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KRAB型锌指蛋白的进化及在物种演化中的功能 被引量:3
1
作者 王进龙 王建 田春艳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期971-978,共8页
C2H2型锌指蛋白家族是目前发现的哺乳动物中最大的转录/转录调控因子家族,由一小群古老的含有真核锌指结构的转录因子经过多次基因复制和功能分化演化而来。KRAB型锌指蛋白(KRAB.containing zinc finger proteins,KRAB-ZFPs)作为C2H2型... C2H2型锌指蛋白家族是目前发现的哺乳动物中最大的转录/转录调控因子家族,由一小群古老的含有真核锌指结构的转录因子经过多次基因复制和功能分化演化而来。KRAB型锌指蛋白(KRAB.containing zinc finger proteins,KRAB-ZFPs)作为C2H2型锌指蛋白家族中最大的亚家族,最早出现在四足脊椎动物,并随物种的进化数量快速增长,在人类中占据C2H2型锌指蛋白的60%左右。在物种演化中,进化压力主要改变KRAB-ZFPs的DNA结合能力,而KRAB-ZFPs介导的转录抑制能力则稳定存在。同时,多种KRAB-ZFPs能够与KRAB相关蛋白1(KRAB-associated protein 1,KAP1)协同作用沉默哺乳动物中反转录元件的活性,并与之协同进化,严格限制反转录原件的跳跃能力。本文综述了KRAB-ZFPs的数量倍增、锌指结构的灵活多变、KRAB-ZFPs/KAP1的转录抑制能力和反转录元件的跳跃性在促进哺乳动物调控网络的差异、基因组稳定性的变化和物种进化中的作用,旨在进一步揭示KRAB-ZFPs在推动物种稳定演化中的特点和功能。 展开更多
关键词 krab 锌指 krab-ZFPs 进化 KAP1 转座子
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KRAB型锌指蛋白(KZNF)的研究进展 被引量:5
2
作者 田春艳 张令强 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1451-1456,共6页
KRAB型锌指蛋白是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布。其结构特征是N端含有KRAB结构域,C端含有多个C2H2型锌指结构。KRAB结构域为一蛋白质-蛋白质相互作用区,可以与多种协同转录抑制因子和转录因子结合,... KRAB型锌指蛋白是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布。其结构特征是N端含有KRAB结构域,C端含有多个C2H2型锌指结构。KRAB结构域为一蛋白质-蛋白质相互作用区,可以与多种协同转录抑制因子和转录因子结合,使KRAB型锌指蛋白作为转录因子和/或转录调控因子发挥依赖于DNA结合的转录抑制功能,在胚胎发育、细胞分化、细胞转化及细胞周期的调控中发挥重要功能。 展开更多
关键词 krab KZNF C2H2型锌指 KAP-1 转录抑制
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一条KRAB型锌指蛋白全长新基因的克隆与功能初探 被引量:2
3
作者 王兆 应康 +3 位作者 林盛榕 吴海 谢毅 毛裕民 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期247-251,共5页
从人胎脑cDNA文库中克隆到一条全长的锌指蛋白新基因的cDNA ,命名为ZNF303。序列分析表明 ,ZNF303的C末端含有7个保守的锌指基序 ,N末端含有一个KRAB(Kr櫣ppel associatedbox)结构域。利用肝癌组织表达谱基因芯片杂交证明 ,该基因... 从人胎脑cDNA文库中克隆到一条全长的锌指蛋白新基因的cDNA ,命名为ZNF303。序列分析表明 ,ZNF303的C末端含有7个保守的锌指基序 ,N末端含有一个KRAB(Kr櫣ppel associatedbox)结构域。利用肝癌组织表达谱基因芯片杂交证明 ,该基因在肝癌组织中的表达量有明显降低。认为这种降低可能跟肝癌的形成和转移有密切的关系。利用辐射杂交基因定位技术 ,得出该基因在人类染色体上的位置是19q13.2。 展开更多
关键词 锌指蛋白 krab 肝癌 ZNF303
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CRISPR/dCas9-KRAB系统沉默猪LncRNA-NEAT1基因
4
作者 赵为民 戴超辉 +6 位作者 陈哲 涂枫 李辉 付言峰 李碧侠 任守文 程金花 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期1036-1042,共7页
