利用MALDI-TOF MS鉴定芽苗菜中解鸟氨酸拉乌尔菌和肺炎克雷伯菌的研究

应用基质解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)方法对芽苗菜中检出率较高的2种微生物进行鉴定,结果为解鸟氨酸拉乌尔菌(33.3%)和肺炎克雷伯菌(43.5%)。应用SARAMIS Premium软件对这2种微生物的蛋白质图谱进行分析,获得解鸟氨酸拉乌尔菌特征标识峰16组,肺炎克雷伯菌特征标识峰10组;对分离微生物进行全标识峰和加权特征峰相关性分析,结果表明特征峰的加权会影响微生物鉴定结果间的相关关系,增强微生物的辨识度;对两种微生物进行多方面比较,发现两种微生物生化特性比较接近,但16Sr DNA分辨率较高,质谱相关分析虽有相交但可辨识。实验结果表明MALDI-TOF MS具有检测芽苗菜中微生物的能力并在其特征分析及溯源研究上具有一定的优势,MALDI-TOF MS为开放平台,对农产品微生物蛋白质特征图谱的收集与优化可提高其鉴定准确性。

一株解鸟氨酸克雷伯菌的鉴定和碳青霉烯类耐药基因的检测

目的对来自住院患者血液标本分离出的1株菌株进行鉴定及碳青霉烯类抗生素耐药的基因型分析。方法利用DL-96II细菌测定系统进行菌株B1635-1的初步鉴定及药敏试验;采用PCR法扩增菌株B1635-1的16SrDNA基因序列;应用MEGA 5.0软件构建菌株B1635-1的系统发育树,确定其种属地位;采用PCR法克隆菌株B1635-1的碳青霉烯类耐药基因。结果 DL-96II细菌测定系统初步鉴定菌株B1645-1为解鸟氨酸克雷伯菌,并显示该菌株对除氨曲南以外的几乎所有β-内酰胺类抗生素耐药,对磺胺类、喹诺酮类和氨基糖苷类抗生素也耐药,但对四环素类抗生素敏感。对菌株B1645-1的16SrDNA基因序列的系统发育树分析,最终鉴定该菌为解鸟氨酸克雷伯菌(Klebsiella ornithinolytica)。菌株B1645-1扩增出编码碳青霉烯酶blaNDM-1基因,未扩增出编码碳青霉烯酶blaKPC、blaVIM、blaTME和blaSHV基因。结论首次从湖北医药学院附属东风医院住院患者的血液标本中成功分离获得一株携带blaNDM-1基因解鸟氨酸克雷伯菌株,产NDM-1型碳青霉烯酶是该株解鸟氨酸克雷伯菌耐碳青霉烯类药物的主要原因,为临床鸟氨酸克雷伯菌的感染治疗提供参考依据。鉴于肠杆菌科细菌耐药速率传播更快,警示相关部门应重视并加强对blaNDM-1基因携带菌的监测与筛查。