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量子动力学框架在Lennard-Jones团簇结构优化中的应用
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作者 王旭 王鹏 吕林桃 《成都信息工程大学学报》 2024年第1期56-60,共5页
Lennad-Jones团簇结构优化是在物理化学和材料科学领域经常遇到的优化问题,由于原子之间的相互作用具有高度的复杂性,因此常用来检验算法性能。量子动力学是一种具有完整数学框架且非常有效的理论模型,量子动力学框架(QDF)已经被证明在... Lennad-Jones团簇结构优化是在物理化学和材料科学领域经常遇到的优化问题,由于原子之间的相互作用具有高度的复杂性,因此常用来检验算法性能。量子动力学是一种具有完整数学框架且非常有效的理论模型,量子动力学框架(QDF)已经被证明在复杂问题中具有很强的竞争力。在不引入任何先验知识的基础下,使用QDF在Lennard-Jones团簇结构优化问题中进行求解,探讨QDF在具有高度复杂的解空间的团簇问题中的性能。将QDF与差分进化算法、骨架烟花算法进行对比,比较最低能量、能量分布和时间精度等。实验结果表明,在Lennard-Jones团簇结构优化问题中,可接受时间内QDF取得优于其他两种算法的最低能量。QDF是一种具有潜力的解决框架。 展开更多
关键词 量子动力学 量子动力学框架 lennard-jones团簇 全局优化 优化算法
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关于Lennard-Jones型势函数参数的几种拟合方法 被引量:3
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作者 刘艳侠 孙佳佳 +2 位作者 高岩 顾慧 刘磊 《辽宁大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第3期206-209,共4页
采用三种方法分别对Fe-C、Cr-C、V-C、Ni-C 4种双原子团簇的Lennard-Jones势函数中的参数进行了拟合,即解方程方法,作图法和最小二乘法.其中,作图法简单易行,但可能会损失一些精度;最小二乘法和作图法均适用于原子间距范围较大的情况.... 采用三种方法分别对Fe-C、Cr-C、V-C、Ni-C 4种双原子团簇的Lennard-Jones势函数中的参数进行了拟合,即解方程方法,作图法和最小二乘法.其中,作图法简单易行,但可能会损失一些精度;最小二乘法和作图法均适用于原子间距范围较大的情况.而解方程求参数的方法更适合于研究平衡态下的性能. 展开更多
关键词 Lennard—jones 参数拟合 双原子团簇
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Prediction of the lowest energy configuration for Lennard-Jones clusters 被引量:1
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作者 LAI XiangJing XU RuChu HUANG WenQi 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2011年第6期985-991,共7页
Based on the work of previous researchers, a new unbiased optimization algorithm—the dynamic lattice searching method with two-phase local search and interior operation (DLS-TPIO)—is proposed in this paper. This alg... Based on the work of previous researchers, a new unbiased optimization algorithm—the dynamic lattice searching method with two-phase local search and interior operation (DLS-TPIO)—is proposed in this paper. This algorithm is applied to the optimization of Lennard-Jones (LJ) clusters with N=2–650, 660, and 665–680. For each case, the putative global minimum reported in the Cambridge Cluster Database (CCD) is successfully found. Furthermore, for LJ533 and LJ536, the potential energies obtained in this study are superior to the previous best results. In DLS-TPIO, a combination of the interior operation, two-phase local search method and dynamic lattice searching method is adopted. At the initial stage of the optimization, the interior operation reduces the energy of the cluster, and gradually makes the configuration ordered by moving some surface atoms with high potential energy to the interior of the cluster. Meanwhile, the two-phase local search method guides the search to the more promising region of the configuration space. In this way the success rate of the algorithm is