本研究利用RT-PCR检测LncRNA-NEAT1基因表达在细胞中的亚定位,采用5′RACE获得LncRNA-NEAT1基因的转录起始位点;利用CRISPOR软件对-300~0 bp区域的LncRNA-NEAT1启动子序列设计sgRNA并构建到px330载体,通过转染细胞与T7E1酶切验证sgRNA效... 本研究利用RT-PCR检测LncRNA-NEAT1基因表达在细胞中的亚定位,采用5′RACE获得LncRNA-NEAT1基因的转录起始位点;利用CRISPOR软件对-300~0 bp区域的LncRNA-NEAT1启动子序列设计sgRNA并构建到px330载体,通过转染细胞与T7E1酶切验证sgRNA效率;利用酶切和亚克隆方法将dCas9-KRAB-BSD片段替换px330载体的Cas9序列,形成重组px330-dCas9-KRAB载体;将验证有效的sgRNA构建到px330-dCas9-KRAB载体,形成px330-sgRNA-dCas9-KRAB载体。添加不同质量浓度的Blasticidin S处理细胞,以最小致死质量浓度来确定筛选质量浓度。转染px330-sgRNA-dCas9-KRAB载体并用Blasticidin S筛选细胞7 d后进行LncRNA-NEAT1基因的表达检测,同时对sgRNA在LncRNA-NEAT1基因启动子上的结合位点进行Sanger测序,以进一步验证上述结合位点是否发生切割。结果显示LncRNA-NEAT1主要表达于细胞核,而在细胞质中几乎不表达。5′RACE获得了LncRNA-NEAT15′端大约270 bp的序列。qPCR检测结果显示,与对照组相比,sgRNA1和sgRNA2能够显著抑制LncRNA-NEAT1的表达(P<0.05)。Sanger测序结果表明sgRNA1和sgRNA2所在的位点并没有发生碱基缺失和插入。研究结果为后续进一步研究LncRNA-NEAT1在先天性免疫反应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 CRISPR dCas9-krab LncRNA-NEAT1基因 基因沉默
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东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A蛋白的分子特性及系统进化分析
5
作者 叶亚萍 吴鹰 +6 位作者 钱加珺 赵浩东 吉挺 蔺哲广 徐细建 陈大福 郭睿 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第4期632-637,共6页
为明确KRAB-A的分子特性并进行东方蜜蜂微孢子虫与其他物种KRAB-A蛋白的系统进化分析,以期丰富KRAB-A的基本信息,使用NCBI数据库中的ORF工具预测KRAB-A蛋白的氨基酸序列。利用ExPASy网站上的相关软件预测和分析KRAB-A蛋白的亲水性、信... 为明确KRAB-A的分子特性并进行东方蜜蜂微孢子虫与其他物种KRAB-A蛋白的系统进化分析,以期丰富KRAB-A的基本信息,使用NCBI数据库中的ORF工具预测KRAB-A蛋白的氨基酸序列。利用ExPASy网站上的相关软件预测和分析KRAB-A蛋白的亲水性、信号肽、磷酸化位点、二级结构及三级结构。通过Mega11.0软件采用邻接法构建基于KRAB-A蛋白的系统进化树。结果显示,KRAB-A基因可编码1018个氨基酸;KRAB-A蛋白的分子式为C5314H8526N1522O1556S43,分子量约为120.00kDa,等电点为9.33,脂溶系数为79.20,亲水性为-0.75;KRAB-A含有41个丝氨酸、21个酪氨酸和16个苏氨酸磷酸化位点,1个H2C2模体,但不含有信号肽;KRAB-A含44.40%的α-螺旋,5.40%的β-转角,16.50%的延伸及33.69%的无规卷曲;蜜蜂微孢子虫的1个KRAB-A蛋白(NAPIS_ORF00138)与明球囊霉的2个KRAB-A蛋白(RCL2_000589200和RCL2_003114000)中存在与东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A蛋白中相同的H2C2模体;东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A(AAJ76_2380003054)与其姐妹种蜜蜂微孢子虫KRAB-A(NAPIS_ORF01514)聚为一支。研究结果明确了东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A基因的分子特性,揭示KRAB-A可能是一种亲水性蛋白和胞内蛋白,东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A(AAJ76_2380003054)与蜜蜂微孢子虫KRAB-A(NAPIS_ORF01514)间具有很高的保守性,为进一步的功能研究提供依据。 展开更多
关键词 东方蜜蜂微孢子虫 锌指蛋白krab-a结构域 krab-A基因 生物信息学分析
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KRAB型锌指蛋白在高等脊椎动物胚胎发育和肿瘤发生、发展中的调控功能 被引量:8
