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鸡圆圈病毒3型可视化LAMP检测方法的建立及应用
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作者 张民秀 谢芝勋 +6 位作者 张艳芳 谢志勤 谢丽基 李孟 罗思思 曾婷婷 王粲 《河南农业科学》 北大核心 2024年第4期128-136,共9页
建立鸡圆圈病毒3型(GyV3)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速检测鸡GyV3提供一种诊断方法。参考GyV3的VP3基因序列,设计1套LAMP特异性引物,分别通过温度优化、引物浓度优化和反应时间的优化,确定鸡GyV3可视化LAMP诊断方... 建立鸡圆圈病毒3型(GyV3)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速检测鸡GyV3提供一种诊断方法。参考GyV3的VP3基因序列,设计1套LAMP特异性引物,分别通过温度优化、引物浓度优化和反应时间的优化,确定鸡GyV3可视化LAMP诊断方法的扩增温度、引物浓度和反应时间,通过特异性试验、敏感性试验、重复性试验和临床样品检测,验证鸡GyV3可视化LAMP诊断方法的特异性、敏感性、稳定性和可靠性。结果显示,鸡GyV3 LAMP检测方法的反应体系:总体积为20.0μL,包括DNA模板1.0μL,2×Master Mix 10.0μL,内引物GyV3-FIP和GyV3-BIP混合液(工作浓度16.0μmol/L)2.0μL,外引物GyV3-F3和GyV3-B3混合液(工作浓度2.0μmol/L)2.0μL,环引物GyV3-LF和GyV3-LB混合液(工作浓度8.0μmol/L)2.0μL,ddH_(2)O 3μL;鸡GyV3 LAMP检测方法的扩增程序:66℃反应20 min,80℃灭活5 min。鸡GyV3可视化LAMP检测方法能特异性检测GyV3,最低检测浓度为10^(1)拷贝/μL,组内和组间变异系数小于5%;与常规PCR方法检测临床样品的结果比较,两者结果符合率达100%。建立的鸡GyV3可视化LAMP检测方法能特异性检测GyV3,具有特异性好、敏感性高及污染小等优点,且检测结果可通过肉眼观察进行判断,适用于GyV3的临床快速筛查。 展开更多
关键词 鸡圆圈病毒3型(GyV3) 可视化lamp 特异性引物 诊断方法 敏感性
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鱼类致病鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)的LAMP检测技术建立与应用 被引量:19
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作者 王国良 刘璐 徐益军 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期27-31,共5页
针对鰤鱼诺卡氏菌16S—23SrRNA基因内转录间隔序列,设计了四条LAMP引物,在外内引物浓度比1:8、dNTP浓度0.8—1.2mmol/L、Mg2+浓度10—14mmol/L、反应温度60—65℃、反应时间60min的优化条件下,扩增产物经电泳后呈现特异性的LAMP梯形条带... 针对鰤鱼诺卡氏菌16S—23SrRNA基因内转录间隔序列,设计了四条LAMP引物,在外内引物浓度比1:8、dNTP浓度0.8—1.2mmol/L、Mg2+浓度10—14mmol/L、反应温度60—65℃、反应时间60min的优化条件下,扩增产物经电泳后呈现特异性的LAMP梯形条带,建立的LAMP法具有高灵敏度,达到10-7μg/μlDNA浓度,比常规PCR方法高100倍。将该方法应用于取自养殖场的乌鳢、大黄鱼、黄姑鱼组织样品检测,结果在16份组织样品中有7份检出自然感染的鰤鱼诺卡氏菌,与同步取样品鱼组织的细菌分离、培养检查结果相一致,并显示既能检测发病鱼,又能检出未发病且已感染的病鱼。分析表明,这是一种能快速、简易、特异、敏感的检测鱼类致病鰤鱼诺卡氏菌的诊断方法。 展开更多
关键词 鰤鱼诺卡氏菌 16S-23S RRNA基因 环介导恒温基因扩增检测法
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嗜水气单胞菌Lamp检测方法的建立及应用 被引量:18
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作者 程天印 刘洵 常小斌 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1013-1016,共4页
