气囊蛋白基因gvpA克隆与序列分析

为了研究极大节旋藻气囊蛋白的分子生物学特性,并为gvpA基因的研究提供基础材料,在对极大节旋藻GSS序列分析的基础上,采用PCR技术克隆了gvpA基因的全长序列,并进行了相关分析。结果表明极大节旋藻gvpA基因编码区的GC含量为42.92%,核苷酸序列和蛋白序列与Planktothrix agardhii的gvpA基因相似性最高(79.4%,97.2%),其次是Pseudanabaena sp.PCC6901(75.3%,94.4%)。系统发生分析表明极大节旋藻gvpA基因与Planktothrix agardhii的gvpA基因同源性最高(89%ML,85%MP,89%NJ)。

红球菌R04气囊蛋白GvpA与GvpJ表达与定位的初步研究

目的探讨红球菌R04气囊蛋白GvpA与GvpJ表达与定位的初步研究。方法通过气囊结构蛋白GvpA与GvpJ基因的克隆和鉴定,分析蛋白的诱导表达,以及荧光显微镜观察。结果由于蛋白质构成的气囊结构广泛存在于自然界许多微生物中,其内充满气体,为水生微生物提供浮力。基因组测序发现土壤微生物红球菌Rhodococcus sp.R04中也存在气囊蛋白基因簇。经比对推测,在红球菌中GvpA是构成气囊的主要结构蛋白,GvpJ与GvpA同源性很高,推测其参与气囊帽子结构的形成。结论本实验克隆并表达了红球菌R04气囊蛋白GvpA和GvpJ,并对其蛋白定位进行了分析,该研究为阐明R04气囊蛋白的生理功能提供了基础。

gvpA-C间隔区在微囊藻株系分型中的应用

从暴发水华的水体分离微囊藻(Microcystis)株,并依据gvpA-C间隔区和16S rDNA序列对其分型和比较。在gvpA-C间隔区序列中,有的类型具有一段172—176 bp的额外序列。以不包括额外序列的0.27 kb序列相比较,不同类型之间差异碱基位点达50余个。在16S rDNA碱基变异集中的0.69 kb序列中,不同类型之间有差异的碱基位点共有8个。与16S rDNA序列相比,微囊藻gvpA-C间隔区序列具有高度变异性,并且其PCR扩增可一步完成,不受其他细菌污染,因而可用于微囊藻株系分型。由于横向转移,2种分型存在交叉关系。此外,原本含有或不含有额外序列的微囊藻gvpA-C间隔区序列在系统进化树中分别聚成一簇。

微囊藻伪空胞gvpA、gvpC与其物理性状之间相关性分析

为了探究gvpA基因拷贝数和gvpC基因内保守重复序列的作用,利用3株微囊藻包括铜绿微囊藻FACHB910、FACHB930以及惠氏微囊藻FACHB929为材料;测量了伪空胞长度、伪空胞直径、相对气体含量、表观压强、临界压强和细胞膨压等性状,分析了gvpA基因拷贝数目、gvpC基因内保守重复序列与这些性状之间的相关性.结果表明,gvpA基因拷贝数目与伪空胞相对气体含量呈极显著线性相关,相关系数为0.999;gvpA基因拷贝数目与伪空胞直径呈极显著负相关,相关系数为-0.861;gvpC基因内保守重复序列与伪空胞直径呈极显著正相关,相关系数0.911,与伪空胞相对气体含量、表观压强、临界压强呈极显著负相关,相关系数分别为-0.851、-0.999、-0.928.故推测:同一藻种内,gvpA基因拷贝数是影响伪空胞相对气体含量的主要因素;伪空胞的直径不仅受到gvpC基因内保守重复序列数量影响,而且还可能受到gvpA基因拷贝数调控.