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中国大陆两种东毕吸虫rDNA-LSU基因的序列分析 被引量:7
1
作者 张广军 陈勤 +1 位作者 邱持平 夏明仪 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期86-89,共4页
目的 测定程氏东毕吸虫、土耳其斯坦东毕吸虫结节变种rDNA LSU基因序列 ,并对照已发表的土耳其斯坦东毕吸虫同一基因序列 ,比较三者的差异 ,探讨东毕吸虫虫种分类问题。 方法 收集两虫种成虫 ,GNT K法抽提基因组DNA ,PCR扩增目的基... 目的 测定程氏东毕吸虫、土耳其斯坦东毕吸虫结节变种rDNA LSU基因序列 ,并对照已发表的土耳其斯坦东毕吸虫同一基因序列 ,比较三者的差异 ,探讨东毕吸虫虫种分类问题。 方法 收集两虫种成虫 ,GNT K法抽提基因组DNA ,PCR扩增目的基因 ,并将其产物克隆入质粒再次扩增 ,提取质粒DNA ,以M 13(F/R)作为测序引物进行测序。从GenBank获得土耳其斯坦东毕吸虫rDNA LSU基因序列 ,用BioEdit软件将 3种血吸虫基因序列排序并比较分析。 结果 程氏东毕吸虫、土耳其斯坦东毕吸虫结节变种的LSU序列完全一致 ,与土耳其斯坦东毕吸虫rDNA LSU基因序列仅相差一个碱基 ,同源性高达 99.99%。 结论 γDNA LSU基因序列分析结果不支持程氏东毕吸虫为独立种 ,土耳其斯坦东毕吸虫结节变种可能是土耳其斯坦东毕吸虫的同种异名。 展开更多
关键词 rDNA-lsu 东毕吸虫 序列分析 中国大陆 基因序列
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实验感染大、小鼠和临床疑似病例肺孢子虫mt LSU rRNA基因检测 被引量:2
2
作者 冯宪敏 李自慧 +2 位作者 卢思奇 张帆 王凤云 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2006年第3期129-134,共6页
为探讨PCR技术对实验感染大、小鼠肺孢子虫肺炎(PCP)和临床疑似病例诊断的可行性。用皮下注射地塞米松法诱导SD大鼠和ICR小鼠PCP并收集临床疑似病例24h深部痰液。受试动物解剖后,制备肺印片,经瑞姬氏复合染色镜检确定肺孢子虫(Pc)感染... 为探讨PCR技术对实验感染大、小鼠肺孢子虫肺炎(PCP)和临床疑似病例诊断的可行性。用皮下注射地塞米松法诱导SD大鼠和ICR小鼠PCP并收集临床疑似病例24h深部痰液。受试动物解剖后,制备肺印片,经瑞姬氏复合染色镜检确定肺孢子虫(Pc)感染的阳性率;同时,以针对虫体mtLSUrRNA基因设计的引物,PCR扩增鼠肺组织和支气管灌洗液(BALF),以及痰液样本中的DNA;比较实验动物样本镜检和PCR两种方法的检测结果;测定PCR的敏感性和特异性。结果表明,SD大鼠和ICR小鼠肺印片的阳性率分别为68.8%(1116)和85.7%(1821),肺组织PCR检测的阳性率分别为75%(1216)和80.9%(1721),肺泡灌洗液PCR的阳性率分别为81.2%(1316)和23.8%(521)。肺印片镜检和PCR技术检测结果无显著性差别;可见,PCR对虫体mtLSUrRNA基因的检测具有显著的特异性和敏感性,至少可以检测出0.6pg的肺孢子虫DNA;6例临床疑似病例样本中2例显示肺孢子虫PCR阳性反应。 展开更多
关键词 肺孢子虫 肺孢子虫肺炎 MT lsu RRNA基因 临床疑似病例 基因检测
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小麦AGPase基因LSU Ⅱ的克隆及反义表达与RNAi干扰载体的构建 被引量:1
3
作者 刘超 康国章 +2 位作者 郭天财 岳彩风 沈丙权 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期1-6,共6页
