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LogP模型的改进与FFT算法的优化设计 被引量:7
1
作者 李晓峰 寿标 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 1996年第6期438-444,共7页
作为大规模并行机上的并行计算模型,LogP为我们提供了独立于具体系统的算法设计依据。虽然它可以精确地调度通信与计算,但却陷入了繁杂的细节设计,导致实际结果和设计期望相去甚远。我们从算法设计和模型概括两方面对它进行了改... 作为大规模并行机上的并行计算模型,LogP为我们提供了独立于具体系统的算法设计依据。虽然它可以精确地调度通信与计算,但却陷入了繁杂的细节设计,导致实际结果和设计期望相去甚远。我们从算法设计和模型概括两方面对它进行了改进,将路障同步和长消息引入LogP模型,既更好地发挥了并行机的效率,又使得实际结果接近设计期望。 展开更多
关键词 并行计算机 logp模型 FFT算法 优化设计
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机群系统LogP通信模型的测试与分析 被引量:1
2
作者 朱子玉 都志辉 李三立 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2002年第8期907-912,共6页
本文形式化描述并发展了通信 Microbenchmark技术 .并在这种技术的基础上 ,比较系统地测试了机群系统上四种并行通信系统—— GM- API、基于 10 0 M以太网的 MPICH、基于 Myrinet网络的 MPICH和 GM- MPI——的表征通信性能的 L og P参... 本文形式化描述并发展了通信 Microbenchmark技术 .并在这种技术的基础上 ,比较系统地测试了机群系统上四种并行通信系统—— GM- API、基于 10 0 M以太网的 MPICH、基于 Myrinet网络的 MPICH和 GM- MPI——的表征通信性能的 L og P参数 ,并通过比较 ,得出四种并行通信系统特点和优劣关系 .最后 ,给出了各个通信系统对不同的并行应用的适用情况 . 展开更多
关键词 机群系统 logp 通信模型 测试 分析 计算机网络 通信延迟
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HPLC法测定联苯双酯衍生物的logP及其与体内降酶活性的关系 被引量:2
3
作者 曾昭钧 罗虹 +3 位作者 钮旭升 杨璇 岳洪义 郑建民 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2002年第1期20-22,共3页
目的研究联苯双酯衍生物的疏水参数logP与体内降酶活性之间的关系。 方法用HPLC法测定联苯双酯衍生物的疏水参数logP。 结果建立了logP与体内降酶活性的定量相关模型。 结论logP与体内降酶活性存在一定相关性 ,并也与其他理化参数有关。
关键词 联苯双酯衍生物 HPLC法 定量构效关系 logp 体内降酶活性
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LogP简化模型参数估计
4
作者 刘辉 戴波 +1 位作者 张艳 张文彬 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第2期229-232,共4页
针对LogP微观通信模型涉及参数较多,其算法分析较复杂;而简化的LogP模型把两台处理机传送长度为N的消息的所需时间分为:与数据量无关和与数据量相关两部分,从而大大简化了算法分析。通过模拟简化的LogP模型的参数,并在LogP环境下对单机... 针对LogP微观通信模型涉及参数较多,其算法分析较复杂;而简化的LogP模型把两台处理机传送长度为N的消息的所需时间分为:与数据量无关和与数据量相关两部分,从而大大简化了算法分析。通过模拟简化的LogP模型的参数,并在LogP环境下对单机和多机分别进行测试,利用测试数据分析网络延迟和软件开销,得出经验公式,从而证明该模型可以正确而有效简化并行算法的设计和分析。 展开更多
关键词 简化的logp模型 参数模拟 经验公式 网络通信
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基于LogP简化模型的矩阵求逆并行算法研究
5
作者 曾庆华 孙世新 陈天麒 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2003年第8期176-177,184,共3页
LogP is becoming a practical parallel computation model that meets the demanding of parallel computersand parallel algorithms. So it is important to re-design parallel algorithms on the LogP model. This paper studies ... LogP is becoming a practical parallel computation model that meets the demanding of parallel computersand parallel algorithms. So it is important to re-design parallel algorithms on the LogP model. This paper studies theparallel algorithm of computing converse matrix on the simplified LogP model, and gets the simulating results. 展开更多
