贵州地方猪品种HSL基因多态性与屠宰性状的关联性研究

本研究旨在分析HSL基因多态性与地方猪品种瘦肉率之间的相关性。采用RFLP方法,以二元杂交猪(长白猪×大约克猪)为对照,对贵州地方猪品种糯谷猪和萝卜猪的HSL基因进行多态性分析。结果表明,贵州地方猪品种HSL基因外显子1中存在BsaH I酶切片段长度多态性,从3个猪群体中都检测到AA、AB和BB基因型,克隆测序后证实,A等位基因于第442 bp处发生了单碱基突变(G→A),导致氨基酸Val→Ile替换。地方猪品种以A等位基因占优势,杂交猪以B等位基因占优势。将猪胴体性状与HSL基因型之间进行关联分析,结果显示大部分年龄段的猪品种中,BB、AB和AA 3种基因型的瘦肉率和眼肌面积均表现出从高到低的变化趋势,而背膘厚则完全相反。结果提示,HSL外显子1的B等位基因具有增加胴体瘦肉率和眼肌面积、降低背膘厚的遗传效应,可作为贵州地方猪品种瘦肉率的分子标记。

PPP3CA基因多态性与江口萝卜猪肉质性能关联性分析

钙调磷酸酶(CaN)是调节肌纤维转化的重要信号分子,PPP3CA基因编码CaN催化亚基,对畜禽肉质性能有重要影响。本实验以江口萝卜猪为研究对象,测定了112头江口萝卜猪11项主要肉质性状指标,提取背最长肌中基因组DNA,扩增了PPP3CA基因全部外显子和启动子序列并测序。结果显示:发现3个SNPs位点,分别为A-918C、G154767A和G316451A。启动子上的A-918C位点等位基因分布较均匀,生物信息学分析发现A-918C位点位于一个高评分核心启动子区附近,还会导致2个转录因子结合位点的消失和2个转录因子结合位点的产生,可能会对PPP3CA基因的表达产生影响。与肉质的关联性分析发现,A-918C位点AA和AC型个体肉色明显高于CC型个体,而剪切力反之。双倍型分析发现,H6H7(CC-GG-GA)和H7H7(CC-GG-GG)肉色显著低于其余双倍型,剪切力明显高于其余双倍型,也说明A-918C位点AA和AC型猪肉质优于CC型猪,说明了A-918C位点对肉质性能有明显影响。G154767A和G316451A位点等位基因频率差异大,等位基因分布不均匀,表明群体内变异程度较低。G154767A位点会使mRNA二级结构最小自由能降低,稳定性降低,极显著偏离Hardy-Weinberg平衡。与肉质的关联性分析发现,G316451A位点GG型和GA型大理石纹评分显著高于AA型。本研究结果表明,PPP3CA基因对江口萝卜猪肉质存在明显影响,A-918C和G316451A位点可能是影响江口萝卜猪肉质的重要功能SNPs位点。

江口萝卜猪和梅山猪的猪应急综合征主效基因RYR1的PCR-RFLP检测

猪兰尼定受体1(Ryanod ine Receptor1,RYR1)基因是导致猪应激综合征、影响猪肉质的主效基因。试验采用RFLP方法,以大白猪、2个杂交猪群(杜洛克×长白猪×大白猪和长白猪×大白猪)为对照,检测了江口萝卜猪与引入的梅山猪群RYR1基因的分布类型。结果表明,对照组中,外三元、外二元杂交猪和大白猪中均检测到RYR1Nn基因型,杂合基因型的发生频率分别为11.11%、12.12%和5.77%;在梅山猪中检测到不利的n等位基因,n等位基因频率为5.56%,说明n等位基因已经侵入梅山猪中,应加强梅山猪的保护;江口萝卜猪中未检测到n等位基因,表明江口萝卜猪具有良好的抗应激能力。

宗地花猪及其杂交猪的育肥性能与胴体和肉质性状

为宗地花猪及其杂交猪的进一步开发利用提供参考依据,选取宗地花猪仔猪及其与江口萝卜猪杂交仔猪各12头,分为纯种组和杂交组,相同条件下育肥172d,各组选3头进行屠宰和肉质性状测定。结果表明：与纯种组相比,杂交组的生长速度缓慢,饲料报酬高,但差异均不显著（P〉0.05）;纯种组胴体重和脂率高于杂交组（P〉0.05）,瘦肉率高于杂交组（P〈0.05）,骨率、皮率及6~7胸椎间皮厚低于杂交组（P〉0.05）;杂交组小排比例高于纯种组（P〉0.05）,其他体躯比例接近;肉质指标均适中,未出现PSE肉和DFD肉。