采用RT-PCR方法从小麦品种豫教2号的发育籽粒中克隆出小麦淀粉合成关键酶—AGPase质体型大亚基(AGPase plastidial large subunit,LSU Ⅱ)cDNA一段特异保守序列,长度为535 bp(GenBank No.EF378944),与DQ409820(小麦)、U66876(大麦)、AK0... 采用RT-PCR方法从小麦品种豫教2号的发育籽粒中克隆出小麦淀粉合成关键酶—AGPase质体型大亚基(AGPase plastidial large subunit,LSU Ⅱ)cDNA一段特异保守序列,长度为535 bp(GenBank No.EF378944),与DQ409820(小麦)、U66876(大麦)、AK069296(水稻)和DQ406819(玉米)分别有98%,97%,88%,88%的同源性,表明克隆出了小麦LSU Ⅱ基因的部分cDNA序列。以pWM101质粒表达载体为基础,将LSU Ⅱ反向置于pWM101质粒的CaMV35S启动子之后,构建了LSU Ⅱ的反义表达载体pWM101LSUIIA;另外,用pFGC5941干扰载体构建了LSU Ⅱ基因的RNAi载体pFGC5941 LSU ⅡSA,这些载体的构建为研究LSU Ⅱ基因的功能打下了基础。 展开更多
关键词 小麦 AGPASE lsu 表达载体
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LSU-1离子交换树脂对U(Ⅵ)的吸附性能研究 被引量:4
4
作者 花榕 李嘉辉 +3 位作者 李爽 冯佳慧 王应财 陈昊梁 《有色金属(冶炼部分)》 CAS 北大核心 2021年第8期94-99,共6页
采用LSU-1离子交换树脂从CO_(2)+O_(2)地浸液中吸附U(Ⅵ)。在中性条件下,LSU-1树脂能够有效吸附U(Ⅵ);当pH=7,U(Ⅵ)初始浓度为300mg/L时,树脂吸附容量为141.42mg/mL。吸附过程符合Langmuir吸附等温模型(R2=0.998)和准二级动力学模型(R2=... 采用LSU-1离子交换树脂从CO_(2)+O_(2)地浸液中吸附U(Ⅵ)。在中性条件下,LSU-1树脂能够有效吸附U(Ⅵ);当pH=7,U(Ⅵ)初始浓度为300mg/L时,树脂吸附容量为141.42mg/mL。吸附过程符合Langmuir吸附等温模型(R2=0.998)和准二级动力学模型(R2=0.991)。动态试验表明,树脂吸附容量为140.52mg/mL,与静态吸附试验相吻合;采用0.5mol/L NaCl和0.5mol/L Na_(2)CO_(3)的混合溶液淋洗,能成功将铀洗脱,适用于CO_(2)+O_(2)采铀工艺。 展开更多
关键词 lsu-1 离子交换树脂 CO_(2)+O_(2)浸出 吸附
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小麦AGPase胞质型基因LSUI的克隆及正义、反义与RNAi干扰载体的构建 被引量:4
5
作者 康国章 张孟琴 +2 位作者 官春云 郭天财 朱云集 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期607-615,共9页
采用RT-PCR方法从小麦品种豫教2号的发育籽粒中克隆出AGPase胞质型大亚基基因(large subunit,LSU I)的cDNA全长(1947 bp,GenBank No.DQ839506),同源性比较结果表明,与GenBank上已报道的LSU I基因同源性达99%,虽与其有2处碱基不同(与Z21... 采用RT-PCR方法从小麦品种豫教2号的发育籽粒中克隆出AGPase胞质型大亚基基因(large subunit,LSU I)的cDNA全长(1947 bp,GenBank No.DQ839506),同源性比较结果表明,与GenBank上已报道的LSU I基因同源性达99%,虽与其有2处碱基不同(与Z21969相比,分别在851 bp处的T变为C和926 bp处的G变为A),但他们的氨基酸序列相同,故不影响其功能.以pBI121质粒为基础,通过中间载体pBSK,构建了由35S启动子调控的LSU I基因的正义表达载体pBI121LSUⅠS;将该基因反向置于pBI121质粒的CaMV35S启动子之后,构建了LSU I的反义表达载体pBI121LSUⅠA.同时还克隆出LSU I基因的250 bp片段,以pFGC5941质粒为基础,构建了RNAi干扰载体pFGCLsuⅠ,这为研究该基因的功能打下了很好的基础. 展开更多
关键词 普通小麦 AGPase胞质型大亚基 表达载体
