hsa-miR-21的生物信息学特征分析

目的:观察人消化道肿瘤细胞株hsa-miR-21表达水平,通过生物信息学预测hsa-miR-21的靶基因,进一步分析其潜在功能,为其后续功能研究提供依据。方法:应用实时荧光定量PCR技术检测人胃癌细胞株AGS、人胆管癌细胞株QBC939、人食管鳞状细胞癌细胞株ECA109以及正常人食管上皮细胞株Het-1A中hsa-miR-21表达水平;应用pubmed检索hsa-miR-21已知相关文献;应用miRbase和NCBI数据库分析hsa-miR-21序列保守性和所在基因组特征;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-21的靶基因,并对其进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果:(1)AGS、QBC939细胞株中hsa-miR-21表达水平显著上调,明显高于Het-1A细胞;(2)已有研究证实hsa-miR-21与多种肿瘤相关;(3)miR-21在多个物种间具有序列保守性;(4)Hsa-miR-21靶基因主要参与转录调控、信号转导和Notch信号通路的正向调控等生物学过程,涉及Notch、细胞周期和轴突导向等信号转导通路。结论:hsa-miR-21可能通过调控多个信号通路参与消化道肿瘤的发病机制。

唐氏综合征消减杂交文库的构建及差异表达基因筛选

目的:分离和鉴定唐氏综合征胎儿与正常胎儿脑组织差异表达的基因片断,为进一步认识DS脑病变发生的分子机制奠定基础。方法:利用抑制性消减杂交的方法对DS胎儿及正常胎儿脑组织样品进行正向消减杂交,利用斑点杂交对所获的基因片断进行进一步的验证。结果:从构建的消减杂交库中随机挑取80个阳性克隆,经点杂交鉴定获得13个代表了在DS胎儿脑组织特异高表达基因片断,其中包括转录因子、神经退行性变相关基因、能量代谢相关基因及神经发育相关基因。结论:所筛选出来的基因中部分与其他神经系统的疾病密切相关,或者具有潜在的致凋亡功能,可能参与了DS的脑病变的发生。