6
作者 马占福 杨冬 +1 位作者 贺福初 姜颖 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期431-436,共6页
KRAB型锌指蛋白(KRAB-ZFPs)最早出现于四足类脊椎动物,且进化非常迅速,是人类基因组编码的最大转录因子家族。尽管当前对此家族蛋白发挥调控功能的分子机制已有较为深入的研究,但关于此家族蛋白所具备的高等脊椎动物特有的调控功能目前... KRAB型锌指蛋白(KRAB-ZFPs)最早出现于四足类脊椎动物,且进化非常迅速,是人类基因组编码的最大转录因子家族。尽管当前对此家族蛋白发挥调控功能的分子机制已有较为深入的研究,但关于此家族蛋白所具备的高等脊椎动物特有的调控功能目前尚无全面系统的认识。文章对KRAB型锌指蛋白在高等脊椎动物的胚胎发育及肿瘤发生、发展中发挥的调控功能进行综述,以期丰富对该家族蛋白在不同生理、病理过程中调控功能的认识,为今后更深入的理论和应用研究打下坚实基础。 展开更多
关键词 krab 胚胎发育 肿瘤 转录调控
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KRAB锌指蛋白的研究进展 被引量:2
7
作者 普燕 李琦涵 《生命的化学》 CAS CSCD 2004年第2期144-147,共4页
约有三分之一C2 H2 锌指蛋白的N端都含有KRAB结构域 ,该结构域在进化上极其保守 ,含有约 75个氨基酸 ,其中富含极性氨基酸 ,因而易于形成两个双亲性螺旋。该结构域已被证实是一个强有力的转录抑制结构域 ,但其介导的抑制作用需要它与TIF... 约有三分之一C2 H2 锌指蛋白的N端都含有KRAB结构域 ,该结构域在进化上极其保守 ,含有约 75个氨基酸 ,其中富含极性氨基酸 ,因而易于形成两个双亲性螺旋。该结构域已被证实是一个强有力的转录抑制结构域 ,但其介导的抑制作用需要它与TIF1β/KAP - 1/KAIP - 1结合。实验表明 ,结合了KRAB结构域针对特异靶基因的锌指蛋白 ,不仅可以抑制基因的表达 ,还可以降低病毒在细胞内的复制。因此 ,KRAB在调控基因表达和胞内抗病毒方面表现出极大的应用潜能。 展开更多
关键词 krab 锌指蛋白 抑制转录
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哺乳动物锌指蛋白家族中KRAB功能域的进化
8
作者 袁力赟 赵中明 丁国徽 《生物信息学》 2009年第3期202-206,211,共6页
KRAB锌指基因是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布,具有五种不同的亚家族,在功能行使上承担着不同的作用。本文通过对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五种哺乳动物全蛋白质组序列及mRNA组织表达谱分析,验... KRAB锌指基因是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布,具有五种不同的亚家族,在功能行使上承担着不同的作用。本文通过对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五种哺乳动物全蛋白质组序列及mRNA组织表达谱分析,验证了C2H2锌指结构在单个KRAB蛋白质中出现的数目多于一般锌指蛋白质;KRAB功能域在各物种中分布显著不同且与分化时间不成正比,这表明KRAB相关功能域多样性在灵长类进化过程中潜在的适应性进化。同时,提出KRAB亚家族进化的路线:即KRAB-Aa为起始家族,Ba由Aa直接演变形成,而Ca,blonga和XRCC三种亚型可能经过Ba或直接从Aa演变形成;此外,锌指结构在单个蛋白质中出现个数伴随KRAB功能域自身的进化路线逐渐递增,反映了KRAB功能域在形成新转录调控因子方面的积极作用。 展开更多
关键词 krab功能域 锌指基因 亚家族 进化
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核不均一核糖核蛋白AB与互作蛋白KRAB相关蛋白1在原发性肝细胞肝癌中的表达谱及其临床意义 被引量:5
9
作者 周正君 王晓怡 +7 位作者 徐晓雨 胡志强 陈二宝 周少来 吴伟忠 周俭 樊嘉 代智 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期452-457,共6页
