云南纳西族HLA-DRB1基因多态性研究及其族源分析

首次在国内采用本室改进的高分辨率的基于内含子的PCR -SBT分型方法 ,检测云南纳西族HLA -DRB1基因多态性。在 60例纳西族个体中共检出 37种HLA -DRB1等位基因 ,其显著特点是等位基因的类型检出较多 ,频率分布比较平均 ,除 1 2 0 2 1 ( 1 7 5 0 % )外其他的等位基因频率均低于 8% ,其他较常见的等位基因 ( >5 % )还有 1 40 4 ( 7 5 0 % ) ,1 5 0 4 ( 5 83% ) ,0 4 0 5 1 ( 5 83% ) ,0 80 32 ( 5 83% ) ,0 90 1 2 ( 5 % ) ,0 30 1 1 ( 5 % )。这几种中频等位基因共占可检出等位基因的 35 % ,与 1 2 0 2 1一起共占 5 2 49%。其中DRB1 0 30 5、0 4 38、1 1 2 3、1 1 32、1 31 0、0 81 2为首次在我国人群中检出 ,并且在世界各地人群中也比较罕见。对纳西族和世界各地人群的HLA -DRB1频率进行了聚类分析。比较分析的结果显示纳西族明显属于中国南方族群 ,未显示出其族源来自北方的痕迹。根据遗传数据 ,并参照民族学、历史学研究 。

云南汉族HLA-DRB1多态性分析及与9个汉族群体的比较

应用聚合酶链反应—微孔板杂交 (PolymeraseChainReactionandMicrotitrePlateHybridization ,PCR MPH)的方法对云南 12 9个无亲缘关系的汉族样品进行了HLA DRB1的遗传多态性分析 ,对MPH初分出的DRB1 15组的样品进行了单链构象多态 (Single StrandConformationPolymorphism ,SSCP)检测。共发现 36种等位基因 ,其中等位基因频率大于 0 0 5的有DRB1 15 0 1(0 12 4 0 ) ,DRB1 0 90 12 (0 0 96 9) ,DRB1 0 80 32 (0 0 930 ) ,DRB1 12 0 2(0 0 891) ,DRB1 12 0 1(0 0 814 ) ,DRB1 14 0 1(0 0 775 ) ,DRB1 0 70 1(0 0 6 2 0 )。云南汉族HLA DRB1等位基因频率与中国其他 9个汉族群体进行 χ2 检验 ,结果显示与云南汉族比较 χ2 >10的有西安汉族 (DR8,χ2 =13 9712 )、上海汉族 (DR4 ,χ2 =10 16 32 )、广东汉族 (DR9,χ2 =12 6 12 1)和南京汉族 (DR4 ,χ2 =10 5 796 )。从遗传距离分析发现 ,在 9个国内汉族群体中云南汉族与辽宁汉族有最近的距离 (0 0 5 4 1) ,而与广东汉族最远 (0 185 1)。云南汉族在构成上可能与辽宁汉族更为接近 ,尽管地处南方 ,但已不属典型的南方汉族。这也可能因云南汉族与当地的少数民族存在基因交流 。

原发性胆汁性肝硬化与自身免疫性胆管炎的临床特征和HLA-DRBl等位基因分析

目的:分析原发性胆汁性肝硬化(PBC)和自身免疫性胆管炎(AIC)患者的临床表现、肝组织病理学特征及其与HLA-DRB1等位基因的相关性.方法:回顾性分析PBC患者94例,筛选出13例AIC、9例PBC和自身免疫性肝炎(AIH)重叠综合征(PBC/AIH重叠综合征),分析AIC、PBC/AIH重叠综合征和单纯PBC患者的临床表现和肝组织病理学特征,采用序列特异性多聚酶链反应(PCR-SSP)进行HLA-DRB1等位基因分析.结果:AIC和单纯PBC比较,在年龄、性别、血生化及肝组织病理学上不能区分二者,但是AIC患者治疗前AIH计分(8.8±0.9vs4.6±0.8,t=17.45,P<0.01)、ANA和/或SMA阳性率(84.6%vs22.2%,c2=17.0039,P<0.01)明显高于单纯PBC.AIC患者血清ALT、AST、IgG明显低于PBC/AIH重叠综合征患者.PBC患者的HLA-DRBl*08基因频率比健康对照组的显著增高(9.7%vs3.3%,RR=4.42,P<0.05),而比AIC患者有增高的趋势.结论:AIC可能仅是PBC的一种变异形式,中国汉族PBC的发病与HLA-DR8相关.