基于嗜水气单胞菌气溶素(aerolysin)基因的序列,设计了1套引物,通过条件优化,成功建立了针对致病性嗜水气单胞菌的环媒恒温基因扩增(Lamp)检测法。采用Lamp法对病原菌进行了扩增,并对病鱼血样进行了检测。结果表明,该法只检出... 基于嗜水气单胞菌气溶素(aerolysin)基因的序列,设计了1套引物,通过条件优化,成功建立了针对致病性嗜水气单胞菌的环媒恒温基因扩增(Lamp)检测法。采用Lamp法对病原菌进行了扩增,并对病鱼血样进行了检测。结果表明,该法只检出致病性嗜水气单胞菌。对不同浓度的细菌悬液扩增结果表明,Lamp检测嗜水气单胞菌的最低菌液浓度为1.4~14/μL。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 气溶素基因 环媒恒温基因扩增检测法
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刺激隐核虫LAMP检测方法的建立 被引量:7
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作者 王国良 周旻曦 徐益军 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期574-577,共4页
为提高大黄鱼刺激隐核虫病的病原体检出率,本研究针对刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans)18S-ITS2基因序列设计4条LAMP引物,在内外引物浓度比2∶1~6∶1、Mg2+浓度2 mmol/L、反应温度61℃~66℃、反应时间60 min的优化条件下,扩增产物... 为提高大黄鱼刺激隐核虫病的病原体检出率,本研究针对刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans)18S-ITS2基因序列设计4条LAMP引物,在内外引物浓度比2∶1~6∶1、Mg2+浓度2 mmol/L、反应温度61℃~66℃、反应时间60 min的优化条件下,扩增产物经电泳后呈现特异性的LAMP梯形条带。本研究建立的LAMP方法具有高灵敏度(10-7ng/μL DNA浓度),比常规PCR方法高100倍。将该方法应用于采集自不同地域的虫体样本、病鱼和水样以及不同组织样品的检测,结果在13份样品中有10份检出阳性,并显示该方法既能够检测发病鱼,也能够检出已感染但未发病的鱼。实验表明,该方法是一种能够快速、简易、特异、敏感地检测海水鱼类刺激隐核虫病的病原学检测方法。 展开更多
关键词 刺激隐核虫 18S-ITS2基因序列 环介导恒温基因扩增检测法
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LAMP法在水产动物病原快速检测中的应用 被引量:24
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作者 赵飞 邹为民 《南方水产》 2007年第2期71-75,共5页
近年来,一种新的恒温核酸扩增方法LAMP法(loop-mediated isothermal amplification),即环介导等温扩增法已经被开发利用。它采用能特异识别靶序列上6个位点的4条引物及一种具有链置换活性的DNA聚合酶(Bst DNA polymerase),在恒... 近年来,一种新的恒温核酸扩增方法LAMP法(loop-mediated isothermal amplification),即环介导等温扩增法已经被开发利用。它采用能特异识别靶序列上6个位点的4条引物及一种具有链置换活性的DNA聚合酶(Bst DNA polymerase),在恒温条件(60~65℃),不到1h的时间里进行核酸扩增,其扩增效率可达到10^9~10^10个数量级,具有特异性强、等温灵敏、操作简单、产物易检测等优点。LAMP法已经被用来快速检测水产动物病原(细菌、病毒、寄生虫)。文章就LAMP法的反应原理、引物设计及其在水产动物病原快速检测中的应用等做简要的综述。 展开更多
关键词 lamp 反应原理 病原 快速检测
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禽流感病毒通用型RT-LAMP快速检测方法的建立 被引量:5
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作者 石霖 王秀荣 +9 位作者 孙阮洋 李雁冰 程荣华 于学武 曹东 薛树山 赵培 徐晓龙 马勇 郑世民 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期383-386,共4页
