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Identification and molecular characterization of Cathepsin L gene and its expression analysis during early ontogenetic development of kuruma shrimp Marsupenaeusjaponicus 被引量:1
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作者 QIAO Ying WANG Jun +5 位作者 MAO Yong LIU Min SONG Xiaohong SU Yongquan WANG Chunzhong ZHENG Zhipeng 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期52-60,共9页
Cathepsin L gene is a member of the cysteine proteinase gene group. In this study Cathepsin L gene was isolated from Kuruma shrimp Marsupenaeusjaponicus (Mj-Cathepsin L) and the full-length DNA sequence was 1 963 bp... Cathepsin L gene is a member of the cysteine proteinase gene group. In this study Cathepsin L gene was isolated from Kuruma shrimp Marsupenaeusjaponicus (Mj-Cathepsin L) and the full-length DNA sequence was 1 963 bp. Mj-Cathepsin L protein showed high homologies with other Cathepsin L proteins documented in vertebrates, mollusks and other crustaceans. Expression analysis of Mj-Cathepsin L gene in different tissues revealed that it was predominant in hepatopancreas. During early ontogenetic development stages Mj-Cathepsin L showed a development-regulated expression, and the Mj-Cathepsin L showed a molting stage-regulated expression during the five molting stages, inferring its role in the ontogenic development of M.japonicus. Two kinds of forms of Mj- Cathepsin L protein: pro-Cathepsin L and Cathepsin L were measured in hepatopancreas, stomach and intestine by Western Blotting. 展开更多
关键词 Cathepsin l gene larval development molting cycle tissue distribution Marsupenaeusjaponicus
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Effects of Lipoxygenase Null Genes of Soybean in Controlling Beany-flavor of Soymilk and Soyflour 被引量:5
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作者 MA Hao, GUAN Chun-yun,HE Xiao-ling, ZHANG Guo-zheng and DIN An-lin(College of Plant Sciences and Technology , Hunan Agricultural University, Changsha 410128 ,P. R. China Soybean ResearchInstitute , Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095 ,P.R. China Institute of Crop Breeding and Cultivation ,Chinese Academy of Agricultural Sciences , Beijing 100081 ,P.R. China ) 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2002年第9期965-971,共7页
The flavor of the soymilk and soyflour obtained from the lipoxygenase mutant isolines was concentrated by simultaneous distillation and extraction (SDE), and its constituents were identified by gas chro-matography (GC... The flavor of the soymilk and soyflour obtained from the lipoxygenase mutant isolines was concentrated by simultaneous distillation and extraction (SDE), and its constituents were identified by gas chro-matography (GC) and gas chromatography-mass spectrometry. Results showed that the same 24 flavor constituents were isolated in both soymilk and soyflour, and most of them were aldehydes and alcohols. Lox2 was most responsible for the production of the volatile and beany-flavor components, and Lox1 less responsible. Lox3 was least responsible and can reduce the yield of hexanal. Either Lx1 or Lx2 could significantly reduce the volatile and beany-flavor, and Lx3 could significantly increase the yield of hexanal. Primary and secondary interactions existed among the null mutant genes, and the major effects and interactions could be affected by processing conditions. The isoline with triple lipoxygenase null genes yielded the least volatile and beany-flavor components, and the isoline without