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陆地棉H^(+)-PPase基因家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 朱心慧 王冬梅 +4 位作者 曹孜怡 冯群 鲍晴 汪保华 方辉 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1363-1373,共11页
【目的】鉴定陆地棉跨膜质子泵焦磷酸酶(H^(+)-PPase)基因家族成员,并分析其表达模式,为探究该家族基因的功能和调控机制及优质纤维棉育种提供理论依据。【方法】从Pfam数据库获取H^(+)-PPase基因家族(PF03030)的隐马尔可夫模型文件,从... 【目的】鉴定陆地棉跨膜质子泵焦磷酸酶(H^(+)-PPase)基因家族成员,并分析其表达模式,为探究该家族基因的功能和调控机制及优质纤维棉育种提供理论依据。【方法】从Pfam数据库获取H^(+)-PPase基因家族(PF03030)的隐马尔可夫模型文件,从陆地棉基因组中筛选包含H^(+)-PPase家族保守结构域的成员,运用生物信息学方法对其理化性质、进化关系、基因定位、共线性关系、基因结构、顺式作用元件和表达模式进行分析,并利用实时荧光定量PCR检测10个在棉纤维发育中表达的侯选基因表达情况。【结果】从陆地棉全基因组水平上鉴定出20个H^(+)-PPase基因家族成员(GhH_PPase1~GhH_PPase20),分布在12条染色体上,基因长度为2531~11810 bp,编码的氨基酸残基数为575~803个,蛋白分子量为60087.76~85197.58 Da,均为疏水性的酸性蛋白,可分为亚族Ⅰ(4个)、亚族Ⅳ(4个)和亚族Ⅴ(12个)三大分支。片段复制事件是陆地棉H^(+)-PPase基因家族扩张的主要驱动力,位于染色体A05和D05上的H_PPase1、H_PPase2、H_PPase11和H_PPase12可能是进化过程中种间传播的主要基因,且陆地棉基因与单双子叶植物的共线性均较低,可能经历了独立的进化事件。有14个GhH_PPases蛋白含有10个保守基序,且排列顺序完全相同;其余6个基因的保守基序差异较明显,可能具有不同的功能。20个GhH_PPases基因启动子区域存在大量光响应元件、胁迫响应元件和激素反应元件。陆地棉H^(+)-PPase基因家族成员的表达具有时空特异性,且相对于其他亚家族,亚族Ⅴ的较多基因在棉花纤维发育过程中发挥更重要的作用。【结论】陆地棉H^(+)-PPase基因家族发生了一定程度的功能分化,多种响应元件协同参与生长发育和逆境应答,部分基因在陆地棉纤维伸长期和次生壁加厚期发挥重要的调控作用。 展开更多
关键词 陆地棉 h^(+)-ppase基因家族 全基因组分析 纤维发育 表达分析
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Genome-Wide Analysis of the F3′5′H Gene Family in Blueberry(Vaccinium corymbosum L.)Provides Insights into the Regulation of Anthocyanin Biosynthesis
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作者 Xiaolan Guo Jinbin Hu +2 位作者 Shimei Yang Delu Wang Jianbing Wang 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第9期2683-2697,共15页
The F3′5′H gene family plays an important role in regulating anthocyanin biosynthesis,abiotic stress,and hormone signaling.In this study,14 F3′5′H genes were identified from the blueberry genome.The chromosomal di... The F3′5′H gene family plays an important role in regulating anthocyanin biosynthesis,abiotic stress,and hormone signaling.In this study,14 F3′5′H genes were identified from the blueberry genome.The chromosomal distribution,physicochemical properties,F3′5′H domain,conserved motifs,cis-acting elements,and intron/exon compositions were analyzed.The functional prediction analysis of these VcF3′5′Hs indicated that their biological functions included light response and other secondary metabolites.The results of qRT-PCR showed that VcF3′5′Hs(especially VcF3′5′H4)were highly expressed at the ripening stage.Subcellular localization revealed that VcF3′5′H4 may be located in the endoplasmic reticulum.Co-expression analysis showed that the VcF3′5′H gene family was related to anthocyanin.This research provides an overview of the blueberry F3′5′H family and helps verify the role of these genes in regulating anthocyanin biosynthesis. 展开更多