目的研究核不均一核糖核蛋白AB(hnRNPAB)在人肝癌细胞系中的互作蛋白谱,探讨hnRNPAB/KRAB相关蛋白1(Kap1)的共表达谱与肝癌患者临床病理特征之间的相关性及其在预测患者术后复发转移的临床价值。方法质谱分析与多肽比对确定与hnRN... 目的研究核不均一核糖核蛋白AB(hnRNPAB)在人肝癌细胞系中的互作蛋白谱,探讨hnRNPAB/KRAB相关蛋白1(Kap1)的共表达谱与肝癌患者临床病理特征之间的相关性及其在预测患者术后复发转移的临床价值。方法质谱分析与多肽比对确定与hnRNPAB蛋白结合的Kapl蛋白肽段,免疫共沉淀验证两者的蛋白相互作用;免疫组织化学染色方法检测,hnRNPAB和互作蛋白Kapl在组织芯片中的表达谱,分析其与临床病理特征及预后的关联性。计数资料比较采用χ2或Fisher精确概率法;计量资料比较用两组间比较的t检验或wilcoxon符号秩检验;生存率的判定使用Kapian—Meier方法,差异性使用Log—rank检验评估。结果免疫共沉淀联合质谱技术鉴定出Kap1是hnRNPAB蛋白在人肝癌细胞中的结合蛋白之一,两者之间存在蛋白相互作用。生存分析结果显示Kap1高表达组肝癌患者术后5年总体生存率为36%,显著低于Kapl低表达组患者的59%,差异有统计学意义(HR=1.67,P〈0.001);其累计复发率为72%,显著高于Kap1低表达组患者的54%(IqR=1.66,P=0.001)。单因素统计分析结果显示单独的hnRNPAB、Kap1以及两者联合均是肝癌患者术后生存和复发的独立预后影响因素,差异均有统计学意义(HR分别为1.35和1.28,P值均〈0.05);联合hnRNPAB和Kap1对术后生存和复发的预测价值高于单个指标,差异均有统计学意义(HR分别为1.24和1.27,P值均〈0.05)。结论在人肝癌细胞中hnRNPAB与Kap1形成蛋白复合体;HnRNPAB联合Kap1是非常好的独立预后指标,能准确预测肝癌患者术后的预后不良。 展开更多
关键词 肝肿瘤 核不均一核糖核蛋白AB krab相关蛋白1 表达谱 预后
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甲状腺乳头状癌中鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1突变及KRAB相关蛋白-1表达研究 被引量:1
10
作者 晏龙强 姜训圳 何向辉 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期2887-2887,共1页
甲状腺乳头状癌(PTC)是最常见的甲状腺恶性肿瘤,占所有甲状腺癌的80%[1].Kimura等[2]发现40% ~45%的PTC存在鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1 (BRAF)基因突变.Silva等[3]发现在肝癌、胃癌、肺癌和乳腺癌中KRAB相关蛋白-1(KAP-1... 甲状腺乳头状癌(PTC)是最常见的甲状腺恶性肿瘤,占所有甲状腺癌的80%[1].Kimura等[2]发现40% ~45%的PTC存在鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1 (BRAF)基因突变.Silva等[3]发现在肝癌、胃癌、肺癌和乳腺癌中KRAB相关蛋白-1(KAP-1)蛋白水平显著提高,但在PTC中报道较少.本实验旨在检测40例PTC患者行BRAF突变和KAP-1表达,探讨BRAFV600E突变及KAP-1表达与PTC侵袭性的关系. 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 滤过性毒菌 基因突变 krab 类肉瘤 蛋白-1 致癌 甲状腺恶性肿瘤
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KRAB-相关蛋白1对胰腺癌细胞化疗耐药性的影响
11
作者 詹磊 江建新 +1 位作者 潘耀振 孙诚谊 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期12-15,共4页
目的 观察KRAB-相关蛋白1(KAP-1)对胰腺癌Capan-2细胞株化疗耐药的影响.方法 PCR扩增KAP-1序列,克隆至pGC-FU-3 FLAG-IRES-Puromycin慢病毒表达载体;双酶切及测序鉴定正确后进行慢病毒包装并进行滴度检测.构建成功后感染人胰腺癌细胞... 目的 观察KRAB-相关蛋白1(KAP-1)对胰腺癌Capan-2细胞株化疗耐药的影响.方法 PCR扩增KAP-1序列,克隆至pGC-FU-3 FLAG-IRES-Puromycin慢病毒表达载体;双酶切及测序鉴定正确后进行慢病毒包装并进行滴度检测.构建成功后感染人胰腺癌细胞株Capan-2细胞,48 h后使用实时定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)以及Westem blot法检测KAP-1的表达量及其相关上皮-间充质转化(EMT)标志蛋白——波形蛋白的表达.采用细胞计数试剂盒(CCK-8)方法测定不同化疗药物在不同浓度下过表达KAP-1的Capan-2细胞生长及化疗药物对胰腺癌细胞的生长抑制作用.