为建立一种禽流感病毒(AIV)的快速检测方法,本研究根据环介导等温扩增技术(LAMP)原理,设计了针对AIV M基因4个不同区段的特异性引物,并对反应条件和反应体系进行优化,建立了AIV的RT-LAMP方法。结果表明,该方法对AIV H1~H16亚型的检... 为建立一种禽流感病毒(AIV)的快速检测方法,本研究根据环介导等温扩增技术(LAMP)原理,设计了针对AIV M基因4个不同区段的特异性引物,并对反应条件和反应体系进行优化,建立了AIV的RT-LAMP方法。结果表明,该方法对AIV H1~H16亚型的检测结果均为阳性,而对其他禽类病毒的扩增均为阴性,具有良好的特异性。对AIV的最低检测限为13.43 EID50/m L,灵敏度为普通一步RT-PCR的10倍;扩增反应可以在恒温水浴内60 min内完成;在反应体系中添加荧光染料后,肉眼即可判定检测结果。该检测方法与RT-PCR方法和荧光定量RT-PCR方法对临床样品检测的符合率均为81.8%。该方法能够简便、快速、灵敏、特异地检测AIV。 展开更多
关键词 禽流感 RT-lamp 诊断方法
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猪繁殖与呼吸综合征RT-LAMP检测方法研究 被引量:5
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作者 杨素 沙才华 +6 位作者 顾海洋 董尚智 廖秀云 徐海聂 薄清如 罗宝正 陈伟生 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第6期136-141,共6页
应用反转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP),利用猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)核衣壳蛋白(N蛋白)ORF7基因保守序列的6个区域设计2对特异引物,经反应体系、反应条件优化及敏感性和特异性试验,建立了PRRSV RT-LAMP检测方法。研究结果表明,... 应用反转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP),利用猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)核衣壳蛋白(N蛋白)ORF7基因保守序列的6个区域设计2对特异引物,经反应体系、反应条件优化及敏感性和特异性试验,建立了PRRSV RT-LAMP检测方法。研究结果表明,该检测方法不需要复杂仪器,仅用一台普通恒温水浴锅,在等温条件(63℃)保温1 h,即可完成核酸扩增反应,加入核酸染料SYBR GreenⅠ后,用肉眼即可对试验结果进行准确判定,为田间和基层部门检测猪繁殖与呼吸综合征病毒提供了一种廉价、简便、快速、敏感、特异的新方法。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 RT-lamp 检测方法 研究
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牛病毒性腹泻病毒LAMP检测方法的建立与应用 被引量:23
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作者 李家伟 郭利 +4 位作者 杨勇 王建科 张淑琴 张加力 程世鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第12期3111-3118,共8页
针对牛病毒性腹泻病毒(BVDV)5′UTR基因(GenBank登录号:AY278459.1)序列设计4条特异性环介导等温扩增(LAMP)引物,特异性识别靶基因序列上4个独立区域,采用LAMP技术,利用实时浊度仪实时检测LAMP反应过程中所产生的焦磷酸镁白色沉淀,实时... 针对牛病毒性腹泻病毒(BVDV)5′UTR基因(GenBank登录号:AY278459.1)序列设计4条特异性环介导等温扩增(LAMP)引物,特异性识别靶基因序列上4个独立区域,采用LAMP技术,利用实时浊度仪实时检测LAMP反应过程中所产生的焦磷酸镁白色沉淀,实时监测反应液浊度来判断反应结果,实现对扩增反应全过程的监控,建立BVDV的LAMP快速检测方法。通过实时浊度仪在恒温63℃下50min完成检测,对方法的特异性、灵敏度、重复性进行了评价。结果显示,经优化该方法只检测BVDV阳性,特异性强;病毒10-6倍稀释时仍能被检测到,比PCR方法灵敏度至少高100倍;重复性良好。LAMP实时浊度法具有简单、快速、灵敏度高、特异性强的优势,为BVDV的临床检测提供了一种简单快速的试验手段。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 环介导等温扩增技术 PCR
