期刊文献+
共找到518篇文章
< 1 2 26 >
每页显示 20 50 100
Detection of Porcine Epidemic Diarrhea Virus in Guangxi Province from 2011 to 2014 and Sequence Analysis of Its M Gene 被引量:3
1
作者 Lu Bingxia Qin Yibin +12 位作者 He Ying Li Yingying Liang Jiaxing Li Keyu Li Bin Su Qianlian Zhou Yingning Jiang Dongfu Lu Jingzhuan Bi Bingfen Liang Baozhong Duan Qunpeng Zhao Wu 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2016年第1期12-17,38,共7页
Detection of pigs epidemic diarrhea virus (PEDV) was conducted on 331 piglets diarrhea fecal samples collected in Nanning, Yulin and other 12 areas of Guangxi Province from January of 2011 to April of 2014 by the me... Detection of pigs epidemic diarrhea virus (PEDV) was conducted on 331 piglets diarrhea fecal samples collected in Nanning, Yulin and other 12 areas of Guangxi Province from January of 2011 to April of 2014 by the method of reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). The results showed that the positive samples of PEDV were 210 and the positive rate was 63.44%. The clone and sequencing of M gene was carried out on 25 positive samples. PEDV reference strains were selected from GeneBank to conduct the sequence homology alignment analysis and the phylogenetic tree of M gene. The M gene homology and amino acid sequence identity between 25 isolated strains and 51 reference strains were 96.0% - 99.6% and 94.3% - 99.6%, respectively. The genetic variation anal- ysis of M gene showed that the genetic relationship of PEDV prevalent strains in Guangxi Province from 2013 to 2014 was close to that of the prevalent strains in Bei- jing, Anhui, Wuhan, Hebei and Guangdong from 2010 to 2013, and which were far from that of the Chinese early isolates CH/S (GenBank number: JN547228 ), vaccine strain CV777 (GenBank number: AF353511 ) and Attenuated DR13 (GenBank number: JQ023162). Indicating that the PEDV strains prevalent in Guan- gxi in recent years showed significant variation with the early isolates. 展开更多
关键词 Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) m gene genetic variation
下载PDF
IMMUNOLOGICAL CHARACTERISTICS OF THE LEUKEMIA CELLS TRANSFECTED WITH ONCOSTATIN M GENE BY RECOMBINANT ADENOVIRUS
2
作者 王全兴 曹雪涛 +1 位作者 弭静 章卫平 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 1997年第4期40-44,共5页
In the present study, FBL3 murine erythroleukemia cells were transfected with human OSM(hOSM) gene by recombinant adenovirus, then the immunological properties of hOSM genetransfected FBL3 cells(FBL3OSM+) were investi... In the present study, FBL3 murine erythroleukemia cells were transfected with human OSM(hOSM) gene by recombinant adenovirus, then the immunological properties of hOSM genetransfected FBL3 cells(FBL3OSM+) were investigated. 4 hours after transfection with hOSM gene, hOSM could be detected in the supernatant of FBL3OSM+ cells and hOSM secretion peaked at 24 h. The proliferation of FBL3OSM+ cells was inhibited markedly. The clonal formation of FBL3OSM+ cells was suppressed more obviously in comparison with wildtype FBL3 cells when analysed in clonal argar culture. Flow cytometry analysis showed that FBL3OSM+ cells expressed higher levels of Fas protein, B7 and ICAM1 molecules.FBL3OSM+ cells also expressed higher level of MHC class I molecules(H2Kb) but remained unchanged in expression of MHC class II molecules (Ia). CD14, which is a specific marker of monocyte/macrophage and not expressed on the wildtype FBL3 cells, was also detected on the surface of FBL3OSM+ cells. The results suggested that OSM gene transfer could increase the immunogenicity of FBL3 cells and promote their differentiation into macrophagelike cells. The data outline a promising approach to OSM gene therapy of leukemia mediated by recombinant adenovirus. 展开更多
关键词 Oncostatin m gene transfer ERYTHROLEUKEmIA ImmUNOGENICITY Costimulatory molecules CD14.