结果 构建的慢病毒载体感染细胞48 h后,在倒置荧光显微镜下观察可见绿色荧光,病毒滴度为2&#215;108 TU/ml.RT-qPCR检测结果表明,实验组、阴性对照组、空白对照组细胞中KAP-1的mRNA相对表达量分别为9.48±0.73、0.03±0.00、0.02±0.00,差异有统计学意义(P<0.05);波形蛋白的mRNA相对表达量分别为7.84±0.21、0.63 ±0.07、0.59±0.12,差异有统计学意义(P<0.05).Western blot检测结果表明:实验组、阴性对照组、空白对照组细胞中KAP-1的蛋白相对表达量分别为2.73±0.97、0.63±0.36、0.51±0.14,差异有统计学意义(P<0.05);波形蛋白的相对表达量为4.75±0.53、1.00±0.26、1.25±0.91,差异有统计学意义(P<0.05).转染过表达KAP-1慢病毒载体的Capan-2细胞株在吉西他滨、5-氟尿嘧啶、顺铂作用下的50%生长抑制所需药物浓度(GI50)值分别为27.53、3.96、3.18;阴性对照组及空白对照组分别为0.28、0.15、0.39;0.14、0.21、0.27,差异有统计学意义(P<0.05).结论 构建了高效稳定表达KAP-1的慢病毒转染系统.KAP-1转录因子可以减慢人类胰腺癌细胞Capan-2细胞株在化疗药物的作用下的增殖速度,并降低该细胞对化疗药物的敏感性.其机制可能与过表达KAP-1影响波形蛋白上调有关. 展开更多
关键词 胰腺癌 krab-相关蛋白1 化疗耐药性 波形蛋白
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KRAB相关蛋白1的功能及其在疾病中的研究进展 被引量:1
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作者 严天晴 马萍 +1 位作者 齐素华 王婉 《中国细胞生物学学报》 CSCD 2021年第7期1543-1549,共7页
KRAB相关蛋白1(KRAB-associated protein 1,KAP1)又称转录中介因子1β(transcriptional intermediary factor 1β,TIF1β),也称三重基序蛋白28(tripartite motif-containing protein 28,TRIM28),是许多基因转录调控复合体中的支架分子,... KRAB相关蛋白1(KRAB-associated protein 1,KAP1)又称转录中介因子1β(transcriptional intermediary factor 1β,TIF1β),也称三重基序蛋白28(tripartite motif-containing protein 28,TRIM28),是许多基因转录调控复合体中的支架分子,参与免疫调节、胚胎早期发育、病毒复制、DNA损伤反应、肿瘤发生发展等许多生理病理过程的调控。KAP1存在磷酸化、乙酰化等多种翻译后修饰且参与蛋白质泛素化、类泛素化修饰和DNA甲基化、组蛋白甲基化、去乙酰化修饰,这对KAP1功能的发挥具有重要作用。该文综述了KAP1的功能及其在疾病中的研究进展,以期为KAP1相关疾病的分子治疗提供指导。 展开更多
关键词 krab相关蛋白1 翻译后修饰 疾病
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PRDM9 KRAB结构域在减数分裂DSB位点决定中的作用
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作者 丁健 林震 童明汉 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2023年第5期725-733,共9页
同源重组是减数分裂过程中的关键步骤,对确保同源染色体正确分离和遗传多样性都有重要意义。重组位点并非随机分布于基因组中,而是被限定在特殊区域,被称为重组热点。在大多数哺乳动物中减数分裂重组位点的决定是由PRDM9介导的。PRDM9... 同源重组是减数分裂过程中的关键步骤,对确保同源染色体正确分离和遗传多样性都有重要意义。重组位点并非随机分布于基因组中,而是被限定在特殊区域,被称为重组热点。在大多数哺乳动物中减数分裂重组位点的决定是由PRDM9介导的。PRDM9首先识别染色体上的特异结合序列,然后催化序列附近核小体的H3K4me3修饰,从而指导SPO11产生程序性的DNA双链断裂。PRDM9主要包括三个保守的结构域:锌指结构域,负责特异性DNA结合;PR/SET结构域,催化H3K4me3修饰;以及KRAB结构域,其功能目前尚不清楚。该研究发现PRDM9的KRAB结构域特异敲除小鼠表现为减数分裂前期I阻滞。在机制上, KRAB结构域特异敲除导致H3K4me3无法在重组热点上形成,继而导致DNA双链断裂产生于基因启动子区域而非重组热点区域。因此, KRAB结构域为PRDM9的组蛋白H3K4甲基转移酶活性所必需。 展开更多
关键词 减数分裂 同源重组 PRDM9 krab结构域
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人类心脏发育候选基因ZNF569的生物信息学分析 被引量:2
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作者 黄欣琼 唐显庆 +3 位作者 张晓红 石金凤 李美香 吴秀山 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期341-344,共4页