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桑脉带相关病毒RT-LAMP检测方法的建立 被引量:4
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作者 吴凡 李杨秀 +2 位作者 黄海娟 陈保善 蒙姣荣 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期116-120,共5页
桑脉带相关病毒Mulberry vein banding-associated virus (MVBaV)是广西桑树病毒病的主要病原病毒。本研究根据MVBaV基因组的核外壳蛋白(nucleocapsid protein, N)基因序列设计了5组引物,筛选获得了1组有效引物,建立了该病毒的反转录环... 桑脉带相关病毒Mulberry vein banding-associated virus (MVBaV)是广西桑树病毒病的主要病原病毒。本研究根据MVBaV基因组的核外壳蛋白(nucleocapsid protein, N)基因序列设计了5组引物,筛选获得了1组有效引物,建立了该病毒的反转录环介导等温扩增技术(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP)检测方法。该方法能在恒温条件(63℃)下1 h内检测MVBaV,其灵敏度是RT-PCR检测方法的10倍。对6个田间样品进行RT-LAMP检测,其结果与RT-PCR的结果一致。该方法可直接在反应管中加入SYBR GreenⅠ,通过颜色变化即可判定结果,无需经过琼脂糖电泳或专门仪器,具有灵敏、快速和特异性好的优点,可应用于MVBaV的快速诊断及其田间监测。 展开更多
关键词 桑脉带相关病毒 反转录环介导等温扩增技术 检测方法
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柑橘溃疡病菌LAMP实时浊度检测方法的建立及应用 被引量:3
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作者 封立平 孔德英 +3 位作者 孙涛 孙冬 纪瑛 王简 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期1153-1160,共8页
以柑橘溃疡病菌特异性高的假定蛋白基因(登录号:AE008923.1)为靶标,设计并筛选4条引物来特异性识别靶标序列中的6个独立区域,建立柑橘溃疡病菌LAMP实时浊度检测方法。该方法利用实时浊度仪检测反应过程中产生的焦磷酸镁白色沉淀,实现对L... 以柑橘溃疡病菌特异性高的假定蛋白基因(登录号:AE008923.1)为靶标,设计并筛选4条引物来特异性识别靶标序列中的6个独立区域,建立柑橘溃疡病菌LAMP实时浊度检测方法。该方法利用实时浊度仪检测反应过程中产生的焦磷酸镁白色沉淀,实现对LAMP整个反应过程的实时监控。从镁离子浓度、甜菜碱浓度、d NTPs浓度、引物浓度和反应温度5个变量参数对LAMP检测体系进行优化,并对方法的特异性、灵敏度、稳定性及实际样品检测效果进行评价。结果显示,该体系经优化后稳定性良好,可在66℃恒温条件下,60 min内完成检测;DNA检测下限可达0.02 ng/μL,灵敏度与荧光定量PCR方法相同,比常规PCR方法高1个数量级;能快速、准确地对田间疑似样品进行检测,与荧光定量PCR方法的检出情况一致,没有漏检。结果说明柑橘溃疡病菌实时浊度LAMP检测方法操作简便、所需时间短,特异性与灵敏度高,为柑橘溃疡病菌的快速筛查提供较好的途径。 展开更多
关键词 lamp实时浊度检测方法 柑橘溃疡病菌 检测
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使用环介导等温扩增(LAMP)技术快速检测鸡蛋中的沙门氏菌 被引量:2
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作者 李雪 唐善虎 +1 位作者 郝小倩 岑璐伽 《农产食品科技》 2012年第1期17-20,共4页
