基于ManagedITK、VTK.NET与C#的医学图像处理系统实现

目的:开发可用于图像分割,配准以及可视化的图像处理系统。方法:在C#环境中应用ManagedITK、VTK.NET进行联合开发。结果:以一组头部CT数据为例,应用该系统将头部CT数据读入并显示,然后对数据进行体分割,最后对分割结果进行了三维重建以及重建结果的三视图显示。结论:该图像处理系统包含了大量分割、配准以及可视化算法,可以胜任常见图像处理需求。

ITK和VTK及其应用新进展

在国外,基于ITK和VTK的3D Slicer和IGSTK两个软件主要应用于为医学图像分析、图像导航手术和微创手术。对ITK和VTK的现状、安装、开发技术作了详细的综述,并介绍了3D Slicer和IGSTK的主要功能和临床应用,为图像引导临床诊断的研究应用指明方向。

基于ITK、VTK和MFC的DICOM图像读写及显示

背景:DICOM文件不仅包含了图像本身的信息,同时在文件头中还携带了大量的医疗相关信息,这使得DICOM标准图像的正确读写和显示工作变得尤为重要。目的:有效地综合利用工具包和开发平台的优点,借以达到一个实现DICOM标准图像的正确读写和显示。方法:首先将ITK工具包、VTK工具包与MFC深度集成,然后在该集成环境下利用这两个工具包所提供的类和函数读写和显示DICOM文件。结果与结论:在ITK、VTK与MFC深度集成环境下,通过其所提供给用户的一个灵活、友好、实用的交互界面,采用文中所述具体的方法实现了DICOM图像文件的正确读写及显示,为三者集成环境下的软件开发做了一个初步的尝试,为在此基础之上三者在医学图像处理方面更多功能的实现打下良好的基础。

利用ITK和VTK集成实现三维医学图像的分割

ITK是一个对图像进行分割配准处理的开源的、基于对象的软件系统。它提供几乎所有的主流医学图像分割算法,能够解决虚拟手术中三维图像分割问题。讨论了ITK中区域生长和Level set分割算法,对CT序列图像进行分割,最后通过VTK对分割数据进行三维重建。利用ITK和VTK的功能集成,对医学图像三维组织体分割,并实现分割结果的可视化。实验证明这种方法能够满足医生对局部病变区域观测的要求,实时性良好。

基于ITK和VTK的医学图像分割与重建

基于开源软件开发包ITK,使用连接门限法和快速步进法分别完成对肺实质和脊柱的医学图像的自动分割,分割效果良好.通过对分割结果的对比分析,得出两种分割方法的适用对象.使用连接门限法分割CT序列图像,并输入到VTK中,实现了胸椎的三维重建.实验结果准确还原了目标组织空间位置、几何特征等信息,各脊柱块间没有粘连,能够满足医生对局部组织的观测需求.

基于ITK、VTK的DICOM图像的显示及信息提取

DICOM文件不仅包含了图像本身的信息,同时还携带了大量的医疗相关信息。通过简要分析DI-COM文件的格式,分别介绍了基于VTK和ITK工具包提供的类和函数读取DICOM文件(包括图像的显示和信息的提取)的两种方法。采用这两种方法,不必对DICOM标准和图像格式进行深入的了解,即可获得DICOM文件头中的医疗信息并显示图像,实现方法简单易行。

Tec家族蛋白酪氨酸激酶Itk PH结构域与OS-9蛋白的相互作用

用酵母双杂交技术筛选与ItkPH结构域相互作用的蛋白分子 ,以了解Itk的功能及其在T细胞信号转导中的位置与作用 .Itk的PH结构域扩增后克隆入酵母双杂交系统的pLexA载体 ,转化酵母细胞EGY4 8(p8op lacZ) ,经检测PH结构域无自激活作用 ,且对酵母细胞无毒性作用 .用PH结构域作为“钓饵”蛋白 ,在酵母双杂交系统中筛选构建于AD载体的T细胞cDNA文库 .将PH结构域及筛库所得基因片段分别进行融合表达 ,用于体外结合实验 ,进一步证实二者的相互作用 .经营养缺陷选择、诱导筛选和鉴定确证 ,筛库所得的插段约 15 0 0bp的文库质粒为一真阳性克隆 .经blast比较分析为骨肉瘤、横纹肌肉瘤等肿瘤组织中高表达的os 9基因 .体外结合实验也表明 ,ItkPH结构域可与该基因表达产物结合 .Itk的PH结构域可与OS 9蛋白相互作用 .

