人类白细胞抗原HLA-A基因多态性与HBV携带的相关性研究

目的探讨人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因多态性与乙型肝炎病毒(HBV)感染的相关性。方法收集云南省昆明市延安医院健康体检者静脉血样本501例,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测HBV二对半,根据HBV二对半检测结果分为HBV携带组和既往感染组以及健康对照组3组,用序列特异性引物聚合酶链反应(polymerase chain reaction with sequence specific primers,PCR-SSP)基因分型技术检测HLA-A抗原的基因型,将HBV携带组和健康对照组以及HBV既往感染组和健康对照组的HLA-A基因多态性的分布频率进行比较。采用SPSS17.0软件进行数据统计分析。结果健康对照组HLA-A2阳性数占比47.49%,等位基因频率数占比31.29%;健康对照组基因分布频率总体与中华骨髓库发布的中国常见及确认的HLA-A等位基因表一致。HBV携带组HLA-A2阳性数占比63.04%,等位基因频率数占比42.23%,携带者的HLA-A2阳性率和等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05);HBV既往感染组HLA-A2阳性数占比56.14%,等位基因频率数占比35.97%,既往感染组的HLA-A2阳性率和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论HLA-A2基因可能是慢性乙型肝炎HBV携带者的易感基因。

卡马西平致HLA-A*3101基因阳性中国汉族人发生Stevens-Johnson综合征1例

1病例资料患者女,39岁,因“发热5天,躯干四肢皮疹伴疼痛4天”于2020年3月24日入北京大学第三医院皮肤科病房治疗。患者入院前18天开始因三叉神经痛服用卡马西平0.1 g,每日两次,甲钴胺0.5 mg,每日三次,入院前5天出现发热,体温最高达38.3℃,血常规提示血小板减少,外院考虑“上呼吸道感染”,并予口服头孢地尼0.1 g,每日三次;莲花清瘟颗粒6 g,每日三次;利可君20 mg,每日三次。入院前4天前胸和腹部出现红斑,并停用以上所有药物,后皮疹逐渐增多并扩散至四肢,部分红斑上出现米粒至黄豆大小水疱,口腔黏膜糜烂,双眼结膜充血,遂至北京大学第三医院皮肤科治疗。入院查体:体温36.3℃,脉搏90次/min,呼吸18次/min,血压130/85 mmHg,系统查体未见明显异常。

卡马西平致HLA-A*31:01基因携带者发生超敏反应综合征一例

目的:明确一例可能由卡马西平诱发的药物超敏反应综合征的诊断,确定致敏药物。方法:收集患者临床资料,提取患者外周血单个核细胞,进行HLA等位基因分型和淋巴细胞转化实验(lymphocyte transformation test,LTT)。结果:该患者HLA等位基因分型提示患者携带HLA-A*31:01;LTT结果显示在卡马西平刺激后,淋巴细胞进行增殖。结论:结合患者临床表现、HLA分型和LTT结果,诊断为由卡马西平诱发的药物超敏反应综合征。

HLA新等位基因A*3018的序列分析和确认

为了识别和确认中国汉族人群中的HLA新等位基因,使用PCR-SSP、FLOW-SSO以及PCR-SBT等HLA分型技术,发现样本A位点的杂合结果A*240201,300101在外显子2有3个位置与数据库不相符。用组特异性引物分别扩增A*24及A*30基因,对外显子2、3、4进行双向测序,发现1个与A*300101序列相近的新等位基因。分析该等位基因与A*300101序列的差异。用EB病毒感染外周血B淋巴细胞,建立该等位基因的无限增殖化B淋巴细胞系。结果表明:该基因与A*300101相比在外显子2有3个碱基的改变,碱基121A→C、123T→C导致密码子17AGT->CGC,17S(丝氨酸)→R(精氨酸);碱基126A→G导致密码子18GGA→GGG,18G(甘氨酸)→G(甘氨酸),该氨基酸是同义突变。成功建立了该等位基因的无限增殖化B淋巴细胞系,该基因序列已提交GenBank,编号为DQ872509。结论:该等位基因为新的HLA-A等位基因,已于2006年8月被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-A*3018(上报编号HWS10004039)。

