PC机群上JIAJIA与MPI的比较

对JIAJIA 和MPI (message passing interface)是进行了比较.JIAJIA 和MPI 分别代表共享存储和消息传递的编程模式.MPI 显式进行数据传输,编程复杂;JIAJIA 由底层维护数据一致性,并附加提供简单的消息传递函数,编程容易、灵活.JIAJIA 分配共享内存时开销较大,初始化时间比MPI 长.提出了一个关于并行加速比与进程数目之间关系的近似经验公式,推出JIAJIA 和MPI 性能差距随着进程数目的增多而增大的结论.测试结果表明,大部分应用程序的JIAJIA 和MPI 版本的并行性能差距不超过10%.对于通信量很小的应用程序,其JIAJIA 和MPI 的性能差距较小,而通信量本身较大的应用程序,其JIAJIA 和MPI 的性能差距主要取决于运行时产生的实际通信量.

基于JIAJIA系统的消息传递和共享存储编程模式比较

为了研究基于软件DSM系统的OpenMP实现，该文以一类具有代表性的用户题为例，分别测试了其基于JIAJIA系统的两种实现方式的加速比：一种是用JIAJIA提供的消息传递系统调用，实现一个类MPI版本（方式1）；另一种是用多个处理机对共享数组的读写来替代消息传递系统调用（方式2）。测试结果发现，对少量处理机系统，两种方式还具有可比性，但是，随着处理机数的增多，共享存储应用的性能急剧下降。通过对测试结果的分析及对用户题的进一步测试，发现方式2的时间主要花费在做一致性处理和缺页中断处理而导致的大量小消息通信上。测试表明，JIAJIA共享存储程序一般会比MPI程序导致更重的网络负载。要在JIAJIA共享存储基础之上建立一种实用的共享并行计算环境，尤其在支持OpenMP等共享编程语言方面，还有待进一步工作。

加减归脾汤联合胃复春治疗脾胃虚弱型慢性萎缩性胃炎伴焦虑临床观察

目的:观察加减归脾汤联合胃复春治疗脾胃虚弱型慢性萎缩性胃炎(Chronic atrophic gastritis,CAG)伴焦虑的临床疗效。探求该药的临床价值及潜在的作用机制,为临床治疗提供一种参考。方法:观察符合纳入要求的CAG伴焦虑患者,共80例,随机地分为对照组和治疗组各40例,对照组予胃复春治疗,治疗组予加减归脾汤联合胃复春,两组以8周为疗程。治疗8周后观察两组中医证候积分、中医证候疗效、汉密尔顿焦虑量表(HAMA)评分、胃镜症候评分、病理评分、血清中胃泌素17(G-17)、胃蛋白酶原I(PGI)、胃蛋白酶原I/II比值(PGR)以及安全性评价。结果:中医症候疗效:相比对照组的总有效率为75.00%,治疗组总有效率92.50%显示较对照组更佳(P<0.05)。中医症候积分:治疗8周后,两组中医证候积分均较前有所下降,对比治疗前后中医症候积分变化情况,治疗组更为明显(P<0.05)。病理积分:将炎症、萎缩、肠化、异型增生的有无,按程度分为分为无、轻、中、重四个轻重等级,记为0、1、2、3分,两组治疗后记录各项目总积分,表明两组治疗均是有效的(P<0.05),且治疗组治疗效果明显高于对照组(P<0.05)。血清G-17、PGI、PGR水平:经治疗两组患者G-17、PGI、PGR较前均上升(P<0.05),且治疗组升幅大于对照组(P<0.05)。汉密尔顿焦虑量表(HAMA)评分:治疗后两组患者焦虑量表评分均较治疗前降低(P<0.05),治疗后两组间比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。表示治疗组较对照组更能改善焦虑。结论:加减归脾汤联合胃复春治疗脾胃虚弱型CAG伴有焦虑的患者时可以显著改善患者的中医症候、心理状态、胃黏膜状态及病理积分,有效调节血清G-17、PGI、PGR水平,对比对照组疗效更佳,且治疗安全,无不良事件发生。