the lipoxygenase gene Lx3 produced the greatest amount of the volatile and beany-flavor components. The amounts of volatile and beany-flavor components produced by the other isolines were between that of the isoline with triple lipoxygenase null genes and the isoline without lipoxygenase gene Lx3. According to the correlation analysis, the hexanal amount could be used as an index in evaluating the importance of lipoxygenase isozymes in the yield of beany-flavor compounds, and the effects of the different types of lipoxygenase null mutants in controlling beany-flavor compounds. The cultivars with triple lipoxygenase null genes will be a quality raw material for soy food processing. 展开更多
关键词 Glycine max (l.) Merrill lipoxygenase null gene Gas chromatography and gas chromato-graphy-mass chromatography Beany-flavor
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辣椒EIL基因家族的鉴定及其在盐碱胁迫下的表达分析
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作者 吴鹏 李冬雪 郭茜茜 《河南农业科学》 北大核心 2024年第5期123-132,共10页
EIL(Ethylene-insensitive 3-like)基因在参与植物乙烯信号通路的转导和生长发育过程中发挥着重要作用。为了解辣椒EIL基因家族成员信息,利用生物信息学手段对辣椒EIL基因家族成员的理化性质、蛋白质结构、系统进化、基因结构、保守域... EIL(Ethylene-insensitive 3-like)基因在参与植物乙烯信号通路的转导和生长发育过程中发挥着重要作用。为了解辣椒EIL基因家族成员信息,利用生物信息学手段对辣椒EIL基因家族成员的理化性质、蛋白质结构、系统进化、基因结构、保守域、启动子顺式作用元件及CaEILs基因在不同组织部位和不同非生物胁迫条件下的表达模式进行分析。同时使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对辣椒叶片中CaEILs在盐碱胁迫下的表达模式进行研究。结果表明,辣椒9个CaEILs分布在6条染色体上,氨基酸数目、蛋白质理论分子质量和脂肪系数分别介于209~677、23.77~76.07 ku和63.10~87.75,且主要为酸性、亲水的不稳定性核蛋白。系统进化分析显示,CaEILs被分成了4个亚家组,9个CaEILs在根、茎、叶、花蕾、花中具有不同程度的表达,而低温、高温、高盐、干旱胁迫下均能诱导CaEILs的表达,其对以上非生物胁迫均具有不同程度的响应。此外,利用qRT-PCR对盐碱胁迫下辣椒叶片中CaEILs进行了检测,结果发现,随着处理时间的延长,CaEIL1、CaEIL2、CaEIL4、CaEIL5、CaEIL8的表达量整体呈上升趋势,而CaEIL3、CaEIL6、CaEIL7、CaEIL9的表达量整体呈下降趋势。 展开更多
关键词 辣椒 EIl基因家族 基因结构 盐碱胁迫 表达
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甘蓝型油菜REVEILLE家族鉴定及诱导表达分析
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作者 刘蓉 田闵玉 +3 位作者 李光泽 谭成方 阮颖 刘春林 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期161-171,共11页
【目的】REVEILLE家族基因具有重要生物学功能,而在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中该家族基因研究较少,深入认识甘蓝型油菜中RVE家族基因功能及其与非生物胁迫的关系。【方法】利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜、白菜(Brassica rapa)... 【目的】REVEILLE家族基因具有重要生物学功能,而在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中该家族基因研究较少,深入认识甘蓝型油菜中RVE家族基因功能及其与非生物胁迫的关系。【方法】利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜、白菜(Brassica rapa)和甘蓝(B.oleracea)中分别鉴定到33、16和16个RVE基因,并对其系统进化、染色体定位、基因结构和理化性质以及启动子顺式元件进行分析。【结果】所有的RVE蛋白被分为两个亚家族。33个BnaRVE分别定位在18条A亚基因组的染色体和15条C亚基因组的染色体上。大部分成员属于较稳定的疏水蛋白;多数Ka/Ks值小于1,说明该家族受到强烈的纯化选择作用。基因结构变异较大,内含子数目在4-11之间。共线性分析结果表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝存在大量的同源基因。大部分甘蓝型油菜RVE家族成员在子叶和叶都有表达且表达量最多。BnaRVE启动子上含有大量与激素和生物逆境相关的元件,通过定量PCR分析,4个BnaRVE在ABA与MeJA诱导和低温胁迫下的表达量显著上调。【结论】在甘蓝型油菜基因组中鉴定出33个BnaRVE家族成员。不同基因在不同发育时期和不同组织中表现出不同的表达模式。不同基因对各种胁迫存在响应,且表达模式不一。RVE家族成员对ABA、MeJA和冷胁迫具有正向响应功能。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 RVE基因家族 生物信息学分析 逆境 植物激素 表达分析 表达谱
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掌叶大黄(RheumpalmatumL.)WRKY基因家族鉴定与分析
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作者 吴圳 张明英 +4 位作者 闫锋 李依民 高静 颜永刚 张岗 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期250-261,共12页
