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利用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物克隆芒果LAX基因家族片段 被引量:10
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作者 李运合 孙光明 《热带作物学报》 CSCD 2011年第12期2278-2282,共5页
详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法,并利用这2个程序设计了8对简并引物,从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段,测序结果表明,这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在NCBI上进行blastx分析,这些序列与其它植物的LAX基... 详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法,并利用这2个程序设计了8对简并引物,从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段,测序结果表明,这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在NCBI上进行blastx分析,这些序列与其它植物的LAX基因具有高度同源性,因此推测,芒果中的LAX基因家族其至少包括4条同源基因。研究结果表明CODEHOP和iCODEHOP设计的简并引物可信性强并具有高效性。 展开更多
关键词 芒果 lax基因 简并引物 iCODEHOP 克隆
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毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 杨乐 张康 李龙 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期89-95,共7页
AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析。结果表明,PheAUX1/LAX候选基因分为Clas... AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析。结果表明,PheAUX1/LAX候选基因分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚组,其中classⅠ的候选基因包含6~7个外显子,而ClassⅡ的候选基因包含8~10个外显子。不同组织器官转录组数据分析表明多数ClassⅠ候选成员在毛竹冬笋中高丰度表达,而ClassⅡ中的PH02Gene38722.t在跳鞭中高丰度表达。通过qRT-PCR对AUX1/LAX候选基因在不同生长发育时期笋中的表达量分析表明,有6个候选基因与对照相比呈现出不同程度的上调表达,表明PheAUX1/LAX候选基因广泛参与毛竹笋的生长发育。本研究将为进一步研究毛竹AUX1/LAX基因的功能和调控机制奠定理论基础。 展开更多
关键词 AUX1/lax 毛竹 基因表达 生物信息学
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Genetic analysis and fine mapping of a lax mutant in rice 被引量:1
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作者 WANGYun XIAOHan +3 位作者 QIANQian LiHongchang LIShigui ZHULihuang 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第19期2072-2076,共5页
We have analyzed a lax mutant that exhibits altered panicle architecture in rice. The primary and secondary rachis-branches are normally initiated and each branch ends in a terminal spikelet, but all the lateral spike... We have analyzed a lax mutant that exhibits altered panicle architecture in rice. The primary and secondary rachis-branches are normally initiated and each branch ends in a terminal spikelet, but all the lateral spikelets are absent and the terminal spikelet displays variegated structures in the mutant. An F2 population from the cross between the lax mutant and a japonica variety, W11, was constructed and analyzed. Using microsatellite and CAPS markers, the lax locus was mapped on the long arm of chromosome 1, co-segregated with a CAPS marker, LZ1, within an interval of 0.28 cM between a CAPS marker, HB2, and a microsatellite marker, MRG4389. RT-PCR analysis revealed that the expressions of the rice B-function MADS-box genes OsMADS2, OsMADS4, OsMADS16 and OsMADS3 were significantly reduced, whereas the expression of the rice A-function gene RAP1A was not altered. 展开更多
关键词 基因分析 水稻 突变异种 微量标记 CAPS 基因定位
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聚合酶链式反应与基因芯片检验致泻性大肠杆菌的价值
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作者 赵璐 《中外医药研究》 2022年第8期151-153,共3页
目的:分析聚合酶链式反应(PCR)与基因芯片检验致泻性大肠杆菌的价值。方法:选取2020年1月-2021年12月北京市延庆区疾病预防控制中心腹泻监测病例中致泻性大肠杆菌感染的患者127例作为研究对象,患者体内的肠出血性大肠杆菌、肠聚集性大... 目的:分析聚合酶链式反应(PCR)与基因芯片检验致泻性大肠杆菌的价值。方法:选取2020年1月-2021年12月北京市延庆区疾病预防控制中心腹泻监测病例中致泻性大肠杆菌感染的患者127例作为研究对象,患者体内的肠出血性大肠杆菌、肠聚集性大肠杆菌、产肠毒素大肠杆菌、大肠杆菌O157、肠致病性大肠杆菌5种致泻性大肠杆菌的特异性作为本次研究的样本基因,采用PCR和基因芯片检测患者体内的菌株。结果:在检测肠出血性大肠杆菌、肠聚集性大肠杆菌、产肠毒素大肠杆菌、大肠杆菌O157、肠致病性大肠杆菌5种致泻性大肠杆菌时,具有良好的特异性。在检测致病菌时,检测灵敏度可达104 cfu/mL。结论:PCR与基因芯片可准确检测出各类致泻性大肠杆菌的特异性,可为临床治疗由致泻性大肠杆菌所引发的腹泻提供真实的参考数据。 展开更多
关键词 聚合酶链式反应 基因芯片 致泻性大肠杆菌 检验结果
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水稻稀穗突变体的遗传分析及其基因的初步定位 被引量:1
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作者 马洪丽 温婵 +1 位作者 吕巧香 张书标 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期2106-2112,共7页
水稻的穗形与其产量关系密切,也是研究的一大热点。利用60Co-γ射线辐射诱变水稻68902B,筛选到一个水稻稀穗突变体,暂命名为Oslp(Oryza sativa lax panicle)。研究了该突变体的主要农艺性状与稀穗的遗传方式,并对稀穗突变基因Oslp进行... 水稻的穗形与其产量关系密切,也是研究的一大热点。利用60Co-γ射线辐射诱变水稻68902B,筛选到一个水稻稀穗突变体,暂命名为Oslp(Oryza sativa lax panicle)。研究了该突变体的主要农艺性状与稀穗的遗传方式,并对稀穗突变基因Oslp进行了分子定位。结果显示稀穗突变体Oslp的每穗粒数为104粒、二次枝梗数目为7个,它们都显著地少于原品种68902B每穗粒数的124粒和二次枝梗数目的 20个。遗传分析揭示突变体Oslp的稀穗性状受一对隐性核基因控制。将(籼稻品种261S×稀穗突变体Oslp)F2代中的稀穗个体作为定位群体,结合BSA和SSR分子标记技术,将基因Oslp定位在第7号染色体短臂的2个分子标记FR-3和FR-4之间,基因Oslp与FR-3和FR-4的遗传距离分别为0.6 c M和0.8 c M。 展开更多
关键词 水稻 稀穗突变体Oslp 遗传分析 基因定位
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