关键词 BLUEBERRY F3′5′h ANThOCYANIN gene expression CO-EXPRESSION
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新疆哈萨克族H型高血压与MTHFR基因多态性及叶酸水平的相关性研究
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作者 廖晟宇 马儒林 +3 位作者 张向辉 王馨平 何欣 郭恒 《农垦医学》 2024年第1期20-25,77,共7页
目的:探讨哈萨克族H型高血压与同型半胱氨酸(Hcy)代谢相关基因MTHFR多态性和叶酸的关联,为H型高血压发病机制提供理论依据。方法:应用新疆哈萨克族H型高血压现况调查数据库,采用病例-对照研究,随机选取H型高血压患者100例、单纯高血压患... 目的:探讨哈萨克族H型高血压与同型半胱氨酸(Hcy)代谢相关基因MTHFR多态性和叶酸的关联,为H型高血压发病机制提供理论依据。方法:应用新疆哈萨克族H型高血压现况调查数据库,采用病例-对照研究,随机选取H型高血压患者100例、单纯高血压患者100例、高Hcy血症患者100例,健康人群100例作为对照组。应用Sanger测序法对所有研究对象的MTHFR基因rs1801133、rs1801131位点进行基因型检测。叶酸采用电化学发光法进行检测。采用χ^(2)检验进行Hardy-Weinberg平衡检验;应用二分类非条件Logistic回归分析H型高血压与MTHFR基因位点以及叶酸之间的关联。结果:以健康组为对照,高水平叶酸是哈萨克族H型高血压的保护因素(OR=0.33,95%CI:0.15-0.72),rs1801133-(CT+TT)基因型是危险因素(OR=6.37,95%CI:2.97-13.68);高水平叶酸是哈萨克族高Hcy血症的保护因素(OR=0.45,95%CI:0.23-0.86),rs1801133-(CT+TT)基因型是危险因素(OR=2.92,95%CI:1.52-5.62)。结论:MTHFR基因的rs1801133-T等位基因和rs1801133-(CT+TT)基因型是H型高血压的危险因素;高水平叶酸是H型高血压的保护因素。 展开更多
关键词 哈萨克族 h型高血压 MThFR基因 叶酸
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茎莴苣F6′H家族基因鉴定及其与鲜切莴苣褐变的关系初探
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作者 梁园丽 帅良 +6 位作者 何纯锋 林德胜 殷菲胧 刘云芬 何妹英 蔡文 廖玲燕 《山东农业科学》 北大核心 2024年第6期7-15,共9页
为深入探究阿魏酰-CoA-6′-羟化酶(feruloyl-CoA 6′-hydroxylase, F6′H)在鲜切莴苣褐变过程中的作用及机制,本研究通过Blastp结合结构域筛选的方法从茎莴苣基因组中搜索鉴定F6′H家族成员,并对其进行生物信息学分析及褐变过程中的表... 为深入探究阿魏酰-CoA-6′-羟化酶(feruloyl-CoA 6′-hydroxylase, F6′H)在鲜切莴苣褐变过程中的作用及机制,本研究通过Blastp结合结构域筛选的方法从茎莴苣基因组中搜索鉴定F6′H家族成员,并对其进行生物信息学分析及褐变过程中的表达分析,同时测定了鲜切莴苣贮藏过程中褐变度和总酚含量的变化。结果表明,共鉴定出11个茎莴苣F6′Hs基因,其编码蛋白均为定位于细胞质中的亲水蛋白,氨基酸数在181~840个之间,分子量在20.74~93.35 kDa之间,等电点在5.16~8.36之间,脂肪系数在82.28~102.98之间,不稳定指数为26.13~55.39。鲜切莴苣贮藏过程中LsF6′H9基因明显上调表达,LsF6′H3和LsF6′H11在贮藏4~6 d上调表达,其余基因下调表达或变化较小;褐变度逐渐升高,总酚含量先升高后降低,贮藏6 d时最高。相关性分析结果显示,总酚含量与褐变度呈显著正相关,表明酚类的积累可能是导致鲜切莴苣发生褐变的重要因素;褐变度及总酚含量均与LsF6′H1、LsF6′H2、LsF6′H3、LsF6′H4、LsF6′H9、LsF6′H10和LsF6′H11的表达量呈正相关,特别是总酚含量与LsF6′H9表达量呈极显著正相关,褐变度与LsF6′H9表达量呈显著正相关,表明LsF6′H9可能在鲜切莴苣褐变中扮演重要角色。本研究结果可为深入探究F6′H在鲜切莴苣褐变过程中的作用及机制提供理论依据。 展开更多
关键词 茎莴苣 F6′h 鲜切褐变 基因表达 总酚含量 相关性分析
