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一种基于Image J软件的植物叶片表型参数测量方法 被引量:4
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作者 杨文源 俞玉 +4 位作者 张世媛 张娟 玛伊努尔·图尔荪 杨涛 徐丽萍 《北方农业学报》 2022年第6期128-134,共7页
【目的】探究一种简便、快捷、低成本的植物叶片表型参数获取方法。【方法】以香瓜茄(Solanum muricatum)为例,采用扫描仪获取离体叶片数字图像,用Image J软件对其表型参数进行测量,并把结果与使用Digimizer软件测量得到的结果进行比较... 【目的】探究一种简便、快捷、低成本的植物叶片表型参数获取方法。【方法】以香瓜茄(Solanum muricatum)为例,采用扫描仪获取离体叶片数字图像,用Image J软件对其表型参数进行测量,并把结果与使用Digimizer软件测量得到的结果进行比较,以此验证方法的可靠性,同时分析了图像质量(图像格式与分辨率)对软件测量结果的影响。【结果】两种软件对香瓜茄叶面积、叶周长、叶长和叶宽测量结果的标准均方根误差(NRMSE)分别为0.471%、1.103%、0.391%和1.662%,相关系数均大于0.97。图像质量会对Image J软件的测量结果有一定影响,对灰度格式或低分辨率图像的影响要小于彩色格式或高分辨率图像,但两种因素叠加会加剧这种影响。【结论】经改进后的扫描仪结合Image J软件测量植物叶片表型参数的方法,具有低成本、半自动、快速、精确、批量等优点,可以为植物叶片表型参数的测量提供一定参考。 展开更多
关键词 香瓜茄 叶片表型参数 image j软件 Digimizer软件 扫描仪
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Image J软件不同阈值处理模式在多裂肌脂肪浸润程度定量评估中的应用价值
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作者 陈灿 张承旻 +4 位作者 喻学科 陈春华 李凯 赵骏 罗飞 《广西医学》 CAS 2023年第1期34-38,共5页
目的探讨Image J软件不同阈值处理模式在多裂肌脂肪浸润程度定量评估中的应用价值。方法选取40例中老年人作为研究对象,均进行MRI常规序列及磁共振波谱(MRS)序列扫描检查。由2名脊柱外科医生借助Image J软件的不同阈值处理模式测量L4~5... 目的探讨Image J软件不同阈值处理模式在多裂肌脂肪浸润程度定量评估中的应用价值。方法选取40例中老年人作为研究对象,均进行MRI常规序列及磁共振波谱(MRS)序列扫描检查。由2名脊柱外科医生借助Image J软件的不同阈值处理模式测量L4~5椎间盘中心层面多裂肌脂肪浸润程度,1周后重复测量。采用组内相关系数(ICC)评估两名观察者之间及同一观察者不同时间的测量结果的可重复性。以MRS序列测量结果作为定量评估多裂肌脂肪浸润程度的“金标准”。分析Image J软件不同阈值处理模式所测得的多裂肌脂肪浸润程度与MRS序列所测结果的相关性。结果两名观察者之间及同一观察者不同时间测量的多裂肌脂肪浸润程度的可重复性均较高(均ICC>0.8)。Image J软件的固定阈值(60~140)模式、自动阈值模式、人工阈值模式测量的多裂肌脂肪浸润程度与MRS序列测量的多裂肌脂肪浸润程度均呈正相关(均P<0.05),其中采用固定阈值模式(阈值设置为80)时,Image J软件测量的多裂肌脂肪浸润程度与MRS序列测量的结果相关性最高。结论Image J软件不同阈值处理模式测量多裂肌脂肪浸润程度的可重复性高,采用固定阈值处理模式(阈值设置为80)在MRI常规序列上测量可替代MRS序列测量,作为评估多裂肌脂肪浸润程度的有效方法。 展开更多
关键词 多裂肌 脂肪浸润程度 image j软件 阈值 功能退变
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植物叶脉标本简单制作方法及基于Image J软件的叶脉图像分析
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作者 全昌彬 姚玉仙 莫光友 《亚热带植物科学》 CAS 2022年第5期397-404,共8页
采用5%氢氧化钾沸水浴对12种植物叶片进行处理,结合超声波清洗使叶肉及表皮脱离,经漂白、染色制成叶脉标本。使用数码相机及显微镜对标本进行成像,利用Image J软件MINA工具宏的分析步骤对图像进行分析,测定12种植物叶脉的密度、分支密... 采用5%氢氧化钾沸水浴对12种植物叶片进行处理,结合超声波清洗使叶肉及表皮脱离,经漂白、染色制成叶脉标本。使用数码相机及显微镜对标本进行成像,利用Image J软件MINA工具宏的分析步骤对图像进行分析,测定12种植物叶脉的密度、分支密度、交点密度、端点密度,并通过手动追踪验证测量结果的准确性。结果表明,该方法可快速获得清晰完整的叶脉网络结构图,并且可以运用Image J软件MINA工具宏的分析步骤对叶脉进行分析。与传统的氢氧化钠组织透明法比较,该方法处理时间短,叶脉网络结构完整清晰,用Image J软件可准确测量叶脉密度。 展开更多
关键词 5%氢氧化钾 超声波清洗 叶脉网络结构 叶脉密度 image j软件