下载PDF
禽流感病毒M基因的重组慢病毒构建
3
作者 潘俊慧 王素春 +7 位作者 禹兰平 周凯钰太 魏世萌 祁倩 李超 隋金钰 康京丽 王楷宬 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第8期85-90,共6页
旨在建立针对禽流感病毒(AIV)的实验室快速分子检测方法。构建重组慢病毒作为分子检测方法中的阳性对照品,采用PCR扩增技术获得AIV M基因的保守区片段,并构建pLVX-M-IRES-ZsGreen1重组慢病毒穿梭载体;将鉴定成功的重组穿梭质粒与骨架质... 旨在建立针对禽流感病毒(AIV)的实验室快速分子检测方法。构建重组慢病毒作为分子检测方法中的阳性对照品,采用PCR扩增技术获得AIV M基因的保守区片段,并构建pLVX-M-IRES-ZsGreen1重组慢病毒穿梭载体;将鉴定成功的重组穿梭质粒与骨架质粒pMD2.G和psPAX2共转染293T细胞,获得携带AIV M基因保守区的重组慢病毒;将重组慢病毒感染293T细胞,观察其荧光表达情况,收集、浓缩病毒液并测定其滴度;用AIV实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测方法检测M基因。结果表明:携带AIV M基因的重组慢病毒成功拯救,且其病毒滴度高、安全性强,可作为分子检测方法的阳性对照标准品。综上,本研究成功构建了AIV M基因的重组慢病毒,可高效包装出含有M基因保守区的慢病毒颗粒,为后续AIV分子检测试剂盒的研制提供参考。 展开更多
关键词 禽流感病毒 m基因 293T细胞 重组慢病毒
下载PDF
新疆维吾尔自治区塔额垦区牛源大肠杆菌耐药性、CTX-M基因携带情况与毒力基因检测
4
作者 赵耀 邢国锋 +4 位作者 苏帆帆 高攀 彭健 吴自豪 吴静 《畜牧与饲料科学》 2024年第1期94-101,共8页
[目的]了解新疆维吾尔自治区塔额垦区牛源大肠杆菌耐药性及CTX-M基因和毒力基因携带情况。[方法]从塔额垦区某牛场采集16份牛腹泻粪样,通过选择性培养、革兰染色镜检、16S rDNA PCR扩增及测序进行大肠杆菌分离鉴定。利用PCR法对牛源大... [目的]了解新疆维吾尔自治区塔额垦区牛源大肠杆菌耐药性及CTX-M基因和毒力基因携带情况。[方法]从塔额垦区某牛场采集16份牛腹泻粪样,通过选择性培养、革兰染色镜检、16S rDNA PCR扩增及测序进行大肠杆菌分离鉴定。利用PCR法对牛源大肠杆菌分离株进行分子分型(系统发育群和脂多糖核心型)以及耐药基因、CTX-M基因亚型、毒力基因检测;分别使用K-B纸片法、CTX与TCL双纸片法进行药物敏感性试验和产ESBLs大肠杆菌鉴定;采用结晶紫染色法半定量检测菌株的生物被膜形成能力。[结果]根据菌落生长特征、革兰染色特性及16S rDNA测序结果,从16份牛腹泻粪样中分离鉴定出16株大肠杆菌,分离率为100%;系统发育群主要为B1群(14/16,87.50%),脂多糖核心型多为R1型(15/16,93.75%)。分离菌株对青霉素、利福平、复方新诺明表现出较强耐药性,耐药率分别为100%、68.75%、68.75%;对多黏菌素、替加环素、美罗培南敏感,耐药率均为0;有12株(75.00%)具有多重耐药表型;有11株(68.75%)产ESBLs;有15株(93.75%)可形成生物被膜。16株大肠杆菌中共检出17种耐药基因,CTX-M、ant(6′)、sul1等8种耐药基因的检出率为100%;有14株(87.50%)为CTX-M-1G基因亚型;共检出12种毒力基因,iroN、ompA、yijP等5种毒力基因的检出率为100%。[结论]新疆维吾尔自治区塔额垦区牛源大肠杆菌CTX-M基因检出率较高,携带多种耐药基因和毒力基因,耐药性较强,对该地区牛健康养殖存在潜在威胁,应加强该地区CTX-M型大肠杆菌的流行情况监控。 展开更多
关键词 大肠杆菌 CTX-m基因 分子分型 耐药性 毒力基因
下载PDF
m.8993T>G相关Leigh综合征合并低瓜氨酸血症患儿4例并文献复习
5
作者 李映雪 王冬娟 +4 位作者 周茂彬 孙浩轩 洪思琦 蒋莉 郭艺 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期940-945,共6页