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基于H&E图像和基因表达数据的多模态深度学习模型预测胃癌生存风险
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作者 马艳雨 贺平安 《软件工程》 2024年第8期37-40,共4页
胃癌作为高发恶性肿瘤,其致死率近年来居高不下,因此精准预测胃癌患者的生存风险对于治疗至关重要。文章提出了一种基于多模态深度学习的预测模型,旨在评估胃癌患者的生存风险。该模型整合了H&E(Hematoxylin-Eosin staining)染色图... 胃癌作为高发恶性肿瘤,其致死率近年来居高不下,因此精准预测胃癌患者的生存风险对于治疗至关重要。文章提出了一种基于多模态深度学习的预测模型,旨在评估胃癌患者的生存风险。该模型整合了H&E(Hematoxylin-Eosin staining)染色图像和基因表达数据,首先,采用ResNet18卷积神经网络模型提取深层H&E图像信息,将其编码为一维特征向量。其次,采用多模态紧凑型双线性池化方法,将图像特征与基因表达数据进行融合,用于预测胃癌患者的风险分数。在TCGA的胃癌样本中,该模型的一致性指数(c-index)为0.70。在测试集上进行的Kaplan-Meier分析结果显示,模型成功地区分出高风险群和低风险群。结果表明,该模型在区分胃癌患者风险层次方面表现出色,具有显著优势。 展开更多
关键词 胃癌 h&E染色图像 基因表达 深度学习 多模态
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H型高血压急性缺血性脑卒中患者亚甲基四氢叶酸还原酶C677T基因多态性及其与肾功能的相关性
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作者 徐玉洁 高娟 +4 位作者 王子文 王井辉 任涵 耿硕 刘海杰 《山东医药》 CAS 2024年第6期24-28,共5页
目的观察H型高血压急性缺血性脑卒中患者亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T的基因多态性,分析其与H型高血压急性缺血性脑卒中患者肾功能的相关性。方法选择153例H型高血压急性缺血性脑卒中患者为观察组,同期158例非H型高血压急性缺血性... 目的观察H型高血压急性缺血性脑卒中患者亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T的基因多态性,分析其与H型高血压急性缺血性脑卒中患者肾功能的相关性。方法选择153例H型高血压急性缺血性脑卒中患者为观察组,同期158例非H型高血压急性缺血性脑卒中患者为对照组。两组均采集外周静脉血,采用PCR扩增和微阵列技术检测MTHFR C677T基因型,测算全身免疫炎症指数(SII),采用日立7600型全自动生化分析仪检测两组血清肌酐,据此测算肾小球滤过率(eGFR)。采用多元线性回归分析法分析MTHFR C677T基因型与H型高血压急性缺血性脑卒中患者同型半胱氨酸(Hcy)、eGFR的相关性,采用Spearman相关分析法分析SII与H型高血压急性缺血性脑卒中患者eGFR、Hcy的相关性。结果与对照组相比,观察组患者TT基因型分布频率最高,T等位基因频率最高(χ^(2)分别为19.188、5.138,P均<0.05)。观察组、对照组患者SII分别为583.54(384.97,903.73)、425.03(310.26,583.16),二者相比,P<0.05。与CC、CT基因型比较,TT基因型的H型高血压急性缺血性脑卒中患者血清Hcy水平高,eGFR水平低(F分别为28.544、3.749,P均<0.05)。MTHFR C677T TT基因型与H型高血压急性缺血性脑卒中患者血清Hcy呈正相关(β=4.173,P<0.05),与eGFR呈负相关(β=-6.559,P<0.05)。SII与H型高血压急性缺血性脑卒中血清Hcy水平呈正相关(r=0.226,P<0.05),与eGFR呈负相关(r=-0.129,P<0.05)。结论H型高血压急性缺血性脑卒中患者MTHFR C677T基因型主要为TT型。MTHFR C677T TT基因型的H型高血压急性缺血性脑卒中患者可能更易引起肾功能下降。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 基因多态性 同型半胱氨酸 全身免疫炎症指数 肾小球滤过率 h型高血压 急性缺血性脑卒中
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拟南芥TRX-h5基因的克隆和表达分析
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作者 穆秀杰 张林林 韩毅 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第3期411-416,共6页