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Image J Analysis of Six Different Annealed Temperatures of 0.17% C of HSLA Steels
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作者 Ngozi Grace Emordi Iweriolor Sunday Onyekpe Basil Obimma 《World Journal of Engineering and Technology》 2020年第4期617-629,共13页
Annealing is a heat treatment procedure in which the mechanical properties of a material <span style="font-family:Verdana;">are</span><span style="font-family:Verdana;"> being alt... Annealing is a heat treatment procedure in which the mechanical properties of a material <span style="font-family:Verdana;">are</span><span style="font-family:Verdana;"> being altered, and such alterations cause changes in its properties such as strength and hardness. It is usually carried out to improve ductility and toughness, to reduce hardness and to remove carbides. This study deals with the use of image analysis processing method for the measurement of structure of six annealed samples of 0.17% High Strength Low Alloy (HSLA) Steels (840<span style="white-space:nowrap;">°</span>C - 990<span style="white-space:nowrap;">°</span>C) with 30<span style="white-space:nowrap;">°</span>C interval and 30 minutes soaking time. From the optical microscope images using Image J program</span><span style="font-family:Verdana;">,</span><span style="font-family:Verdana;"> some parameters like calculation of area, pixel value statistics, distances and angles measurements, edge detection, such as the circularity, ferret angle, solidity and perimeter, average area and the percentage area </span><span style="font-family:Verdana;">were</span><span style="font-family:Verdana;"> examined. The annealed sample of 960<span style="white-space:nowrap;">°</span>C gave the highest grain count of 543 with a perimeter of 41.518;standard deviation 7.057 and a mean of 28.722 which shows that annealing greatly improved the fatigue life of the steel. From the mechanical analysis result, the annealed sample at 840<span style="white-space:nowrap;">°</span>C has a highest hardness value of 129.4 BHN and gave the lowest impact value of 58.75 J. This study shows a significant decrease in the hardness value as the annealing temperature increased which signifies that annealing temperature enhanced the fatigue property and tensile strength (wear strength) of the steel in study.</span> 展开更多