目的分析人类心脏发育候选基因ZNF569的生物信息学,对其功能研究提供指导意见。方法利用生物信息学网站及生物软件对人类心脏发育候选基因ZNF569进行生物信息学分析。结果ZNF569是一个新的人类KRAB/C2H2型锌指蛋白基因。此基因在基因组... 目的分析人类心脏发育候选基因ZNF569的生物信息学,对其功能研究提供指导意见。方法利用生物信息学网站及生物软件对人类心脏发育候选基因ZNF569进行生物信息学分析。结果ZNF569是一个新的人类KRAB/C2H2型锌指蛋白基因。此基因在基因组DNA上长约56.28 kb,定位于19q13.12。开放阅读框全长2061个碱基,含6个外显子,5个内含子,编码一个长686个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白包含一个KRAB结构域和18个锌指结构域,进化分析表明各种真核生物中都存在ZNF569的同源蛋白,而ZNF569蛋白与鼠ZNF74蛋白的相似度达到94%,它们之间的蛋白质序列保守度更高。ZNF569本身18个锌指结构蛋白质序列也高度保守。结论ZNF569及其同源蛋白构成了一个在进化中高度保守的新的KRAB-ZF基因,而它的功能尚未见报道。 展开更多
关键词 ZNF569基因 心脏发育 krab/C2H2
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KAPtain in charge of multiple missions: Emerging roles of KAP1 被引量:5
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作者 Chun-Ting Cheng Ching-Ying Kuo David K Ann 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2014年第3期308-320,共13页
KAP1/TRIM28/TIF1β was identified nearly twenty years ago as a universal transcriptional co-repressor because it interacts with a large KRAB-containing zinc finger protein(KRAB-ZFP) transcription factor family. Many s... KAP1/TRIM28/TIF1β was identified nearly twenty years ago as a universal transcriptional co-repressor because it interacts with a large KRAB-containing zinc finger protein(KRAB-ZFP) transcription factor family. Many studies demonstrate that KAP1 affects gene expression by regulating the transcription of KRAB-ZFP-specific loci, trans-repressing as a transcriptional co-repressor or epigenetically modulating chromatin structure. Emerging evidence suggests that KAP1 also functions independent of gene regulation by serving as a SUMO/ubiquitin E3 ligase or signaling scaffold protein to mediate signal transduction. KAP1 is subjected to multiple post-translational modifications(PTMs), including serine/tyrosine phosphorylation, SUMOylation, and acetylation, which coordinately regulate KAP1 function and its protein abundance. KAP1 is involved in multiple aspects of cellular activities, including DNA damage response, virus replication, cytokine production and stem cell pluripotency. Moreover, knockout of KAP1 results in embryonic lethality, indicating that KAP1 is crucial for embryonic