【目的】本研究为开展WRKY基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据。【方法】基于掌叶大黄(R.palmatum L.)的全长转录组数据,通过生物信息学方法鉴定掌叶大黄WRKY基因家族成员,分析其蛋白理化性质... 【目的】本研究为开展WRKY基因功能验证提供基础,进而为大黄药材品质形成的转录调控机制研究提供科学依据。【方法】基于掌叶大黄(R.palmatum L.)的全长转录组数据,通过生物信息学方法鉴定掌叶大黄WRKY基因家族成员,分析其蛋白理化性质、结构域、系统发育关系、蛋白互作,结合转录组数据进行不同组织和茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)处理的表达谱分析。【结果】掌叶大黄WRKY基因家族包含53个成员,编码蛋白氨基酸数量为192-748,均为亲水性蛋白,预测定位均在细胞核。掌叶大黄WRKY基因家族与拟南芥WRKY基因家族成员进化树可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个亚族,其中Ⅱ亚族WRKY占比最高(58.49%)。转录组数据分析显示掌叶大黄WRKY基因家族成员在掌叶大黄根、根茎和叶中差异表达,其中7个基因在根和根茎中表达量较高,12个基因响应MeJA处理呈差异表达,其中10个被MeJA显著诱导,4个候选基因RpWRKY5/6/9/33的qPCR分析与其转录组结果基本一致。蛋白互作网络显示RpWRKY2/16/20/22/23与查尔酮合酶(chalconesynthase,CHS)发生相互作用。【结论】获得53个掌叶大黄WRKY基因、生物信息、组织及响应MeJA的表达特征,其中5个可能与大黄蒽醌类物质的合成有关。 展开更多
关键词 掌叶大黄 WRKY 转录因子 基因表达 茉莉酸甲酯
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基于QTL和转录组测序鉴定甘蓝型油菜耐旱候选基因
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作者 李阳阳 吴丹 +11 位作者 许军红 陈倬永 徐昕媛 徐金盼 唐钟林 张娅茹 朱丽 严卓立 周清元 李加纳 刘列钊 唐章林 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期820-835,共16页
干旱胁迫严重限制了甘蓝型油菜种植面积的扩大和产量的提升。耐旱性是由多基因控制的复杂数量性状,将QTL定位与转录组测序相结合,是鉴定甘蓝型油菜耐旱候选基因的有效手段。本研究对甘蓝型油菜干旱敏感品系三六矮和耐旱品系科里纳-2构建... 干旱胁迫严重限制了甘蓝型油菜种植面积的扩大和产量的提升。耐旱性是由多基因控制的复杂数量性状,将QTL定位与转录组测序相结合,是鉴定甘蓝型油菜耐旱候选基因的有效手段。本研究对甘蓝型油菜干旱敏感品系三六矮和耐旱品系科里纳-2构建的F2:6和F2:8重组自交系群体幼苗进行正常灌溉和干旱胁迫处理,测定地上部鲜重、地上部干重、叶片相对含水量、丙二醛和可溶性糖含量,利用SSR和SNP多态性分子标记构建遗传连锁图谱,鉴定耐旱相关QTL和候选区间,结合耐旱材料No11和干旱敏感材料No28的转录组测序,筛选耐旱相关候选基因。研究结果表明:干旱胁迫使甘蓝型油菜幼苗地上部鲜重、地上部干重和叶片相对含水量下降,使叶片丙二醛和可溶性糖含量上升;耐旱相关QTL和候选区间分布于A01、A02、A06、A08、A09、A10、C02、C03、C04、C06和C09染色体;对耐旱材料和干旱敏感材料正常灌溉、干旱24 h、36 h和48 h进行转录组分析,主要差异表达基因显著富集到光合作用、脂肪酸代谢、氨基酸代谢、植物激素信号转导、核糖体、昼夜节律及角质、木栓素和蜡质的生物合成等相关途径;将QTL与转录组测序相结合,鉴定到28个耐旱相关候选基因,主要编码FLC、bHLH105、TGA4、TEM1、ERF003、ACO3、CHLI1、LHCB6和PORC等,具有转录因子活性、乙烯产生和信号传导、叶绿素生物合成与结合、叶绿素氧化还原酶以及编码核糖体相关蛋白等功能。这些结果可为揭示甘蓝型油菜耐旱机理及分子标记辅助选育耐旱新品种奠定基础。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 耐旱 QTl 转录组 候选基因
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黄瓜和南瓜Bcl-2相关抗凋亡家族全基因组鉴定与表达模式分析
7
作者 胡永波 雷雨田 +6 位作者 杨永森 陈馨 林黄昉 林碧英 刘爽 毕格 申宝营 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期219-237,共19页
【目的】分析Bcl-2相关抗凋亡(Bcl-2 associated athanogene,BAG)家族蛋白成员在黄瓜和南瓜中响应非生物胁迫以及在黄瓜/南瓜嫁接愈合过程中响应光照的表达模式,为解析黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合机理及黄瓜和南瓜等蔬菜的抗性分子育种提... 【目的】分析Bcl-2相关抗凋亡(Bcl-2 associated athanogene,BAG)家族蛋白成员在黄瓜和南瓜中响应非生物胁迫以及在黄瓜/南瓜嫁接愈合过程中响应光照的表达模式,为解析黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合机理及黄瓜和南瓜等蔬菜的抗性分子育种提供有利基因。【方法】基于黄瓜和南瓜基因组信息,利用生物信息学手段,对黄瓜和南瓜中BAG基因家族进行鉴定,并对其理化特性、染色体定位、基因结构、系统发育和共线性进行了分析。基于公共数据库及黄瓜/南瓜嫁接苗在嫁接愈合过程中转录组测序数据,分析BAG基因在黄瓜和南瓜中响应非生物胁迫以及在嫁接愈合过程中响应光照的表达模式。【结果】在黄瓜和南瓜中分别鉴定到12和18个BAG家族基因,均分为2个亚族,基因成员保守性高,I亚家族的BAG主要参与基因调控和逆境响应,而II亚家族的BAG主要参与植物的发育过程。黄瓜和南瓜BAG基因分别与拟南芥、水稻、番茄存在多种线性关系,但CsaV3_1G017210与拟南芥、水稻、番茄和南瓜中的BAG基因均不存在线性关系。不同BAG基因具有组织特异性表达模式。CsaV3_6G000970和CmoCh08G008520(BAG family molecular chaperone regulator 6)在黄瓜和南瓜响应非生物胁迫以及黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合过程中均发生上调表达。【结论】BAG家族基因在黄瓜和南瓜对非生物胁迫的响应以及黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合过程中对光的响应中具有差异性,协同调控了黄瓜和南瓜的生长发育及嫁接愈合,在黄瓜和南瓜非生物胁迫以及黄瓜/南瓜嫁接苗嫁接愈合过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 黄瓜 南瓜 BAG基因家族 生物信息学 嫁接愈合
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马铃薯PYL5基因对非生物胁迫的响应分析及其启动子的活性鉴定
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作者 张春利 解潇飞 +7 位作者 张莹 张锋 孙超 毕真真 刘玉汇 刘震 姚攀锋 白江平 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期302-313,共12页