关键词 High Strength Low Alloy Steel MICROSTRUCTURE image j
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一种基于Image J软件的沙葱幼苗根长测量方法
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作者 杨文源 俞玉 徐丽萍 《伊犁师范大学学报(自然科学版)》 2023年第3期46-54,共9页
植物根系与神经元突起具有相类似的结构.Neuron J是一个用于追踪、测量神经元突起长度的Image J插件,为探究将其运用于植物幼苗简单根系长度测量的可行性,以沙葱幼苗根系为例,利用平台扫描仪获取根系数字图像,使用Neuron J软件对根长进... 植物根系与神经元突起具有相类似的结构.Neuron J是一个用于追踪、测量神经元突起长度的Image J插件,为探究将其运用于植物幼苗简单根系长度测量的可行性,以沙葱幼苗根系为例,利用平台扫描仪获取根系数字图像,使用Neuron J软件对根长进行测量,然后对其测量结果同常用的专业根系图像处理分析软件SmartRoot的测量结果进行比较,从而验证将Neuron J软件运用在植物幼苗简单根系长度测量的可行性与可靠性.验证结果表明:Neuron J软件与SmartRoot软件在测量结果之间存在极高的线性相关(R2=0.9989),标准均方根误差(NRMSE)为1.62%;而且Neuron J软件的测量精度不受图像扫描模式、分辨率与背景颜色的太大影响,操作简便、结果可靠.因此,可作为一种沙葱幼苗根长测量的方法在科学研究中使用. 展开更多
关键词 image j软件 Neuron j SmartRoot 根长 沙葱
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基于手机拍照结合Image J软件对干辣椒外观品质的分级研究
6
作者 胡晋伟 赵志峰 +4 位作者 张欣莹 祝贺 李波 孙海清 徐炜桢 《食品与发酵工业》 CAS 2025年第1期273-279,共7页
干辣椒外观形状和色泽是其品质分类的重要指标。目前GB 10465—1989《辣椒干》中对干辣椒外观形状和色泽的检测方式还停留在人工检测阶段,通常受到主观感知、误差、视觉生理等多种因素影响,未形成科学标准化的检测方法。该研究利用手机... 干辣椒外观形状和色泽是其品质分类的重要指标。目前GB 10465—1989《辣椒干》中对干辣椒外观形状和色泽的检测方式还停留在人工检测阶段,通常受到主观感知、误差、视觉生理等多种因素影响,未形成科学标准化的检测方法。该研究利用手机拍照对干辣椒获取图像,通过Image J软件进行图像处理,提出了一种便捷、快速、准确的干辣椒外观形状相关特征量的测定方法。与游标卡尺法、剪纸法等人工测量相比,该方法更方便快速,可用于干辣椒的长度、宽度、面积等表型指标的测量。同时,通过构建红绿蓝(RGB)色彩模型获得干辣椒的外观颜色特征参数,色泽分选采用R/(G+B)比率为分级依据,结合干辣椒宽长比和面积可以将干辣椒分为优质、合格、不合格3个等级。 展开更多
关键词 干辣椒 手机拍照 image j软件 RGB色彩模型 分级
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基于Java语言和ImageJ平台的数字图像处理实验教学方案 被引量:3
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作者 李荣 《电脑知识与技术》 2016年第12X期146-148,共3页
数字图像处理课程是一项以实验为主的教学课程,其教学目的就是利用各向难易程度的教学实验,让学生掌握数字图像处理技术,增强学生的自主学习能力。很多学生已经学习过Java语言,但是对Image J软件并不是非常了解,所以,开展实验教学的基... 数字图像处理课程是一项以实验为主的教学课程,其教学目的就是利用各向难易程度的教学实验,让学生掌握数字图像处理技术,增强学生的自主学习能力。很多学生已经学习过Java语言,但是对Image J软件并不是非常了解,所以,开展实验教学的基础首先是让学生理解其含义,同时还要学会使用Image J插件的代码模板。教师在教学中会根据现有的数字图像处理代码,科学性的对现有插件进行适当扩展,便于学生深入学习。 展开更多
关键词 jAVA语言 image j平台 图像处理 教学方案
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Image J软件评估颌骨囊肿开窗减压术的临床疗效研究 被引量:14
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作者 章礼玉 周瑜 +6 位作者 叶茂昌 陈传俊 王来平 王祎 朱伟政 彭晖 项先旺 《临床口腔医学杂志》 2022年第1期52-55,共4页
