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q^2引导构象选择CoMFA方法研究HIV-1 RT抑制剂
被引量:
3
1
作者
曾宝珊
陈敏伯
+1 位作者
董喜成
刘新泳
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期1121-1128,共8页
对未知受体结构的药物设计其主导方法CoMFA来说,柔性目标分子的多种构象造成了问题的复杂性.本文介绍交叉验证参数R^2(q^2)引导的构象选择CoMFA方法,选择化合物的最佳构象.将一组47个HIV-1 RT抑制剂进行有、无构象选择的CoMFA分析来作评...
对未知受体结构的药物设计其主导方法CoMFA来说,柔性目标分子的多种构象造成了问题的复杂性.本文介绍交叉验证参数R^2(q^2)引导的构象选择CoMFA方法,选择化合物的最佳构象.将一组47个HIV-1 RT抑制剂进行有、无构象选择的CoMFA分析来作评价.根据化合物的活性、毒性、选择性指数(毒性/活性比)等实验数据构建得到的模型,其交叉验证参数q^2为0.7以上,非交叉验证的相应参数为0.94以上,最后,还经过试验集化合物验证该模型的预测能力,置信度(1-α)>0.99.
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关键词
q^2引导构象选择
CoMFA方法
hiv-1rt
抑制剂
比较分子场分析
配体药物
药物设计
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职称材料
干崖子橐吾的化学成分研究
被引量:
7
2
作者
李云森
王峥涛
+2 位作者
罗士德
陈纪军
张勉
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期342-345,共4页
目的 :研究云南民间使用的草药干崖子橐吾药用部位的化学成分 ,为其资源开发提供化学基础。方法 :运用层析法、结晶法等手段分离了 8个化合物 ,并通过理化常数及波谱方法鉴定了结构。结果 :8个化合物的结构为 :9α-hydroxypinoresinol( ...
目的 :研究云南民间使用的草药干崖子橐吾药用部位的化学成分 ,为其资源开发提供化学基础。方法 :运用层析法、结晶法等手段分离了 8个化合物 ,并通过理化常数及波谱方法鉴定了结构。结果 :8个化合物的结构为 :9α-hydroxypinoresinol( 1 ) ,1 1 -hydroxyeremophil-6 ,9-dien-8-one( 2 ) ,大黄素 ( 3) ,大黄素甲醚 ( 4 ) ,大黄素甲醚 -8-O-β-葡萄糖苷 ( 5 ) ,东莨菪内酯 ( 6 ) ,β-谷甾醇及胡萝卜苷。结论 :以上 8个化合物均为首次从干崖子橐吾中分离得到 ,其中化合物 3、4、5为首次从橐吾属中分离得到 ,化合物 1~ 6经过初步抗 HIV-1 RT活性测试 ,没有明显的抗 HIV-1
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关键词
干崖子橐吾
化学成分
抗
hiv-1rt
活性
提取
分离
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职称材料
HIV-1逆转录酶抑制剂的三维定量构效关系
3
作者
谢惠定
邱开雄
+1 位作者
谢小光
付继军
《分子科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期315-320,共6页
采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)对一系列非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂(苯磺酰基亚胺噻唑类化合物)进行了三维定量构效关系的研究,获得了高可靠性的CoMFA和CoMSIA模型,其交叉验证相关系数q2值分别为0....
采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)对一系列非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂(苯磺酰基亚胺噻唑类化合物)进行了三维定量构效关系的研究,获得了高可靠性的CoMFA和CoMSIA模型,其交叉验证相关系数q2值分别为0.748和0.607.通过对CoMFA和CoMSIA模型三维等势图的分析,确定了该类化合物抗HIV-1活性的结构要求.研究结果表明,对苯磺酰基亚胺噻唑类化合物而言,在苯环的C-5位引入体积大和电负性强的基团能增加其抑制活性;苯环的C-2位的氢键给体基团对活性有利;噻唑环的R2取代基疏水性增大会降低生物活性.研究结果表明,可以指导新HIV-1逆转录酶抑制剂的设计和合成.