【目的】脱落酸(ABA)作为一种“应激激素”在植物生长发育和响应干旱、盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,PYR/PYL/RCARs(以下简称“PYL”)作为ABA受体在多种植物中也被广泛研究。基于对马铃薯StPYL5基因生物信息学及表达模式分析,并通... 【目的】脱落酸(ABA)作为一种“应激激素”在植物生长发育和响应干旱、盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,PYR/PYL/RCARs(以下简称“PYL”)作为ABA受体在多种植物中也被广泛研究。基于对马铃薯StPYL5基因生物信息学及表达模式分析,并通过对其启动子活性鉴定,为进一步揭示马铃薯StPYL5功能及抗逆育种提供依据。【方法】根据转录组数据克隆得到StPYL5基因,通过DNAMAN、MEGA等软件分析了StPYL5的分子特征;通过qPCR检测了StPYL5基因的组织特异性及其对非生物胁迫的响应;利用PlantCARE网站对StPYL5基因启动子进行了分析,并通过瞬时转化烟草对其活性进行了鉴定。【结果】StPYL5基因全长534 bp,共编码177个氨基酸,蛋白质分子量20.19 ku,理论等电点(pI)为5.97。系统进化分析显示,StPYL5与SpPYL9-like亲缘关系较近。组织特异性分析结果显示,青薯9号(QS9)中StPYL5在根和叶中表达量较高,其次分别是茎和花,在块茎中表达量较低。不同胁迫下StPYL5表达量分析表明,青薯9号(QS9)中StPYL5在干旱、低温、盐和ABA胁迫下的表达量先升高后降低,且StPYL5的表达受Me JA和SA的诱导。此外,笔者成功克隆得到2 000 bp的StPYL5基因启动子。在烟草中的瞬时转化后的组织化学染色结果表明,StPYL5基因启动子具有成功启动下游GUS报告基因表达的启动子活性。【结论】全面分析了StPYL5基因的分子特征及其在多种非生物胁迫下的表达谱,并成功克隆到具有活性的pStPYL5启动子,该结果为深入研究StPYL5基因的功能以及马铃薯抗逆育种提供依据。 展开更多
关键词 马铃薯 ABA信号通路 StPYl5 基因克隆 非生物胁迫 表达分析
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金鱼草WAK/WAKL基因家族鉴定及抗核盘菌候选基因挖掘
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作者 杨冬梅 夏文念 +5 位作者 宋佳怡 杨洁 严苍海 苏芸丽 汪仲毅 胡慧贞 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期24-36,共13页
【目的】鉴定金鱼草细胞壁相关受体激酶(Wall-associated kinase,WAK)及类WAK蛋白(WAK-like kinases,WAKL)基因家族成员,并挖掘抗核盘菌的候选基因,为深入解析金鱼草抗核盘菌的WAK/WAKL分子调控机制提供理论参考。【方法】以拟南芥WAK/W... 【目的】鉴定金鱼草细胞壁相关受体激酶(Wall-associated kinase,WAK)及类WAK蛋白(WAK-like kinases,WAKL)基因家族成员,并挖掘抗核盘菌的候选基因,为深入解析金鱼草抗核盘菌的WAK/WAKL分子调控机制提供理论参考。【方法】以拟南芥WAK/WAKL家族蛋白为参考序列,利用生物信息学方法从金鱼草基因组数据库中鉴定出WAK/WAKL基因家族成员,并对其理化性质、系统发育、基因结构、保守基序、顺式作用元件及共线性关系等进行预测分析,并通过转录组测序和实时荧光定量PCR对该家族基因在金鱼草抗感核盘菌材料中的表达模式进行分析。【结果】从金鱼草基因组中共鉴定出27个WAK/WAKL基因家族成员,其中WAK家族基因16个(AmWAK1~AmWAK16),WAKL家族基因11个(AmWAKL1~AmWAKL11),编码的氨基酸数量为615~1085个;理论等电点(pI)为4.94~8.69,绝大多数蛋白呈酸性;所有蛋白的总平均亲水性指数(GRAVY)值小于0,均为亲水性蛋白;大多数蛋白亚细胞定位于细胞质膜区域,少部分定位于细胞外、液泡、高尔基体和细胞核。27个WAK/WAKL基因家族成员不均匀地分布在金鱼草的8条染色体上,且与拟南芥WAK/WAKL家族基因存在7对共线性同源基因;基因启动子区域含有与防御和胁迫响应、茉莉酸甲酯响应及水杨酸响应等顺式作用元件。通过叶片离体接种核盘菌试验,筛选出抗性差异明显的易感病品种Am1和抗病品种Am6。有12个WAK/WAKL家族基因在金鱼草抗感材料中显著差异表达(P<0.05),有9个基因表达模式与转录组测序结果基本一致。这9个基因中,有5个基因(AmWAK7、AmWAKL2、AmWAKL8、AmWAK6和AmWAK13)在金鱼草的根、茎和叶组织中高表达,而剩余4个基因(AmWAK2、AmWAK8、AmWAK9和AmWAK12)在根、茎和叶中基本不表达。【结论】筛选出的27个金鱼草WAK/WAKL基因家族成员,具有相似的基因结构和蛋白功能结构域,其中AmWAK6、AmWAK7、AmWAK13、AmWAKL2和AmWAKL8为金鱼草抗核盘菌的关键候选基因,具有介导抗病的潜在功能。 展开更多
关键词 金鱼草 WAK/WAKl基因家族 鉴定 核盘菌抗性 转录组测序 候选基因挖掘
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全基因组关联分析定位水稻分蘖角度QTL
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作者 朱裕敬 桂金鑫 +4 位作者 龚成云 罗新阳 石居斌 张海清 贺记外 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期266-276,共11页
【目的】水稻分蘖角度是影响水稻产量的关键农艺性状,挖掘水稻分蘖角度QTL(基因)及其优势单倍型,有助于构建水稻理想株型。【方法】以333份来自水稻3K资源的核心种质为研究材料,于2020年和2022年分别在湖南农业大学耘园基地和春华基地种... 【目的】水稻分蘖角度是影响水稻产量的关键农艺性状,挖掘水稻分蘖角度QTL(基因)及其优势单倍型,有助于构建水稻理想株型。【方法】以333份来自水稻3K资源的核心种质为研究材料,于2020年和2022年分别在湖南农业大学耘园基地和春华基地种植,在抽穗期测量分蘖角度,结合基因型,利用TASSEL 5.2的MLM模型进行全基因组关联分析。【结果】共检测到6个分蘖角度QTL位点,分布在水稻2、5、6、9和12号染色体上,分别命名为qTA2、qTA5、qTA6.1、qTA6.2、qTA9和qTA12,这些QTL的表型贡献率为6.23%~16.22%。除了qTA9与分蘖角度主效QTL TAC1共定位外,其余5个QTL均为新的位点。进一步对5个QTL位点进行候选基因分析,初步筛选到qTA2和qTA6.1的候选基因别为Os02g0817900和Os06g0682800,候选基因Os02g0817900编码水稻细胞色素P450家族蛋白,候选基因Os06g0682800编码锌指结构域蛋白。【结论】本研究挖掘到新的水稻分蘖角度相关位点并对候选基因进行了分析,为分蘖角度新QTL(基因)的克隆以及分蘖角度的遗传改良提供参考。 展开更多
关键词 水稻 分蘖角度 QTl 候选基因 单倍型
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大蒜MtN3/saliva/SWEET基因家族的全基因组鉴定及表达分析
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作者 许凯 路海玲 +4 位作者 杨雪莲 王帅 封烁 梁健 王乐 《青海大学学报》 2024年第3期47-55,共9页
探究大蒜AsSWEETs基因家族特征和生物学功能,可为大蒜鳞茎发育调控的分子机制提供参考。本研究基于大蒜“二水早”全基因组数据,通过HMM搜索对AsSWEETs成员进行筛选和鉴定,并利用实时荧光定量PCR分析其在不同激素处理下的表达模式。结... 探究大蒜AsSWEETs基因家族特征和生物学功能,可为大蒜鳞茎发育调控的分子机制提供参考。本研究基于大蒜“二水早”全基因组数据,通过HMM搜索对AsSWEETs成员进行筛选和鉴定,并利用实时荧光定量PCR分析其在不同激素处理下的表达模式。结果表明:在大蒜基因组中共鉴定到35个AsSWEETs基因,均为疏水蛋白,含2~7个不等的跨膜螺旋,除AsSWEET 1、AsSWEET 2位于scaffold外,其余均分布于染色体上,成员间差异显著。综合系统进化和表达模式发现,AsSWEET5、14、21、23、26、28(第III支系,转运蔗糖)可能是参与鳞茎膨大的主要调控基因;AsSWEET 2、30、33(IV分支)的表达量在鳞茎发育不同阶段变化较大,可能参与鳞茎发育过程中的果糖代谢调节。qRT-PCR定量表明,在不同激素处理下,AsSWEET5、11、16呈现出不同的表达模式,预示AsSWEETs家族成员功能存在分化和差异。综上,大蒜AsSWEET s基因的糖转运活性参与了鳞茎的生长发育,有助于解释鳞茎膨大发育过程。 展开更多
