玉米CDK抑制子ICK基因家族的生物信息学分析

采用生物信息学方法对玉米基因组中的细胞周期蛋白依赖的激酶（CDK）抑制子（ICK）基因进行了全面鉴定,并对其基因结构、蛋白质保守序列和基因表达情况进行了分析。结果表明：玉米基因组中含有9个ICK基因,片段复制是玉米ICK基因家族数目扩增的主要动力。玉米ICK基因的外显子数为2-4个不等,同一亚族基因的外显子/内含子结构具有一定保守性。蛋白质保守序列分析鉴定出6个保守的基序,这些基序与ICK蛋白的核定位、功能和稳定性调节以及对CDK活性的抑制相关,说明玉米ICK蛋白可能是有功能的CDK抑制子。基于基因芯片和EST数据的表达模式分析表明,多数玉米ICK基因在各组织器官中均有表达,部分基因的表达具有一定的组织特异性。