应用PCR-SSOP技术研究中国汉族、维吾尔族HLA-A基因座基因多态性(英文)

人类白细胞抗原 (HumanLeukocyteAntigen ,HLA)基因复合物位于 6p2 1.3,有 2 2 0多个不同的功能基因 ,是人类基因组最复杂的遗传多态系统。HLA等位基因的变异在医学、法医学、人类学等领域具有重要的意义。自从 196 4年以来 ,HLA分型一直采用经典的微量淋巴细胞毒实验 ,但该方法是血清学水平的分型 ,不能识别很多特异性的等位基因 ,而且高质量的抗体也不易获得。从 2 0世纪 90年代起 ,在国家自然科学基金的资助下 ,首先开展HLAⅡ类位点基因分型研究及大规模群体多态性调查 ,所获得的中国主要民族基因数据已应用于多个领域。相比之下 ,HLAⅠ类基因数量更丰富 ,包含了A、B、C、E、F、G和假基因H、J、K、L等 10个位点 ;基因分子结构更复杂 ,更具多态性。因此 ,HLAⅠ类DNA分型比HLAⅡ类分型有许多困难。直至目前中国人群HLA A基因座基因多态性和分布频率的研究尚未充分进行。而任何DNA标记用于遗传分析、法医鉴定等领域之前 ,必须先进行群体调查 ,建立不同民族基因数据库 ,这是不可逾越的基础工作。鉴于此 ,采用灵敏而非同位素污染的PCR SSOP基因分型技术 ,对 16 5个汉族和 16 2个维吾尔族个体的HLA A基因座多态性进行调查。结果在汉族群体中发现 2 2种等位基因 ,频率最高的是HLA A 110 1(19.7% ) 。

人肿瘤转移相关抗原肝素酶HLA-A2.1限制性CTL表位的预测及初步鉴定

目的预测并鉴定肿瘤转移相关抗原肝素酶来源的HLA-A2.1限制性CTL表位。方法采用超基序、量化基序和分子模拟相结合的方法,对肝素酶HLA-A2.1限制性CTL表位进行预测,合成候选表位肽;利用T2细胞的特点,对合成的候选肽与HLA-A2.1分子进行亲和力分析,初步验证预测结果;利用标准51Cr释放试验检测特异性CTLs诱导活性。结果在所筛选的5个候选CTL表位中,Hpa(525-533)、Hpa(277-285)、Hpa(405-413)可在体外有效诱导肝素酶特异性CTLs的产生,对肝素酶阳性且HLA-A2阳性的KATO-Ⅲ细胞具有明显的杀伤效应。结论Hpa(525-533)、Hpa(277-285)、Hpa(405-413)有可能是肿瘤抗原肝素酶HLA-A2.1的限制性CTL表位。

HLA-A*02等位基因与云南宣威肺癌相关性研究

目的:探讨HLA-A*02等位基因及其亚型在云南宣威肺癌患者中的分布频率,为肺癌高发区的防治研究提供群体遗传学资料。方法:选取宣威籍肺癌患者与健康对照组,运用序列特异性引物基因分型技术(PCR-SSP)进行HLA-A位点及其HLA-A*02亚型分型。按照病例-对照研究方法分析HLA-A等位基因在两组之间频率分布的差异及肺癌HLA-A*02亚型多态性分布。结果:肺癌组与健康对照组HLA-A*02阳性率分别为68.75%及47.50%,肺癌组HLA-A*02阳性率显著增加(P=0.004,OR=2.432,95%CI=1.314～4.500);两组间HLA-A*02等位基因频率分别为41.67%及25.00%,具有显著性差异(P<0.05);宣威健康人群HLA-A等位基因分布频率总体特征与中国南方汉族人群一致;HLA-A*02阳性的肺癌组样本经高分辨检出HLA-A*0201、0203、0206、0207四种等位基因亚型,频率分别为29.73%、16.22%、13.51%、40.54%,符合中国南方汉族人群以A*0207为主的特征。结论:HLA-A*02可能与宣威肺癌易感相关,肺癌患者HLA-A*02亚型以A*0207为主,宣威地区人群属于南方汉族人群。