本次试验分别采用LAMP法、PCR和国标法对市场上销售的鸡蛋蛋壳及内容物进行沙门氏菌的检测。鸡蛋内容物及蛋壳样本经过增菌后,样液采用酚氯仿法提取细菌DNA,作为LAMP和PCR反应的模板。试验结果表明:LAMP和PCR的沙门氏菌检出率均高于... 本次试验分别采用LAMP法、PCR和国标法对市场上销售的鸡蛋蛋壳及内容物进行沙门氏菌的检测。鸡蛋内容物及蛋壳样本经过增菌后,样液采用酚氯仿法提取细菌DNA,作为LAMP和PCR反应的模板。试验结果表明:LAMP和PCR的沙门氏菌检出率均高于国标法,而LAMP法敏感性、特异性和符合率也均高于PCR法,因此,LAMP是一种快速、敏感和高度特异性的沙门氏菌检测方法,值得推广。在本研究中还发现,鸡蛋内容物检出沙门氏菌的鸡蛋样品中,大约有70%的鸡蛋在蛋壳上都能检出沙门氏菌。因此,沙门氏菌污染鸡蛋主要是由于外部原因引起的,为了减少沙门氏菌污染,建议企业做好蛋壳的消毒工作,加强生产、储存、运输和销售过程的管理。 展开更多
关键词 鸡蛋内容物 蛋壳 lamp PCR 国标法
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恙虫病东方体目视LAMP现场化检测方法的建立 被引量:6
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作者 陶志勇 UMAR Ibrahim +5 位作者 吕樵岚 刘韦萍 张培艺 靳小霞 方强 夏惠 《热带病与寄生虫学》 2021年第1期15-18,共4页
目的建立基于“染料-蜡丸”的目视LAMP检测恙螨中恙虫病东方体的方法,为恙虫病的防治提供新工具。方法选择Ot GroEL基因作为检测靶序列,在线设计并合成LAMP引物。构建r Ot-GroEL重组质粒作为阳性对照。建立基于SYBR Green I的“染料-蜡... 目的建立基于“染料-蜡丸”的目视LAMP检测恙螨中恙虫病东方体的方法,为恙虫病的防治提供新工具。方法选择Ot GroEL基因作为检测靶序列,在线设计并合成LAMP引物。构建r Ot-GroEL重组质粒作为阳性对照。建立基于SYBR Green I的“染料-蜡丸”目视LAMP,并联合便携式LAMP仪使其利于现场应用。结果新设计的引物针对Ot GroEL基因的237 bp靶区域,所构建的重组质粒r Ot-GroEL测序结果正确。在便携式LAMP仪上运用“染料-蜡丸”目视LAMP法,其检测下限为1×10^2拷贝质粒。结论成功建立了一种可与便携式LAMP仪联合使用的检测恙螨体内恙虫病东方体的“染料-蜡丸”目视LAMP法。 展开更多
关键词 恙虫病 恙虫病东方体 恙螨 检测方法 便携式lamp
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版纳病毒和芒市病毒可视化RT-LAMP检测方法的建立及应用
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作者 杨振兴 李卓然 +5 位作者 何于雯 李占鸿 李乐 廖德芳 杨恒 朱建波 《动物医学进展》 北大核心 2022年第6期6-12,共7页
为建立版纳病毒(BAV)和芒市病毒(MSV)的可视化RT-LAMP检测方法,根据我国分离的BAV(YNSZ043)和MSV(V301/YNJH/2019)毒株Seg-12基因的保守序列,分别设计2对特异性引物和1条环引物,通过反应条件优化,分别建立了2种病毒的可视化RT-LAMP检测... 为建立版纳病毒(BAV)和芒市病毒(MSV)的可视化RT-LAMP检测方法,根据我国分离的BAV(YNSZ043)和MSV(V301/YNJH/2019)毒株Seg-12基因的保守序列,分别设计2对特异性引物和1条环引物,通过反应条件优化,分别建立了2种病毒的可视化RT-LAMP检测方法,其最佳反应条件为64℃50 min,分别利用2种方法检测西藏环状病毒、流行性出血病病毒、蓝舌病病毒、中山病病毒、广西环状病毒和阿卡斑病毒等虫媒病毒的核酸样品,结果2种方法仅能分别检测出BAV和MSV,其他虫媒病毒均无非特异性扩增。灵敏度试验检出BAV和MSV的最低检测限制分别为13.7拷贝/μL和19.0拷贝/μL,敏感性是常规RT-PCR的10倍以上。应用2种病毒的RT-LAMP及RT-PCR方法分别对2596只蠓虫和蚊虫的核酸样品进行检测,结果阳性检出率均是RT-PCR的2倍以上。结果表明,建立的BAV和MSV可视化RT-LAMP检测方法具有特异性强、敏感性高和可视化等优点,为我国开展2种病毒的现场快速检测与流行病学研究提供了有效的技术支撑。 展开更多
关键词 版纳病毒 芒市病毒 反转录-环介等温扩增 可视化检测
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改良LAMP检测鸡肉中单增李斯特氏菌的研究 被引量:5