目的:通过Image J软件评估颌骨囊肿传统摘除术(TE)与开窗减压术(FD)的临床疗效差异。方法:收集我院2018年6月~2020年6颌骨囊肿病例共64例,按手术方式不同分为TE组和FD组,其中TE组34例,FD组30例。通过Image J软件测量术前、术后曲面体层... 目的:通过Image J软件评估颌骨囊肿传统摘除术(TE)与开窗减压术(FD)的临床疗效差异。方法:收集我院2018年6月~2020年6颌骨囊肿病例共64例,按手术方式不同分为TE组和FD组,其中TE组34例,FD组30例。通过Image J软件测量术前、术后曲面体层片资料,比较分析囊肿面积及灰度值的变化情况及围手术期相关信息的差异性,评估两种手术方式用于颌骨囊肿治疗的疗效。结果:TE组与FD组囊肿面积均较术前减小(P<0.05)。术后3个月两治疗组囊肿面积变化率差异无统计学意义(P>0.05),术后6个月FD组囊肿面积变化率大于TE组(P<0.05);TE组术后3个月囊肿面积变化率大于术后6个月,FD组术后6个月囊肿面积变化率大于术后3个月,差异均有统计学意义(P<0.05)。两治疗组及不同随访时间囊肿密度差异均无统计学意义(P>0.05)。FD组术中出血量及住院天数均少于TE,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:传统摘除术和开窗减压术用于颌骨囊肿治疗都有较好的临床疗效,开窗减压术在术后囊肿减小速率、术中出血及住院时间方面优于传统囊肿摘除术。 展开更多
关键词 颌骨囊肿 传统摘除术 开窗减压术 image j软件
原文传递
一种使用Image J重构昆虫感器支配神经的方法 被引量:1
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作者 程振丰 付丙鲜 +1 位作者 祝增荣 洪健 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期213-221,共9页
【目的】Image J是一款基于Java的完全开源软件,本文通过Image J重构昆虫感器支配神经,以期提供一种开源的三维重构方法。【方法】Image J重构包括调整系列图片亮度及对比度、图像校准、手动绘制填色图片、导入填色图片、通过图形工作... 【目的】Image J是一款基于Java的完全开源软件,本文通过Image J重构昆虫感器支配神经,以期提供一种开源的三维重构方法。【方法】Image J重构包括调整系列图片亮度及对比度、图像校准、手动绘制填色图片、导入填色图片、通过图形工作站运行3D Viewer。【结果】基于Image J,完成了灰飞虱触角盘状感器支配神经的三维重构,重构模型生动展示了盘状感器支配神经元组的数量及空间延展关系。在三维查看器中可旋转、放大三维模型观察精细结构,也可调整阈值观察特定结构,还可调整模型透明度及模型整体颜色。【结论】Image J具有广阔的升级空间和应用前景,有望为昆虫、其他节肢动物及生物组织的三维重构提供有力支持。 展开更多
关键词 image j软件 昆虫 感器 支配神经 三维重构
原文传递
Image J色度分析在烟丝纤维素漂白过程中的应用 被引量:1
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作者 张建平 刘泽春 +4 位作者 蓝洪桥 李孟昱 陈伟珠 方华 郑泉兴 《烟草科技》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期70-77,共8页
为了研究漂白条件对烟丝纤维素漂白效果的影响,并定量分析烟丝中纤维素的质量分数,利用Image J色度分析软件,同时结合烟丝纤维素的质量分数和提取率,研究确定了烟丝纤维素漂白的最佳制备工艺。考察了加热温度、加热时间、漂白溶液的pH... 为了研究漂白条件对烟丝纤维素漂白效果的影响,并定量分析烟丝中纤维素的质量分数,利用Image J色度分析软件,同时结合烟丝纤维素的质量分数和提取率,研究确定了烟丝纤维素漂白的最佳制备工艺。考察了加热温度、加热时间、漂白溶液的pH和漂白次数对漂白效果的影响。结果表明:采用60 mL pH=3的3%(质量百分数)亚氯酸钠漂白溶液,在75℃水浴中加热30 min,重复漂白2次,达到最佳漂白效果,烟丝纤维素漂白提取率为65.32%,质量分数为93.25%,烟丝纤维素压片照片的色度比仅是对照组(Con)的11.67%。利用Image J色度分析软件对烟丝纤维素压片照片的色度比定量分析结果有效。 展开更多
关键词 烟草 烟丝纤维素 image j色度分析 色度比 纤维素漂白 亚氯酸钠
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基于光学显微技术的淀粉粒计量方法及其在中药三七中的应用
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作者 杨迪 杨杰 +3 位作者 鲁瑶 邸学 李娜 王添敏 《广东化工》 CAS 2024年第5期135-138,共4页
目的:建立基于光学显微技术的淀粉粒计量方法,并应用于中药三七中淀粉粒的计量。方法:基于光学显微技术的原理,利用淀粉遇碘液变蓝紫色的性质,采用稀碘液对淀粉粒染色;利用Image J软件对染色的淀粉粒进行自动计量。以中药三七粉末样品... 目的:建立基于光学显微技术的淀粉粒计量方法,并应用于中药三七中淀粉粒的计量。方法:基于光学显微技术的原理,利用淀粉遇碘液变蓝紫色的性质,采用稀碘液对淀粉粒染色;利用Image J软件对染色的淀粉粒进行自动计量。以中药三七粉末样品为测量材料,对稀碘液浓度、样品浓度、显微测量区域进行考查。结果:以0.002 mol/L浓度的稀碘液、15 mg/mL的样品浓度、显微测量9个区域为最佳实验条件,对样品中的淀粉粒面积占比进行测量。此方法的精密度、重复性、重现性的RSD均小于10.5%,表明该方法稳定、可靠。采用该方法测定三七中淀粉粒,结果表明不同规格等级三七中淀粉粒的面积占比差异均有统计学意义,淀粉粒变化规律为:40头>60头>120头>无数头>筋条>绒根≈剪口。结论:本研究建立基于光学显微技术的淀粉粒计量方法,在不同规格等级三七中得到很好的应用,为植物样品中淀粉粒显微计量提供了有效方法。 展开更多