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关键词
比较分子力场分析法
比较分子相似性指数分析法
hiv-
1
逆转录酶
苯磺酰基亚胺噻唑类化合物
原文传递
题名
q^2引导构象选择CoMFA方法研究HIV-1 RT抑制剂
被引量:
3
1
作者
曾宝珊
陈敏伯
董喜成
刘新泳
机构
中国科学院上海有机化学研究所
山东大学药学院药物化学研究所
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第7期1121-1128,共8页
基金
中国科学院2002年度创新工程资助项目。
文摘
对未知受体结构的药物设计其主导方法CoMFA来说,柔性目标分子的多种构象造成了问题的复杂性.本文介绍交叉验证参数R^2(q^2)引导的构象选择CoMFA方法,选择化合物的最佳构象.将一组47个HIV-1 RT抑制剂进行有、无构象选择的CoMFA分析来作评价.根据化合物的活性、毒性、选择性指数(毒性/活性比)等实验数据构建得到的模型,其交叉验证参数q^2为0.7以上,非交叉验证的相应参数为0.94以上,最后,还经过试验集化合物验证该模型的预测能力,置信度(1-α)>0.99.
关键词
q^2引导构象选择
CoMFA方法
hiv-1rt
抑制剂
比较分子场分析
配体药物
药物设计
Keywords
3D-QSAR
CoMFA
q2 guided conformation selection
分类号
TQ460 [化学工程—制药化工]
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职称材料
题名
干崖子橐吾的化学成分研究
被引量:
7
2
作者
李云森
王峥涛
罗士德
陈纪军
张勉
机构
中国药科大学生药学研究室
中国科学院昆明植物研究所植物化学开放实验室
出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期342-345,共4页
基金
国家杰出青年基金资助项目 ( NO 3982 5 12 9)
文摘
目的 :研究云南民间使用的草药干崖子橐吾药用部位的化学成分 ,为其资源开发提供化学基础。方法 :运用层析法、结晶法等手段分离了 8个化合物 ,并通过理化常数及波谱方法鉴定了结构。结果 :8个化合物的结构为 :9α-hydroxypinoresinol( 1 ) ,1 1 -hydroxyeremophil-6 ,9-dien-8-one( 2 ) ,大黄素 ( 3) ,大黄素甲醚 ( 4 ) ,大黄素甲醚 -8-O-β-葡萄糖苷 ( 5 ) ,东莨菪内酯 ( 6 ) ,β-谷甾醇及胡萝卜苷。结论 :以上 8个化合物均为首次从干崖子橐吾中分离得到 ,其中化合物 3、4、5为首次从橐吾属中分离得到 ,化合物 1~ 6经过初步抗 HIV-1 RT活性测试 ,没有明显的抗 HIV-1
关键词
干崖子橐吾
化学成分
抗
hiv-1rt
活性
提取
分离
Keywords
Ligualria kanaitizensis
Chemical constituents
Anti HIV
1
rt
activity
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
HIV-1逆转录酶抑制剂的三维定量构效关系
3
作者
谢惠定
邱开雄
谢小光
付继军
机构
云南大学化学科学与工程学院
昆明医科大学药学院暨云南省天然药物药理重点实验室
出处
《分子科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期315-320,共6页
基金
云南省应用研究基础计划项目(2011FZ096)
文摘
采用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)对一系列非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂(苯磺酰基亚胺噻唑类化合物)进行了三维定量构效关系的研究,获得了高可靠性的CoMFA和CoMSIA模型,其交叉验证相关系数q2值分别为0.748和0.607.通过对CoMFA和CoMSIA模型三维等势图的分析,确定了该类化合物抗HIV-1活性的结构要求.研究结果表明,对苯磺酰基亚胺噻唑类化合物而言,在苯环的C-5位引入体积大和电负性强的基团能增加其抑制活性;苯环的C-2位的氢键给体基团对活性有利;噻唑环的R2取代基疏水性增大会降低生物活性.研究结果表明,可以指导新HIV-1逆转录酶抑制剂的设计和合成.
关键词
比较分子力场分析法
比较分子相似性指数分析法
hiv-
1
逆转录酶
苯磺酰基亚胺噻唑类化合物
Keywords
CoMFA
CoMSIA
hiv-1rt
thiazolidenebenzenesulfonamide derivatives
分类号
O643 [理学—物理化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
q^2引导构象选择CoMFA方法研究HIV-1 RT抑制剂
曾宝珊
陈敏伯
董喜成
刘新泳
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
3
下载PDF
职称材料
2
干崖子橐吾的化学成分研究
李云森
王峥涛
罗士德
陈纪军
张勉
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001
7
下载PDF
职称材料
3
HIV-1逆转录酶抑制剂的三维定量构效关系
谢惠定
邱开雄
谢小光
付继军
《分子科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
原文传递
已选择
0
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