硫氧还蛋白(TRX-h)是一类催化二硫键还原的小分子蛋白,在调控氧化应激响应中发挥重要作用。为了研究硫氧还蛋白的结构及其功能,文章以野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana)Columbia(Col-0)为研究材料,通过反转录-聚合酶链式反应(reverse ... 硫氧还蛋白(TRX-h)是一类催化二硫键还原的小分子蛋白,在调控氧化应激响应中发挥重要作用。为了研究硫氧还蛋白的结构及其功能,文章以野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana)Columbia(Col-0)为研究材料,通过反转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)技术获得TRX-h5基因的编码序列(coding sequence,CDS),体外构建pET28a(+)-TRX-h5及pET28a(+)-TRX-h5M(第39位和第42位半胱氨酸位点突变)的原核表达载体,转化至大肠杆菌感受态细胞BL21(DE3)中,诱导后经镍柱纯化得到带有6个His标签的融合蛋白。通过SDS-PAGE电泳技术检测到14 kDa处的目的条带,与理论值预测一致。运用生物信息学分析得出,TRX-h5基因编码118个氨基酸,相对分子质量为13122.32,理论等电点为5.19,该蛋白的不稳定参数为26.74,属于稳定性蛋白。点突变分析发现,TRX-h5的第39位和第42位半胱氨酸位点决定了该蛋白的催化活性,为进一步探究TRX-h5的蛋白功能和高等植物氧化还原系统的研究提供了新思路。 展开更多
关键词 TRX-h5基因 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
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HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT两例罕见突变引起血红蛋白H病家系分析
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作者 王秋华 陈杏园 +4 位作者 唐宁 严提珍 黄钧 钟青燕 罗世强 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期520-524,共5页
目的:分别对HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT两种罕见HBA2基因起始密码子突变复合东南亚型α-地贫的血红蛋白H病病例及其家系成员进行致病基因分析,了解HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT突变与临床表型的关系。方法:采集家系成员外周血进行... 目的:分别对HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT两种罕见HBA2基因起始密码子突变复合东南亚型α-地贫的血红蛋白H病病例及其家系成员进行致病基因分析,了解HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT突变与临床表型的关系。方法:采集家系成员外周血进行血细胞分析及毛细管电泳血红蛋白分析,缺口PCR(Gap-PCR)、反向点杂交法(RDB)检测ɑ-地贫基因常见类型突变,Sanger测序法对HBA1和HBA2基因序列进行分析。结果:检测出两个先证者基因型分别为--SEA/αα复合HBA2:c.2T>C和--SEA/αα复合HBA2:c.2delT,家系成员中检出HBA2:c.2T>C/WT和HBA2:c.2delT/WT,均表现为小细胞低色素性贫血。结论:HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT为杂合突变时机体可出现静止型α-地贫的表型,当其复合轻型α-地贫时可使机体出现血红蛋白H病的临床表现,本研究为遗传咨询提供依据。 展开更多
关键词 α-珠蛋白基因 hBA2:c.2T>C hBA2:c.2delT 血红蛋白h
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多浆旱生植物霸王液泡膜H^+-PPase基因片段的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 席杰军 伍国强 +1 位作者 包爱科 王锁民 《草业学报》 CSCD 北大核心 2011年第1期119-124,共6页
根据其他植物H+-PPase基因的保守序列设计一对简并性引物,以霸王叶片总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出H+-PPase基因片段并克隆到PUCm-T载体。阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,序列分析结果表明,克隆到3个同源的序列片段(898bp),编码299... 根据其他植物H+-PPase基因的保守序列设计一对简并性引物,以霸王叶片总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出H+-PPase基因片段并克隆到PUCm-T载体。阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,序列分析结果表明,克隆到3个同源的序列片段(898bp),编码299个氨基酸;所得序列与GenBank中注册的高等植物H+-PPase基因核苷酸序列的同源性均在69%以上、氨基酸序列的同源性达78%以上。 展开更多
关键词 霸王 h+-ppase基因 克隆 序列分析
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刚毛柽柳液泡膜H^+-PPase基因的克隆与胁迫下的表达分析 被引量:4