关键词 大蒜(Allium sativum l.) AsSWEETs基因家族 生物信息学分析 表达分析
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水稻早衰突变体psl4(t)的表型鉴定及基因定位
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作者 龚晓平 何焕然 +6 位作者 莫春红 李加胜 陈锐 张致力 孙小红 勾治琴 罗挺 《西南大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第2期44-51,共8页
水稻叶片早衰严重影响水稻的产量与品质,挖掘水稻叶片早衰相关基因并解析其分子机制,对提高水稻产量具有重要意义.从涪恢9802和LR杂交后代中筛选到叶早衰突变体psl4(t),该突变体6叶期前叶片呈正常绿色,从7叶期至剑叶(倒1叶)期每张叶片... 水稻叶片早衰严重影响水稻的产量与品质,挖掘水稻叶片早衰相关基因并解析其分子机制,对提高水稻产量具有重要意义.从涪恢9802和LR杂交后代中筛选到叶早衰突变体psl4(t),该突变体6叶期前叶片呈正常绿色,从7叶期至剑叶(倒1叶)期每张叶片均是从叶尖至叶中部逐渐衰老,叶片的叶绿体发育受阻其体积变小、光合色素质量分数减少,叶片提前衰老.农艺性状分析结果表明:与野生型相比,突变体psl4(t)的穗长、有效分蘖数和籽粒宽变化无统计学意义,而株高、每穗粒数、结实率及千粒质量显著降低.遗传分析结果发现:突变体psl4(t)的早衰性状受单隐性核基因控制,利用分子标记将目标基因定位于第4染色体长臂端两个SSR标记(RM17004和RM17006)之间38.5 kb的范围内.研究为psl4(t)基因的克隆及功能解析、早衰分子机制研究奠定基础. 展开更多
关键词 水稻 早衰突变体psl4(t) 遗传分析 基因定位
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与辣椒抗TMV L^(3)基因连锁的分子标记的筛选及种质资源抗TMV鉴定 被引量:1
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作者 陈灵芝 张茹 +1 位作者 王兰兰 高彦萍 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期585-592,共8页
以含抗辣椒TMV的L^(3)基因的材料L15为基础,利用与L^(3)基因连锁的3个分子标记189D23MF、PMFR11和PMFR21对种质资源进行鉴定.对L15、3份感病材料H8/H9/H11×L15 F_(1)、46份辣椒种质资源进行室内人工TMV接种并对其进行表型抗性鉴定... 以含抗辣椒TMV的L^(3)基因的材料L15为基础,利用与L^(3)基因连锁的3个分子标记189D23MF、PMFR11和PMFR21对种质资源进行鉴定.对L15、3份感病材料H8/H9/H11×L15 F_(1)、46份辣椒种质资源进行室内人工TMV接种并对其进行表型抗性鉴定和RT-PCR检测.对筛选出的标记在F_(1)及BC_(1)P_(1)群体中进行验证.结果表明:分子标记189D23MF在L15和12份辣椒种质上均未扩增出条带;SCAR标记PMFR11在L15和46份辣椒种质上呈现共显性分离,SCAR标记PMFR21为显性标记.通过室内人工接种鉴定方式,2份材料L15、H11×L15表现为高抗.H9×L15表现为抗,H8×L15及5份材料A1、A35、A39、A55、L16表现为中抗,11份材料表现为感病,30份材料表现为高感.在F1及BC1P1群体中PCR扩增结果表明SCAR标记PMFR21可用于辣椒抗TMV分子标记辅助选择. 展开更多
关键词 辣椒 l^(3)基因 分子标记 种质资源 TMV
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蜀葵ArbHLH148基因克隆与表达分析
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作者 高文 闫庚洋 +4 位作者 左俊凯 许乐 侯蕊利 景其昌 任昊 《河南农业科学》 北大核心 2023年第9期133-140,共8页
为解析蜀葵ArbHLH148基因在雄蕊瓣化中的功能,以红色重瓣蜀葵花朵为试材,结合转录组数据,采用逆转录PCR方法克隆了ArbHLH148基因,并对其序列特征和表达特性进行了分析。结果表明,ArbHLH148基因cDNA序列全长为672 bp,该基因与树棉bHLH14... 为解析蜀葵ArbHLH148基因在雄蕊瓣化中的功能,以红色重瓣蜀葵花朵为试材,结合转录组数据,采用逆转录PCR方法克隆了ArbHLH148基因,并对其序列特征和表达特性进行了分析。结果表明,ArbHLH148基因cDNA序列全长为672 bp,该基因与树棉bHLH148转录因子基因具有80%的一致性(E值为1e-119)。在系统进化上,ArbHLH148与拟南芥AtbHLH147、AtbHLH148、AtbHLH149、AtbHLH150关系很近,而且其具有典型的碱性螺旋-环-螺旋保守结构域(Basic helix‑loop‑helix,bHLH)。氨基酸序列预测显示,该蛋白质是位于细胞核内的亲水性蛋白,也是没有跨膜区的非分泌蛋白。组织特异性表达分析显示,ArbHLH148及其功能相关基因ArIAA1、ArARF8、ArTIR1在萼片、花瓣、雄蕊和瓣化雄蕊中均有表达,但其在雄蕊中的表达量相对较多,在花瓣、瓣化雄蕊中的表达量依次减少,这与生长素信号相关基因ArIAA1、ArARF8、ArTIR1在雄蕊、花瓣、瓣化雄蕊中的表达模式及生长素含量变化相似。表明ArbHLH148基因和生长素信号相关基因的表达差异可能是产生雄蕊瓣化的原因。 展开更多
关键词 蜀葵 ArbHlH148 基因克隆 序列分析 表达分析 雄蕊瓣化
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Expression of ACC Oxidase Gene from Sugarcane Induced by Hormones and Environmental Force 被引量:6
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作者 WANGAi-qin YANG Li-tao +3 位作者 WANG Zi-zhang WEI Yu-tuo HE Long-fei LI Yang-rui 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2005年第8期609-613,共5页
In the present study, a full-length cDNA encoding 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase gene has been cloned from sugarcane (named GZ-ACO). Two primers were designed for coding the ORF in the full-length cDN... In the present study, a full-length cDNA encoding 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid oxidase gene has been cloned from sugarcane (named GZ-ACO). Two primers were designed for coding the ORF in the full-length cDNA of GZ-ACO gene from sugarcane. PCR amplification was performed with sugarcane DNA template, and a fragment