大疱性类天疱疮与HLA-DRB1等位基因相关性研究

目的:研究大疱性类天疱疮与HLA- DRB1等位基因相关性。方法:采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR- SSP)技术,检测大疱性类天疱疮患者HLA DRB1等位基因。结果:大疱性类天疱疮患者组中, HLA -DRB1* 110X和HLA DRB1* 120X等位基因频率均较正常对照组明显增高,有显著性差异(HLA- DRB1* 110X:χ2=3. 87,RR=2. 71,P<0. 05;HLA DRB1* 120X:χ2 =5. 298,RR=3. 17,P<0. 05)。结论:大疱性类天疱疮与HLA DRB1* 110X和HLA DRB1* 120X有显著相关性。

海南汉族人群HLA-DRB1等位基因多态性研究

目的 研究海南汉族人群HLA -DRB1位点的遗传特征。方法 应用聚合酶链反应 -序列特异性引物(PCR -SSP)方法对原籍海南地区的 62 5名健康无关捐献造血干细胞血样者进行基因特异性分析 ,并与广东汉族、天津汉族DRB1基因频率进行比较。结果 检出DRB1基因型 13个 ,其中DRB1 15 ( 19.5 0 % )、DRB1 0 9( 13 .5 6% )、DRB1 12 ( 13 .10 % )、DRB1 0 4( 12 .46% )基因频率分布较高 ,统计分析表明与广东汉族差异较小 ,与天津汉族差异显著。结论 本研究提供了较翔实的海南汉族HLA -DRB1基因多态性资料 ,研究表明海南汉族HLA -DRB1基因频率分布与南方汉族人群 (如广东汉族 )接近 ,但也存在地域间差异。

湖南地区人群HLA-DRB1基因多态性的研究

目的研究湖南地区人群HLA—DRB1位点等位基因的多态性。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR—SSP)技术对3 664名湖南地区健康汉族人群进行HLA—DRB1等位基因的低分辨分型。结果检出的13种DRB1位点等位基因中,频率最高的为DRB1*09(19．693%),其次为DRB1*15(14．014%)、DRB1*12(12．973%)、DRB1*04(11．960%)、DRB1*08(9．017%),频率较低的为DRB1*10(1．167%)和DRB1*01(0．877%),DRB1*09频率较其它地区人群为高。从遗传距离分析发现,湖南人群和广东人群距离最近(0．1378),和辽宁人群距离最远(0．3356)。结论湖南地区人群的HLA—DRB1位点等位基因具有复杂的多态性,以DRB1*09、DRB1*15、DRB1*12和DRB1* 04频率为高,其等位基因频率的分布属于中国南方人群,但有其自身特点。

湖南汉族人群HLA-DRB1位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性研究

目的 探讨湖南汉族人群HLA -DRB1位点基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间关系。 方法 用多聚酶链反应 -序列特异性寡核苷酸探针斑点杂交方法 ,对 93例湖南汉族鼻咽癌患者与 93例健康对照作HLA -DRB1位点基因分型 ,采用 χ2 检验比较两组各位点等位基因频率分布差异。 结果 鼻咽癌组DRB1 0 80 1较对照组高 (χ2 =4.2 2 ,P =0 .0 4 ,RR =1 .95) ,DRB1 1 1 0 1较对照组降低 (χ2 =5 .2 8,p =0 .0 2 ,RR =0 .33) ,但P值经Bonferoni校正后 ,差异无显著性(Pc >0 .0 5)。 结论 本研究结果未能证实HLA

5186例上海汉族无关脐带血HLA基因多态性研究

目的了解上海地区汉族人群脐带血供者HLA-A、B、DRB1基因及单体型频率的分布特征。方法采用基因分型技术对5 186例脐带血进行HLA-A、B、DRB1基因分型,利用最大似然性原理方法计算HLA-A、B、DRB1基因及单体型频率。结果 5 186例脐带血样本中,共观察到72种HLA基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1基因分别为A2、A11、A24、B60、B13、B46、DR9、DR12、DR4、DR15。385条A-B单体型中,195条单体型呈现显著的正连锁不平衡(A.L.D>0),12条表现为强连锁不平衡(R.L.D>0.40),26条单体型的频率高于0.01;387条B-DRB1单体型中,159条单体型呈现显著的正连锁不平衡(A.L.D>0),7条表现为强连锁不平衡(R.L.D>0.40),20条单体型的频率高于0.01;1847条A-B-DRB1单体型中,760条单体型是"可靠的"(频率≥2.89×10-4),单体型频率高于0.005有29条。结论上海汉族新生人群脐带血HLA基因和单体型多态性较为丰富,其频率分布数据和相关遗传参数为临床移植供者的选择、脐带血库的建立及人类遗传学研究提供了重要的参考。