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牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫ITS和28S rDNA-LSU序列分析 被引量:1
6
作者 仇建华 李利 +3 位作者 王春仁 陈佳 陈爱华 翟延庆 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期183-186,190,共5页
目的探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。方法粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯... 目的探讨牛羊源土耳其斯坦东毕吸虫(Orientobilharzia turkestanicum)核糖体内转录间隔区(ITS)和28S核糖体大亚基序列(rDNA-LSU)的差异。方法粪便检查、剖杀自然感染东毕吸虫的绒山羊、山羊、绵羊和黄牛,收集虫体,形态学鉴定为土耳其斯坦东毕吸虫。抽提成虫基因组DNA,扩增其ITS(包括ITS-1、5.8S rDNA和ITS-2)和28S rDNA-LSU序列,测序并分析以上序列,以及28S rDNA-LSU序列RNA二级结构。结果牛、羊源土耳其斯坦东毕吸虫的ITS-1、5.8S rDNA、ITS-2和28S rDNA-LSU序列分别长384、159、331和1304bp。牛源和羊源的ITS-1和5.8S rDNA序列完全相同;黄牛源、绵羊源和绒山羊源的ITS-2序列完全相同,与山羊源存在1个碱基的差异;绵羊源和绒山羊源的28S rDNA-LSU序列完全相同,与牛源和山羊源分别有2个碱基的差异。绵羊源和绒山羊源的28S rDNA-LSU序列RNA二级结构相同,与山羊源存在微小差异,但牛源与羊源存在较大差异。结论不同终末宿主源土耳其斯坦东毕吸虫的核糖体序列存在不同程度的差异,羊源28S rDNA-LSU序列的RNA二级结构相同或相似,但与牛源存在较大差异。 展开更多
关键词 土耳其斯坦东毕吸虫 核糖体内转录间隔区 5.8S核糖体DNA 28S核糖体DNA大亚基序列 序列分析
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贝盖侧耳的系统发育地位——基于nrDNA-LSU和ITS序列分析的研究 被引量:18
7
作者 李雪玲 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期67-71,共5页
通过同时对细胞核编码的核糖体大亚基DNA(nrDNA LSU)和内转录间隔区(ITS)两个片段序列进行测定,分析了贝盖侧耳的系统发育地位.结果显示:贝盖侧耳与幕盖菇属亲缘关系较远,而与侧耳属成员关系密切,担子果侧生和具有菌幕并不能作为与幕... 通过同时对细胞核编码的核糖体大亚基DNA(nrDNA LSU)和内转录间隔区(ITS)两个片段序列进行测定,分析了贝盖侧耳的系统发育地位.结果显示:贝盖侧耳与幕盖菇属亲缘关系较远,而与侧耳属成员关系密切,担子果侧生和具有菌幕并不能作为与幕盖菇属同源的依据.在侧耳属中,贝盖侧耳与同样能产生菌幕的栎侧耳和Pleurotuslevis亲缘关系并不密切,而与不产生菌幕的红侧耳关系最近. 展开更多
关键词 贝盖侧耳 核糖体大亚基 内转录间隔区 分子系统学
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Phylogenetic Analysis of Morels Based on ITS and LSU Sequences 被引量:1
8
作者 Senlin ZHU Bo CHEN +5 位作者 Fen JIAN Zhun XIANG Qian LUO Xiaomin WANG Xu CHEN Bangxi ZHANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2022年第3期6-9,共4页
