一个巴西橡胶树过氧化物酶基因克隆与生物信息学分析

采用分子生物学和生物信息学技术,在橡胶树热研7-33-97的叶片中扩增了一个过氧化物酶基因的全长c DNA,命名为Hb PRX2。该基因全长1 179 bp,5’端29 bp,3’端145 bp,阅读框1 005 bp,编码335个氨基酸。推导的氨基酸理论分子量34.85 u,等电点4.98。推导的氨基酸含有过氧化物酶蛋白特征性的Peroxidase4结构域。Hb PRX2蛋白与巴西橡胶树Hb PRX1、Hb PRX42、拟南芥At PER42和水稻Os PRX33的过氧化物酶蛋白相似性分别为63.22%、32.37%、33.73%和37.80%。生物信息学分析表明,橡胶树Hb PRX2蛋白定位于分泌途径中,属于亲水性蛋白,性质稳定,在7-24、36-55、130-151和278-301氨基酸处具有跨膜结构域,在29-30氨基酸处具有信号肽结构。本研究为深入研究Hb PRX2基因的结构与功能及其抗逆机制奠定基础。