significantly increased. At the final stage of the optimization, in order to decrease energy of the cluster further, the positions of surface atoms are further optimized by using the dynamic lattice searching method. In addition, a simple new method to identify the central atom of icosahedral configurations is also presented. DLS-TPIO has higher computing speed and success rates than some well-known unbiased optimization methods in the literature. 展开更多
关键词 能量配置 优化算法 搜索方法 预测 团簇 中心原子 DLS C650
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Lennard-Jones团簇最低能量构型的预测 被引量:3
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作者 赖向京 许如初 黄文奇 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1137-1144,共8页
针对Lennard-Jones(LJ)团簇的结构优化问题,在前人工作的基础上,提出了一个新的无偏优化算法,即DLS-TPIO(dynamic lattice searching method with two-phase local searchand interior operation)算法.对LJ2-650,LJ660,LJ665-680这666... 针对Lennard-Jones(LJ)团簇的结构优化问题,在前人工作的基础上,提出了一个新的无偏优化算法,即DLS-TPIO(dynamic lattice searching method with two-phase local searchand interior operation)算法.对LJ2-650,LJ660,LJ665-680这666个实例进行了优化计算.为其中每个实例所找到的构型其势能均达到了剑桥团簇数据库中公布的最好记录.对LJ533与LJ536这两个算例,所达到的势能则优于先前的最好记录.在DLS-TPIO算法中,采用了内部操作,两阶段局部搜索方法以及动态格点搜索方法.在优化的前一阶段,内部操作将若干能量较高的表面原子移入团簇的内部,从而降低团簇的能量,并使其构型逐渐地变为有序.与此同时,两阶段局部搜索方法指导搜索进入更有希望的构型区域.这种做法显著地提高了算法的成功率.在优化的后一阶段,借用动态格点搜索方法对团簇表面原子的位置作进一步优化,以再一次降低团簇的能量.另外,为识别二十面体构型的中心原子,本文给出了一个简单的新方法.相比于文献中一些著名的无偏优化算法,DLS-TPIO算法具有较高的计算速度与成功率. 展开更多
关键词 全局优化 lennard-jones团簇 内部操作 两阶段局部搜索 动态格点搜索
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模拟退火算法的一种改进及其应用研究 被引量:22
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作者 赵晶 唐焕文 朱训芝 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期775-780,共6页
针对连续函数全局优化问题提出了改进的模拟退火算法:采用新的解扰动策略,并将局部极小化过程引入模拟退火算法.数值试验证实了该算法的可行性及有效性.作为该方法的应用,计算了著名的L ennard-Jones簇问题,通过比较说明新方法可以提高... 针对连续函数全局优化问题提出了改进的模拟退火算法:采用新的解扰动策略,并将局部极小化过程引入模拟退火算法.数值试验证实了该算法的可行性及有效性.作为该方法的应用,计算了著名的L ennard-Jones簇问题,通过比较说明新方法可以提高精度及成功率;此外对脑啡肽的空间结构进行了预测,也得到了较好的结果. 展开更多
关键词 最优化方法 模拟退火算法 lennard-jones簇问题 蛋白质结构预测
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钯团簇形成和增长机理的Monte Carlo研究 被引量:7
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作者 郭向云 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第2期174-176,共3页
利用MonteCarlo(MC)方法和Lennard-Jones加Axilord-Teller(LJ+AT)势能函数,研究了气相中钯团簇的形成过程和增长机理.发现具有二十面体结构的Pd13团簇可以在气相中自发形成,较大的团簇通过在Pd13二十面体结构的表面添加原子组成四面体... 利用MonteCarlo(MC)方法和Lennard-Jones加Axilord-Teller(LJ+AT)势能函数,研究了气相中钯团簇的形成过程和增长机理.发现具有二十面体结构的Pd13团簇可以在气相中自发形成,较大的团簇通过在Pd13二十面体结构的表面添加原子组成四面体的方式形成.通过分析团簇结构和能量之间的关系,发现除了Pd13和Pd55以外,Pd19和Pd39团簇也具有五次对称性,都是比较稳定的结构. 展开更多
关键词 MonteCarlo方法 Axilord-Teller势函数 钯团簇 二十面体
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基于盆地跳和极小值跳算法的兰纳-琼斯簇全局优化对比研究
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作者 姚成 姚懿 +1 位作者 何山 赵晋陵 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期373-378,共6页