[Objectives]Fifty two strains were identified and phylogenetically analyzed to solve the current phenomenon of"synonym and homonym"in morels.[Methods]Based on the ITS and LSU sequences of ribosomal DNA,the c... [Objectives]Fifty two strains were identified and phylogenetically analyzed to solve the current phenomenon of"synonym and homonym"in morels.[Methods]Based on the ITS and LSU sequences of ribosomal DNA,the collected 52 morel samples were sequenced,and BLAST alignment was performed by NCBI to construct phylogenetic trees.[Results]The collected morel strains were mainly divided into two major groups:namely black morel and yellow morel groups,of which the black morel group was most,mainly including Morchella sextelata,Morchella importuna,Morchella crassipes,and Morchella eximia.There were very few yellow morel strains,including M.crassipes and M.eximia.[Conclusions]This study lays a foundation for the classification and research of morel germplasm resources,and provides a powerful reference value for the research and production of high-quality morel strains. 展开更多
关键词 MOREL ITS analysis lsu analysis Strain identification PHYLOGENY
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赤潮异弯藻和海洋原甲藻LSU rDNA扩增及序列分析
9
作者 董云伟 董双林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期358-364,共7页
利用引物 D1R和 D2 C扩增并测定了赤潮异弯藻 (H eterosigma akashiwo Hada)和海洋原甲藻 (Prorocentrum micans Ehrenberg)的 L SU r DNA D1与 D2序列 ,并与 Gen Bank中相关序列进行比较分析。结果表明 :在种内水平 ,所测的 H .akashiw... 利用引物 D1R和 D2 C扩增并测定了赤潮异弯藻 (H eterosigma akashiwo Hada)和海洋原甲藻 (Prorocentrum micans Ehrenberg)的 L SU r DNA D1与 D2序列 ,并与 Gen Bank中相关序列进行比较分析。结果表明 :在种内水平 ,所测的 H .akashiwo 6个株系之间共有 5个变异位点 ,序列H.k与 H.k- 2 ,H.k- 4均存在碱基替换 ;原甲藻属不同种内各株系之间的遗传距离为 0 .0 0 2~0 .0 2 3之间 ,所测序列 P.mi与 P.micans其他株系之间均存在碱基替换。在种间水平上 ,原甲藻属不同种之间的遗传距离在 0 .0 4 5~ 0 .139之间 ,大于种内遗传距离 ,每个种都具有特定的保守序列。根据序列间的遗传变异 ,可设计特异性的探针对不同株系和物种进行检测和计数。 展开更多
关键词 赤潮异弯藻 海洋原甲藻 DNA 序列分析 海洋污染
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LSU以基因工程法研制优质马铃薯
10
作者 王璋瑜 《生物技术通报》 CAS CSCD 1989年第5期28-29,共2页