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作者 冯显显 杨倩 +5 位作者 张先舟 马晓燕 李英军 张伟 王建昌 陈启跃 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2018年第19期130-136,共7页
本研究建立一种改良环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术检测鸡肉中单增李斯特氏菌(Listeria monocytogenes,L. monocytogenes)的方法。针对单增李斯特氏菌的溶血素基因(hlyA)设计LAMP引物,对单增李斯特... 本研究建立一种改良环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术检测鸡肉中单增李斯特氏菌(Listeria monocytogenes,L. monocytogenes)的方法。针对单增李斯特氏菌的溶血素基因(hlyA)设计LAMP引物,对单增李斯特氏菌进行特异性检测,通过荧光曲线和肉眼观察荧光颜色来判定检测结果。试验结果表明:改良LAMP方法检测单增李斯特氏菌具有良好的特异性,7株单增李斯特氏菌呈阳性结果,24株非单增李斯特氏菌呈阴性结果。与聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)方法相比,改良LAMP方法具有灵敏度高(5.4×100 fg/μL)、检出限低(3.9×100 CFU/g)的特点,均是PCR结果的100倍。对66份鸡肉样品进行检测,得到改良LAMP方法的敏感性为100%,特异性为98.41%,符合率为98.48%。综上所述,改良LAMP方法能够快速、准确的检测单增李斯特氏菌,具有很好的应用前景。 展开更多
关键词 改良环介导等温扩增方法 单增李斯特氏菌 hlyA基因 检测 鸡肉
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LAMP法鸟类性别鉴定的研究与应用 被引量:7
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作者 李巍 杨卓 +5 位作者 陈明非 高东梅 刘佳 苍真伟 程淑晶 王德强 《现代畜牧兽医》 2017年第3期12-18,共7页
本研究利用鸡W染色体中EE0.6序列上的Eco R片段为靶序列,进行引物设计,建立了基于LAMP法的快速鸟类性别鉴定方法。试验表明,该引物可用于多属种鸟类的性别鉴定,在64℃条件下,60 min即可完成检测。同时利用实时浊度法和荧光目视法两种LAM... 本研究利用鸡W染色体中EE0.6序列上的Eco R片段为靶序列,进行引物设计,建立了基于LAMP法的快速鸟类性别鉴定方法。试验表明,该引物可用于多属种鸟类的性别鉴定,在64℃条件下,60 min即可完成检测。同时利用实时浊度法和荧光目视法两种LAMP检测法对体系进行了敏感性试验,并与PCR方法进行比较,实时浊度法与荧光目视法敏感性相近,是PCR方法的100倍。方法建立后,在大连老虎滩鸟语林进行了11目14科35种鸟类的性别鉴定临床试验,符合率为100%。 展开更多
关键词 lamp 鸟类 性别鉴定 实时浊度法 荧光目视法
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猪流行性腹泻病毒RT-LAMP快速检测方法的建立及应用 被引量:8
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作者 狄亚心 谭飞 +8 位作者 秦松跃 于晓丽 崔文 姜艳平 王丽 唐丽杰 周晗 王晓娜 乔薪瑗 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期832-837,共6页
为建立一种适用于现场快速检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)的环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法,本研究以PEDV N基因的保守序列为靶基因设计引物,优化并建立了基于RT-LAMP的PEDV快速检测方法。结果显示,RT-LAMP方法的最佳反应条件为:反应温度... 为建立一种适用于现场快速检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)的环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法,本研究以PEDV N基因的保守序列为靶基因设计引物,优化并建立了基于RT-LAMP的PEDV快速检测方法。