利用VTK与ITK的集成实现医学图像可视化

在开发医学三维可视化系统时,利用ITK的图像读取与处理功能及VTK在可视化方面的突出能力,将二者有机地集成起来是非常重要与理想的技术路线。讨论了在VisualC++开发环境中,VTK与ITK实现集成的方法与步骤,实验结果验证了该方法在医学图像三维可视化及交互方面具有良好的性能。

基于ITK和VTK的脊髓扩散张量成像实现

扩散张量成像是一种新的磁共振成像技术,比传统的扩散加权成像更能够准确地反映出水分子的扩散情况。在脊髓的扩散张量成像方面的研究成果并不多,且存在很大的发展空间。提出并实现了基于ITK和VTK的脊髓图像扩散张量成像系统,其中使用ITK实现图像三维配准和扩散张量及其旋转不变量的计算等功能,使用VTK辅助完成三维图像显示,为脊髓扩散张量成像进一步研究提供了一个研究平台。仿真结果表明,该平台可以有效地完成扩散张量成像及显示等功能。

基于ITK的水平集医学图像分割算法

根据基于水平集图像分割的原理,采用ITK中提供的医学图像分割算法,实现了对医学图像的有效分割。

ITK在医学图像区域生长分割中的应用

通过将ITK中一个具体的区域生长分割算法应用于MR颅脑图像分割出白质、脑室、灰质等结构,介绍了如何使用ITK进行图像分割方法及此区域生长分割实例中类的使用。

ITK及其在医学图像分割中的应用

ITK(The Insight Toolkit)是一个开放的、面向对象的类库。它提供了强大的二维医学图像处理功能,主要用于医学图像的预处理、分割及配准。本文主要介绍图像分割的算法以及ITK在图像分割中的应用,并简要介绍一个基于ITK的医学图像处理的实现。

一种基于ITK脑部MRI混合分割方法的设计与实现

背景:由于脑部MR图像中信息对比度不高,各种脑部组织的形状复杂等特点,分割方法的选择比较困难,单一的算法很难获得满意的分割结果。目的:针对脑部MRI的特点综合利用现有的算法开发和定制有效的分割应用算法。方法:根据邻域连接和Canny水平集分割算法的优缺点,结合图像特征,用邻域连接方法的分割结果作为Canny水平集分割算法的先验分割模型,借以确定出Canny算法的下限阈值,从而完成两种算法的混合分割。结果与结论:采用实验所用混合方法得到的白质和灰质的分割结果,经与专家手工分割结果对比,证明该方法取得了较好的分割效果,从而证明综合利用现有的算法,不仅避免了重复劳动,还能开发和定制出更加有效的分割应用算法,具备很好的应用潜力。

基于ITK、VTK和MFC的医学图像处理系统集成

ITK与VTK分别是医学图像处理、数据可视化开发包,具有强大的处理功能和源代码开放特点,但是,它们缺乏实用、灵活的用户界面。本文针对ITK、VTK数据流特点,建立以Visual C++6.0的MFC为基础的用户界面,解决ITK、VTK和MFC三者之间接口问题。并以三维医学图像分割的子系统集成为示例,介绍三者结合的过程。

基于ITK、MITK和MFC的医学图像分割与显示

ITK是一个专门针对医学影像分割和配准的开发包,提供了几乎所有主流的医学影像分割和配准算法,但是它并没有实现可视化的功能。MITK是由中国科学院自动化研究所开发的集成化的医学影像处理与分析C++类库。MITK具有一致接口、可复用、灵活高效等特点,但是其算法还不够丰富。本文结合ITK和MITK的特点,建立以Visual C++6.0的MFC为基础的用户界面,利用MITK解决ITK的可视化问题。并以Fast Marching算法分割脑部二维DICOM图像为例,介绍ITK、MITK在MFC下应用程序开发的过程。