山东地区汉族寻常型银屑病与HLA-DRB1、DQB1等位基因的相关性研究

目的:探讨HLA-DRB1、DQB1位点基因与山东地区汉族寻常型银屑病的相关性。方法:用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)方法,对98例山东汉族寻常型银屑病患者进行了HLA-DRB1、DQB1等位基因的分型,并分析了上述基因在各组中的分布。结果:寻常型银屑病患者组HLA-DRB1*07、DQB1*0201等位基因频率较正常对照组显著增高;I型寻常型银屑病HLA-DRB1*07、DQB1*0201等位基因频率较正常对照组显著增高;II型寻常型银屑病HLA-DRB1*10基因频率较正常对照组显著增高。结论:HLA-DRB1*07,HLA-DQB1*0201和HLA-DRB1*10可能是山东地区汉族寻常型银屑病的易感相关基因。

Ⅰ型自身免疫性肝炎与人类白细胞抗原DR4的相关性

目的 分析人类白细胞抗原(HLA)-DRBI等位基因与Ⅰ型自身免设性肝炎(AIH)的相关性。方法 采用序列特异性多聚酶链反应(PCR-SSP),对32例Ⅰ型AIH患者和48例健康对照者进行HLA-DRBI等位基因及有关基因亚型分析。结果 HLA-DR4基因频率在Ⅰ型AIH患者中较健康对照组显著增高(相对危险度=3.35,P=0.014)。对HLA-DR4等位基因亚型的分析表明,Ⅰ型AIH患者组DRBI＊0405的基因频率较健康对照有有增加趋势(P=0.04,但Pc=0.08)。HLA-DRβ分子的第三等位基因高变区第71位精氨酸残基的频率在Ⅰ型AIH患者中显著增高(相对危险度=3.82,P=0.008)。结论 Ⅰ型AIH的发病与HIA-DR4相关。

HLA-DRB1位点等位基因多态性与新疆汉族鼻咽癌的相关性研究

目的探讨新疆汉族人群HLA-DRB1位点基因多态性与鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)遗传易感性的关系。方法应用聚合酶链反应/序列特异性引物(PCR-SSP)方法对50例鼻咽癌患者(NPC组)及43例正常体检者(对照组)进行HLA-DRB1位点基因分型,比较两组HLA-DRB1位点等位基因频率分布差异。结果 NPC组DRB1*1201较对照组降低(χ2=6.785,P=0.009,OR=0.319,CI=0.131～0.777),P值经Bonferroni校正后HLA-DRB1位点等位基因频率差异均无统计学意义(Pc>0.05)。结论新疆汉族人群HLA-DRB1位点基因多态性与鼻咽癌遗传易感性无相关性。

新疆柯尔克孜族HLA-DRB1基因的多态性

目的：旨在研究新疆柯尔克孜族HLA-DRB1位点等位基因的多态性。方法：采用聚合酶链反应-序列特异引物法（PCR-SSP）对新疆地区柯尔克孜族85名健康无关个体进行HLA-DRB1等位基因分型。结果：共检出HLA-DRB1位点等位基因14种，其中高频率的等位基因是HLA-DRB1＊03（0．3769）、HLA-DRB1＊11（0．1391）、HLA-DRB1＊07（0．1056），低频率的等位基因是HLA-DRB1＊08（O．0059）、HLA-DRB1＊01（0．0178）、HLA—DRB1＊1302（0．0178）、HLA-DRB1＊1401（0．0118）。柯尔克孜族的HLA-DRBl基因频率分布具有中国北方人群的特点，尤其与西北地区汉族和蒙古族人群最为接近（0．156、0．237）。结论：提供了新疆地区柯尔克孜族人HLA-DRB1的14种等位基因的基因频率，为该民族的人类学及疾病相关研究提供了参考数据。

Ⅰ型糖尿病HLA—DRB1等位基因分析

应用ＰＣＲ／ＳＳＰ基因分型方法鉴定了ＨＬＡ－ＤＲＢ１与北京地区胰岛素依赖型糖尿病的关联。证明ＩＤＤＭ的ＤＲ９频率较对照人群明显升高ＶＳ１７．９２％。而ＤＲ３在ＩＤＤＭ中虽有升高，但无统计学意义。糖尿病患者中ＤＲ２频率明显降低。上述结果表明ＤＲ９、ＤＲ３与ＩＤＤＭ易感正相关，而ＤＲ２与ＩＤＤＭ抗性相关。