中国鲁南地区汉族人群HLA-A,B,DRB1高分辨等位基因多态性分析

本研究旨在分析中国鲁南地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因的高分辨多态性分布特征。采用PCR-SBT对中国鲁南地区688名无血缘关系的汉族健康人群进行HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型,并对分型结果做统计学分析。结果表明:688例样本A、B、DRB1座位分别检出31、63、39个等位基因,其中频率大于0.05的常见等位基因为A*24:02、A*30:01、A*11:01、A*02:01、A*33:03、A*02:06、B*13:02、B*44:03、B*51:01、B*46:01、B*15:01、B*58:01、DRB1*07:01、DRB1*15:01、DRB1*09:01和DRB1*08:03。上述A、B、DRB1位点常见等位基因累计基因频率分别为0.7223、0.4432、0.5453。最常见的A*-B*-DRB1*单倍型是A*30:01-B*13:02-DRB1*07:01(0.1151),最常见的两位点连锁单倍型分别是A*30:01-B*13:02(0.1303)、A*30:01-DRB1*07:01(0.1157)和B*13:02-DRB1*07:01(0.1307)。结论:获得了中国鲁南汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因和单倍型分布特征,为评估该地区患者找到HLA匹配供者的机率,为合理选择移植供者及移植免疫、HLA与疾病相关性研究提供了参考数据。

HLA-A02基因型与中国高发区肝细胞癌的密切关联

目的：探讨ＨＬＡＡ０２型及其亚型与启东肝细胞癌的相关性。方法：用ＰＣＲＳＳＰ法分析启东肝细胞癌和正常人中ＨＬＡＡ０２型及其亚型的分布。结果：１０３例经病理诊断的肝细胞癌中５７例为ＨＬＡＡ０２型，其比例达到５５％，显著高于启东正常人群ＨＬＡＡ０２型３２％（３３／１０２）的比例，Ｐ＜０．００１。同时揭示包括ＨＬＡＡ０２型在内的ＨＬＡＡ位点的等位基因多为杂合型。启东肝细胞癌ＨＬＡＡ０２型中Ａ０２０１亚型所占的比例稍高于正常人群，但没有显著差异。分析比较表明，启东肝细胞癌中ＨＬＡＡ０２型的相对集中与当地肝癌中ｐ５３基因２４９密码子突变的高频度发生并没有关联。结论：在乙肝病毒和黄曲霉毒素均为危险因子的启东地区，ＨＬＡＡ０２型与肝细胞癌密切相关。

人Ⅱ型胶原的HLA-A~＊0201限制性CTL表位的预测及初步鉴定

目的预测和初步鉴定类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)主要自身抗原Ⅱ型胶原(CollagenⅡ,CⅡ)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS、SYFTEPITHI、IEDB、SVMHC、AntiJen预测工具预测该抗原HLA-A*0201限制性结合肽;人工合成待测表位肽,利用T2细胞株通过直接免疫荧光法测定各肽与HLA-A*0201分子的结合力。利用酶联免疫斑点检测(enzyme-linked immunospotassay,ELISPOT)方法检测候选肽刺激关节滑液单个核细胞(synovial fluid mononuclear cell,SFMC)分泌IFN-γ的能力。结果综合BIMAS、SYFTEPITHI、IEDB、SVMHC、AntiJen预测结果筛选出来可能与HLA-A*0201结合的5条肽。MHC亲和力实验表明,在候选的5条肽中,P1261、P1365及P1399具有与HLA-A*0201分子结合的能力,平均荧光强度分别为:1.35、2.53、1.78。ELISPOT试验结果表明,P1365具有刺激SFMC分泌IFN-γ的能力。结论表位预测结果与初步鉴定结果具有一致性,两者联合应用初步认为P1365是HLA-A*0201限制性CTL表位的可能性最大,为下一步表位鉴定及基于人CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定理论基础。