不同屠宰体重对江口萝卜猪胴体性状、肉品质、氨基酸和脂肪酸的影响

为研究不同屠宰体重对江口萝卜猪胴体性状、肉品质、氨基酸及脂肪酸的影响,本研究选取60、70、80、90、100、110kg各6头江口萝卜猪测定了其不同体重阶段的胴体品质和肉质特性,以分析其胴体性状、肉品质及肌肉营养成分随体重的变化规律。结果显示,江口萝卜猪在体重达80kg之前,其屠宰率、眼肌面积随体重的增加增长较快,氨基酸的含量增加明显,80kg时肌肉中含有丰富的脂肪酸种类,其中油酸、亚油酸等不饱和脂肪酸含量较高。江口萝卜猪在体重达90kg之后脂肪过多沉积,各体重组赖氨酸、缬氨酸、苏氨酸等必需氨基酸的含量呈显著或极显著差异(P<0.05;P<0.01)。总体上看,江口萝卜猪在体重达80kg左右时其胴体性状及肉质性能较好,肌肉中氨基酸和脂肪酸含量丰富,且具有理想的氨基酸和脂肪酸构成,尤其是必需氨基酸及鲜味氨基酸含量高,不饱和脂肪酸及饱和脂肪酸构成比例适宜。因此,综合各项测定指标江口萝卜猪在体重达80kg左右屠宰较优。

江口萝卜猪种质研究进展

萝卜猪是铜仁市江口县人民在长期的放养过程中,通过人工选育和自然选择形成的特有品种,具有体型矮小耐粗饲、抗逆性强等特点,肉质细嫩,滋味鲜美,是贵州省优良地方猪种之一。文章拟对萝卜猪生长肥育性能、繁殖泌乳指标、胴体肉质性状、肌肉营养成分等种质性状进行综述,并讨论其保护开发现状,旨在为萝卜猪研发利用提供借鉴与参考。

江口萝卜猪UCP2基因多态性与基因表达量及肉品质的相关性研究

为研究UCP2基因与猪肉品质性状之间的关系,本研究测定10~12月龄144头江口萝卜猪11项肉品质指标,并提取基因组DNA构建DNA池扩增UCP2基因全部外显子序列,测序后筛选SNPs位点,单个样本DNA扩增后测序验证并分型,分析不同基因型个体肉品质差异。检测不同基因型个体背最长肌中UCP2基因表达量,研究UCP2基因表达量与肉品质的相关性。结果表明:共发现3个SNPs位点,分别为UCP2-T5728G、UCP2-T5774G、UCP2-C5878T;群体遗传参数分析发现等位基因频率差异均较大,多态信息含量均为中度多态,UCP2-C5878T位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点为完全连锁不平衡;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点野生型的大理石纹评分显著高于杂合型,UCP2-C5878T位点杂合型和野生型的剪切力显著高于突变型;UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点杂合型的UCP2基因表达量极显著高于野生型和突变型,UCP2-C5878T位点杂合型和野生型的表达量极显著高于突变型;UCP2基因在背最长肌中的表达量与剪切力呈极显著正相关,与大理石纹和肌内脂肪含量呈极显著负相关。上述结果说明,江口萝卜猪背最长肌中UCP2基因的表达量越高则肌内脂肪含量越低,肉品质越差,UCP2-T5728G和UCP2-T5774G位点杂合型为基因高表达型,肌内脂肪沉积效率降低,对肉品质有不利影响,UCP2-C5878T位点突变型基因表达量极显著降低,肌内脂肪沉积效率升高,有利于肉品质性改善。本研究证明UCP2基因可以作为辅助江口萝卜猪选种选育的候选基因,筛选到的3个SNPs位点均可能是影响猪肉品质性状的重要SNPs位点。