development and possibly impacts a wide-range of(patho)physiological manifestations. Indeed, studies from conditional knockout mouse models reveal that KAP1-deficiency significantly impairs vital physiological processes, such as immune maturation, stress vulnerability, hepatic metabolism, gamete development and erythropoiesis. In this review, we summarize and evaluate current literatures involving the biochemical and physiological functions of KAP1. In addition, increasing studies on the clinical relevance of KAP1 in cancer will also be discussed. 展开更多
关键词 krab domain-associated PROTEIN 1 TRANSCRIPTIONAL CO-REPRESSOR POST-TRANSLATIONAL modification CHROMATIN remodeling krab-containing zinc finger PROTEIN
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在心脏组织表达的一个人类新基因
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作者 罗开梅 王跃群 +3 位作者 皮花亮 袁婺洲 李大力 吴秀山 《湖南师范大学自然科学学报》 EI CAS 北大核心 2003年第2期79-83,共5页
KRAB C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子.初步克隆了一个新的人类KRAB C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为ZNF382.此基因长2824bp,含5个外显子,4个内含子,在基因组DNA上长约23kb.它编码548个氨基酸,在氮... KRAB C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子.初步克隆了一个新的人类KRAB C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为ZNF382.此基因长2824bp,含5个外显子,4个内含子,在基因组DNA上长约23kb.它编码548个氨基酸,在氮末端含一个KRAB框,碳末端含一个未成形的锌指(VZF)和9个锌指(ZF).Northern杂交结果表明,ZNF382mRNA在早期胚胎时期(至少在妊娠34d之前)就开始表达,在不同时期人类胚胎组织中广泛表达,包括小脑、肾、大脑、肺、心脏、骨骼肌、舌和肾上腺.在成人组织其表达限制在心脏,其结构和表达特征预示着ZNF382在心脏发育和功能的发挥起着潜在的作用. 展开更多
关键词 人类基因组 krab/C2H2型锌指蛋白 人类胚胎组织 基因表达 基因克隆 心脏发育
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在心脏组织表达的一个人类新基因
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作者 黄欣琼 唐显庆 +3 位作者 张晓红 石金凤 李美香 吴秀山 《中国实用医药》 2009年第15期1-2,共2页
KRAB/C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子。初步克隆了一个新的人类KRAB/C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为ZNF569。此基因在基因组DNA上长约56.28 kb。定位于19q13.12.ORF全长2061个碱基,含6个外显子,5... KRAB/C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子。初步克隆了一个新的人类KRAB/C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为ZNF569。此基因在基因组DNA上长约56.28 kb。定位于19q13.12.ORF全长2061个碱基,含6个外显子,5个内含子,编码一个长686个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白包含一个KRAB结构域和18个锌指结构域。Northern杂交结果表明,ZNF382 mRNA在早期胚胎时期就开始表达,在不同时期人类胚胎组织中广泛表达,包括脑,心脏,肝和骨骼肌。在成人组织中重点表达在心脏,在肝,胰和骨骼肌中也有表达,其结构和表达特征预示着ZNF569在心脏发育和功能的发挥起着潜在的作用。 展开更多