of 1 104 bp (GZ34) was obtained. GZ34 was labeled with [α-32P] dCTP as the probe and used for hybridization after cloning and sequencing. Southern blotting analysis indicated that there were at least three other sequences, which weakly hybridized with the GZ34. Northern analysis showed that GZ34 was strongly induced by treatment with IAA, BA, ethephon, LiC1 and cold stress, respectively. As a contrast, the mRNA for ACO gene was at lower levels for both the light-grown and dark-grown plants without additional treatment. There were two transcripts in the dark-grown plants and three transcripts in the treatments with IAA, BA and cold stress, but there was only one transcript in ethephon treatment. It showed that GZ-ACO might be a gene connected with ethylene formation and take part in response to the induction of plant hormone and environmental stress. 展开更多
关键词 ACC oxidase Saccharum l. Hybrid gene expression
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Effects of the Fhb1 gene on Fusarium head blight resistance and agronomic traits of winter wheat 被引量:6
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作者 Teng Li Hongjun Zhang +11 位作者 Yiwen Huang Zhenqi Su Yun Deng Hongwei Liu Chunyan Mai Guangjun Yu Huili Li Liqiang Yu Tongquan Zhu Li Yang Hongjie Li Yang Zhou 《The Crop Journal》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期799-808,共10页
The gene Fhb1 has been used in many countries to improve wheat Fusarium head blight(FHB) resistance. To make better use of this gene in the Yellow-Huai River Valleys Winter Wheat Zone(YHWZ), the most important wheat-p... The gene Fhb1 has been used in many countries to improve wheat Fusarium head blight(FHB) resistance. To make better use of this gene in the Yellow-Huai River Valleys Winter Wheat Zone(YHWZ), the most important wheat-producing region of China, it is desirable to elucidate its effects on FHB resistance and agronomic traits in different genetic backgrounds. Based on a diagnostic marker for Fhb1, six BC2 populations were developed by crossing dwarf-male-sterile(DMS)-Zhoumai 16 to three Fhb1 donors(Ningmai 9, Ningmai 13, and Jianyang 84) and backcrossing to Zhoumai 16 and Zhoumai16’s derivative cultivars(Lunxuan 136 and Lunxuan 13) using marker-assisted backcross breeding. The progenies were assessed for FHB resistance and major agronomic traits.The Fhb1 alleles were identified using the gene-specific molecular marker. The plants with the Fhb1-resistant genotype(Fhb1-R) in these populations showed significantly fewer infected spikelets than those with the Fhb1-susceptible genotype(Fhb1-S). When Lunxuan 136 was used as the recurrent parent, Fhb1-R plants showed significantly fewer infected spikelets per spike than Fhb1-R plants produced using Lunxuan 13 as the recurrent parent, indicating that the genetic backgrounds of Fhb1 influence the expression of FHB resistance. Fhb1-R plants from the DMS-Zhoumai 16/Ningmai 9//Zhoumai 16/3/Lunxuan 136 population showed the highest FHB resistance among the six populations and a significantly higher level of FHB resistance than the moderately susceptible control Huaimai 20. No significant phenotypic differences between Fhb1-R and Fhb1-S plants were observed for the eight agronomic traits investigated. These results suggest that it is feasible to improve FHB resistance of winter wheat withoutreducing yield potential by introgressing Fhb1 resistance allele into FHB-susceptible cultivars in the YHWZ. 展开更多
关键词 TRITICUM AESTIVUM l. Fhb1 gene Marker-assisted selection FUSARIUM head blight RESISTANCE AGRONOMIC traits