基于蒙太奇手法的古村落改造设计研究——以高安贾家古村为例

在工业化和城镇化进程中,由于地理位置偏僻、人口迁移,以及现代生活方式的冲击、工业布局调整等原因,古村落逐步衰败下来。随着国家对文化自信以及留住乡愁的大力倡导,近些年来,社会各界对古村落的保护与改造愈加重视。然而,随着旅游业的蓬勃兴起,村落保护利用过程中过度的逐利倾向日益突出,导致古村落风貌遭到破坏,历史记忆丢失。该文以贾家古村传统空间重建为例,从该村落传统空间现状出发,引入蒙太奇设计手法,从整体的空间关系、整合记忆等角度总结重建策略,为古村落旅游发展中的传统空间保护和发展提供新的思路。

曙光1000A上消息传递与共享存储的比较

分布式共享存储虽然有易于编程的优点 ,但往往被认为效率不高 .完全由软件实现的分布式共享存储系统 (又称为虚拟共享存储系统 )更是如此 .文中以典型的消息传递系统 PVM与分布式共享存储系统 JIAJIA为例 ,分析了这两种并行程序设计环境的特点 ,并用 7个应用程序在曙光 10 0 0 A上分别比较了这两个系统的性能 .实验结果表明 ,JIAJIA的性能与 PVM基本相当 ,但基于 JIAJIA的并行程序设计却比

机群Open MP系统的设计与实现

OpenMP以其易用性和支持增量并行的特点成为共享存储体系结构的编程标准 .目前机群系统已成为高性能计算的主流平台 ,研究机群OpenMP系统对推进并行应用的开发和普及非常有意义 .该文作者以软件DSM系统JIAJIA作为OpenMP的运行时系统 ,结合一个前端编译器OMP2JIA ,在机群系统上实现了OpenMP/JIAJIA计算环境 ,同时在提高性能方面根据机群系统特点扩展了OpenMP制导 ,优化了后端运行时库 .通过 11个OpenMP应用 ,作者比较了该计算环境和一个支持OpenMP的硬件cc NUMA系统 (SGI 2 10 0 )的性能 .结果表明 ,作者的机群OpenMP系统的 7机平均加速比为 4 .6 2 ;SGI 2 10 0系统为 4 .5 5 ,二者性能相当 .

基于新型Cache一致性协议的共享虚拟存储系统

介绍了一个基于新型Ｃａｃｈｅ一致性协议的共享虚拟存储系统ＪＩＡＪＩＡ．与目前国际上具有代表性的共享虚拟存储系统相比，ＪＩＡＪＩＡ采用了基于ＮＵＭＡ的结构，能够把多个机器的物理地址空间组织成一个更大的共享虚拟地址空间．此外，ＪＩＡＪＩＡ实现了一种基于锁的新型一致性协议，通过附带在锁上的ｗｒｉｔｅ－ｎｏｔｉｃｅ来维护一致性，从而避免了传统的目录协议中由目录引起的存储开销和系统复杂度．利用一些被广泛使用的测试程序，例如ＳＰＬＡＳＨ２和ＮＡＳ并行程序集，对ＪＩＡＪＩＡ进行的测试表明，同近期实现的共享虚拟存储系统（如ＣＶＭ）比较，ＪＩＡＪＩＡ不仅具有更高的性能，而且可以解决更大规模的问题．

通信对机群并行计算性能的影响

分析了通信和计算重叠模型及 L og GP模型 ,指出各通信参数对并行计算性能的影响 ,结合并行程序的特征介绍了在机群环境下改善并行计算性能经常采用的五种通信方式 :采用高速网络、采用用户级通信协议、利用 SMP通信、动态预取或迁移数据、消息合并发送 ,详尽测试了各种方式影响性能情况并分析了其特点和适用范围 .采用高速网络是最常用的方法 ,性能提高明显 ,适用于各类应用程序 .需要传送大量小消息的并行程序还应采用用户级通信协议 .对于特定的一类应用程序 ,采用消息合并发送方式提高性能最多 .采用动态预取或迁移数据和利用 SMP通信时要慎重 。

针对非规则应用的OpenMP制导扩展

许多非规则应用的核心是稀疏矩阵运算 .稀疏矩阵运算的特点是对一个数组元素的引用依赖于另两个数组的元素值 ,因此具有非规则访存特点 .本文针对稀疏矩阵运算特点 ,提出一种新的 Open MP制导子句 indirect,并在机群 Open MP系统Open MP/ JIAJIA上进行了实现 .采用一个真实的 Open MP应用 Equake进行了测试 ,测试结果表明该制导扩展很有效 ,对于直接使用该制导子句的函数代码 ,其性能改进了 18% ,而整个应用的性能改进了 15 % .