Itk与炎症性疾病关系的研究进展

Itk(IL-2介导的T细胞激酶)是非受体性蛋白酪氨酸激酶Tec家族成员之一,它主要表达于T细胞、肥大细胞以及人的自然杀伤细胞,在T细胞的信号转导过程中起着重要的作用,对其分化、增殖、活化等有很大的影响,并在Th2反应中起重要的作用,特别是Itk的酪氨酸磷酸化及与其它信号分子的相互作用是细胞信号转导过程中不可忽略的环节。了解Itk在细胞中的位置及其调控机理,可以为今后将其作为药物的靶标提供基础研究,进而控制Itk的表达,最终来影响炎症性疾病的转归。本文介绍了Itk在T细胞分化增殖中的作用以及它对炎症性疾病治疗的影响。

Itk及Syk在外周T细胞淋巴瘤组织中的表达及意义

目的探讨外周T细胞淋巴瘤(PTCL)组织中Itk及Syk的表达及与临床病理特征间的关系。方法选择并收集55例PTCL患者的肿瘤组织及普通淋巴结炎组织,采用免疫组化法检测肿瘤组织及淋巴结炎组织的Itk及Syk的表达阳性率,并分析不同肿瘤组织病理参数的阳性率情况。结果 (1)肿瘤组织的Itk表达阳性率高于淋巴结炎组织(P<0.01),而Syk的表达阳性率均低于淋巴结炎组织(P<0.01);(2)Itk表达阳性肿瘤组织的"++++"阳性细胞数和"+++"染色强度均最高,而Syk表达阳性肿瘤组织的"+"阳性细胞数和"+"染色强度均最高;(3)Syk和Itk蛋白表达与患者性别、年龄无关(P>0.05),而与恶性程度、临床分期及远处转移有关(P<0.05)。结论 PTCL组织中Itk及Syk的表达阳性率均与淋巴结炎组织有差异,其与肿瘤组织的恶化以及浸润情况有关,其水平可用于PTCL的病例诊断。

基于VTK和ITK环境的超声图像三维重建

背景:医学图像的三维模型,能够准确的三维结构在临床诊断上凸显重要性。目的:对连续多帧的超声图像进行三维结构重建。方法:利用可视化工具VTK和图像的配准分割工具ITK,在VC++的平台下,采取直接体绘制的方法,对连续多帧的DICOM医学超声图像进行了三维重建,并且用户可以利用鼠标与图片进行交互,实现任意角度的旋转。结果与结论:合成体绘制在重建中的效果较优,相对而言更适合超声图像的三维重建。

ITK在肺CT图像分割中的应用探讨

目的探讨ITK在肺CT图像分割中的应用,尝试将其用于肺结节的计算机辅助检测。方法分别应用ITK中的连接域值等图像分割算法对肺CT图像进行分割,并对结果进行比较。结果不同的分割算法处理结果不尽一致,表明图像分割是图像处理中的难点之一。结论肺CT图像的分割非常困难,ITK提供的诸多算法中,Connected Threshold Image Filter算法对肺分割效果较好。

基于ITK的多模态医学图像非刚性配准研究

目的:研究基于the insight toolkit(简称ITK)的多模态医学图像非刚性配准,分析基于ITK的多模态医学图像非刚性配准效果。方法:从医学图像配准的基本框架出发,针对多模态医学图像的非刚性配准,深入研究了框架各模块在配准中应发挥的作用,选择了利用互信息作为相似性测度、Blackman-Harris窗函数改进的部分体积插值(PV)、基于B样条的自由形变变换方式、有限存储LBFGS搜索算法,以满足多模态非刚性图像配准要求。结果:利用ITK软件包,实现了对人体肝脏的核磁和CT图像的配准。结论:基于改进的医学图像配准框架实验数据证明了该方法的有效性。