HPV16E7抗原HLA-A2限制性CTL表位预测及其合成

目的 预测、合成、纯化及鉴定人乳头瘤病毒E7抗原的HLA A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位 ,为表位抗原特异性鉴定和临床研究提供靶肽。方法 采用超模体、多项式和量化模体方案相结合的方法 ,对靶抗原HPV16E7的HLA A2限制性细胞毒性T淋巴细胞 (CytotoxicTlymphocyte ,CTL)表位进行预测 ,并运用固相合成法合成多肽 ,经RP HPLC纯化及纯度分析 ,用质谱进行定性鉴定。结果 分别预测出了 16个、10个和 3个九肽表位 ,确定其中 5个九肽为候选合成表位 ,各合成肽的纯度都在 95 %以上。经质谱分析 ,各肽的分子量测定值与理论值相符。结论 超模体、多项式和量化模体方案联合应用可提高预测效率 ,避免了在研究E7抗原表位时盲目合成多肽 ;所合成的多肽为高纯度靶肽 。

中国北方汉族人群HLA-A、HLA-B、HLA-DR等位基因频率检测及其临床意义

目的从基因水平了解中国北方地区汉族人群人类白细胞抗原HLA-A、HLA-B、HLA-DR位点的 等位基因(以下分别简称为A等位基因、B等位基因及DR等位基因)频率,获得更完整、准确的HLA群体遗传学 数据。方法 应用聚合酶链反应一序列特异性引物(PCR-SSP)方法对2000名北方汉族健康志愿者进行A、B、DR 等位基因分型。结果鉴定了17个A等位基因,32个B等位基因,13个DRB1等位基因。最常见的基因型分别 为A*02、B*13、DRB1*15,其相应基因频率范围分别为0.2400-0.2767、0.1330-0.1432和0.1557-0.1707。结 论 本结果可作为我国HLA多态性研究的群体资料和正常参考值,对群体遗传、疾病关联研究以及寻找HLA 相合的异基因造血干细胞供者具有重要意义。

HLA-A~*02等位基因分型技术及汉族HLA-A~*02多态性研究

建立高分辨率的套式ＰＣＲ－ＳＳＰ，对１７个ＨＬＡ－Ａ＊０２等位基因分型。利用国际标准分型细胞进行特异性鉴定，并在５４例Ａ＊０２阳性的无血缘关系汉族健康人中应用。共检测到５个Ａ＊０２亚型，显示出较高多态性：其中Ａ＊０２１１（ｎ＝２）首次在东方人群检测到；Ａ＊０２０１频率最高，占有４８．２％；其余依次为Ａ＊０２０６、Ａ＊０２０７和Ａ＊０２０３。套式ＰＣＲ－ＳＳＰ既适用于移植供体选择，又可用于人类进化研究。

HLA-A2^+供者外周血hCMV特异性CTL的定量及其表型分析

目的:利用加载人巨细胞病毒(hCMV)结构蛋白pp65衍生抗原肽NLV(pp65495-503)的HLA-A0201(A2-NLV)四聚体,探讨四聚体染色条件的优化及其在特异性CTL表型分析中的应用。方法:取HLA-A2+供者外周血,以A2-NLV四聚体/PE在不同条件下染色,然后以anti-CD3-FITC和anti-CD8-APC标记,流式细胞术分析染色结果,寻找四聚体最佳染色条件,并分析特异性CTL的表型和活化抗原表达。结果:以全血样进行四聚体染色结果优于分离的PBMC。A2-NLV四聚体用量为0.3μg时,与100μL全血于4℃温育1h,特异性染色效果最佳,而与CD8-T细胞非特异性结合很低。以此优化条件进行特异性CTL表型分析,结果显示CD28阳性的A2-NLV四聚体特异性CTL的百分率较非特异性CTL低,表达CD57的百分率较非特异性CTL高,CD25分子只表达于活化的特异性CTL上。结论:通过对染色条件进行优化可明显提高四聚体染色的特异性,降低非特异性结合,优化的四聚体染色法能用于抗原特异性CTL的表型和功能分析。