关键词 淀粉粒 光学显微技术 计量方法 三七 规格等级 image j软件
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青年人群慢性非特异性腰背痛的MRI研究
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作者 崔迪 雷振 孙羽 《中国医药导刊》 2024年第3期270-274,共5页
目的:采用SIEMENS Verio 3.0T磁共振成像(MRI)系统及Image J软件测量椎旁肌[多裂肌(multifidus muscle,MF);竖脊肌(erector spinae,ES)]影像学参数,包括横截面积(cross-sectional area,CSA)及脂肪浸润程度(fatty infiltration,FI),评价... 目的:采用SIEMENS Verio 3.0T磁共振成像(MRI)系统及Image J软件测量椎旁肌[多裂肌(multifidus muscle,MF);竖脊肌(erector spinae,ES)]影像学参数,包括横截面积(cross-sectional area,CSA)及脂肪浸润程度(fatty infiltration,FI),评价椎旁肌CSA和FI与慢性非特异性腰背痛的关系,并探讨不同性别人群椎旁肌影像学参数是否有差异。方法:选取2020年6月至2021年5月于我院行腰椎常规MRI T2WI(T2-weighted imaging)序列矢状位、T2WI轴位扫描的慢性非特异性腰背痛青年患者53例设为腰背痛组进行回顾性分析,其中男28例,女25例,所有患者均有明确腰背痛病史,病程超过12周,年龄18~40周岁,且排除其他特异性疾病;并选同时间段内于我院进行MRI相同序列检查的体检青年人员50例设为对照组,其中男25例,女25例。用Image J软件手动勾画L1~S1所有椎间盘中心层面椎旁肌感兴趣区域(ROI),并测量轴位图像椎旁肌CSA和FI。采用t检验比较腰背痛组与对照组之间及不同性别患者椎旁肌CSA、FI的差异。结果:腰背痛组与对照组多节段多裂肌、竖脊肌的CSA比较,差异均无统计学意义;腰背痛组患者多裂肌、竖脊肌FI均大于对照组(P<0.05)。男性组多裂肌、竖脊肌的CSA均大于女性组;多裂肌、竖脊肌FI均小于女性组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:在青年人群中,慢性非特异性腰背痛患者的多裂肌、竖脊肌脂肪浸润程度较正常人群更加严重;青年男性多裂肌、竖脊肌的CSA大于青年女性、FI低于青年女性。 展开更多
关键词 青年 慢性非特异性腰痛 椎旁肌横截面积 脂肪浸润 磁共振成像 image j软件
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一种表征可吸收胶原蛋白材料孔结构的方法研究
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作者 王常斌 王秀秀 +3 位作者 陈洪建 艾冲冲 万敏 卢文博 《中国医疗设备》 2024年第4期8-12,共5页
目的研究一种表征可吸收胶原蛋白材料微观形貌的方法,并分析其孔隙率和孔径。方法利用场发射扫描电子显微镜(Scanning Electron Microscope,SEM),在不同的加速电压下对未喷金样品和喷金样品进行拍摄,使用Image J软件对所得的SEM图像的... 目的研究一种表征可吸收胶原蛋白材料微观形貌的方法,并分析其孔隙率和孔径。方法利用场发射扫描电子显微镜(Scanning Electron Microscope,SEM),在不同的加速电压下对未喷金样品和喷金样品进行拍摄,使用Image J软件对所得的SEM图像的孔隙率和孔径进行分析,并对结果的有效性进行验证。结果样品未喷金时使用低倍加速电压可获得清晰的SEM图像;样品喷金后其耐受电压能力明显提高,即使在较高的加速电压下依然能获得清晰的SEM图像。使用Image J软件可对拍摄的SEM图像的孔径和孔隙率进行分析,其中,平均孔隙率为50.9%,平均孔径为11.9μm;孔隙率离散系数为8.6%,孔径离散系数6.7%。结论场发射SEM结合Image J软件是一种表征可吸收胶原蛋白材料孔结构的有效方法,可解决相关标准中方法缺失的问题。 展开更多
关键词 场发射扫描电子显微镜 可吸收胶原蛋白 孔结构 image j软件
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Bacillus siamensis ZCST-1菌发酵产物的排油能力及其特性 被引量:2
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作者 曾超 周菁菁 +3 位作者 臧润民 周海龙 张春枝 高子晴 《大连工业大学学报》 CAS 北大核心 2020年第6期396-400,共5页