关键词 矩阵求逆 并行算法 logp简化模型 串行算法 并行处理系统
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基于LogP模型的MPI广播算法的性能分析与评价 被引量:1
6
作者 张凌晓 唐存东 《华北水利水电学院学报》 2008年第1期92-95,共4页
LogP模型是描述并行系统的有效模型,广播是MPI并行编程中常用的通信类型.基于LogP模型,对常用的4种广播算法进行了理论分析,得出了各自的执行时间或上下界,从而有效地区分出了各个算法的利弊及最适合的并行计算环境.该分析具有通用性,... LogP模型是描述并行系统的有效模型,广播是MPI并行编程中常用的通信类型.基于LogP模型,对常用的4种广播算法进行了理论分析,得出了各自的执行时间或上下界,从而有效地区分出了各个算法的利弊及最适合的并行计算环境.该分析具有通用性,同样可以用于MPI其他通信类型算法的分析、选择与设计. 展开更多
关键词 logp模型 MPI广播算法 分析与评价
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基于主动消息与LogP模型的并行程序设计
7
作者 李晓峰 寿标 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 1996年第6期428-432,共5页
主动消息(activemessage)将通信和计算集成为一体,是一种相当有效和高适应性的通信体系结构。LogP模型是一种面向实际的并行算法设计模型,较好地反映了当前MPP的关键性能参数。本文讨论了它的特点,在此基础上... 主动消息(activemessage)将通信和计算集成为一体,是一种相当有效和高适应性的通信体系结构。LogP模型是一种面向实际的并行算法设计模型,较好地反映了当前MPP的关键性能参数。本文讨论了它的特点,在此基础上着重分析了它在并行程序设计上的互补性。我们认为,依据LogP模型设计算法,用主动消息处理通信。 展开更多
关键词 主动消息 logp模型 并行程序 程序设计
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基于LogP模型的并行计算模拟器
8
作者 乔香珍 杨晔 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 1997年第9期641-645,共5页
本文简述了常用的一些并行计算模型,并重点讨论了LogP模型,提出了一个基于LogP模型的并行计算模拟器.叙述了它的功能、原理、结构、实现和实算测试结果.
关键词 可扩展性 logp模型 并行计算模拟器
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LogP模型上一类蝶式计算的通信策略
9
作者 陈国良 许锦波 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 1997年第8期695-701,共7页
本文研究LogP模型上一类蝶式计算中的通信问题.以FFT的并行计算为例,通过仔细安排消息的发送顺序,使得由有限带宽引起的延迟与局部计算重叠,在g-logg+1≤logp(p为处理器数,g为带宽因子)的条件下,只要输入... 本文研究LogP模型上一类蝶式计算中的通信问题.以FFT的并行计算为例,通过仔细安排消息的发送顺序,使得由有限带宽引起的延迟与局部计算重叠,在g-logg+1≤logp(p为处理器数,g为带宽因子)的条件下,只要输入长度n满足最基本的要求(n≥2p2),g便被完全隐含于局部计算中,算法时间复杂度可达到最优.最后与文献[1]的结果比较,分析了它们的优缺点及各自的适用范围. 展开更多
关键词 蝶式计算 logp模型 通信 算法
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PRAM,BSP和LogP并行模型之间的关系及其比较 被引量:6
10
作者 刘久星 孙永强 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 1999年第11期824-827,共4页
本文详细讨论了PRAM,BSP和LogP三种并行模型.我们提出用一个五元组(P, G, O, L, S)来概括这三种模型,并指出它们之间的关系.本文还讨论了这三种模型各自的优缺点。
关键词 BSP PRAM logp 并行计算模型 并行计算机
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用Hirshfeld电荷预报取代苯胺的logP值
11
作者 韦亮 苏婉芬 +4 位作者 罗海霞 王赛龙 罗寅辉 刘诗咏 钟爱国 《当代化工》 CAS 2015年第6期1219-1221,共3页
用密度泛函活性理论与方法(DFT/B3LYP)及基组6-31+G(d,p),优化了20种苯胺及其取代苯胺分子的几何结构。结果发现,苯环胺基上N原子的Hirshfeld电荷值(HIR)与其实验油水分配系数(log P)值之间具有良好的线性相关性,普遍比其H原子拟合核静... 用密度泛函活性理论与方法(DFT/B3LYP)及基组6-31+G(d,p),优化了20种苯胺及其取代苯胺分子的几何结构。结果发现,苯环胺基上N原子的Hirshfeld电荷值(HIR)与其实验油水分配系数(log P)值之间具有良好的线性相关性,普遍比其H原子拟合核静电势电荷(ESP)值以及自然电荷值(NBO)拟合的好。计算了20种未知log P值的取代苯胺化合物胺基的11N原子Hirshfeld电荷值,归入拟合出的最佳线性参数方程式,发现与商业软件ACD/Labs6.0预测得到的多取代苯胺及其衍生物分子的log P预测值非常接近,相对偏差(SD)小于±0.15%. 展开更多
