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Cloning and Bioinformatics Analysis of Lfcin Gene of Datong Yak 被引量:2
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作者 裴杰 阎萍 +6 位作者 姬国红 冯瑞林 梁春年 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 褚敏 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第3期50-54,共5页
[Objective] This study was to clone Lfcin gene from Datong yak, so as to provide reference for applying this gene in feed industry and breeding industry. [Method] Using PCR technology, the lactoferricin(Lfcin)-encodin... [Objective] This study was to clone Lfcin gene from Datong yak, so as to provide reference for applying this gene in feed industry and breeding industry. [Method] Using PCR technology, the lactoferricin(Lfcin)-encoding gene was obtained from genome of Datong yak; then it was cloned into pGEM-T easy vector, and then sequenced; the sequencing results were subsequently aligned with the sequences of dairy cow accessed in GenBank. Moreover, amino acid sequences of Lfcin gene from various species including yak, dairy cow, human and mouse were used for sequence alignment and phylogenesis analysis. [Result] The second exon of lactoferrin(LF) from Datong yak, which is 778 bp in length, was obtained, within which the coding region of Lfcin gene is 75 bp (25 amino acid residues); sequence analysis showed that there is discrepancy of eleven bases between Datong yak and dairy cow; Lfcin proteins from various species shared high homeology, of which that from Datong yak and dairy cow were completely identical; phylogenesis analysis showed that cladogram based on Lfcin was consistent with species evolutionary law. [Conclusion] This study laid a foundation for the prokaryotic or eukaryotic expression of Lfcin gene and further understanding the activity of Lfcin protein. 展开更多
关键词 YAK lfcin gene CLONE BIOINFORMATICS
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天祝白牦牛Lfcin基因克隆及生物信息学分析 被引量:2
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作者 裴杰 阎萍 +4 位作者 姬国红 梁春年 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-6,共6页
利用PCR技术从天祝白牦牛基因组DNA中获得乳铁蛋白素(Lactoferricin,Lfcin)基因序列,将Lfcin基因连接于pGEM-T easy载体进行测序后,与奶牛的Lfcin基因序列进行比对;对牦牛、奶牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋白序列进行比对和进化树分析.... 利用PCR技术从天祝白牦牛基因组DNA中获得乳铁蛋白素(Lactoferricin,Lfcin)基因序列,将Lfcin基因连接于pGEM-T easy载体进行测序后,与奶牛的Lfcin基因序列进行比对;对牦牛、奶牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋白序列进行比对和进化树分析.结果表明:克隆获得了含天祝白牦牛乳铁蛋白第二外显子的DNA序列,共778 bp,其中Lfcin基因编码区长75 bp,编码25个氨基酸;序列分析显示,克隆获得的牦牛DNA序列与奶牛该序列存在9个碱基的变异,其中Lfcin基因编码区内有1个变异,为同义突变;牦牛和奶牛的Lfcin蛋白质序列完全相同,各物种Lfcin蛋白具有较高的同源性. 展开更多
关键词 牦牛 L fcin基因 克隆 生物信息学
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新疆巴州牦牛Lfcin基因的克隆与分子特征 被引量:1
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作者 裴杰 阎萍 +6 位作者 冯瑞林 梁春年 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 朱新书 褚敏 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第5期50-54,共5页
利用PCR技术首次从新疆巴州牦牛基因组DNA中扩增获得了乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)基因exon 2编码区,其中含有乳铁蛋白素(Lactoferricin,Lfcin)基因编码区序列;利用在线生物软件对Lfcin蛋白的结构进行预测。结果表明:克隆获得了含新疆巴... 利用PCR技术首次从新疆巴州牦牛基因组DNA中扩增获得了乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)基因exon 2编码区,其中含有乳铁蛋白素(Lactoferricin,Lfcin)基因编码区序列;利用在线生物软件对Lfcin蛋白的结构进行预测。结果表明:克隆获得了含新疆巴州牦牛LF基因exon 2的DNA序列(GenBank:EU547256),共778 bp,其中LF基因exon 2编码区长165 bp,Lfcin基因编码区长75 bp;序列分析显示,克隆获得的牦牛DNA序列与奶牛该序列存在11个碱基的变异;牦牛和奶牛的Lfcin蛋白质序列完全相同,各物种Lfcin蛋白具有较高的同源性;各物种的Lfcin蛋白进化树符合物种进化规律;同源建模预测的Lfcin 3D模型显示,Lfcin为一段由α-螺旋和β-折叠组成的"U型"结构。首次从新疆巴州牦牛品种中克隆获得Lfcin基因编码区全长序列并揭示了其分子特征,为牦牛Lfcin蛋白基因工程和蛋白质功能方面的研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 牦牛 lfcin基因 克隆 序列分析