Bacillus siamensis ZCST-1是从大连近海岸石油污染的沙壤中筛选出的一株具有较强排油能力的菌株,主要对其发酵液中分离出来的具有表面活性产物的特性进行了研究。薄层层析和红外光谱分析的结果表明,B.siamensis ZCST-1菌所产的具有排... Bacillus siamensis ZCST-1是从大连近海岸石油污染的沙壤中筛选出的一株具有较强排油能力的菌株,主要对其发酵液中分离出来的具有表面活性产物的特性进行了研究。薄层层析和红外光谱分析的结果表明,B.siamensis ZCST-1菌所产的具有排油活性的产物属于脂肽类化合物;实验条件下CMC值为5 mg/L,此时表面张力为27.834 mN/m;在不同温度、pH、矿化度和紫外线照射时长下,该产物均具有较好的稳定性,且在存放6月后仍具有较好的乳化和排油能力。结果表明该菌株的脂肽类产物对后续提高石油采收率方面具有应用价值。 展开更多
关键词 脂肽 生物表面活性剂 石油微生物 image j油膜面积分析
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GDS-80手持基因枪在橡胶树遗传转化上应用的参数优化与配件改进 被引量:1
15
作者 范璟璋 华玉伟 +5 位作者 范月婷 辛士超 戴雪梅 黄天带 黄华孙 李季 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第9期2458-2467,共10页
GDS-80手持基因枪是美国Wealtec公司2009年推出的基因传递系统,具有操作简便、高效的特点。已报道的橡胶树基因枪转化研究都是使用台式基因枪。本文首先利用考马斯亮蓝轰击滤纸去除明显不适合的参数,接着以绿色荧光蛋白(GFP)基因作为报... GDS-80手持基因枪是美国Wealtec公司2009年推出的基因传递系统,具有操作简便、高效的特点。已报道的橡胶树基因枪转化研究都是使用台式基因枪。本文首先利用考马斯亮蓝轰击滤纸去除明显不适合的参数,接着以绿色荧光蛋白(GFP)基因作为报告基因,轰击巴西橡胶树体细胞胚以及愈伤组织,用荧光显微镜观察绿色荧光,探究适合橡胶树的轰击参数。而且比较了Image J软件和肉眼统计荧光斑点数及GDS-80手持基因枪与PDS-1000/He台式基因枪的差异。结果表明:对于橡胶树体细胞胚和愈伤组织,仅依靠原厂配件难以获得较好的转化效果。本文设计了直径3 cm(与轰击范围相同),高度2.5 cm,孔径60目的过滤网。同时改进装试验材料的培养皿,用刀片在培养皿的中心割出一个直径3 cm的圆圈,轰击胚状体时,将上述设计的过滤筛网正向卡在圆圈上,胚状体放入过滤网中,轰击时将培养皿用试管架架高,压力就从筛网及底部的空洞分解,微弹完全轰击到试验材料。轰击胚状体最优参数为:轰击压力为60 psi,针状调节阀为3圈,目标间隔盘为6 cm。轰击愈伤时将材料放到普通培养皿中心的轰击范围内,反向盖上过滤筛网。最优轰击参数为:轰击压力为50 psi,针状调节阀为4圈,目标间隔盘为6 cm。本文采用Image J软件进行荧光斑点计数,准确率与肉眼相当,但较肉眼省时。GDS-80手持基因枪与PDS-1000/He台式基因枪转化效率相当,但GDS-80手持基因枪每打一枪比PDS-1000/He台式基因枪快12 min。研究结果为橡胶树遗传转化提供了高效的基因枪转化体系,为转基因研究提供了一个高效的统计荧光数的软件。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 GDS-80 基因枪 GFP基因 image j
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叶用莴苣叶面积测定方法的研究 被引量:14
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作者 刘小锐 黄成东 祝红伟 《中国蔬菜》 北大核心 2020年第12期78-81,共4页
叶面积大小是决定植物光合作用产物量的重要因素。为了得到一种快速、准确、灵活测定蔬菜叶面积的方法,本试验以叶用莴苣为例,运用Image J图像处理软件进行植株叶面积的测定,然后与传统测定方法方格计数法与纸样称重法的测定结果进行比... 叶面积大小是决定植物光合作用产物量的重要因素。为了得到一种快速、准确、灵活测定蔬菜叶面积的方法,本试验以叶用莴苣为例,运用Image J图像处理软件进行植株叶面积的测定,然后与传统测定方法方格计数法与纸样称重法的测定结果进行比较验证。结果表明:方格计数法、纸样称重法与Image J图像处理3种方法测定结果之间不存在显著性差异;通过方程线性回归分析发现,3种方法之间的相关系数均在0.99以上。由此可见Image J图像处理软件可准确地应用于叶用莴苣叶面积测定。 展开更多
关键词 叶用莴苣 叶面积 image j 图像处理
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软件分析睑板腺囊肿术后儿童睑板腺功能和形态 被引量:1
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作者 骆文婷 邸悦 +1 位作者 李思红 乔彤 《医学综述》 2020年第16期3317-3322,共6页
