基于生物信息学分析HOXC9在神经母细胞瘤中的表达及临床应用

目的研究HOXC9在神经母细胞瘤(Nuroblastoma,NB)中的表达与临床应用。方法筛选来自TARGET数据库的NB基因表达数据集,分析差异表达基因(DEG);再利用DAVID数据库进行富集分析,筛选出NB关键基因并进行预后分析。另收集36例NB患儿术中肿瘤组织,荧光定量PCR法检测HOXC9表达水平,分析HOXC9的表达与NB临床资料的关系。结果筛选出681个DEG,生存分析发现HOXC9低表达水平与不良预后有关。Q-PCR结果发现HOXC9的表达与患儿年龄、肿瘤分期、病理分型、转移情况有关。结论HOXC9与NB的发生和预后相关。

不同品种山羊Hoxc9基因的克隆及序列比较分析

【目的】分析不同山羊品种Hoxc9基因序列及其推导氨基酸的差异性,为探索Hoxc9基因在山羊毛囊生长发育中的作用机制及研究绒山羊绒毛分子调控机理奠定基础。【方法】根据GenBank上已发表的Hoxc9基因序列设计3对引物,利用PCR扩增安哥拉山羊、萨能奶山羊、藏山羊、波尔山羊4个山羊品种的Hoxc9基因序列,然后与前期研究获得的绒山羊Hoxc9基因序列进行对比分析。【结果】利用设计的3对引物均能克隆获得安哥拉山羊、波尔山羊、萨能山羊和藏山羊的Hoxc9基因,与绒山羊Hoxc9基因比较,其5’UTR序列同源性为99.2%~100.0%,3’UTR序列同源性为99.0%~100.0%,cDNA序列同源性为99.5%~100.0%,内含子序列同源性为99.2%~99.7%,推导氨基酸序列同源性为98.8%~100.0%。Hoxc9蛋白质序列比较分析发现,安哥拉山羊和波尔山羊氨基酸的变异未造成Hoxc9蛋白质功能位点改变,但其二级结构有4处不同。【结论】不同山羊品种Hoxc9基因序列的同源性比较高,但也存在差异性。

安哥拉山羊Hoxc9基因克隆与序列分析

根据已报道的Hoxc9基因序列保守区设计3对引物,利用PCR技术从安哥拉山羊血液基因组DNA中扩增Hoxc9基因序列。目的片段纯化后连接到PMD19-T载体上,经鉴定得到重组质粒。测序结果通过与Gen-Bank数据库中序列比对分析,确定该序列为Hoxc9基因,核苷酸序列长3224 bp,包括1个内含子和2个外显子,cDNA序列长783 bp,编码260个氨基酸。与哺乳动物氨基酸序列的同源性非常高,达到99.2%以上,同斑马鱼和日本鳉的同源性较低。

内蒙古绒山羊Homeoboxc9基因在皮肤毛囊中的表达

试验通过原位杂交检测Homeoboxc9(Hoxc9)基因在皮肤毛囊中的表达情况,结果显示Hoxc9在胚胎期75d的上皮细胞中表达,伴随着毛囊的生长发育,Hoxc9基因分别在初级毛囊的毛母质、毛乳头、内根鞘、外根鞘和毛干几个部位表达;在次级毛囊的内根鞘和绒干表达。在这个过程中毛囊角质化细胞大量增殖,表明在毛囊发育中Hoxc9基因对于角质化细胞的增殖可能起一定作用。

同源盒基因与血管重构的相关研究进展

血管重构是血管壁结构的生理及病理性改变,主要涉及血管内皮细胞、血管平滑肌细胞等的增殖、迁移、凋亡,以及细胞外基质的合成、降解等过程。同源盒基因与胚胎心血管系统形成、成年人血管重构的过程以及血管内皮细胞、血管平滑肌细胞功能失调有关。本文就血管重构及其相关疾病与同源盒基因家族成员的相关研究进展予以综述。