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作者 张春蕊 贾园园 +3 位作者 王艳敏 王玉成 杨传平 王超 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期881-887,共7页
通过对刚毛柽柳转录组分析,鉴定获得1个液泡膜H^+-PPase基因的cDNA序列,命名为ThVP1。该cDNA序列全长3 022bp,开放阅读框为2 298bp,编码765个氨基酸,编码蛋白相对分子质量80.37kD,理论等电点5.25。ThVP1编码蛋白的疏水性较强,含有13个... 通过对刚毛柽柳转录组分析,鉴定获得1个液泡膜H^+-PPase基因的cDNA序列,命名为ThVP1。该cDNA序列全长3 022bp,开放阅读框为2 298bp,编码765个氨基酸,编码蛋白相对分子质量80.37kD,理论等电点5.25。ThVP1编码蛋白的疏水性较强,含有13个跨膜区。氨基酸多序列比对结果显示,ThVP1具有典型的液泡膜H^+-PPase家族3个高度保守片段(CS1、CS2和CS3),与大豆VP1氨基酸序列一致性最高,为93%。系统进化分析表明,ThVP1属于I型液泡膜H^+-PPase基因。实时荧光定量RT-PCR分析显示,NaCl和PEG胁迫下,ThVP1在柽柳根和叶中均呈现明显上调表达,表达量最高达到对照的20.9倍,暗示ThVP1可能在刚毛柽柳抗旱耐盐过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 刚毛柽柳 液泡膜h^+-ppase 胁迫响应 基因表达
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红麻液泡膜质子泵H^+-PPase(Hcvp1)基因的克隆、序列分析和表达 被引量:3
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作者 李辉 李德芳 +3 位作者 陈安国 唐慧娟 李建军 黄思齐 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期9-14,共6页
为了阐明红麻耐盐机理,以耐盐性较强的中红麻16号为材料,从红麻耐盐转录组测序结果中获得了1个与AVP1基因高度相似的Unigene,根据该片段的序列设计引物,直接进行PCR扩增,经Sanger测序获得该基因全长c DNA序列。对该基因序列进行生物信... 为了阐明红麻耐盐机理,以耐盐性较强的中红麻16号为材料,从红麻耐盐转录组测序结果中获得了1个与AVP1基因高度相似的Unigene,根据该片段的序列设计引物,直接进行PCR扩增,经Sanger测序获得该基因全长c DNA序列。对该基因序列进行生物信息学分析表明:该基因全长2 298 bp,开放阅读框为2 298 bp,编码765个氨基酸,其编码蛋白质的分子量和等电点分别为80.2 k Da和5.25,与雷蒙德氏棉、甜橙、毛果杨、烟草和大豆的H+-PPase基因核苷酸序列的相似性分别为90%,85%,85%,83%,83%,蛋白质序列的相似性分别为96%,93%,91%,93%,94%,说明该基因与AVP1为同源基因,命名为Hcvp1。qRT-PCR分析表明,该基因的表达量随着Na Cl浓度的增加而增加。这将为Hcvp1基因的功能验证和红麻耐盐机理的研究奠定坚实的基础。 展开更多
关键词 红麻 h^+-ppase基因 耐盐
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截形苜蓿液泡膜H^+ -PPase基因克隆与序列分析 被引量:10
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作者 王建武 沈裕虎 +1 位作者 王沛 王海庆 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期435-442,共8页
采用EST电子克隆技术,以拟南芥AVP1基因cDNA序列为信息探针,在GenBank中对豆科模式植物截形苜蓿(Medicago truncatula)的同源EST序列进行查询比较和拼接,获得了1个完整的cDNA序列跨叠群(con-tig),并通过RT-PCR成功获得了该cDNA序列,将... 采用EST电子克隆技术,以拟南芥AVP1基因cDNA序列为信息探针,在GenBank中对豆科模式植物截形苜蓿(Medicago truncatula)的同源EST序列进行查询比较和拼接,获得了1个完整的cDNA序列跨叠群(con-tig),并通过RT-PCR成功获得了该cDNA序列,将其命名为MtVP1.该序列包含1个2 298 bp的最大读码框,编码765个氨基酸.MtVP1编码的氨基酸序列与来自绿豆、拟南芥等高等植物的Ⅰ类液泡膜H+-PPase的氨基酸序列的一致性高达84%~93%,疏水性分析和结构预测表明MtVP1编码蛋白是一个典型的膜蛋白,含有13个跨膜区,含有3个在液泡膜H+-PPase中高度保守的区域(CS1、CS2和CS3).从结构分析结果推测MtVP1与AVP1在功能上具有相似性. 展开更多
关键词 液泡膜h+-ppase 截形苜蓿 电子克隆
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小拟南芥液泡膜H^+-PPase基因OpVP1的克隆、序列分析及表达 被引量:8
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作者 徐芳 赵云霞 +3 位作者 魏艳玲 李超 孙黎 黄先忠 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2013年第1期77-82,共6页