为探索寻找经典模型兰纳-琼斯簇的全局最优构型的更优算法,选取盆地跳和极小值跳算法,计算了13粒子、38粒子以及60粒子的兰纳-琼斯簇最优构型.结果表明:这两种算法都可以成功找到最优构型,其中极小值跳方法相比较而言有较快的搜索速度,... 为探索寻找经典模型兰纳-琼斯簇的全局最优构型的更优算法,选取盆地跳和极小值跳算法,计算了13粒子、38粒子以及60粒子的兰纳-琼斯簇最优构型.结果表明:这两种算法都可以成功找到最优构型,其中极小值跳方法相比较而言有较快的搜索速度,它的搜索步数约比盆地跳算法少至少一个数量级. 展开更多
关键词 全局最优化 盆地跳算法 极小值跳算法 兰纳-琼斯簇
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改进的模拟退火算法在L—J问题中的应用
8
作者 赵晶 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第2期18-20,共3页
针对高维连续函数的全局优化问题,笔者将两种确定性局部极小化过程分别引入到模拟退火算法当中,并将该算法应用到Lennard—Jones簇问题中.通过结果比较说明该算法可以提高计算的精度和成功率,并且Hooke—Jeaves方法在处理复杂的函... 针对高维连续函数的全局优化问题,笔者将两种确定性局部极小化过程分别引入到模拟退火算法当中,并将该算法应用到Lennard—Jones簇问题中.通过结果比较说明该算法可以提高计算的精度和成功率,并且Hooke—Jeaves方法在处理复杂的函数问题时比单纯形法有效. 展开更多
关键词 模拟退火算法 全局优化 局部极小化 Lennard—jones簇问题
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基于改进粒子群优化算法的氩原子团簇结构优化 被引量:1
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作者 曾思琴 叶美盈 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期52-58,共7页
采用改进粒子群优化算法(IPSO)结合Lennard-Jones势对氩原子团簇结构进行优化,得到了氩原子团簇的稳态结构能量.以氩原子团簇Ar_n(n=2~14)为例,验证了该方法的有效性.结果表明,应用本文提出的方法可得到对称性良好的团簇结构.与基本粒... 采用改进粒子群优化算法(IPSO)结合Lennard-Jones势对氩原子团簇结构进行优化,得到了氩原子团簇的稳态结构能量.以氩原子团簇Ar_n(n=2~14)为例,验证了该方法的有效性.结果表明,应用本文提出的方法可得到对称性良好的团簇结构.与基本粒子群优化算法(BPSO)及遗传算法(GA)相比,改进粒子群优化算法具有更好的收敛特性,能较快地得到氩原子团簇结构的最优解. 展开更多
关键词 氩原子团簇 团簇结构 粒子群优化算法 Lennard—jones
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动态格点搜索的改进算法用于团簇结构快速优化 被引量:1
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作者 吴夏 程文 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期917-920,共4页
结合高效的动态格点搜索(DLS)算法与扰动操作(Perturbation Operation)提出一种新的改进方法(DLS-PO),用于确定团簇的最低能量结构。针对一个特定构型,DLS算法总能给出其对应搜索空间的最规则结构。然而,一次失败的DLS优化将消耗大量的... 结合高效的动态格点搜索(DLS)算法与扰动操作(Perturbation Operation)提出一种新的改进方法(DLS-PO),用于确定团簇的最低能量结构。针对一个特定构型,DLS算法总能给出其对应搜索空间的最规则结构。然而,一次失败的DLS优化将消耗大量的运算资源。为此,采取原子移动和结构旋转的扰动操作成功地改变了构型,再结合后续的DLS操作,提高了优化效率。将该算法用于原子数高达309的Lennard-Jones团簇及100原子NP-B函数铝团簇的结构优化。优化结果显示相比于DLS算法,DLS-PO算法更为高效。 展开更多
关键词 全局优化 lennard-jones团簇 铝团簇 动态格点搜索 免疫优化算法
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蜘蛛香HPLC指纹图谱及化学模式识别研究 被引量:12
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作者 程盛勇 付洋 +4 位作者 郁林娜 尹航 刘兴赋 罗喜荣 杨军 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期489-493,共5页
目的建立蜘蛛香HPLC指纹图谱,为其质量控制提供科学依据。方法采用■ C_(18)色谱柱(4.6 mm×250mm,5μm),乙腈(A)-0.1%甲酸水溶液(B)为流动相梯度洗脱,检测波长为327 nm(0~33 min)、256 nm(33~90 min),体积流量为1.0 m L·min... 目的建立蜘蛛香HPLC指纹图谱,为其质量控制提供科学依据。方法采用■ C_(18)色谱柱(4.6 mm×250mm,5μm),乙腈(A)-0.1%甲酸水溶液(B)为流动相梯度洗脱,检测波长为327 nm(0~33 min)、256 nm(33~90 min),体积流量为1.0 m L·min^(-1),柱温为30℃。通过相似度评价、聚类分析(HCA)、主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)对25批蜘蛛香指纹图谱进行分析。结果建立了25批蜘蛛香HPLC指纹图谱,标定了36个共有峰,指认了9个共有峰,其中18批样品相似度大于0.9,所有样品可分成2类,发现缬草三酯、乙酰缬草三酯、异绿原酸A等6个差异较大的成分。结论HPLC指纹图谱结合化学模式识别能较好地反映蜘蛛香的整体质量,可为蜘蛛香质量控制和评价提供参考。 展开更多
关键词 蜘蛛香 指纹图谱 波长切换 聚类分析 主成分分析 偏最小二乘判别分析 化学模式识别
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