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哈迪-温伯格平衡检验及其基因频率的估计
被引量:
14
1
作者
管宇
张香云
+3 位作者
徐群芳
吴志松
顾光同
聂文
《浙江林学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期122-126,共5页
哈迪-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)是群体遗传学中最重要的原理,是群体有性繁殖上下代之间基因频率与基因型频率是否保持平衡的检验尺度。在HWE检验时通常需要对各基因频率作估计。研究了存在显隐性时基因频率的极...
哈迪-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)是群体遗传学中最重要的原理,是群体有性繁殖上下代之间基因频率与基因型频率是否保持平衡的检验尺度。在HWE检验时通常需要对各基因频率作估计。研究了存在显隐性时基因频率的极大似然估计值的牛顿迭代算法,牛顿迭代算法的收敛速度快于EM算法;讨论了最小Pearson χ2统计量估计与极大似然法估计的近似关系。推荐极大似然估计牛顿迭代法和最小Pearson χ2估计法。
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关键词
哈迪-温伯格平衡
hwe
检验
基因频率
极大似然估计
最小Pearson
χ2估计
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职称材料
题名
哈迪-温伯格平衡检验及其基因频率的估计
被引量:
14
1
作者
管宇
张香云
徐群芳
吴志松
顾光同
聂文
机构
浙江林学院理学院
出处
《浙江林学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期122-126,共5页
基金
浙江省自然科学基金资助项目(Y607480)
浙江省森林培育重中之重学科开放基金资助项目(200604)
文摘
哈迪-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)是群体遗传学中最重要的原理,是群体有性繁殖上下代之间基因频率与基因型频率是否保持平衡的检验尺度。在HWE检验时通常需要对各基因频率作估计。研究了存在显隐性时基因频率的极大似然估计值的牛顿迭代算法,牛顿迭代算法的收敛速度快于EM算法;讨论了最小Pearson χ2统计量估计与极大似然法估计的近似关系。推荐极大似然估计牛顿迭代法和最小Pearson χ2估计法。
关键词
哈迪-温伯格平衡
hwe
检验
基因频率
极大似然估计
最小Pearson
χ2估计
Keywords
Hardy-Weinberg equilibrium (
hwe
)
hwe test
frequency of allele
maximum likelihood estimate
minimum Pearsonχ^2 estimate
分类号
Q348 [生物学—遗传学]
O29 [理学—应用数学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
哈迪-温伯格平衡检验及其基因频率的估计
管宇
张香云
徐群芳
吴志松
顾光同
聂文
《浙江林学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
14
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