LCMT1在肝癌中的表达和预后的意义

目的:探讨亮氨酸羧基甲基转移酶1(LCMT1)在肝癌中的表达和预后的意义。方法:通过收集网络数据库GEPIA中有关信息进行LCMT1表达情况的分析、相关性分析和生存分析,然后通过免疫组化染色进一步分析LCMT1在肝癌中的表达和预后。结果:LCMT1在肾上腺皮质癌、弥漫性大B细胞淋巴瘤、肝癌和胸腺瘤中的表达和正常组织的表达相比具有统计学意义(P<0.05)。LCMT1在肝癌中高表达,且高表达的患者生存时间短,更容易发生转移。LCMT1和金属蛋白酶2(MMP2)之间的相关系数为0.324(P<0.05)。LCMT1和丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)存在正相关关系且相关系数为0.76(P<0.05)。结论:LCMT1在肝癌中高表达,且高表达与患者的不良预后有关,LCMT1可能通过激活MAPK3的磷酸化而促进肝癌的发生。

肝特异性LCMT1基因敲除小鼠模型的制备及鉴定

目的建立肝特异性LCMT1基因敲除小鼠模型。方法运用CRISPR/Cas9技术构建肝特异性LCMT1-KO小鼠。通过RT-PCR、实时定量PCR、Western Blot和HE染色等方法鉴定及比较野生和敲除小鼠的差异;观察和分析两组小鼠的一般情况、繁殖能力和子代存活率。结果成功鉴定子代的基因型;LCMT1-KO小鼠肝LCMT1 mRNA和蛋白质水平显著低于对照组小鼠;两组小鼠的饮食、饮水、体重、繁殖能力、子代存活率、肝外观和HE染色无明显差异;LCMT1-KO小鼠心脏、大脑和肾组织中LCMT1表达与对照组相比没有显著变化;LCMT1-KO小鼠sgRNA未发生脱靶。结论成功构建肝特异性LCMT1基因敲除小鼠,为研究LCMT1基因在疾病中的调控作用提供实验手段。

胃癌组织的LCMT1-AS2水平及临床意义

目的探讨胃癌组织中长链非编码RNA LCMT1反义RNA 2(LCMT1-AS2)的水平及临床意义。方法基于UALCAN在线分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中375例胃癌组织和32例正常组织的LCMT1-AS2水平,通过NCBI提供的GEO2R平台检索GEO数据库GSE54129中111例胃癌组织和21例正常组织的LCMT1-AS2水平,采用实时定量PCR(qPCR)检测本院2015年1月至2019年12月手术切除的117例胃癌组织和103例癌旁正常组织的LCMT1-AS2水平,分层分析LCMT1-AS2水平与胃癌临床病理特征(性别、年龄、Lauren分型、肿瘤直径、TNM分期、分化程度、淋巴结转移和浸润深度)的关系,Kaplan-Meier法进行生存分析并采用Engauge Digitizer软件在生存曲线上提取1、3、5年生存率。结果TCGA数据库和GSE54129数据集中胃癌组织的LCMT1-AS2水平均高于正常组织(P<0.05);qPCR结果显示胃癌组织的LCMT1-AS2水平为3.413±1.463,高于癌旁组织的1.735±0.735(P<0.05);LCMT1-AS2水平与胃癌的性别、年龄和分化程度无关(P>0.05),而与Lauren分型、肿瘤直径、TNM分期、淋巴结转移和浸润深度有关(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库分析显示LCMT1-AS2高水平者的中位总生存期(OS)为36.4个月,短于低水平者的70.4个月(HR=1.30,95%CI:1.04~1.62,P=0.021)。LCMT1-AS2低水平者的1、3、5年总生存率分别为98.4%、76.0%和48.1%,高于LCMT1-AS2高水平者的92.9%、40.9%和9.8%,中位OS为50.0个月,长于LCMT1-AS2高水平者的34.0个月,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素分析显示,LCMT1-AS2高水平为胃癌患者预后不良的危险因素(HR=3.451,95%CI:1.259~6.257,P<0.05)。结论LCMT1-AS2在胃癌组织中高表达,且该指标水平异常升高与恶性程度和不良预后有关,一定程度上参与胃癌的发生发展,可作为胃癌诊治的候选靶点。

基于iTRAQ技术分析LCMT1高表达对人胚肾细胞的影响

LCMT1是重要的哺乳动物甲基转移酶,为了探索LCMT1在生物体内可能涉及的生物进程,并建立LCMT1高表达的差异表达蛋白谱。我们成功构建了LCMT1高表达和质粒对照细胞株,利用同位素标记相对和绝对定量（isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ）技术鉴定LCMT1高表达引起的差异表达蛋白,并进行了生物信息学分析。我们共鉴定到4 480个蛋白,差异表达蛋白233个,其中上调蛋白78个,下调蛋白155个。涉及到的细胞生物进程5条,信号通路15条。蛋白质相互作用分析结果表明差异表达蛋白主要分为4群,这些差异表达蛋白主要与RNA翻译与泛素化,肾脏发育,羧酸代谢过程相关。本研究发现LCMT1高表达引起了大量蛋白的差异表达,而这些差异表达蛋白的识别为后续LCMT1相关疾病的研究提供了丰富的理论依据。

社会机会网络中基于节点相遇历史信息的路由算法

针对Bubble Rap路由算法的路由开销不理想的问题,提出一种利用节点相遇历史信息和删除消息副本相结合的低开销路由(LCMT)算法。利用与目的节点相遇次数进行消息转发改变了Bubble Rap单一的消息转发评判标准,使其对不同数据集场景的适应性得到提高,并结合效用函数对消息副本数进行控制,从而减小了路由开销。和Bubble Rap路由算法相比,仿真结果表明在Infocom06和MIT数据集中,该算法可在保证良好消息传输成功率的前提下显著降低路由开销。

糖原合酶激酶-3β对蛋白磷酸酯酶2A甲基化的调节

目的 :研究磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinases,PI3K)信号通路及其中重要组分糖原合酶激酶-3β(glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β)对蛋白磷酸酯酶2A(protein phosphotase 2A,PP2A)甲基化修饰的调节。方法 :用分子生物学及药物学手段改变Hep G2和HEK-293T细胞中PI3K信号通路及此通路中重要分子GSK-3β的活性,用Western blots分析PI3K信号通路及GSK-3β活性改变对PP2A的催化亚基-C亚基(catalytic subunit C,PP2A-C)甲基化修饰的影响。采用GSTpull down探讨PP2A-C特异性的亮氨酸甲基转移酶(leucine carboxyl methyltransferase-1,LCMT-1)与GSK-3β之间是否存在相互作用。结果:用LY294002下调细胞的PI3K信号通路,促进PP2A-C的甲基化。用GSK-3β抑制剂AR-A014418处理细胞抑制PP2A-C的甲基化。GSK-3β的GST融合蛋白GST-GSK-3β可以pull down LCMT-1。结论 :PI3K信号通路参与PP2A催化亚基甲基化的调节,抑制GSK-3β减少PP2A-C的甲基化修饰。GSK-3β与LCMT-1存在相互作用,GSK-3β可能通过LCMT-1,调节PP2A-C的甲基化修饰,进而影响PP2A的活性。