西北地区汉族HLA-A ,B基因座单元型分析

目的 调查分析西北地区汉族人群中HLA A ,B基因座单元型频率。方法 采用PCR SSO反向斑点杂交技术对 87个家系 2 76名西北地区汉族个体HLA A ,B基因座进行检查 ,通过HLA以单元型遗传方式遗传的规律归结出单元型。结果 居单元型频率前三位的是A0 2 B4 6、A30 B13、A0 2 B4 0 ;具有明显连锁不平衡的单元型 11种。结论 西北地区汉族人群中HLA A ,B基因座单元型频率与国内其他地区汉族人群相比有其自身特点 ,A30 B13、A0 1 B37、A32 B4

4082名上海骨髓库汉族无关供者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究

目的了解上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1在高分辨分型水平上的等位基因及单体型频率分布特征。方法采用PCR-测序分型技术(Sequence-based typing,SBT)对4 082名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库上海分库汉族造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果 4 082例样本中,共观察到204个HLA等位基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1等位基因分别有A*11∶01、A*24∶02、A*02∶01、B*46∶01、DRB1*09∶01、DRB1*15∶01。841条A-B单体型中,70条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),17条单体型的频率高于0.01;1 027条B-DRB1单体型中,99条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),12条单体型的频率高于0.01;3 344条A-B-DRB1单体型中,681条单体型是"可靠的"(频率≥3.67×10-4),单体型频率高于0.001有135条。结论获得上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,为临床移植供者的选择、中国人群CWD表的制订、骨髓库最适库容的评估及人类遗传学研究提供参考数据。

乙肝后肝硬化患者HLA-A、DRB1等位基因多态性研究

目的 :了解乙肝后肝硬化患者的HLA A、DRB1等位基因多态性。方法 :用基因芯片分型方法分析比较 6 1例慢性乙肝后肝硬化患者与 14 6例正常人HLA A、DRB1等位基因的多态性。结果 :HLA A位点中的HLA A0 2、11、2 4与HLA DRB1位点中的HLA DRB1 12、0 9、0 4为正常人群常见等位基因。乙肝后肝硬化患者组HLA A0 2 (43 4 %vs 2 9 1% ,OR :1 87,P =0 0 0 5 ,95 %CI:1 2 1 2 89)与HLA DRB1 0 7(13 9%vs5 1% ,OR :3 0 0 ,P =0 0 0 2 ,95 %CI:1 4 8 6 0 7)、HLA DRB1 0 8(16 4 %vs6 8% ,OR :2 6 7,P =0 0 0 3,95 %CI:1 4 0 5 0 8)、HLA DRB1 11(12 3%vs 5 8% ,OR :2 2 7,P =0 0 2 5 ,95 %CI:1 11 4 6 4 )的出现频率较正常对照组明显升高。在HLA A位点中 ,乙肝后肝硬化患者组的纯合子比例较正常组有升高趋势 ,但无统计学意义。结论 :HLA A0 2与HLA DRB1 0 7、0 8、11可能是乙肝后肝硬化的易感基因。

中华骨髓库湖北分库志愿者HLA-A*02亚型基因多态性分析

目的:检测中华骨髓库湖北分库志愿者HLA-A*02基因亚型,了解其亚型基因多态性分布特点。方法:采用序列特异性寡核苷酸探针聚合酶链反应技术(PCR-SSOP)及聚合酶链反应-直接测序技术(PCR-SBT)对分库1 364名志愿者进行HLA-A高分辨率分型。结果:1 364例HLA-A基因分型结果中,共691例A*02阳性,A*02低分辨基因型频率为0.301,检出A*0201、A*0203、A*0205、A*0206、A*0207、A*0210、A*0211、A*0290,8个等位基因。其中A*0201是优势基因,A*0207、A*0206、A*0203为常见型基因,本研究人群中还检测出了东亚人群罕见型基因:A*0205、A*0211、A*0290。其基因频率分布与台湾慈济脐血库、日本、北爱尔兰、亚裔美国人比较,存在统计学差异。此人群A*02低、高分辨杂合度分别为83.4%、96.7%,其高分辨率纯合子呈现规律性的分布。结论:中华骨髓库湖北分库志愿者HLA-A*02亚型基因频率呈高度多态性,其基因多态性与台湾慈济脐血库、日本、北爱尔兰、亚裔美国人存在显著性差异。