关键词 密度泛函理论 自然原子轨道电荷 ACD—Labs 6.0 取代苯胺 logp
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Structural Characterization and Octanol/water Partition Coefficients(LogP) Prediction for Oxygen-containing Organic Compounds 被引量:8
12
作者 廖立敏 黄茜 雷光东 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2017年第8期1243-1250,共8页
New descriptors were constructed and structures of some oxygen-containing organic compounds were parameterized. The multiple linear regression(MLR) and partial least squares regression(PLS) methods were employed t... New descriptors were constructed and structures of some oxygen-containing organic compounds were parameterized. The multiple linear regression(MLR) and partial least squares regression(PLS) methods were employed to build two relationship models between the structures and octanol/water partition coefficients(LogP) of the compounds. The modeling correlation coefficients(R) were 0.976 and 0.922, and the "leave one out" cross validation correlation coefficients(R(CV)) were 0.973 and 0.909, respectively. The results showed that the structural descriptors could well characterize the molecular structures of the compounds; the stability and predictive power of the models were good. 展开更多
关键词 oxygen-containing organic compounds octanol/water partition coefficients(logp structural descriptors relationship between structures and properties
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将基于PRAM模型的算法转换为基于LogP模型的算法的一种方法
13
作者 焦进 张晓云 +1 位作者 姜殿启 张德富 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 1997年第6期27-33,共7页
本文提出了一种将基于PRAM模型的并行算法转换为基于LogP模型的并行算法的方法,并通过在算法的通信结构有向无环图上进行线性分组的方法。
关键词 PRAM LOG 有向无环图 并行计算机 算法
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水源热泵循环经济指标的logp-h图分析 被引量:2
14
作者 常继彬 《重庆工商大学学报(自然科学版)》 2006年第1期93-95,共3页
主要介绍了水源热泵的含义,水源热泵的制冷循环和热泵循环,以及水源热泵循环在logp-h图上的表示,并结合logp-h对系统的经济性指标制冷系数和泵热系数进行了理论上的分析。
关键词 水源热泵 制冷系数 泵热系数 LOG p-h图
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MECC保留值与logP的相关性 被引量:1
15
作者 刘震 邹汉法 +1 位作者 倪坚毅 张玉奎 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1998年第6期566-573,共8页
研究了不同有机改性剂下胶束电动毛细管色谱 (MECC)中电中性化合物的保留值与其正辛醇 水分配系数 (logP)间的相关性。结果表明 :溶质在MECC中的保留值 (logk′)与logP的相关性决定于MECC体系在分配行为上与正辛醇 水体系的相似性 ,用l... 研究了不同有机改性剂下胶束电动毛细管色谱 (MECC)中电中性化合物的保留值与其正辛醇 水分配系数 (logP)间的相关性。结果表明 :溶质在MECC中的保留值 (logk′)与logP的相关性决定于MECC体系在分配行为上与正辛醇 水体系的相似性 ,用logk′w 代替logk′并不能改善相关性 ;溶质的受质子碱性是影响相关性的最主要的溶质性质 ;使用有机改性剂可以调节溶质在MECC体系中的分配行为接近于正辛醇 水体系 ,THF是调节溶质受质子碱性的影响的最佳有机改性剂 ;要使MECC体系在溶质分配行为上全面接近于正辛醇 水体系 。 展开更多