目的探索m.8993T>G变异致Leigh综合征的早期诊断生物学标志。方法回顾性分析2014年1月—2024年1月在重庆医科大学附属儿童医院确诊的4例m.8993T>G相关Leigh综合征患儿的临床资料并文献复习。结果4例患儿血氨基酸和酰基肉碱谱分析... 目的探索m.8993T>G变异致Leigh综合征的早期诊断生物学标志。方法回顾性分析2014年1月—2024年1月在重庆医科大学附属儿童医院确诊的4例m.8993T>G相关Leigh综合征患儿的临床资料并文献复习。结果4例患儿血氨基酸和酰基肉碱谱分析发现瓜氨酸降低,其中1例最早于新生儿遗传代谢病筛查发现。目前已报道的m.8993T>G变异合并低瓜氨酸血症的线粒体病患儿(含该研究4例)共26例,其中12例临床表型为Leigh综合征或Leigh样综合征,18例最早于新生儿遗传代谢病筛查发现存在瓜氨酸降低和/或3-羟基异戊酰肉碱(C5-OH)升高。结论低瓜氨酸血症可能是m.8993T>G相关Leigh综合征早期诊断的血清生物学标志物,最早可在新生儿遗传代谢病筛查中发现。 展开更多
关键词 LEIGH综合征 m.8993T>G mT-ATP6基因 低瓜氨酸血症 儿童
下载PDF
鸡脾脏METTL3、METTL14基因对肠炎沙门氏菌感染的表达调控
6
作者 赵亚男 任艳茹 +2 位作者 谢宾 王园美 李显耀 《中国畜禽种业》 2024年第1期13-18,共6页
为探讨鸡METTL3、METTL14基因对肠炎沙门氏菌感染的调控作用,该试验将40只2日龄肠炎沙门氏菌阴性广西瑶鸡(父本)和济宁百日鸡(母本)杂交的F1代随机均分为2组,试验组和对照组分别接种0.3mL肠炎沙门氏菌菌液及PBS,在接种后第1天和第7天鸡... 为探讨鸡METTL3、METTL14基因对肠炎沙门氏菌感染的调控作用,该试验将40只2日龄肠炎沙门氏菌阴性广西瑶鸡(父本)和济宁百日鸡(母本)杂交的F1代随机均分为2组,试验组和对照组分别接种0.3mL肠炎沙门氏菌菌液及PBS,在接种后第1天和第7天鸡的脾脏组织提取总RNA,采用实时荧光定量PCR检测不同时间点METTL3、METTL14基因的表达水平。结果显示:METTL3和METTL14具有相似的表达趋势,均在感染后第1天试验组高于对照组(P<0.05),感染后第7天试验组低于对照组,但只有METTL14差异显著(P<0.05)。可见,鸡感染肠炎沙门氏菌后,可以引起脾脏组织METTL3和METTL14基因的差异表达。 展开更多
关键词 m^(6)A 肠炎沙门氏菌 mETTL3 mETTL14 基因表达
下载PDF
稳定表达PRRSV M蛋白的MARC-145^(ORF6)细胞系的构建及其对PRRSV增殖的影响
7
作者 荆扬 王玉淼 +4 位作者 李洋 常辉 马志倩 李志伟 肖书奇 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1159-1169,共11页
为了给深入研究猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndromevirus,PRRSV)ORF6基因编码的M蛋白的生物学功能提供重要试验材料,本研究首先利用慢病毒包装系统构建了过表达PRRSVORF6基因的重组慢病毒质粒,将该... 为了给深入研究猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndromevirus,PRRSV)ORF6基因编码的M蛋白的生物学功能提供重要试验材料,本研究首先利用慢病毒包装系统构建了过表达PRRSVORF6基因的重组慢病毒质粒,将该质粒连同辅助质粒共同转染至HEK293T细胞获得重组慢病毒;之后将重组慢病毒感染MARC-145细胞,利用嘌呤霉素结合有限稀释法进行筛选,连续筛选3轮后建立了稳定表达PRRSVM蛋白的MARC-145ORF6细胞系;并使用CCK-8试验评估过表达PRRSVM蛋白对MARC-145细胞生长的影响。利用RT-PCR、蛋白免疫印迹(Westernblot)和间接免疫荧光(IFA)评估MARC-145ORF6细胞系的传代稳定性并鉴定M蛋白的亚细胞定位,进一步利用RT-qPCR评估过表达M蛋白对MARC-145细胞的干扰素及相关调节基因的影响;此外,还测定了PRRSV在MARC-145ORF6细胞系、MARC-145Flag细胞系和MARC-145细胞中的病毒滴度并绘制多步生长曲线以比较其差异。