LA-PCR快速克隆传染性法氏囊病病毒基因组A节段全长cDNA方法的建立

从浙江省某鸡场暴发疑似传染性法氏囊病 (IBD)的法氏囊病料中分离到 1株致死率高达 70 %的强毒株 (IBDV-ZJ2 0 0 0 )。通过筛选 ,采用效果最理想的蛋白酶 K法从法氏囊中提取病毒基因组 RNA,经 L i Cl纯化后 ,优化各种反应参数和条件 ,建立了 L ong- accurate PCR(L A- PCR)一步直接扩增 IBDV A节段全长 c DNA的方法 ,得到一约 3.2 6 kb的片段。L A- PCR法能快速从病鸡法氏囊和细胞适应毒中扩增 A节段全长 c DNA,为研究各 IBDV毒株 A节段的结构和功能打下了基础。

用LA-PCR方法克隆东方田鼠部分Y染色体序列

目的克隆东方田鼠长江亚种（Microtus fortis calamorum）和宁夏指名亚种（Microtus fortis fortis）Y染色体的部分序列，并挖掘这两个亚种间的单核苷酸多态性位点（SNPs）。方法本研究利用依据Y染色体保守性靶标位点（YCATS）设计的引物，测得Y染色体上的8个内含子短片段序列，进而设计长片段PCR（LA—PCR）引物来获得相距几kb的两个内含子之间的长片段序列。结果获得东方田鼠长江亚种和宁夏指名亚种Y染色体上的7300bp序列，比对这两个亚种的序列后发现4个SNPs位点。结论获得了田鼠Y染色体上的7300bp序列和4个SNPs位点。

成都地区HBV基因型分布研究

目的调查成都地区乙型肝炎患者外周血中乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布情况。方法以长片段高保真聚合酶链反应(LA-PCR)扩增乙肝病毒S基因区,结合双脱氧链末端终止法(Sanger)测序技术对该地区90例乙型肝炎患者感染的HBV进行基因分型;同时与常用的基因型特异引物扩增分型法获得的分型结果进行比较,做重复试验以证实所用方法的可靠性和准确性。结果S基因直接测序法检测成都地区人群HBV基因分型结果为B基因型57例(63.3%)、C型30例(33.3%),D型3例(3.3%),无其他基因型和混合型;基因型特异引物分型法除榆出23例(25.5%)混合基因型外,其他各例结果均与S基因测序法吻合。结论成都地区HBV优势基因型以B型为主,C型次之,偶见D型。S基因直接测序法能准确鉴定HBV基因型,并较好地反映HBV基因组变化的准种特征,总体上优于型特异引物分型法,此结论具有统计学意义(P<0.001)。