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Cloning and Characterization of a Salt Tolerance-Associated Gene Encoding Trehalose-6-Phosphate Synthase in Sweetpotato 被引量:8
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作者 JIANG Tao ZHAI Hong +4 位作者 WANG Fei-bing ZHOU Hua-nan SI Zeng-zhi HE Shao-zhen LIU Qing-chang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第8期1651-1661,共11页
Trehalose plays an important role in metabolic regulation and abiotic stress tolerance in a variety of organisms. In plants, its biosynthesis is catalyzed by two key enzymes: trehalose-6-phosphate synthase(TPS) and... Trehalose plays an important role in metabolic regulation and abiotic stress tolerance in a variety of organisms. In plants, its biosynthesis is catalyzed by two key enzymes: trehalose-6-phosphate synthase(TPS) and trehalose-6-phosphate phosphatase(TPP). In the present study, a TPS gene, named IbTPS, was first isolated from sweetpotato(Ipomoea batatas(L.) Lam.) cv. Lushu 3 by rapid amplification of cDNA ends(RACE). The open reading frame(ORF) contained 2 580 nucleotides encoding 859 amino acids with a molecular weight of 97.433 kDa and an isoelectric point(pI) of 5.7. The deduced amino acid sequence showed high identities with TPS of other plants. Real-time quantitative PCR analysis revealed that the expression level of IbTPS gene was significantly higher in stems of Lushu 3 than in its leaves and roots. Subcellular localization analysis in onion epidermal cells indicated that IbTPS gene was located in the nucleus. Transgenic tobacco(cv. Wisconsin 38) plants over-expressing IbTPS gene exhibited significantly higher salt tolerance compared with the control plant. Trehalose and proline content was found to be significantly more accumulated in transgenic tobacco plants than in the wild-type and several stress tolerance related genes were up-regulated. These results suggest that IbTPS gene may enhance salt tolerance of plants by increasing the amount of treahalose and proline and regulating the expression of stress tolerance related genes. 展开更多
关键词 cloning IbTPS gene Ipomoea batatas(l.) lam. salt tolerance
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辣椒中L型凝集素类受体激酶CaLecRKs鉴定及其对辣椒疫霉的响应
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作者 金庆敏 徐小万 +2 位作者 衡周 王恒明 徐晓美 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期122-130,193,共10页
L型凝集素类受体激酶(LecRKs)广泛参与植物的先天免疫过程。目前未见在辣椒Capsicum annuum中全基因组鉴定LecRKs的报道。本研究对辣椒中的CaLecRK进行了全基因组鉴定,并在接种辣椒疫霉Phytophthora capsici条件下通过基因表达分析探究... L型凝集素类受体激酶(LecRKs)广泛参与植物的先天免疫过程。目前未见在辣椒Capsicum annuum中全基因组鉴定LecRKs的报道。本研究对辣椒中的CaLecRK进行了全基因组鉴定,并在接种辣椒疫霉Phytophthora capsici条件下通过基因表达分析探究其对辣椒疫霉的响应情况,旨在挖掘参与辣椒抗疫病防御反应的CaLecRK基因。研究结果表明,辣椒基因组中共鉴定出24个CaLecRK,以其构建系统发育树发现,可将24个CaLecRK分为7个分支。基因表达分析结果显示,有4个CaLecRK基因(CaLecRK 2.2、CaLecRK 3.2、CaLecRK 8.1和CaLecRK 10.1)受辣椒疫霉诱导,和接菌后0 h相比,接菌处理后12 h或36 h基因表达差异显著,推测其在辣椒抗疫病防御反应中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 辣椒 l型凝集素类受体激酶 辣椒疫霉 基因表达 诱导
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Gene Expression of Fas,Soluble Fas and Fas-Ligand in Thyroid Tissues and Thyrocytes from Patients with Graves′ Disease 被引量:1
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作者 武晓泓 刘超 +3 位作者 覃又文 刘翠萍 段宇 蒋须勤 《Journal of Nanjing Medical University》 2002年第1期12-17,共6页