植物液泡膜质子转运无机焦磷酸酶(V-PPase)酸化植物液泡并为液泡的次级转运系统提供能量,在植物耐盐性起着重要的作用。为了克隆小拟南芥液泡膜H+-PPase基因,采用RT-PCR结合RACE的方法从小拟南芥叶片的cDNA中克隆了1个液泡膜H+-PPase基... 植物液泡膜质子转运无机焦磷酸酶(V-PPase)酸化植物液泡并为液泡的次级转运系统提供能量,在植物耐盐性起着重要的作用。为了克隆小拟南芥液泡膜H+-PPase基因,采用RT-PCR结合RACE的方法从小拟南芥叶片的cDNA中克隆了1个液泡膜H+-PPase基因,命名为OpVP1。OpVP1基因的cDNA全长为2698bp,开放阅读框(ORF)为2313bp,编码770个氨基酸。OpVP1蛋白与琴叶拟南芥、拟南芥相似性最高,分别为98.6%、98.4%。系统进化分析表明OpVP1基因属于Ⅰ型液泡膜质子焦磷酸酶基因。OpVP1蛋白的分子量是80745.9Da,等电点pI为5.13,含有14个跨膜螺旋结构。三维结构分析表明OpVP1蛋白是由2个单体组成的二聚体蛋白。qRT-PCR表明OpVP1基因在角果中表达高于根、茎、叶和花中的表达。 展开更多
关键词 焦磷酸酶 h+-ppase 小拟南芥 OpVP1 克隆
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植物“液泡膜”H^+ -PPase的功能与应用 被引量:2
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作者 孙艳香 冯雪 +2 位作者 贾永红 张一名 赵学良 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期591-596,共6页
H+-PPase是一类将焦磷酸水解与质子转运相耦联的焦磷酸酶。在植物中,主要定位在液泡膜,少量定位于细胞质膜,除具有酸化液泡、有助于有毒离子的液泡区室化功能外,还有调控质膜H+-ATPase介导的根际酸化,促进氮、磷吸收的功能。本文就植物&... H+-PPase是一类将焦磷酸水解与质子转运相耦联的焦磷酸酶。在植物中,主要定位在液泡膜,少量定位于细胞质膜,除具有酸化液泡、有助于有毒离子的液泡区室化功能外,还有调控质膜H+-ATPase介导的根际酸化,促进氮、磷吸收的功能。本文就植物"液泡膜"H+-PPase的定位、结构与性质、调控与作用机制及其在基因工程中的利用等方面展开论述,旨在使研究者系统地了解"液泡膜"H+-PPase的研究进展,为未来通过调控H+-PPase的表达来改进植物的生长发育、抗盐耐旱能力、氮、磷肥的利用效率等生产应用提供参考。 展开更多
关键词 h+-ppase 质子泵 抗盐耐旱 肥料利用率
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百脉根液泡膜H^+-PPase基因LcVP1植物表达载体构建与转基因毛白杨的获得 被引量:1
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作者 孙艳香 冯雪 赵学良 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第4期134-138,共5页
为通过基因工程手段进行杨树耐盐性状的遗传改良,笔者分析已克隆的百脉根液泡膜H+-PPase基因LcVP1的cDNA序列,根据其与植物表达中间载体pGN上的酶切位点设计1对带酶切位点的特异性引物,以测序质粒为模板,PCR扩增百脉根液泡膜H+-PPase基... 为通过基因工程手段进行杨树耐盐性状的遗传改良,笔者分析已克隆的百脉根液泡膜H+-PPase基因LcVP1的cDNA序列,根据其与植物表达中间载体pGN上的酶切位点设计1对带酶切位点的特异性引物,以测序质粒为模板,PCR扩增百脉根液泡膜H+-PPase基因开放阅读框片段。双酶切PCR回收产物和pGN载体,将目的片段定向连接构建成植物表达载体pGVP,并转入根癌农杆菌;在此基础上,利用根癌农杆菌介导的叶盘转化法,将百脉根液泡膜H+-PPase基因转入毛白杨基因组中。转基因杨树的获得,为获得耐盐性提高的杨树品系提供了基础。 展开更多
关键词 百脉根 液泡膜h+-ppase LcVP1 pGVP 毛白杨
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LaCl_3和CPZ对磷饥饿番茄液泡膜H^+-ATPase和H^+-PPase活性的影响
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作者 徐函兵 曾镭 +2 位作者 单树花 刘晶茹 宋克敏 《北方园艺》 CAS 北大核心 2011年第7期1-4,共4页
采用水培法研究了LaCl3和氯丙嗪(CPZ)对磷饥饿番茄幼苗液泡膜H+-ATPase和H+-PPase活性的影响。结果表明:LaCl3处理抑制了液泡膜H+-ATPase活性,但提高了H+-PPase活性;而CPZ处理既抑制了液泡膜H+-ATPase活性,又抑制了液泡膜H+-PPase活性... 采用水培法研究了LaCl3和氯丙嗪(CPZ)对磷饥饿番茄幼苗液泡膜H+-ATPase和H+-PPase活性的影响。结果表明:LaCl3处理抑制了液泡膜H+-ATPase活性,但提高了H+-PPase活性;而CPZ处理既抑制了液泡膜H+-ATPase活性,又抑制了液泡膜H+-PPase活性。同时,CPZ处理引起磷饥饿番茄幼苗可溶性蛋白质含量下降,LaCl3处理引起可溶性蛋白质含量增加。 展开更多