高蛋白的抗病马铃薯对发展中国家和美国均有价值。路易丝安那州立大学(LSU)Jes- se Jaynes博士已合成编码含大量必需氨基酸的蛋白的基因,该蛋白“比现存任何蛋白都好”。该氏合成该基因后,使之在大肠杆菌中表达,然后尝试将其引入各种植... 高蛋白的抗病马铃薯对发展中国家和美国均有价值。路易丝安那州立大学(LSU)Jes- se Jaynes博士已合成编码含大量必需氨基酸的蛋白的基因,该蛋白“比现存任何蛋白都好”。该氏合成该基因后,使之在大肠杆菌中表达,然后尝试将其引入各种植物——马铃薯是第一种。该基因在马铃薯中获表达,并已检测出。 展开更多
关键词 优质马铃薯 lsu 中获 必需氨基酸 国际马铃薯中心 工程法 安那 病原细菌 病原真菌 紫茵
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LSU对防蚁产品的研究
11
作者 王乐 《国际木业》 2002年第4期27-27,共1页
关键词 lsu 防蚁产品 研究 住宅
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基于ITS和LSU序列对一株野生鹅膏菌的分类鉴定 被引量:8
12
作者 渠文思 石家祺 石亚伟 《山西农业科学》 2018年第12期2073-2076,共4页
以山西左权地区一株野生的鹅膏菌作为研究材料,提取鹅膏菌基因组DNA后,将r DNA的ITS和LSU区段进行克隆后连接到T载体上进行测序。通过GenBank核酸数据库对测序得到的ITS和LSU序列进行同源性比对,并从GenBank检索获得7个相似物种的ITS和... 以山西左权地区一株野生的鹅膏菌作为研究材料,提取鹅膏菌基因组DNA后,将r DNA的ITS和LSU区段进行克隆后连接到T载体上进行测序。通过GenBank核酸数据库对测序得到的ITS和LSU序列进行同源性比对,并从GenBank检索获得7个相似物种的ITS和LSU序列,与测序得到的ITS和LSU序列分别做系统发育树。测序结果表明,ITS序列有666 bp,LSU序列有968 bp;系统发育树结果显示,ITS序列以100%的支持值与拟橙盖鹅膏菌聚在一起,LSU序列以98%的支持值与拟橙盖鹅膏菌聚在一起。结合形态学观察,将山西左权鹅膏菌鉴定为拟橙盖鹅膏菌(Amanita caesareoides)。 展开更多
关键词 鹅膏菌 RDNA 内转录间隔区 核糖体大亚基基因组序列 分类鉴定
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无柄灵芝遗传多样性的SRAP、ITS、TEF1-α和LSU分析 被引量:15
13
作者 谭秀梅 阿地力·沙塔尔 +4 位作者 朴春根 薛寒 郭民伟 汪来发 李永 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2667-2677,共11页
【目的】研究来自我国不同地区的45株无柄灵芝菌株的遗传多样性。【方法】利用ITS、TEF1-α和LSU多基因分析及SRAP分子标记两种方法,对供试无柄灵芝菌株进行聚类分析和遗传多样性研究。【结果】筛选出8对SRAP引物共扩增出95条条带,其中... 【目的】研究来自我国不同地区的45株无柄灵芝菌株的遗传多样性。【方法】利用ITS、TEF1-α和LSU多基因分析及SRAP分子标记两种方法,对供试无柄灵芝菌株进行聚类分析和遗传多样性研究。【结果】筛选出8对SRAP引物共扩增出95条条带,其中具有多态性条带79条,平均多态性比例为82.4%,多态性信息含量(PIC)变幅在0.28-0.43,平均为0.38。ITS、TEF1-α和LSU多基因序列分析结果显示,同一地域的部分菌株聚在一起,亲缘关系较近,而地域相隔较远的部分菌株也聚在同一个进化支上,其亲缘关系也很近,这与SRAP聚类分析结果相吻合。【结论】无柄灵芝菌株遗传多样性较为丰富,其遗传相似性与地理分布存在一定的相关性,ITS、TEF1-α、LSU基因及多基因分析更适合无柄灵芝分类鉴定,而SRAP分子标记更适合于无柄灵芝遗传多样性分析。 展开更多
关键词 无柄灵芝 SRAP ITS TEF1-α lsu 遗传多样性
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浙江洞头岛自由生活线虫两个优势种的形态描述及其系统发育分析