目的探讨睑板腺囊肿术后儿童睑板腺形态和泪膜稳定性的变化。方法选择2019年2月1日至6月30日在上海交通大学附属儿童医院眼科行双眼睑板腺囊肿手术的34例(68眼)儿童睑板腺囊肿患者作为睑板腺囊肿组,选取同期21例(39眼)无症状健康儿童作... 目的探讨睑板腺囊肿术后儿童睑板腺形态和泪膜稳定性的变化。方法选择2019年2月1日至6月30日在上海交通大学附属儿童医院眼科行双眼睑板腺囊肿手术的34例(68眼)儿童睑板腺囊肿患者作为睑板腺囊肿组,选取同期21例(39眼)无症状健康儿童作为正常对照组。使用Keratograph 5M采集睑板腺形态和非侵入性首次泪膜破裂时间(NIBUTf)、下泪河高度(LTMH);采用Image J软件及METLAB 2016b软件测量睑板腺缺失比例和睑板腺腺泡比例。结果睑板腺囊肿组睑板腺缺失率、睑板腺缺失评分均明显高于正常对照组[(26.60±19.50)%比(12.62±8.42)%、1(1,2)分比1(1,1)分](P <0.01),睑板腺数量、睑板腺腺泡比例、LTMH均明显低于正常对照组[(18.18±5.91)条比(22.85±3.32)条、(32.99±6.60)%比(41.31±6.54)%、0.16(0.14,0.19) mm比0.2(0.18,0.26) mm](P <0.01),两组睑板腺弯曲度、NIBUTf、眼红分析评分比较差异无统计学意义(P> 0.05)。睑板腺囊肿组LTMH与NIBUTf呈正相关(rs=0.351,P=0.003),睑板腺囊肿组睑板腺缺失率与睑板腺弯曲度呈负相关(rs=-0.328,P=0.006);睑板腺缺失率与年龄、性别均无相关性(P> 0.05);睑板腺缺失量与NIBUTf、LTMH、眼红分析均无相关性(P> 0.05)。结论睑板腺囊肿可导致更多睑板腺缺失,且可能与睑板腺管弯曲所致睑板腺管阻塞有关;而泪膜指标的检测无法判断睑板腺功能。 展开更多
关键词 睑板腺囊肿 睑板腺缺失率 睑板腺弯曲度 image j软件 METLAB 2016b软件
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用于数字等温扩增系统的荧光图像分析技术 被引量:2
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作者 徐静 汪磊 +4 位作者 赵俊 花昌义 朱灵 王明龙 周正仙 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2020年第10期1255-1261,共7页
基于微流控芯片的数字等温扩增技术作为一种新型分子检测技术,可以通过对采集到的荧光图像进行特定的图像处理,以实现对待测目标的绝对定量分析。本研究利用本课题组研制的数字微流控芯片所采集到的荧光图像为分析对象,并结合实际应用环... 基于微流控芯片的数字等温扩增技术作为一种新型分子检测技术,可以通过对采集到的荧光图像进行特定的图像处理,以实现对待测目标的绝对定量分析。本研究利用本课题组研制的数字微流控芯片所采集到的荧光图像为分析对象,并结合实际应用环境,开发出配套的软件分析系统。该系统中的荧光图像处理分析部分具备图像拼接、图像倾斜校正、目标区域的截取、图像分割以及荧光亮点计数等功能。该系统能很好地满足核酸分子数检测的需求,并具有良好的人机交互性能。结果表明该系统的分析结果与Image J图像处理软件的统计结果不仅具有一致性,而且能够对检测到的结果实现自动化的计算分析,这为该款软件分析系统的广泛应用奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 数字等温扩增技术 荧光图像 微流控芯片 image j图像处理软件
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Seeing the wood for the trees:towards improved quantification of glial cells in central nervous system tissue 被引量:1
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作者 Sinéad Healy Jill McMahon Una FitzGerald 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2018年第9期1520-1523,共4页
The following mini-review attempts to guide researchers in the quantification of fluorescently-labelled proteins within cultured thick or chromogenically-stained proteins within thin sections of brain tissue.It follow... The following mini-review attempts to guide researchers in the quantification of fluorescently-labelled proteins within cultured thick or chromogenically-stained proteins within thin sections of brain tissue.It follows from our examination of the utility of Fiji