关键词 液泡膜 h+-ATPase h+-ppase 磷饥饿 番茄
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过表达截形苜蓿液泡膜H^+-PPase基因促进拟南芥的生长和根围酸化
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作者 王建武 相微微 《山西农业科学》 2016年第7期907-909,917,共4页
在前期研究工作中,中国科学研究院西北高原生物研究所分子实验室已从豆科模式植物截形苜蓿(Medicago truncatula)中克隆到一种液泡膜焦磷酸酶(V-H^+-PPase)基因Mt VP1,并进行了序列分析。在前期工作的基础上,构建植物表达载体pBI121-Mt ... 在前期研究工作中,中国科学研究院西北高原生物研究所分子实验室已从豆科模式植物截形苜蓿(Medicago truncatula)中克隆到一种液泡膜焦磷酸酶(V-H^+-PPase)基因Mt VP1,并进行了序列分析。在前期工作的基础上,构建植物表达载体pBI121-Mt VP1,把Mt VP1基因转入到拟南芥中,观察转基因拟南芥的表型变化。结果表明,过表达Mt VP1能使转基因株系的根系更发达,主根数增多1~2条,地上部生物量增大,并且促进了转基因株系的根围酸化能力;但幼苗耐盐性试验表明,转基因株系与对照没有明显差异。 展开更多
关键词 液泡膜h+-ppase 根发育 根围酸化 耐盐性
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怀化地区犬瘟热病毒H、F基因遗传多样性及其遗传进化分析
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作者 罗世民 李中波 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期3248-3257,共10页
【目的】探究怀化地区犬瘟热病毒的基因变异与遗传多样性情况,阐明其遗传进化关系。【方法】从怀化地区收集30株犬源犬瘟热病毒样本,用PCR法扩增其H、F基因序列。利用DNAStar软件分析H、F基因序列碱基组成;利用Clustal X、MegAlign软件... 【目的】探究怀化地区犬瘟热病毒的基因变异与遗传多样性情况,阐明其遗传进化关系。【方法】从怀化地区收集30株犬源犬瘟热病毒样本,用PCR法扩增其H、F基因序列。利用DNAStar软件分析H、F基因序列碱基组成;利用Clustal X、MegAlign软件进行变异位点和遗传多样性分析;运用Clustal X、PhyML 3.0软件,采用最大似然法(ML)对怀化地区犬瘟热病毒进行遗传进化分析,并用FigTree v 1.3.1软件构建遗传进化树。【结果】30株怀化地区犬瘟热病毒均为Asia-Ⅰ型,其H、F基因序列长度分别为1778和1850 bp,其AT含量分别为56.8%~57.9%和54.9%~56.1%,GC含量分别为42.2%~43.0%和44.1%~44.9%。H基因的种内差异为0~3.1%,种间差异为51.36%~60.15%;F基因的种内差异为0~2.4%,种间差异为39.60%~53.09%。基于H、F基因序列所构建的遗传进化树发现,来源于怀化地区的30株犬源犬瘟热病毒全部位于遗传进化树的同一分支上。【结论】来源于怀化地区犬瘟热病毒之间虽存在一定程度的基因变异和遗传多样性,但它们之间的亲缘关系较近。且其H、F基因序列的种内差异小、种间差异大,是研究犬瘟热病毒基因变异、遗传多样性和遗传进化的重要遗传标记。 展开更多
关键词 犬瘟热病毒 h基因 F基因 基因变异 遗传多样性
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Cloning and Sequence of Glycoprotein H Gene of Duck Plague Virus 被引量:12
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作者 HAN Xian-jie WANG Jun-wei MA Bo 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2006年第5期397-402,共6页
The glycoprotein H (gH) gene homologue of duck plague virus (DPV) was cloned by degenerate polymerase chain reaction (PCR) and sequenced. It was located immediately downstream from the thymidine kinase gene (TK... The glycoprotein H (gH) gene homologue of duck plague virus (DPV) was cloned by degenerate polymerase chain reaction (PCR) and sequenced. It was located immediately downstream from the thymidine kinase gene (TK). In addition, the 3'-end of the gene homologue to herpesvirus UL21 