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软刺裸鲤和齐口裂鳆鱼HIF1B和HIF2A的克隆及低氧适应性的表达分析
被引量:
9
1
作者
姜华鹏
张驰
+1 位作者
王丛丛
许强华
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2015年第5期11-18,共8页
获得高原软刺裸鲤(Gymnocypris dobula)和齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)HIF1B和HIF2A基因c DNA完整的开放阅读框(ORF),并进行氨基酸序列分析;采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,检测了HIF1B和HIF2A在两种裂腹鱼体内各组织中的表达,以...
获得高原软刺裸鲤(Gymnocypris dobula)和齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)HIF1B和HIF2A基因c DNA完整的开放阅读框(ORF),并进行氨基酸序列分析;采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,检测了HIF1B和HIF2A在两种裂腹鱼体内各组织中的表达,以及应激性低氧条件下罗非鱼不同组织中的表达。基因序列分析结果显示,软刺裸鲤和齐口裂腹鱼HIF1B基因长度分别为2 322 bp和2 313 bp,预测编码773和770个氨基酸;HIF2A基因长度分别为2 466 bp和2 502 bp,预测编码821和833个氨基酸。同源分析显示,齐口裂腹鱼和软刺裸鲤HIF1B ODD结构域氨基酸序列同源性为93.12%,HIF2A为89.56%。在CODD保守结构域中,软刺裸鲤HIF1B的LxxLAP位点突变成Pxx LAP,这可能是高原裂腹鱼HIF1B功能进化的重要标志。定量检测结果表明,在应激性低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达上升;而在长期低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达下降,推测硬骨鱼体内可能存在两种不同的机制来适应长期低氧和应激性低氧环境。
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关键词
裂腹鱼类
低氧环境
hif1b
HIF2A
基因克隆
进化
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职称材料
题名
软刺裸鲤和齐口裂鳆鱼HIF1B和HIF2A的克隆及低氧适应性的表达分析
被引量:
9
1
作者
姜华鹏
张驰
王丛丛
许强华
机构
上海海洋大学海洋科学学院
大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室
远洋渔业协同创新中心
国家远洋渔业工程技术研究中心
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2015年第5期11-18,共8页
基金
国家自然科学基金重点项目(31130049)
教育部科学技术研究项目(213013A)
+1 种基金
上海市教委科研创新项目曙光计划(13SG51)
上海市教委水产学一流学科项目
文摘
获得高原软刺裸鲤(Gymnocypris dobula)和齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)HIF1B和HIF2A基因c DNA完整的开放阅读框(ORF),并进行氨基酸序列分析;采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,检测了HIF1B和HIF2A在两种裂腹鱼体内各组织中的表达,以及应激性低氧条件下罗非鱼不同组织中的表达。基因序列分析结果显示,软刺裸鲤和齐口裂腹鱼HIF1B基因长度分别为2 322 bp和2 313 bp,预测编码773和770个氨基酸;HIF2A基因长度分别为2 466 bp和2 502 bp,预测编码821和833个氨基酸。同源分析显示,齐口裂腹鱼和软刺裸鲤HIF1B ODD结构域氨基酸序列同源性为93.12%,HIF2A为89.56%。在CODD保守结构域中,软刺裸鲤HIF1B的LxxLAP位点突变成Pxx LAP,这可能是高原裂腹鱼HIF1B功能进化的重要标志。定量检测结果表明,在应激性低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达上升;而在长期低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达下降,推测硬骨鱼体内可能存在两种不同的机制来适应长期低氧和应激性低氧环境。
关键词
裂腹鱼类
低氧环境
hif1b
HIF2A
基因克隆
进化
Keywords
Schizothoracinae
hypoxia condition
hif1b
HIF2A
gene cloning
evolution
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
软刺裸鲤和齐口裂鳆鱼HIF1B和HIF2A的克隆及低氧适应性的表达分析
姜华鹏
张驰
王丛丛
许强华
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2015
9
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职称材料
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参考文献
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