江口萝卜猪UCP2基因启动子变异分析

【目的】研究江口萝卜猪UCP2基因启动子变异,并对其进行生物信息学分析,为江口萝卜猪品种选育及开发利用提供理论依据。【方法】利用江口萝卜猪基因组DNA构建混合DNA池,PCR产物直接测序后采用DNASTAR等生物软件分析筛选出SNP位点,然后采用Neural Network Promoter Prediction、TFsitescan、WebGene等生物信息学分析软件预测单核苷酸突变前后的UCP2基因启动子核心区域、转录因子结合位点和CpG岛。【结果】在江口萝卜猪UCP2基因启动子上共筛选到3个SNPs位点,分别是G-84>A、G-161>C和T-366>A。利用生物信息学分析软件分析单核苷酸突变对UCP2基因启动子核心区域、转录因子结合位点及CpG岛的影响,结果发现,从江口萝卜猪UCP2基因启动子上筛选到的3个SNPs位点均不在预测到的启动子核心区域,但靠近转录起始点;3个SNPs位点也不在预测得到的CpG岛内,且不会影响UCP2基因启动子的甲基化水平;3个SNPs位点能在不同程度上导致转录因子结合位点消失或产生新的转录因子结合位点,其中G-161>C突变对转录因子结合位点的影响最大。【结论】从江口萝卜猪UCP2基因启动子上筛选到3个SNPs位点,分别为G-84>A、G-161>C和T-366>A,虽然这3个SNPs位点均不在启动子核心区域及CpG岛内,但不同程度造成转录因子结合位点消失或产生,其中G-161>C的影响最大,可能是调控UCP2基因表达的重要功能突变位点。

江口萝卜猪STAT3基因多态性及生物信息学分析

【目的】明确碱基突变对江口萝卜猪STAT3基因mRNA二级结构及其编码蛋白二、三级结构的影响,为更好地开发利用江口萝卜猪种质资源打下基础。【方法】利用江口萝卜猪血样提取基因组DNA构建DNA池,采用混合DNA池结合PCR产物直接测序的方法对STAT3基因进行多态性分析,筛选出SNP多态位点及估算等位基因频率,并进行生物信息学分析。【结果】从江口萝卜猪血样中扩增获得STAT3基因的24个外显子,并筛选出7个SNPs位点,分别是:Exon2-A^(19)>C、Exon2-G^(20)>C、Exon2-G^(74)>A、Exon4-T^(81)>A、Exon5-G^(57)>A、Exon5-C^(64)>A和Exon22-C^(43)>A。其中,Exon2-G^(74)>A、Exon4-T^(81)>A和Exon5-G^(57)>A为同义突变,不改变其编码氨基酸序列;Exon2-A^(19)>C、Exon2-G^(20)>C、Exon5-C^(64)>A和Exon22-C^(43)>A为错义突变,会导致其编码氨基酸发生改变。Exon22-C^(43)>A突变后致使最小自由能降低为-755.90 kcal/mol,结构稳定性增强;Exon2-A^(19)>C、Exon5-G^(57)>A和Exon5-C^(64)>A突变均促使最小自由能增加,分别为-754.00、-753.40和-752.60 kcal/mol,且导致m RNA二级结构改变,结构稳定性降低,其中Exon5-G^(57)>A突变导致mRNA二级结构完全改变。Exon2-A^(19)>C、Exon2-G^(20)>C、Exon5-C^(64)>A和Exon22-C^(43)>A突变均可导致编码蛋白二、三级结构的改变,具体表现为α-螺旋增加、β-折叠减少,而无规则卷曲除Exon2-A^(19)>C突变呈增加趋势外,其他突变均呈减少趋势。其中,Exon2-G^(20)>C突变对蛋白二级结构影响最大,而Exon2-A^(19)>C突变的影响最小。【结论】从江口萝卜猪STAT3基因的24个外显子上检测出7个SNPs位点,其中Exon2-A^(19)>C、Exon2-G^(20)>C、Exon5-C^(64)>A和Exon22-C^(43)>A 4个为错义突变,除了造成编码氨基酸改变外,还导致mRNA及编码蛋白二、三级结构的改变,进而可能对STAT3蛋白的功能造成影响。

江口萝卜猪STAT3基因第16外显子多态性及其与肉质性状、基因表达量的相关性分析

为研究江口萝卜猪信号传导及转录激活因子3(signal transducers and activators of transcription 3,STAT3)基因与肉质性状之间的关系,本试验测定了105头江口萝卜猪11个主要肉质性状指标,构建混合DNA池测序筛选SNP位点,单个样本直接测序验证和基因分型,并检测了不同基因型个体背最长肌中STAT 3基因的表达量,利用生物统计软件分析了SNP位点与肉质性状和基因表达量之间的相关性。结果显示,在STAT 3基因第16外显子上检测出1个SNP位点(Exon16-C+78T),单个样本测序只发现了CT和TT两种基因型,群体遗传参数分析发现T为优势等位基因,多态信息含量表现为中度多态,χ2检验发现该位点显著偏离了Hardy-Weinberg平衡。相关性分析发现,江口萝卜猪TT基因型大理石纹评分和熟肉率均显著高于CT基因型(P<0.05),且TT基因型剪切力显著低于CT基因型(P<0.05);TT基因型江口萝卜猪背最长肌中STAT 3基因表达量显著高于CT基因型(P<0.05)。在一定范围内,江口萝卜猪STAT 3基因表达量的提高可能对于肉质性状的改善具有积极作用,TT基因型个体相较于CT基因型个体STAT 3基因的表达量更高,肉质性状表现也更好。研究结果证明,STAT 3基因可以作为辅助江口萝卜猪选育的候选基因,Exon16-C+78T可能是影响猪肉质性状的重要SNP位点。