was located downstream from the gH gene. DPV gH gene open reading frame (ORF) was 2 505 bp in length and its primary translation product was a polypeptide of 834 amino acids long. It possessed several characteristics of membrane glycoproteins, including an N-terminal hydrophobic signal sequence, an external domain containing eight putative N-linked glycosylation sites, a C-terminal transmembrane domain, and a charged cytoplasmic tail. Comparison with other herpesvirus revealed identities of 20.2, 25.1, 23.0, 23.0, 26.5 and 26.0% with the gH counterparts of the human herpesvirus virus 1 (HSV1), equine herpesvirus 4 (EHV4), bovine herpesvirus 1 (BHV1), pseudorabies virus (PRV), gallid herpesvirus 2 (GHV2) and gallid herpesvirus 3 (GHV3), respectively. 展开更多
关键词 duck plague virus glycoprotein h gene degenerate PCR
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Effects of salinity on activities of H^+-ATPase, H^+-PPase and membrane lipid composition in plasma membrane and tonoplast vesicles isolated from soybean(Glycine max L.) seedlings 被引量:9
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作者 YUBing-jun LAMHon-ming +1 位作者 SHAOGui-hua LIUYou-ling 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2005年第2期259-262,共4页
The effects of NaCl stress on the H +-ATPase, H +-PPase activity and lipid composition of plasma membrane(PM) and tonoplast(TP) vesicles isolated from roots and leaves of two soybean cultivars(Glycine max L.) differ... The effects of NaCl stress on the H +-ATPase, H +-PPase activity and lipid composition of plasma membrane(PM) and tonoplast(TP) vesicles isolated from roots and leaves of two soybean cultivars(Glycine max L.) differing in salt tolerance(Wenfeng7, salt-tolerant; Union, salt-sensitive) were investigated. When Wenfeng7 was treated with 0.3%(W/V) NaCl for 3 d, the H +-ATPase activities in PM and TP from roots and leaves exhibited a reduction and an enhancement, respectively. The H +-PPase activity in TP from roots also increased. Similar effects were not observed in roots of Union. In addition, the increases of phospholipid content and ratios of phospholipid to galactolipid in PM and TP from roots and leaves of Wenfeng7 may also change membrane permeability and hence affect salt tolerance. 展开更多
关键词 SALINITY Glycine max L. plasma membrane TONOPLAST h +-ATPase h +-ppase membrane lipid composition
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