结果显示,RT-LAMP方法的最佳反应条件为:反应温度为61℃,反应时间为50 min,Mg2+和dNTPs浓度分别为8.0 mmol/L和4.0 mmol/L,外引物和内引物最佳浓度比为1.4。特异性试验结果显示,该方法只能检测出PEDV,对其他病原检测均为阴性,具有良好的特异性;敏感性试验结果显示,该方法能够检测出的最低RNA浓度为6.52×10^(-5)mg/L,而常规RT-PCR能检测到最低浓度为6.52×10-3mg/L,表明RT-LAMP敏感性是RT-PCR的100倍;重复性试验结果显示,批内和批间重复性试验结果无明显差异,重复性较好。利用RT-LAMP和RT-PCR方法分别对3份已知阳性样品,5份已知阴性样品以及52份未知临床样品进行检测。阳性样品经RT-LAMP和RT-PCR方法均检测到PEDV,阴性样品均未检测到PEDV。52份临床样品中,RT-LAMP对PEDV检测阳性率为23.08%(12/52);RT-PCR检测阳性率为17.31%(9/52),二者的符合率为94.23%。以上结果表明,建立的RT-LAMP方法具有成本低、检测快、灵敏度高、特异性强等优点。且结果易于判定、便于现场检测,在病原检测方面具有良好的应用前景,为该病的流行病学调查及综合防制提供重要的实验依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 RT-lamp RT-PCR 诊断方法
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十足目虹彩病毒(DIV1)环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立及应用 被引量:6
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作者 邹莹 郭晓萌 +2 位作者 万晓媛 邱亮 张庆利 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2020年第6期156-164,共9页
本研究以十足目虹彩病毒(Decapod iridescent virus 1,DIV1)主要衣壳蛋白基因为靶序列设计引物,建立了DIV1的环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,并以pMD18-DIV1质粒标准品为模板对该方法的检测灵敏... 本研究以十足目虹彩病毒(Decapod iridescent virus 1,DIV1)主要衣壳蛋白基因为靶序列设计引物,建立了DIV1的环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,并以pMD18-DIV1质粒标准品为模板对该方法的检测灵敏度、检测特异性等进行了评估。结果显示,此方法最适反应温度为64.4℃,优化后的25μl反应体系中包含2.5μl 10×Isothermal amplification buffer、4.0 mmol/L Mg^2+、1.2 mmol/L dNTPs、6.4 U Bst 2.0 WarmStart■DNA聚合酶、0.8μmol/L EvaGreen■和4.4μl ddH2O。该方法检测灵敏度下限为3.54×10^2拷贝/反应;与虾肝肠胞虫(EHP)、致急性肝胰腺坏死病副溶血弧菌(VpAHPND)、对虾偷死野田村病毒(CMNV)、传染性皮下及造血组织坏死病病毒(IHHNV)、白斑综合征病毒(WSSV)、桃拉综合征病毒(TSV)和黄头病毒(YHV)等主要虾类病原没有交叉反应;具有较好的重复性和稳定性。以GeneFinder■替换EvaGreen■并将其预置于反应管内,结合上述扩增方法可实现对DIV1的现场快速高灵敏检测。本研究建立的DIV1-LAMP实时荧光定量和现场检测方法具有灵敏、特异和快速等特点,为近几年新发虾类病原DIV1的定性、定量以及现场快速检测提供了新的技术选择,有利于对虾养殖业中开展DIV1的监测、预警和防控。 展开更多
关键词 十足目虹彩病毒(DIV1) 虾血细胞虹彩病毒(SHIV) 环介导等温扩增(lamp) 检测方法
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LAMP法在水牛早期胚胎性别鉴定中的应用 被引量:7
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作者 潘宏 段亚萍 +3 位作者 李敏玲 陈富美 付强 张明 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1106-1110,共5页