江口萝卜猪钙调磷酸酶调节亚基编码基因(PPP3R1)多态性研究

钙调磷酸酶(CaN)对于肌纤维类型的转化起关键作用,所以其调节亚基(CnB)编码基因(PPP3R1)对于畜禽肉质性状有着重要影响。该试验以江口萝卜猪为研究对象,采用混合DNA池测序的方法研究钙调磷酸酶调节亚基基因(PPP3R1)外显子多态性。运用生物信息学分析软件预测了SNPs突变位点对基因编码的mRNA二级结构、蛋白质的理化性质、蛋白质二、三级结构的影响。结果表明,在江口萝卜猪PPP3R1基因中共检测到6个SNPs位点,分别为Exon2-T23>G、Exon3-G41>A、Exon3-T52>G、Exon3-C116>T、Exon4-A35>G、Exon6-T56>C。其中,Exon2-T23>G、Exon3-T52>G为错义突变,会导致氨基酸序列第9位和第32位的亮氨酸变为色氨酸。生物信息学分析发现,所有突变位点均不改变mRNA二级结构,但Exon3-T52>G和Exon3-C116>T突变会使二级结构最小自由能增加,导致稳定性降低。蛋白理化性质分析发现,CnB蛋白为较稳定的亲水性蛋白,不是分泌蛋白,两个位点突变后会增加其稳定性和亲水性。Exon3-T52>G位点对蛋白二、三级结构无影响,Exon2-T23>G位点则会导致蛋白二、三级结构的改变,稳定性略微降低。

江口萝卜猪肌肉氨基酸组成及营养价值分析

江口萝卜猪是贵州著名的小型地方猪种,主要分布于贵州省江口县、松桃县和岑巩县,它具有耐粗饲、适应性强、肉嫩和味香浓等优点。试验旨在探究江口萝卜猪肌肉蛋白质营养价值,为其今后肉品深加工提供理论依据和实践参考。采用氨基酸比值系数法对江口萝卜猪肌肉蛋白质氨基酸模式进行评价。结果表明,脱脂江口萝卜猪肌肉中总氨基酸含量高达80.74%,鲜味、甜味和芳香类族氨基酸的含量分别为19.43%,12.47%和7.57%,各种人体必需氨基酸种类齐全,且比例相对均衡,蛋氨酸+胱氨酸的氨基酸比值系数(RC)为1.10,比值系数分(SRC)为77.59。几种人体必需氨基酸中,第一限制氨基酸为缬氨酸,第二限制性氨基酸为亮氨酸和异亮氨酸。

江口萝卜猪的保护和开发利用

笔者以贵州优秀地方猪种江口萝卜猪为试验对象,对其体态特征、种质特性及保护现状进行了详细阐述。同时,对江口萝卜猪的未来发展提出了切实可行的规划,旨在为江口萝卜猪资源保护和可持续发展提供参考。

江口萝卜猪FABPs主要家族基因SNPs筛选及生物信息学分析

以江口萝卜猪为试验材料构建DNA池,采用直接测序技术对猪L-FABP、I-FABP、H-FABP、A-FABP基因进行SNPs快速筛查,共检测出7个SNPs,分别为intron1-T1745C、exon2-T125C、exon2-A131C、exon2-C153A、exon2-A65T、exon2-G40A、intron3-C65T。其中intron1-T1745C、intron3-C65T位于内含子上;exon2-T125C、exon2-C153A为同义突变;exon2-A131C、exon2-A65T、exon2-G40A为错义突变,分别使编码氨基酸发生Glu→Ala、Lys→Met、Glu→Lys的改变,对其进行生物信息学分析表明,突变前后的等位基因频率估算,mR NA二级结构预测,蛋白质二级、三级结构预测分析均有差异。

氮肥磷肥对红三叶中苯丙氨酸解氨酶活性的影响

笔者以岷山红三叶为试验材料,研究了不同施肥处理对不同生育时期红三叶中苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性的影响,以确定最佳氮、磷肥施用量。研究结果表明,不同施肥处理对PAL活性的影响极其显著,最佳氮肥施用量为A3 100 kg N/hm^2,最佳磷肥施用量为B3240 kg P_2O_5/hm^2。