ObjectiveTo investigate Fas,soluble Fas(sFas)and Fas ligand(Fas L)gene expression in thyroid tissues and thyrocytes from patients with Graves disease(GD)and to find the interrelationship between apoptosis and pathog... ObjectiveTo investigate Fas,soluble Fas(sFas)and Fas ligand(Fas L)gene expression in thyroid tissues and thyrocytes from patients with Graves disease(GD)and to find the interrelationship between apoptosis and pathogenesis of GD. MethodsThyroid tissues were obtained from 7 GD patients and 3 healthy subjects who died accidentally. Thyrocytes were cultured in Eagle′s medium. Total RNA was isolated from thyroid tissues and cultured thyrocytes. The cDNA was prepared by reverse transcription and amplified for Fas,sFas and Fas L by polymerase chain reaction(PCR). ResultsFas and sFas mRNA were detected in all samples from both GD and normal thyroid tissues and thyrocytes,but Fas L mRNA was only found in GD thyroid tissues and thyrocytes. Semi quantitative analysis showed that when compared with those of normal controls,the Fas and sFas mRNA levels were markedly increased in GD thyroid tissues(P<0.01),whereas in GD thyrocytes only the sFas mRNA levels was significantly elevated(P<0.01). ConclusionGene expression of Fas,sFas and Fas L showed abnormality in both thyroid tissues and thyrocytes from GD. The increased production of sFas might be involved in the hyperplasia of thyroid gland. 展开更多
关键词 thyroid Graves′ disease apoptosis Fas/Fas l gene expression
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Relationship between differ- ential gene expression pat- terns in functional leaves of maize (Zea mays L.) at milk filling stage and heterosis using cDNA-AFLP 被引量:10
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作者 TIAN Zengyuan & DAI Jingrui National Maize Improvement Center of China, China Agricultural Uni-versity, Beijing 100094, China Correspondence should be addressed to Tian Zengyuan (e-mail: tian-zengyuan@yahoo.com.cn) 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第1期76-81,共6页
To understand the molecular mechanism of maize heterosis, differential gene expression patterns in the functional leaves of 35 maize hybrids relative to their parents involving 10 elite inbreds at milk filling stage w... To understand the molecular mechanism of maize heterosis, differential gene expression patterns in the functional leaves of 35 maize hybrids relative to their parents involving 10 elite inbreds at milk filling stage were analyzed by using cDNA-AFLP. The correlation analyses of various differential expression patterns with the performance and heterosis of main maize agronomic traits were evaluated. The main results were as follows: For uniparental specific expression, significant positive correlations were detected with the performance of seed weight per ear and 100-seed weight at 0.01 and 0.05 probability levels respectively. For biparental specific expression, significant negative correla-tions were detected with the performance of ear diameter and seed weight per ear at 0.01 probability level. For uni-parental specific expression, significant positive correlations were detected with the heterosis of ear diameter and seed weight per ear at 0.01 and 0.05 probability levels respectively. For biparental specific expression, significant negative cor-relation was detected with the heterosis of ear diameter at 0.05 probability level. However, for F1-specific expression, for fragments detected only in one parent and F1, and for fragments detected only in two parents or only in F1, no sig-nificant correlation was detected with the performance or heterosis of all agronomic traits surveyed. 展开更多
关键词 玉米 灌浆期 叶片 差异基因表达模式 杂种优势 相关性 CDNA-AFlP 农艺性状
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