CCK-8试验结果表明,过表达PRRSVM蛋白对MARC-145细胞活力无显著影响;RT-qPCR、Westernblot和IFA等试验结果表明,MARC-145ORF6细胞系能够表达PRRSV的M蛋白且在传代过程中稳定。此外,稳定表达PRRSVM蛋白显著下调了细胞系的Ⅰ型干扰素及其相关调节基因;多步生长曲线表明,MARC-145ORF6细胞系促进PRRSV增殖,提高其病毒滴度。综上,本研究构建了可以稳定表达PRRSVM蛋白的MARC-145ORF6细胞系,发现其Ⅰ型干扰素水平显著下调且促进PRRSV复制。本研究构建的MARC-145ORF6细胞系将为M蛋白功能的深入研究提供重要生物材料。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 过表达细胞系 ORF6基因 m蛋白 mARC-145细胞
下载PDF
25羟维生素D3、M型磷脂酶A2受体基因多态性交互影响原发性膜性肾病病情进展的研究
8
作者 黄显莉 文飞亚 郝炎 《临床肾脏病杂志》 2024年第10期834-840,共7页
目的探究25羟维生素D3[1,25-dihydroxy vitmin D3,25-(OH)D3]、M型磷脂酶A2受体(M-type phospholipase A2 receptor 1,PLA2R1)基因多态性交互影响原发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)病情进展的作用。方法选取2019年... 目的探究25羟维生素D3[1,25-dihydroxy vitmin D3,25-(OH)D3]、M型磷脂酶A2受体(M-type phospholipase A2 receptor 1,PLA2R1)基因多态性交互影响原发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)病情进展的作用。方法选取2019年1月至2023年1月自贡市第一人民医院收治的101例IMN患者进行前瞻性研究,根据6个月内是否复发分为复发组、未复发组。比较两组患者基线资料、25-(OH)D3水平、PLA2R1基因多态性,以Logistic回归分析影响IMN病情进展的因素,以交互作用系数γ和OR值分析25-(OH)D3、PLA2R1基因多态性交互影响IMN病情进展的作用。结果复发组尿酸[(419.36±25.44)μmol/L比(366.20±28.34)μmol/L]高于未复发组,25-(OH)D3水平[(33.60±10.74)nmol/L比(42.40±9.56)nmol/L]低于未复发组(P<0.05)。复发组rs4664308位点AA基因型(69.44%比44.62%)患者占比高于未复发组,GA基因型(27.78%比43.08%)、GG基因型(2.78%比12.31%)患者占比低于未复发组(P<0.05)。Logis-tic回归分析显示,尿酸、25-(OH)D3、rs4664308位点GA和AA基因型均与IMN病情进展相关(P<0.05),尿酸每升高一个单位,IMN患者病情进展的风险增加4.233倍;25-(OH)D3每降低一个单位,IMN患者病情进展的风险增加0.581倍;rs4664308位点GA和AA基因型患者,病情进展的风险分别是基因型GG患者的3.253、4.054倍。交互作用分析显示,25-(OH)D3和PLA2R1基因多态性交互的OR值<两者单独存在OR值的乘积,两者对IMN病情进展的影响符合次相乘模型,且交互作用系数γ>1,25-(OH)D3非正常对PLA2R1基因多态性的效应具有正向交互作用(P<0.05)。结论25-(OH)D3、PLA2R1基因多态性均与IMN患者病情进展有关,25-(OH)D3水平对PLA2R1基因多态性的效应具有正向交互作用,联合检测两者状态可能有助于预测患者病情进展的风险,为临床个性化预防干预提供决策支持。 展开更多
关键词 25羟维生素D3 m型磷脂酶A2受体 基因多态性 交互作用 原发性膜性肾病
下载PDF
m^(6)A相关基因在激素性股骨头坏死中的生物信息学分析 被引量:2
9
作者 令狐熙涛 桂佳琦 +2 位作者 梁卓智 瓦庆德 黄帅 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第36期5811-5816,共6页