关键词 ZNF569 心脏发育 krab/C2H2 克隆 表达
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人类锌指蛋白新基因ZNF641的克隆及表达
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作者 齐兴柱 朱伟 吴秀山 《海南大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第1期54-62,共9页
从人类心脏cDNA文库中分离并鉴定了一个新的人类锌指基因ZNF641,该基因的cDNA序列全长4.9 kb,编码一个含438个氨基酸的蛋白质,从进化上看,该蛋白质在从小鼠到人的脊椎动物中都高度保守.Northern Blot分析显示:ZNF641在人类的多数组织中... 从人类心脏cDNA文库中分离并鉴定了一个新的人类锌指基因ZNF641,该基因的cDNA序列全长4.9 kb,编码一个含438个氨基酸的蛋白质,从进化上看,该蛋白质在从小鼠到人的脊椎动物中都高度保守.Northern Blot分析显示:ZNF641在人类的多数组织中都有表达,尤其是在骨骼肌中有较高水平的表达.而亚细胞定位则显示ZNF641在细胞核及细胞质中均有定位. 展开更多
关键词 ZNF641 krab 亚细胞定位 表达
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锌指基因ZNF569的转录活性分析
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作者 唐显庆 黄欣琼 +1 位作者 吴秀山 龙治锋 《中国实用医药》 2009年第36期56-58,共3页
目的构建GAL4-ZNF569和pCMV-Tag2C-ZNF569重组质粒。通过它控制报告基因的表达情况来确定它的转录激活/抑制活性以及它是否参与了细胞信号途径调控。结果GAL4-ZNF569和pCMV-Tag2C-ZNF569重组质粒转染细胞后发现ZNF569具有转录抑制活性... 目的构建GAL4-ZNF569和pCMV-Tag2C-ZNF569重组质粒。通过它控制报告基因的表达情况来确定它的转录激活/抑制活性以及它是否参与了细胞信号途径调控。结果GAL4-ZNF569和pCMV-Tag2C-ZNF569重组质粒转染细胞后发现ZNF569具有转录抑制活性并能抑制SRE和AP-1的转录活性。对ZNF569的分段结构域的转录活性分析表明ZNF569的KRAB结构域和C2H2锌指结构域都具有抑制转录因子转录活性的作用。结论由此笔者得出结论认为ZNF569的KRAB框和C2H2锌指都具有抑制因子作用,为进一步研究ZNF569在真核细胞中的信号调控奠定了一定的实验基础。 展开更多
关键词 ZNF569 转录因子 krab结构域 C2H2锌指结构域
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小鼠胚胎脑特异表达的新基因bsg3的克隆及初步研究 被引量:1
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作者 姚艺桑 付佳琪 +4 位作者 陈微 杨玮 邹星 李宁 李亦平 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期397-403,共7页
通过消减差异筛选的方法克隆到一个在小鼠胚胎脑特异表达的基因bsg3(brainspecificgene 3) .它编码的蛋白与人的KIAA0 96 1具有 80 .3%的同源性 .bsg3基因包含一个 16 4 4bp的完整阅读框 ,编码一个含 5 4 8个氨基酸 ,具有 1个KRAB结构域... 通过消减差异筛选的方法克隆到一个在小鼠胚胎脑特异表达的基因bsg3(brainspecificgene 3) .它编码的蛋白与人的KIAA0 96 1具有 80 .3%的同源性 .bsg3基因包含一个 16 4 4bp的完整阅读框 ,编码一个含 5 4 8个氨基酸 ,具有 1个KRAB结构域 (kruppel associatedbox)和 13个C2H2型锌指结构域的蛋白 .该基因定位在小鼠第 7号染色体上 ,包含 5个外显子 ,4个内含子 .以bsg3基因全长编码区为探针的原位杂交结果显示 ,bsg3在小鼠胚胎脑及鸡胚脑特异表达 .半定量反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)的结果表明 ,在成体小鼠的组织中 ,bsg3基因脑中表达也较强 .这提示bsg3基因可能在小鼠脑发育中起着重要的作用 . 展开更多
关键词 bsg3基因 krab结构域 小鼠
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