访存密集型应用在SMP机群系统中的性能分析

SM P机群系统因其良好的性价比、卓越的可扩展性与可用性,逐渐成为当前高性能计算机领域的主流结构.这种结点内共享存储、结点间消息传递的两级混合结构是目前并行计算研究的热点.在单个SM P结点中,总线和内存带宽是否满足CPU和I/O的需求对于访存密集型应用的性能影响很大.本文针对访存密集型应用的特点测试分析了在SM P机群中访存冲突对系统性能的影响,结果表明我们的SM P结点存在性能瓶颈,这种量化分析对于设计大规模的基于SM P的机群系统有很好的指导意义.

适合机群OpenMP系统的制导扩展

OpenMP以其易用性和支持增量并行的特点成为共享存储体系结构的编程标准 .机群OpenMP系统在机群上实现了OpenMP计算环境 ,它将OpenMP的易编程性和机群的可扩展性结合起来 ,是很有意义的 .OpenMP的编程方式主要有循环级和SPMD两种 ,其中循环级方式易于编程而SPMD方式难于编程 .然而在机群OpenMP系统中获得高性能OpenMP程序 ,必需采用SPMD方式 .该文描述了适合机群OpenMP系统的一个简单的OpenMP制导扩展子集 (包括数据分布制导、循环调度模式 ) ,并在机群OpenMP系统OpenMP/JIAJIA上进行了实现 .应用测试表明 ,利用这些制导扩展进行编程 ,既保持循环级方式的易编程性又获得与SPMD方式相当的性能 ,是有效的编程方式 .

谢嘉嘉教授运用岭南中药辨治慢性咳嗽临证经验

谢嘉嘉教授从事肺系疾病诊疗工作20余载,秉承岭南历代医家的临床经验,在治疗慢性咳嗽时结合岭南地区的气候特点,通过八纲辨证、脏腑辨证结合患者的体质特性,分因辨证,重视脏腑咳,辨治兼证,确定病位病性,擅长辨证运用龙脷叶、枇杷叶、风栗壳、岗梅根、毛冬青、青天葵、广藿香、猫爪草、布渣叶、芒果核、五指毛桃等多种岭南药材治疗慢性咳嗽,在临床获益颇丰,其辨证方法及治疗思维值得临床借鉴和学习。

一种适用于机群OpenMP系统的有效调度算法

OpenMP作为共享存储并行编程标准 ,以其良好的易用性、支持增量并行等特点成为并行程序设计的主流模型之一 OpenMP标准是针对UMA共享存储结构制定的 ,其循环调度机制只考虑了负载平衡而无须考虑数据分布 然而在机群OpenMP系统中 ,数据局部性是影响性能的关键因素 针对OpenMP标准中静态调度策略不适合机群计算的缺点 ,提出了一个充分体现拥有者计算原则的LBS调度算法 ,并通过扩展制导的方式在机群OpenMP系统 (OpenMP/JIA JIA)上加以实现 测试结果表明 。

可恢复的软件DSM系统JIACKPT

软件 DSM(distributed shared memory)系统在机群上构造了共享存储编程环境,结合了共享存储的易编程性和机群的可扩展性,引起了广泛的研究.由于软件 DSM 系统是一个分布式系统,系统失败风险大,需要实现容错技术以促进其实用化.利用用户级检查点技术,在支持域存储一致模型的软件 DSM 系统 JIAJIA 的基础上,设计并实现了一个可恢复的高可移植的软件 DSM 系统 JIACKPT(JIAjia with ChecKPoinTing).由于采用适合软件 DSM 系统的强全局一致状态以及多种优化措施,JIACKPT 易于实现且获得很好的性能.在一个 8 节点的 PC 机群上的应用测试表明,即使每分钟做一次检查点,大部分应用的检查点开销也小于 10%.此外,JIACKPT 还具有高可移植性.这些都表明 JIACKPT 已经成为一个比较实用的系统.