Image J thresholding and binarization algorithms.Describing how we identified the maximum intensity projection as the best of six tested for two dimensional(2 D)-rendering of three-dimensional(3 D) images derived from a series of z-stacked micrographs,the review summarises our comparison of 16 global and 9 local algorithms for their ability to accurately quantify the expression of astrocytic glial fibrillary acidic protein(GFAP),microglial ionized calcium binding adapter molecule 1(IBA1) and oligodendrocyte lineage Olig2 within fixed cultured rat hippocampal brain slices.The application of these algorithms to chromogenically-stained GFAP and IBA1 within thin tissue sections,is also described.Fiji’s Bio Voxxel plugin allowed categorisation of algorithms according to their sensitivity,specificity accuracy and relative quality.The Percentile algorithm was deemed best for quantifying levels of GFAP,the Li algorithm was best when quantifying IBA expression,while the Otsu algorithm was optimum for Olig2 staining,albeit with over-quantification of oligodendrocyte number when compared to a stereological approach.Also,GFAP and IBA expression in 3,3′-diaminobenzidine(DAB)/haematoxylin-stained cerebellar tissue was best quantified with Default,Isodata and Moments algorithms.The workflow presented in Figure 1 could help to improve the quality of research outcomes that are based on the quantification of protein with brain tissue. 展开更多
关键词 organotypic brain slice culture glial cell quantification thresholding algorithms Fiji image j Bio Voxxel plug-in STEREOLOGY
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电磁辐射下海陆相页岩孔隙结构演化差异研究 被引量:1
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作者 李冲冲 朱富福 +1 位作者 柯昱江 高金剑 《断块油气田》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期238-245,共8页
电磁辐射是一种绿色页岩油气储层改造技术,相比常规热传导加热,电磁辐射加热页岩的孔隙结构更为复杂。参考前人在不同辐射时间和功率条件下页岩孔隙演化的研究,将海相页岩和陆相页岩在电磁辐射下的孔隙结构进行对比分析。选取龙马溪组... 电磁辐射是一种绿色页岩油气储层改造技术,相比常规热传导加热,电磁辐射加热页岩的孔隙结构更为复杂。参考前人在不同辐射时间和功率条件下页岩孔隙演化的研究,将海相页岩和陆相页岩在电磁辐射下的孔隙结构进行对比分析。选取龙马溪组海相页岩与鄂尔多斯盆地陆相页岩,借助自主研制的电磁辐射装置、氮气吸附、高压压汞、场发射扫描电镜等表征手段和Image J软件,研究了电磁辐射下海陆相页岩孔隙结构演化规律及差异。结果表明:相同的辐射时间,陆相页岩终温较海相页岩高;高TOC质量分数的海相页岩以有机孔增加为主,而高黏土含量的陆相页岩以裂缝开度增加为主;电磁辐射下,页岩有机质热解、黏土矿物脱水收缩以及热应力差等的共同作用,导致页岩孔隙和裂隙增加,显著提高了储层的渗流能力。 展开更多
关键词 电磁辐射 海相页岩 陆相页岩 孔隙结构演化规律及差异 image j软件 控制机理
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