卷丹LlAGO1基因的克隆及表达分析

以卷丹(Lilium lancifolium)叶腋组织为研究材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆得到AGO1基因的c DNA全长,命名为Ll AGO1。其全长4 014 bp,开放阅读框长3 687 bp,编码1 228个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为135.36 k D,理论等电点(p I)为9.57。氨基酸序列分析表明Ll AGO1含有PAZ和Piwi两个AGO1典型的结构域;信号肽预测结果表明Ll AGO1蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白;亚细胞定位预测其主要定位于细胞核;与相关同源蛋白高度相似,且与芦笋AGO1a蛋白(XP_020260210.1)亲缘关系最近。q RT-PCR分析结果表明:Ll AGO1在卷丹叶腋、鳞片、根、叶等不同组织均有表达,其中在叶腋中的表达量最高,叶片和根中的表达较弱;腋生珠芽形成过程中,Ll AGO1仅在可形成珠芽的上部叶腋表达,且在珠芽形成时表达量最高,而在不形成珠芽的下部叶腋几乎不表达,推测Ll AGO1可能与卷丹珠芽的形成相关。