14
作者 郭文 梁慧鑫 +1 位作者 吕艳伟 王春明 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期45-52,共8页
为了了解浙江洞头岛自由生活线虫(Nematoda)的种类和多样性,作者对该海域线虫进行分类研究,发现了2个优势种并进行了重新描述。其中,丑萨巴线虫(Sabatieria foetida Gagarin&Nguyen Vu Thanh,2008)为一新纪录种,主要特征为:表皮具... 为了了解浙江洞头岛自由生活线虫(Nematoda)的种类和多样性,作者对该海域线虫进行分类研究,发现了2个优势种并进行了重新描述。其中,丑萨巴线虫(Sabatieria foetida Gagarin&Nguyen Vu Thanh,2008)为一新纪录种,主要特征为:表皮具环状排列的小点,有较大的点组成的侧装饰,4根头刚毛较短(3~4μm),化感器呈螺旋状(2.5~3.0圈),交接刺细长,近端略膨大,中间开始至远端变细(65~69μm),引带具直的引带突(20~25μm),具13~15个小的乳突状肛前辅器;厦门后菱光线虫(Metachromadora xiamenensis Zhou,Zeng,Cai,Fu&Tan,2020)特征为:表皮具明显环纹,4根头刚毛短且粗,脊线由食道中部延伸至尾中部,双环状化感器位于身体最前端,交接刺近端具头状膨大(58~65μm),肛前辅器细管状(15个),尾为短圆锥形。同时,获得了两种线虫核糖体大亚基(LSU)的D2-D3片段序列数据,构建了两种线虫基于贝叶斯推论法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(maximum likelihood,ML)的系统发育树,结果表明萨巴线虫属和后菱光线虫属表现出了多系进化的趋势。 展开更多
关键词 丑萨巴线虫(Sabatieria foetida) 厦门后菱光线虫(Metachromadora xiamenensis) lsu 系统发育
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TM图像杨树林识别的MLC与LSU算法应用分析——以河北省文安县为例 被引量:1
15
作者 赵宇鸾 李秀彬 +1 位作者 辛良杰 张英 《地球信息科学学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期252-259,共8页
以Landsat5 TM1、TM2、TM3、TM4、TM5和TM7等图像数据,经预处理后进行植被指数提取和主成分分析,生成13个波段数据集;并用最优指数法(OIF)选取目视解译波段,运用最大似然法(MLC)和线性光谱分解法(LSU)对华北平原农区河北省文安县2007年... 以Landsat5 TM1、TM2、TM3、TM4、TM5和TM7等图像数据,经预处理后进行植被指数提取和主成分分析,生成13个波段数据集;并用最优指数法(OIF)选取目视解译波段,运用最大似然法(MLC)和线性光谱分解法(LSU)对华北平原农区河北省文安县2007年5月的杨树林地面积信息作了应用分析。结果表明:(1)TM数据中可见光红光波段、近红外波段和中红外波段,以及冠层植被指数和前三个主成分量在杨树信息提取中具有优势;(2)根据波段间相关系数分组计算最优指数值(OIF),可减少计算量;(3)MLC提取杨树林地面积为11 259.84hm2,占研究区总面积的10.95%。经野外实地验证,生产者精度和用户精度分别为84.07%和93.14%,分类和空间制图效果较好;(4)利用亚像元的LSU分析技术,提取地表破碎地类面积,且提取杨树林地面积为13 701.71hm2,达到研究区面积的13.33%(较前者大幅增加)。这可为杨树林资源快速调查监测和林-粮土地合理利用提供参考。 展开更多
关键词 MLC lsu TM影像 杨树林 图像识别
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mtLSU-巢式PCR检测实验大鼠卡氏肺孢子虫的实验研究
16
作者 张小娟 杨芳芳 +3 位作者 欧阳颐 王鸽 黎学铭 林睿 《热带医学杂志》 CAS 2011年第4期372-374,432,共4页