关键词 毛细管色谱 logp 有机改性剂 保留值 MECC
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网上logP数据库的实现
16
作者 荔建锋 杨铄 +1 位作者 袁身刚 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 2000年第1期159-160,共2页
介绍了网上数据库查询接口的实现方法以及上网的logP数据库的库结构和查询方法。
关键词 数据库 logp 网上查询 库结构 化学数据库
原文传递
基于HMLP参数的二肽logP值支持向量机预测模型
17
作者 印家健 李梦龙 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期265-268,共4页
肽的亲(疏)水性在生物活性肽的合理设计和药物发现中是非常重要的参数。基于表征氨基酸性质的HMLP参数,分别用直接替代法和加和替代法表征肽段的结构信息,采用留一法交叉检验,利用支持向量回归(SVR)构建了36个二肽辛醇-水分配系数(logP... 肽的亲(疏)水性在生物活性肽的合理设计和药物发现中是非常重要的参数。基于表征氨基酸性质的HMLP参数,分别用直接替代法和加和替代法表征肽段的结构信息,采用留一法交叉检验,利用支持向量回归(SVR)构建了36个二肽辛醇-水分配系数(logP)的预测模型(ε=0.001,σ=7.5,C=200和ε=0.001,σ=10,C=200),结果表明加和替代法要好于直接替代法,且其留一法交叉检验的复相关系为0.8768,其预测结果与实验值一致。但二者都说明了logP主要与肽的分子表面积和亲水指标有关,同时说明HMLP参数能够较好地表征氨基酸或肽链的结构信息。 展开更多
关键词 HMLP参数 logp 定量结构活性关系 支持向量机
原文传递
化合物脂水分配系数计算软件及比较研究 被引量:10
18
作者 苏笠 杨劲 +1 位作者 王友群 王广基 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期178-182,共5页
目的:介绍几种常用的化合物脂水分配系数计算软件,并比较它们的准确度和适用范围等。方法:从分子结构出发,运用CLOGP、ACD/LogP、Pallas和Molinspiration 4种计算软件获得logP值,比较其计算准确度。结果:本文选择的4种计算软件均能比较... 目的:介绍几种常用的化合物脂水分配系数计算软件,并比较它们的准确度和适用范围等。方法:从分子结构出发,运用CLOGP、ACD/LogP、Pallas和Molinspiration 4种计算软件获得logP值,比较其计算准确度。结果:本文选择的4种计算软件均能比较准确的计算出化合物的logP值。结论:运用软件计算的方法得到大批量化合物的logP值,有助于计算机辅助药物设计。 展开更多
关键词 定量构效关系 计算机辅助药物设计 脂水分配系数 分子结构 Clogp PALLAS ACD/logp Molinspiration
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黔南州冰雹天气环流特征分析
19
作者 黄麟媛 罗喜平 +2 位作者 罗雄 赵杰 莫乙冬 《山地气象学报》 2024年第3期80-85,共6页
【目的】为了建立黔南地区冰雹发生前天气背景流型配置和T-logP图形态本地化天气概念模型。【方法】选取2006—2022年黔南30次降雹事件,运用天气学分析方法对常规高空、地面气象资料进行研究分析。【结果】以地面流型为主、高低空流型为... 【目的】为了建立黔南地区冰雹发生前天气背景流型配置和T-logP图形态本地化天气概念模型。【方法】选取2006—2022年黔南30次降雹事件,运用天气学分析方法对常规高空、地面气象资料进行研究分析。【结果】以地面流型为主、高低空流型为辅,黔南地区冰雹事件发生前天气类型可分为热低压辐合型、高架雷暴型和冷锋低槽(切变)型3类。【结论】3类天气分型特征如下:(1)热低压辐合型降雹高频次区域为黔南中北部,高架雷暴型降雹高频次区域为黔南中部,冷锋低槽(切变)型降雹高频次区域为黔南中南部;(2)T-logP图形态共有4种,分别为漏斗无梭形、无漏斗梭形、小漏斗梭形、大漏斗梭形,热低压辐合型以大漏斗梭形为主,高架雷暴型以漏斗无梭形为主,冷锋低槽(切变)型以无漏斗梭形为主。 展开更多
关键词 冰雹 天气环流 T-logp
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有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法 被引量:13
20
作者 王艳玲 李婕 王任小 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1742-1754,共13页
有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中... 有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中应用较多的计算有机化合物脂水分配系数和溶解度的理论方法主要有片段加合法和基于描述符的方法.本文总结了这两大类方法的优缺点以及在该领域中未来可能的发展方向. 展开更多
关键词 溶解度 脂水分配系数 药代动力学性质 logp/logD LOGS
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