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“大通牦牛”Lfcin基因克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 裴杰 阎萍 +6 位作者 冯瑞林 梁春年 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 朱新书 褚敏 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第18期8380-8382,8395,共4页
[目的]克隆"大通牦牛"Lfcin基因,为将该基因应用于饲料工业和养殖业提供依据。[方法]利用PCR技术从"大通牦牛"基因组DNA中获得乳铁蛋白素(Lactoferricin,Lfcin)基因序列;将Lfcin基因连接于pGEM-T easy载体,送至生... [目的]克隆"大通牦牛"Lfcin基因,为将该基因应用于饲料工业和养殖业提供依据。[方法]利用PCR技术从"大通牦牛"基因组DNA中获得乳铁蛋白素(Lactoferricin,Lfcin)基因序列;将Lfcin基因连接于pGEM-T easy载体,送至生物公司测序;将"大通牦牛"与奶牛的Lfcin基因序列进行比对;同时,对牦牛、奶牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋白进行序列分析和进化树分析。[结果]克隆获得了含"大通牦牛"LF(Lactoferrin)第二外显子的DNA序列,共778 bp,其中Lfcin基因编码区长75 bp,编码25个氨基酸;序列分析显示,克隆获得的牦牛DNA序列与奶牛该序列存在11个碱基的变异;牦牛和奶牛的Lfcin蛋白质序列完全相同,各物种Lfcin蛋白具有较高的同源性;进化树分析表明Lfcin进化树符合物种进化规律。[结论]该研究为Lfcin基因在原核或真核细胞中的表达研究以及进一步研究Lfcin蛋白的生活活性奠定了基础。 展开更多
关键词 牦牛 lfcin基因 克隆 生物信息学
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甘南牦牛Lfcin基因克隆及序列分析
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作者 裴杰 阎萍 +5 位作者 厍睿 马瑞林 梁春年 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2008年第12期10-12,共3页
利用PCR技术从甘南牦牛基因组DNA中扩增获得了含乳铁蛋白素(lactoferricin,Lfcin)基因的DNA序列,将该DNA序列连接于pGEM-Teasy载体并测序,将甘南牦牛含Lfcin基因的DNA序列与奶牛相应序列进行比对,同时对牦牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋... 利用PCR技术从甘南牦牛基因组DNA中扩增获得了含乳铁蛋白素(lactoferricin,Lfcin)基因的DNA序列,将该DNA序列连接于pGEM-Teasy载体并测序,将甘南牦牛含Lfcin基因的DNA序列与奶牛相应序列进行比对,同时对牦牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋白进行序列分析和进化树分析。结果:试验首次克隆获得了含甘南牦牛乳铁蛋白(lactoferrin,LF)第二外显子的DNA序列(在Gen-Bank中获得登陆号EU247256),共778 bp,其中LF基因第二外显子长165 bp,编码55个氨基酸,Lf-cin蛋白占25个氨基酸;序列分析结果显示,克隆获得的牦牛DNA序列与奶牛相应序列存在3个碱基的变异;牦牛和奶牛的Lfcin蛋白质序列完全相同;各物种Lfcin蛋白具有较高的同源性,Lfcin蛋白进化树符合物种进化规律。 展开更多
关键词 牦牛 lfcin基因 克隆 序列分析
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高原牦牛乳铁蛋白素基因克隆及序列分析 被引量:2
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作者 裴杰 阎萍 +5 位作者 姬国红 冯瑞林 梁春年 郭宪 曾玉峰 包鹏甲 《中国畜牧兽医》 CAS 2008年第4期37-41,共5页
利用PCR技术从高原牦牛基因组DNA中获得了乳铁蛋白素(lactoferricin,Lfcin)基因序列;将Lfcin基因连接于pGEM-T easy载体,送至生物公司测序;将高原牦牛与奶牛的Lfcin基因序列进行比对;同时,对牦牛、奶牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋白序列... 利用PCR技术从高原牦牛基因组DNA中获得了乳铁蛋白素(lactoferricin,Lfcin)基因序列;将Lfcin基因连接于pGEM-T easy载体,送至生物公司测序;将高原牦牛与奶牛的Lfcin基因序列进行比对;同时,对牦牛、奶牛、人、小鼠等物种的Lfcin蛋白序列进行分析。结果表明:克隆获得了含高原环湖牦牛LF(lactoferrin)第2外显子的DNA序列,共778 bp,其中Lfcin基因编码区长75 bp,编码25个氨基酸;序列分析显示,克隆获得的牦牛DNA序列与奶牛这一序列存在9个碱基的变异;牦牛和奶牛的Lfcin蛋白质序列完全相同,各物种Lfcin蛋白具有较高的同源性。 展开更多
关键词 牦牛 乳铁蛋白素基因 克隆
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杂合肽基因的合成及在大肠杆菌中的表达 被引量:1
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作者 高鹏 冯兴军 +1 位作者 毕重朋 单安山 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期99-103,共5页
将LfcinB15-Ma12杂合肽基因克隆到载体pET32a上,构建抗菌肽LfcinB15-Ma12杂合肽基因,并在大肠杆菌中表达融合蛋白。根据已报道的抗菌肽LfcinB和Magainin基因的氨基酸序列,推导出其cDNA序列,将两者连接为杂合基因并克隆到载体pET32a上,I... 将LfcinB15-Ma12杂合肽基因克隆到载体pET32a上,构建抗菌肽LfcinB15-Ma12杂合肽基因,并在大肠杆菌中表达融合蛋白。根据已报道的抗菌肽LfcinB和Magainin基因的氨基酸序列,推导出其cDNA序列,将两者连接为杂合基因并克隆到载体pET32a上,IPTG诱导表达。构建了LfcinB15-Ma12杂合肽基因重组质粒,经PCR扩增和DNA测序分析,成功构建了LfcinB15-Ma12杂合肽基因重组质粒,经IPTG诱导,成功表达了杂合肽LfcinB15-Ma12。这为利用基因工程表达其他抗菌肽奠定了基础。 展开更多
关键词 lfcin B MAGAININ 杂合肽基因 表达
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