背景:m^(6)A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m^(6)A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制。方法:在GEO数据库中检索并... 背景:m^(6)A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m^(6)A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制。方法:在GEO数据库中检索并下载与激素性股骨头坏死相关的mRNA表达谱数据集(GSE123568),通过R软件对数据集进行差异基因筛选及GO功能、KEGG通路富集分析。识别差异基因中的m^(6)A差异表达基因(m^(6)A-DEGs)并对其进行GO功能与KEGG通路富集分析,比较m^(6)A-DEGs的表达量并分析它们之间的相关性。最后通过Cytoscape构建m^(6)A-DEGs的PPI互作网络及筛选核心基因。使用TargetScan,miRTarBase和miRBD数据库预测m^(6)A-DEGs相关的潜在miRNAs,同时使用ChIPBase及hTFtarget数据库预测7个核心基因潜在转录因子,然后分别构建m^(6)A-miRNA与转录因子m^(6)A调控网络。最后使用数据集GSE74089验证7个核心m^(6)A-DEGs的表达水平。结果与结论:①从数据集中共筛选出2460个差异表达的基因,其中1455个上调,1005个下调。②从数据集中筛选出了14个m^(6)A-DEGs,包括3个下调和11个上调基因,m^(6)A-DEGs在激素性股骨头坏死中的表达具有显著差异(P<0.05),Spearman分析表明它们之间具有一定相关性。③m^(6)A-DEGs的GO和KEGG富集分析主要集中在骨髓细胞分化与发育、免疫受体与细胞因子受体活性、破骨细胞分化、AMPK与白细胞介素17信号通路。④m^(6)A-DEGs前7个核心基因包括YTHDF3,YTHDF1,YTHDF2,ALKBH5,METTL3,HNRNPA2B1及HNRNPC,它们在miRTarBase,miRDB和TargetScan数据库中共有44个miRNA重叠,在ChIPBase及hTFtarget数据库中共有79个重叠转录因子。⑤在GSE74089数据集中有6个核心m^(6)A-DEGs的表达水平与GSE123568数据集一致。⑥结果证实,根据生物信息学方法筛选的7个m^(6)A-DEGs可能通过调控多个miRNA、转录因子和AMPK及白细胞介素17信号通路表达,进而影响激素性股骨头坏死中骨髓细胞分化发育与破骨细胞分化,为进一步深入研究激素性股骨头坏死的发病机制和靶向治疗提供了数据支持和研究方向。 展开更多
关键词 激素性股骨头坏死 m^(6)A甲基化 微小RNA 转录因子 生物信息学 差异基因 基因调控网络 核心基因
下载PDF
Cloning of M and NP Gene of H5N1 Avian Influenza Virus and Immune Efficacy of their DNA Vaccines 被引量:2
10
作者 Po Tien 《中国病毒学》 CSCD 2007年第1期46-52,共7页
H5N1 鸟的流行性感冒病毒(A/chicken/Hubei/489/2004 ) 的 M 和 NP 基因被 RT-PCR 从病毒的 RNA 放大,并且分别地克隆向量进 pMD18-T。包含 M 基因(pHM6-m ) 或 NP 基因(pHM6-np ) 的表示 plasmid 然后被把 M 或 NP 基因插入到 pHM6 ... H5N1 鸟的流行性感冒病毒(A/chicken/Hubei/489/2004 ) 的 M 和 NP 基因被 RT-PCR 从病毒的 RNA 放大,并且分别地克隆向量进 pMD18-T。包含 M 基因(pHM6-m ) 或 NP 基因(pHM6-np ) 的表示 plasmid 然后被把 M 或 NP 基因插入到 pHM6 优核质表示向量构造;构造 plasmid 然后被定序。32 只 BALB/c 老鼠(6-week-old ) 在随机被划分成四个组。三组 BALB/c 老鼠被接种一次有 plasmid pHM6-m, plasmid pHM6-np 的 30 渭 g 或 plasmid pHM6-m (15 渭 g ) 和 pHM6-np (15 渭 g ) 的混合的任何一个 30 渭 g 的肌内的线路分别地。