【目的】建立LAMP法快速鉴定水牛早期胚胎性别体系,为预知性别水牛胚胎移植奠定基础。【方法】分别采用化学裂解法和非化学裂解法提取水牛早期胚胎DNA,对比不同方法对G3PDH基因扩增效果的影响;基于水牛SRY基因和12S r RNA基因分别设计... 【目的】建立LAMP法快速鉴定水牛早期胚胎性别体系,为预知性别水牛胚胎移植奠定基础。【方法】分别采用化学裂解法和非化学裂解法提取水牛早期胚胎DNA,对比不同方法对G3PDH基因扩增效果的影响;基于水牛SRY基因和12S r RNA基因分别设计雄性特异性引物及雌、雄性共用引物用于LAMP法胚胎性别鉴定,同时以PCR对LAMP法鉴定结果进行验证。【结果】化学裂解法对水牛早期胚胎DNA具有良好的裂解效果,其有效检出率为94.1%。优化的LAMP法对水牛早期胚胎性别鉴定的准确率与检出率均为100.0%,检测灵敏度为2×10-5 ng。LAMP扩增产物中加入1%SYBR green I,于紫外光下观察,阳性呈绿色,阴性呈淡黄色;自然光下观察,阳性呈黄色,阴性呈橙色。以LAMP法对37枚水牛IVF早期胚胎性别进行鉴定,其中雄性为28枚,雌性为9枚。PCR验证结果与LAMP法鉴定结果一致。【结论】用化学裂解法提取水牛早期胚胎DNA,再根据水牛SRY基因及12S r RNA基因设计引物进行LAMP法水牛胚胎性别鉴定切实可行。 展开更多
关键词 水牛 早期胚胎 性别鉴定 lamp 化学裂解
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玉米根腐病菌麦根腐平脐蠕孢的LAMP检测方法
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作者 刘树森 郭宁 +3 位作者 孙华 马红霞 张海剑 石洁 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期162-167,共6页
麦根腐平脐蠕孢是玉米根腐病的重要病原菌之一,旨为建立一种基于环介导等温扩增技术(LAMP)的麦根腐平脐蠕孢快速检测方法。首先,根据麦根腐平脐蠕孢参与黑色素生物合成途径的Brn1基因部分序列设计了一套LAMP检测引物;然后,针对该引物组... 麦根腐平脐蠕孢是玉米根腐病的重要病原菌之一,旨为建立一种基于环介导等温扩增技术(LAMP)的麦根腐平脐蠕孢快速检测方法。首先,根据麦根腐平脐蠕孢参与黑色素生物合成途径的Brn1基因部分序列设计了一套LAMP检测引物;然后,针对该引物组筛选了其最佳反应温度,检测了LAMP反应的特异性和灵敏度,并以人工接种麦根腐平脐蠕孢的玉米根腐病病株为样本评价了LAMP检测方法的效果。结果表明,本研究设计的引物组在61~68℃条件下均能实现对靶标基因的扩增,其中以66℃为最佳反应温度;在特异性检测中,引物组能从10种分离自玉米根腐病样本的主要病原真菌DNA中特异性地检测出麦根腐平脐蠕孢;在灵敏度检测中,对携带靶基因Brn1的质粒DNA最低检测限是10 copies/μL,在此检测限浓度下,25 min左右即可实现扩增;在对玉米根腐病样本检测中,在1 pg/μL的玉米根组织DNA中即可检测出麦根腐平脐蠕孢。建立的麦根腐平脐蠕孢LAMP检测方法具有较强的特异性和较高的灵敏度。 展开更多
关键词 玉米根腐病 麦根腐平脐蠕孢 Brn1基因 环介导等温扩增 检测方法
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环介导等温可视扩增(LAMP)检测禽肺炎病毒方法的建立 被引量:4
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作者 谢志勤 谢芝勋 +5 位作者 邓显文 谢丽基 庞耀珊 刘加波 范晴 罗思思 《中国动物检疫》 CAS 2013年第3期48-51,共4页
建立一种快速简单检测禽肺炎病毒的方法。根据已发表的禽肺炎病毒的F基因序列,设计并合成6条特异扩增禽肺炎病毒F基因片段的引物,通过条件优化,成功建立了针对禽肺炎病毒的环介导等温扩增(LAMP)检测法,测定其特异性和敏感性,并对采集的... 建立一种快速简单检测禽肺炎病毒的方法。根据已发表的禽肺炎病毒的F基因序列,设计并合成6条特异扩增禽肺炎病毒F基因片段的引物,通过条件优化,成功建立了针对禽肺炎病毒的环介导等温扩增(LAMP)检测法,测定其特异性和敏感性,并对采集的禽临床样品的DNA分别进行了检测。结果表明该法只检出禽肺炎病毒;敏感性扩增结果表明,Lamp检测禽肺炎病毒为100fg的RNA模板。该LAMP方法有简便、快速和特异性高的优点,可用于临床上对禽肺炎病毒的快速检测。 展开更多
关键词 禽肺炎病毒 环介导等温扩增(lamp) 检测
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