目的对mtLSU-巢式PCR方法检测大鼠卡氏肺孢子虫的应用价值以及基因序列进行评价。方法采用地塞米松免疫抑制法诱导大鼠感染肺孢子虫;实验组10只,对照组1只;诱导至第7周时收集实验组及对照组大鼠肺组织和支气管肺泡灌洗液(BALF)标本,采用... 目的对mtLSU-巢式PCR方法检测大鼠卡氏肺孢子虫的应用价值以及基因序列进行评价。方法采用地塞米松免疫抑制法诱导大鼠感染肺孢子虫;实验组10只,对照组1只;诱导至第7周时收集实验组及对照组大鼠肺组织和支气管肺泡灌洗液(BALF)标本,采用mtLSU-巢式PCR方法对人源与鼠源肺孢子虫共有的基因进行扩增和序列测定,同时采用镜检法对实验组大鼠肺组织和肺泡灌洗液标本进行检测,评估两种方法的敏感性。结果采用mtLSU-巢式PCR方法对实验感染大鼠肺组织和BAL进行检测,卡氏肺孢子虫DNA阳性率分别为100%(10/10)、90%(9/10)。而GMS染色镜检法检测的阳性率分别为80%(8/10)、60%(6/10)。所测Wistar大鼠卡氏肺孢子虫mtLSU基因序列长度为155bp,与GenBank的大鼠源肺孢子虫(U20170)及人源肺孢子虫(DQ473446)同源性均为100%(154/154、155/155)。结论 mtLSU-巢式PCR方法应用于大鼠卡氏肺孢子虫检测敏感性高,特异性强;获得与人源耶氏肺孢子虫相同的Wistar大鼠卡氏肺孢子虫mtLSU的基因序列。 展开更多
关键词 卡氏肺孢子虫 线粒体核糖体大亚基RNA基因(mtlsu) 巢式PCR 基因序列
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药品质量控制中常见产毒真菌ITS和LSU rRNA基因的序列分析 被引量:2
17
作者 蒋波 冯震 +2 位作者 秦峰 刘浩 杨美成 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1933-1939,共7页
目的:评价rRNA基因的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和大亚基单元(large subunit,LSU)序列对药品质量控制中常见产毒真菌的鉴定作用。方法:以形态分类方法对8个产毒真菌属的菌株进行初步鉴定;然后从试验菌株中提取基因... 目的:评价rRNA基因的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和大亚基单元(large subunit,LSU)序列对药品质量控制中常见产毒真菌的鉴定作用。方法:以形态分类方法对8个产毒真菌属的菌株进行初步鉴定;然后从试验菌株中提取基因组DNA,对ITS和LSU序列进行PCR扩增和序列测定,通过序列聚类关系分析,进一步评价不同序列对产毒真菌的分子鉴定能力。结果:分别采用ITS、LSU rRNA基因序列分析方法对产毒真菌的鉴定至少可达到"属"水平,采用ITS和LSU rRNA基因的串联序列可以将青霉属和曲霉属中的试验菌株鉴定至"种"水平。结论:ITS和LSU rRNA序列系统发育分析可作为产毒真菌的鉴定方法。 展开更多
关键词 产毒真菌 内转录间隔区 大亚基单元 系统发育分析
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贵州省毕节地区大型真菌资源调查及亲缘关系分析
18
作者 杨雨 秦利军 《中国食用菌》 2023年第4期18-27,共10页
通过随机采样法对贵州毕节部分地区大型真菌进行调查,最终获得30份样品。参照《中国·贵州高等真菌原色图鉴》和《贵州大型真菌》对采集的30份样品进行形态学比较和分类;同时,结合ITS和LSU保守区扩增、比对,最终确定30份样本分属于2... 通过随机采样法对贵州毕节部分地区大型真菌进行调查,最终获得30份样品。参照《中国·贵州高等真菌原色图鉴》和《贵州大型真菌》对采集的30份样品进行形态学比较和分类;同时,结合ITS和LSU保守区扩增、比对,最终确定30份样本分属于2门2纲5目13科15属。其中,伞菌目(Agaricales)占比最高,约占总数的53.3%;其次为红菇目(Russulales),占总数的30.0%;而地星目(Geastrales)和蘑菇目(Agaricales)数量最少,均约占总数的3.3%。基于ITS保守区聚类结果表明,不同菌株与其近缘物种表现出优先聚类的特点。其中BJ-17和BJ-28以99%的支持率聚为一支,暗示两者可能为同一个种,而BJ-7与栎裸脚伞(Gymnopus dryophilus MW816514.1)、BJ-25与栎裸脚伞(G.dryophilus var.MW554237.1)的ITS序列相似性低于90%,则推测其可能为裸脚伞属(Gymnopus)不同种。调查发现,红菇属(Russula)和乳菇属(Lactarius)在毕节地区较为常见且经济价值较大,可作为该地区大型食用菌种质资源开发的优良菌种。 展开更多
