目的筛选HIV感染相关Burkitt淋巴瘤(Burkitt lymphoma,BL)与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma, DLBCL)中差异性微小核糖核酸(microRNA, miRNA)。方法收集上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心5份BL和3份DLBC...目的筛选HIV感染相关Burkitt淋巴瘤(Burkitt lymphoma,BL)与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma, DLBCL)中差异性微小核糖核酸(microRNA, miRNA)。方法收集上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心5份BL和3份DLBCL新鲜冰冻组织标本,19份BL和15份DLBCL石蜡标本。Agilent human miRNA microarray芯片技术检测新鲜冰冻的BL和DLBCL组织中miRNA表达情况,查找差异miRNA。利用SmartRNAplex? miRNA技术在BL和DLBCL石蜡组织中验证关键miRNA,生物信息学方法预测靶基因。结果以DLBCL为参照,BL组中有42个差异性miRNA,其中28个miRNA上调,14个miRNA下调。以真核生物正向调控和高表达分子能促进肿瘤发生为依据,从BL组表达上调的miRNA选出5个关键miRNA验证,结果与芯片一致。与DLBCL相比,5个miRNA在BL中的表达均上调,分别为miRNA-16-2-3p、miRNA-20a-3p、miRNA-130b-3p、miRNA-185-5p和miRNA-423-5p(t值分别为2.715、2.539、2.750、4.004和3.625,均P〈0.05)。其中miRNA-16-2-3p对应的靶基因可能主要为CTNND2和RAD21;miRNA-20a-3p的靶基因可能主要为DYRK1A和GPAM;miRNA-130b-3p的靶基因可能主要与IRF1、DICER1、PTEN等相关;miRNA-185-5p的靶基因可能主要为VEGFA、NFATC3和SEC24C;miRNA-423-5p的靶基因可能主要是PA2G4和PNKD。结论BL和DLBCL中存在差异表达的miRNA,有望为BL和DLBCL诊断、鉴别诊断提供新的分子标志物。关键miRNA潜在靶基因与细胞生存、增殖、分化、凋亡和癌变等相关,可能对BL的发生、发展起重要作用。展开更多
文摘目的筛选HIV感染相关Burkitt淋巴瘤(Burkitt lymphoma,BL)与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma, DLBCL)中差异性微小核糖核酸(microRNA, miRNA)。方法收集上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心5份BL和3份DLBCL新鲜冰冻组织标本,19份BL和15份DLBCL石蜡标本。Agilent human miRNA microarray芯片技术检测新鲜冰冻的BL和DLBCL组织中miRNA表达情况,查找差异miRNA。利用SmartRNAplex? miRNA技术在BL和DLBCL石蜡组织中验证关键miRNA,生物信息学方法预测靶基因。结果以DLBCL为参照,BL组中有42个差异性miRNA,其中28个miRNA上调,14个miRNA下调。以真核生物正向调控和高表达分子能促进肿瘤发生为依据,从BL组表达上调的miRNA选出5个关键miRNA验证,结果与芯片一致。与DLBCL相比,5个miRNA在BL中的表达均上调,分别为miRNA-16-2-3p、miRNA-20a-3p、miRNA-130b-3p、miRNA-185-5p和miRNA-423-5p(t值分别为2.715、2.539、2.750、4.004和3.625,均P〈0.05)。其中miRNA-16-2-3p对应的靶基因可能主要为CTNND2和RAD21;miRNA-20a-3p的靶基因可能主要为DYRK1A和GPAM;miRNA-130b-3p的靶基因可能主要与IRF1、DICER1、PTEN等相关;miRNA-185-5p的靶基因可能主要为VEGFA、NFATC3和SEC24C;miRNA-423-5p的靶基因可能主要是PA2G4和PNKD。结论BL和DLBCL中存在差异表达的miRNA,有望为BL和DLBCL诊断、鉴别诊断提供新的分子标志物。关键miRNA潜在靶基因与细胞生存、增殖、分化、凋亡和癌变等相关,可能对BL的发生、发展起重要作用。