Graves病白细胞减少易感性与HLA-DRB1基因多态性的关联

目的 探讨天津地区汉族Graves病 (GD)白细胞减少易感性与HLA DRB1基因多态性的关联。方法 采用聚合酶链反应 序列特异性引物 (PCR SSP)方法检测 45例GD白细胞减少患者、5 0例GD白细胞正常患者和 90名正常对照的HLA DRB1等位基因频率。结果 (1)在不考虑白细胞变化的情况下 ,GD患者DRB1 0 8基因频率明显高于对照组 (P <0 .0 1,RR =2 .6 2 ) ,DRB1 0 7基因频率明显低于对照组 (P <0 .0 1,RR =0 .2 4)。 (2 )GD白细胞减少组DRB1 0 8(P <0 .0 1,RR =4.17)和DRB1 15 (P <0 .0 5 ,RR =1.6 9)基因频率较对照组显著增高 ,DRB1 0 7基因频率明显低于对照组 (P <0 .0 1,RR =0 .13)。 (3)GD白细胞减少组DRB1 0 8基因频率 (P <0 .0 1)和DRB1 15基因频率 (P <0 .0 5 )均明显高于白细胞正常组 ,DRB1 0 9(P <0 .0 5 )基因频率明显低于白细胞正常组。结论 天津地区汉族GD白细胞减少易感性与HLA DRB1 0 8,HLA DRB1 15基因频率增加有关 ;GD的保护性与HLA DRB1 0

人类白细胞抗原DRB1及DPB1等位基因多态性与南方部分地区汉族人多发性硬化的相关性研究

目的探讨人类白细胞抗原（HLA）-DRB1、HLA-DPB1基因多态性与我国南方汉族人群多发性硬化（MS）的相关性。方法采用基于测序的分型方法（SBT）对26例南方汉人普通型MS（C-MS）、13例视神经-脊髓型MS（OS-MS）患者及50名正常对照进行HLA-DRB1、HLA-DPB1等位基因分型，并比较各型MS之间及其与对照组之间等位基因型频率的差异。结果共检测到27种HLA-DRBI和13种HLA-DPB1等位基因片段，其中DRB1^＊0406和DRB1^＊1302的基因型频率在OS-MS患者中均高于正常人群（P值分别为0．014和0、007，OR值为2．09和2．84）；DRB1^＊120201频率在C-MS患者中高于正常人群（P=0．021，OR=3．89）和OS-MS患者（P=0．07，OR=6．87）；HLA-DPB1^＊2101频率在OS-MS患者组高于正常人群（P=0．04）。然而，以上差异经校正后均无统计学意义（均Pc〉0．1）。HLA-DRB1^＊150l和DPB1^＊0501的基因型频率在本组C-MS、OS-MS患者之间及其与正常对照之间差异均无统计学意义（均P〉0．1）。结论我国南方汉族人群MS与HLA-DRB1和-DPB1基因多态的相关性与西方、日本及我国北方人群者不同。南方汉人MS可能与HLA-DRB1^＊0406、DRB1^＊1302、DRB1^＊120201及HLA-DPB1^＊2101有关，而与HLA-DRB1^＊1501和DPB1^＊0501无关。

原发性肾病综合征与HLA—A、HLA—B、HLA—DRB1基因相关性的研究

目的探讨HLA—A、HLA—B、HLA—DRB1位点基因与山西汉族激素抵抗肾病综合征（SRNS）的相关性。方法用聚合酶链反应序列特异性引物法，对30例SRNS患者（成人22例，儿童8例）和45例正常对照者进行了HLA—A、HLA—B、HLA—DRB1等位基因分型，并分析了A、B、DRB1基因在各组的分布。结果SRNS患者组HLA—B＋15、B＋44基因频率较正常对照组增高（P〈0．05）；成人SRNS患者组HLA—DRB1＊07、B＊44基因频率较正常对照组增高（P〈0．05），成人SRNS患者组HLA—DRBl}15基因频率较正常对照组降低（P〈0．05）；儿童SRNS患者组HLA—DRB1＊10基因频率较正常对照组增高（P〈0．05）。结论SRNS发病可能与HLA—B＊15、B＋44基因有关，成人SRNS发病可能与HLA-DRB1＊07、B＊44基因有关，HLA—DRB1＊15对成人SRNS发病可能有保护作用，儿童SRNS发病可能与HLA—DRB1＊10基因有关；HLA与SRNS的相关性不仅与人种、国家和地区有关，还可能与发病年龄有关。