关键词 大型真菌 形态特征 ITS lsu 亲缘关系
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变端元混合像元分解冬小麦种植面积测量方法 被引量:10
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作者 赵莲 张锦水 +2 位作者 胡潭高 陈联裙 李乐 《国土资源遥感》 CSCD 2011年第1期66-72,共7页
针对线性混合像元分解(Linear Spectral Unmixing,LSU)在端元(Endmember)个数不变情况下常会出现端元分解过剩现象导致分解结果精度不高的问题,以地物分布的聚集性特征为基础,提出了基于格网的变端元线性混合像元分解(Dynamic Endmember... 针对线性混合像元分解(Linear Spectral Unmixing,LSU)在端元(Endmember)个数不变情况下常会出现端元分解过剩现象导致分解结果精度不高的问题,以地物分布的聚集性特征为基础,提出了基于格网的变端元线性混合像元分解(Dynamic Endmember LSU,DELSU)方法。以冬小麦为研究目标,采用Landsat TM图像为实验数据、高分QuickBird图像目视解译冬小麦结果为真值精度评价数据,利用本文提出的DELSU方法进行冬小麦提取。实验结果表明:该方法比最大似然方法、LSU方法更能准确地获取冬小麦面积,在一定程度上吸收了传统分类方法的优点,提高了目标地物的测量精度;同时作为一种改进的LSU方法也适用于其他土地利用/覆盖类型的测量。 展开更多
关键词 DElsu lsu 格网 冬小麦 遥感
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广西钦州湾一株巴夫藻的形态描述和分子鉴定
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作者 谢欢达 徐轶肖 +2 位作者 黎慧玲 吴淼 温玉娟 《南宁师范大学学报(自然科学版)》 2023年第1期157-163,共7页
巴夫藻隶属于定鞭金藻门巴夫藻纲,是潜在的水产养殖优良饵料生物,为了研究广西沿海巴夫藻的种类信息,于2021年8月从广西钦州湾海域成功分离出一株巴夫藻(BGERL121),应用光学显微镜初步观察其形态,并运用DNA分子鉴定技术对其核糖体大亚基... 巴夫藻隶属于定鞭金藻门巴夫藻纲,是潜在的水产养殖优良饵料生物,为了研究广西沿海巴夫藻的种类信息,于2021年8月从广西钦州湾海域成功分离出一株巴夫藻(BGERL121),应用光学显微镜初步观察其形态,并运用DNA分子鉴定技术对其核糖体大亚基(LSU rDNA)和核糖体小亚基(SSU rDNA)进行序列和系统发育分析。结果表明:该藻株细胞长×宽为(2.96~5.59)×(2.73~4.89)μm,藻液呈黄绿色或黄色,藻体近前端具有两根不等长的鞭毛,在鞭毛附着点附近有一个红色的眼点,藻体后端略微凸起,包裹着一个蛋白核。LSU rDNA和SSU rDNA两种序列与NCBI数据库BLAST搜索得到的Pavlova pinguis相似度均超过99%,构建的两种序列系统发育树显示巴夫藻钦州湾株与Pavlova pinguis聚在一起,自展值均为100,由此确定钦州湾BGERL121藻株为Pavlova pinguis。本研究首次发现广西钦州湾海域存在Pavlova pinguis,也是我国第二次对该种类的分子鉴定报道,结果将丰富我国巴夫藻的物种及地理分布信息,为巴夫藻的种类鉴定提供一定依据。 展开更多
关键词 巴夫藻 Pavlova pinguis lsu rDNA SSU rDNA 钦州湾
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