PCR-DGGE技术应用于手足口病儿童口腔微生物菌群变化的初步研究

目的应用PCR-DGGE技术对手足口病(HFMD)、疱疹性口腔炎(HGS)及正常儿童口腔微生物菌群变化进行初步分析,以期了解三者是否存在差异。方法按随机数字表法选择3例手足口病唾液样本,1例幼儿园正常儿童唾液以及1例疱疹性口腔炎患儿唾液。样本进行微生物群落总DNA的抽提;以此为模板扩增16S rRNA V3可变区,产物经DGGE指纹图谱分析其组成结构,并运用UVIBAND/MAP等软件比较所得群落指纹图谱的相似性指数;对DGGE指纹图谱上的泳带中优势条带切胶测序,进行基因序列分析,得出该样本的优势菌群。结果手足口病组优势菌群:Capnocytophaga嗜二氧化碳噬细胞菌、Selenomonas月形单胞菌属、Prevotella普氏菌属、TM7_genera_incertae_sedis菌属、Streptococcus链球菌属、Neisseria奈瑟菌属、Porphyromonas卟啉单胞菌属、Campylobacter弯曲菌属、Campylobacter弯曲菌属、Granulicatella菌属、Leptotrichia纤毛菌属、Veillonella韦永氏球菌属、Bacteroides-like sp菌属、Actinomyces放线菌、Fusobacterium梭菌属。正常对照组优势菌群:Veillonella韦永氏球菌属、Capnocytophaga嗜二氧化碳噬细胞菌、Prevotella普氏菌、Gemella双胎溶血菌属、Porphyromonas卟啉单胞菌属、Ruminococcaceae瘤胃球菌属、Lachnospiraceae毛螺菌属、Selenomonas月形单胞菌属、Clostridium梭状芽孢杆菌、Haemophilus嗜血杆菌。疱疹性口腔炎组优势菌群:Lactococcus乳球菌属、Prevotella普氏菌属。结论手足口病组菌群结构更为复杂,与疱疹性口腔炎组相比菌群结构差异明显。