常用药用辅料数据库的设计与构建

采用MDL ISIS/Base数据库管理系统建立了常用药用辅料数据库,该数据库共收录了270种辅料。数据库由辅料基本信息、理化信息和结构信息3部分内容构成。其中,基本信息主要包括辅料的中英文名称、来源与制法、管理状态等17个字段;理化信息主要包括辅料的理化性质,如熔点、溶解性等11个字段;结构信息主要是由材料计算平台Materials Studio 4.1中的Synthia模块计算得到的部分聚合物辅料性质数据。该数据库为药用辅料信息的查询提供了极大便利,同时也为基于数据库的数据挖掘提供了研究平台。

CAS登记号查询数据库的建立

在化学及相关研究中,常常需要根据化合物的CAS登记号查询其结构。本文通过整合山东省生物信息工程技术研究中心现有的数据,创建成一个化合物CAS登记号与其结构相互对应的数据库,应用于科研。先从CMC、MDDR、ACD、CNPD、NCI等7个数据库中,共导出575468个化合物的相关数据,这些数据经处理后,导入ChemFinder化学数据库系统。通过查重,保留了404269个独立CAS登记号的化合物,每个化合物都包含其结构、CAS登记号、来源数据库及编号、分子式、分子量、脂水分布系数等信息。数据库还保留了sdf和mol2两种文件格式,以满足虚拟筛选等后续研究的需要。