软件并行处理技术在SAR图像处理中的应用

近年来，雷达遥感图像特别是SAR图像在农业、林业、军事、测绘和灾害监测等方面的应用越来越广。对于连续成像的SAR图像，数据量大，处理时很难满足实际应用的需要。本文通过利用网络共享内存（DSMs）软件JIAJIA的并行处理环境，进行了机械SAR图像几何纠正和重要地物分类提取等串、并行实验，证明了在这种软件技术支持下，开发图像处理系统，特别是针对SAR图像等遥感图像的处理具有一定的实用价值。

基于锁集合的动态数据竞争检测方法

数据竞争使得共享存储程序难于调试 .以前大部分针对共享存储程序的动态数据竞争检测工作都是通过维护发生序来实现 .这种方法有一个重要缺点 ,即针对程序的一种输入 ,对程序的一次执行进行检测 ,不能检测出所有的可行数据竞争 .文中利用存储一致性模型的框架模型 ,针对域一致性模型提出了增强发生序概念 ,并依此得出一种基于锁集合的动态数据竞争检测算法 ,克服了这个问题 .在软件DSM系统JIAJIA上的实现获得了很好的性能 ,应用平均减速比为 3.14 .利用该方法 ,在TSP程序中找到了大量的读写数据竞争的情况 .

地理数字图像机群并行处理试验

地理数字图像是指与地理位置有关的数字图像,包括栅格图像、矢量图形等.随着数字地球时代的到来,地理数据采集设备分辨率的提高,地理图像所蓄含的信息量呈海量增[2],这要求图像处理速度应加快,效率应提高.因此,并行性引入数字图像处理成了必然趋势[3].地理图像处理中一般为几十兆一几百兆字节的矩阵操作,需大内存;分块矩阵计算过程中通信量少,因而地理数字图像处理易于并行化.

秦佳佳补肾为主治疗卵巢早衰

[目的]探究秦佳佳导师补肾为主治疗卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)的临床经验。[方法]收集秦师在临床上治疗POF的相关病例,整理与分析秦师对于POF的病因病机及辨证论治特点。[结果]秦师认为POF以肾虚为主,尤以肾阴虚为要,多兼有肝郁。证型可分为肾阴虚、肾阳虚、肾阴阳两虚、肾虚肝郁四型。肾阴虚型,治宜滋养肾阴;肾阳虚型,治宜温肾扶阳;阴阳两虚型,治宜阴阳双补;肾虚肝郁型,治宜补肾填精,疏肝解郁。[结论]POF的治疗当以补肾为主,疏肝为辅,治法应常中有变,病证结合。

牵引配合毫火针针刺“下颈夹脊穴”对神经根型颈椎病肌电图动作电位峰值、腋神经神经传导速度的影响

目的:观察颈椎牵引配合毫火针治疗神经根型颈椎病的临床效果。方法:选择2015年1月—2015年12月就诊于宜宾市第一人民医院的神经根型颈椎病患者60例,随机分为治疗组和对照组,每组30例。治疗组给予颈椎牵引配合毫火针针刺治疗,对照组给予颈椎牵引配合镇痛灸外敷治疗。治疗两周后观察两组治疗前后肌电图动作电位峰值、腋神经神经传导速度变化情况。结果:治疗组治疗后动作电位峰值优于对照组(P<0.05);治疗组治疗后腋神经神经传导速度优于对照组(P<0.05)。结论:颈椎牵引配合毫火针针刺治疗神经根型颈椎病,能改善患者肌电图动作电位峰值、腋神经神经传导速度。

秦佳佳从调补肝肾角度防治卵巢早衰

近年来卵巢早衰的中医药防治研究百花齐放,相对于西医而言,治疗方法较为灵活,且不良反应少,远期疗效可靠。秦佳佳教授认为,卵巢早衰多为肾虚、肝郁、血瘀相扰为害,治疗上以补肾疏肝治其本,活血化瘀顾其标,常以左归丸、右归丸或二仙汤为主方随症加减,获以良效。