老鼠的一个另外的组作为控制与 100 渭 l PBS 被注射。二个星期以后,所有老鼠与相应 H5N1 鸟的流行性感冒病毒被质问,并且在下列 12 天内观察了。在 pHM6-m 组, pHM6-np 组和混合 plasmids 组的老鼠的幸存率分别地是 62.5% , 25.0% 和 50.0% 。结果证明有效保护能被 pHM6-m 或 pHM6-np 提供,但是 pHM6-m 比 pHM6-np 提供了更好保护的效果。关键词 H5N1 流行性感冒病毒 - M 基因 - NP 基因 - 克隆 - DNA 疫苗的 CLC 数字 S852.65 基础条款:国家基本科学才能训练资助(NSFC J0630648 ) 展开更多
关键词 H5N1 influenza virus m gene NP gene CLONING DNA vaccine
下载PDF
Occurrence of Extended Spectrum Beta Lactamase Encoding Genes among Urinary Pathogenic <i>Escherichia coli</i>and <i>Klebsiella pneumoniae</i>Isolates Obtained from a Tertiary Hospital in Gombe Nigeria
11
作者 Adamu Yarima Ali Ahmed Haroun +1 位作者 Timothy Bulus Mohammed M. Manga 《Journal of Biosciences and Medicines》 2020年第9期42-55,共14页
This study was conducted to assess the occurrence and nature of extended-spectrum beta lactamase (ESBL) producing <em>Escherichia coli</em> and <em>Klebsiella pneumoniae</em> isolates from pati... This study was conducted to assess the occurrence and nature of extended-spectrum beta lactamase (ESBL) producing <em>Escherichia coli</em> and <em>Klebsiella pneumoniae</em> isolates from patients who presented with urinary tract infection at Federal Teaching Hospital Gombe. Isolates collected were recovered on MacConkey agar at 35<span style="white-space:nowrap;">&deg;</span>C and were identified as members of Enterobacteriaceae, and further screened for antimicrobial susceptibility and resistance by disc diffusion method. Isolates resistant to oxyimino-cephalosporins were confirmed as ESBL producers using Double Disks Synergy Test (DDST). The study shows 66% resistance to ceftriaxone (30 μg) in <em>K. pneumoniae</em>, which was the highest value recorded and a 51% resistance to cefpodoxime (10 <em>μ</em>g) in <em>E. coli</em>. The sensitivity of <em>E. coli </em>and <em>K. pneumoniae</em> isolates to cefpodoxime (10 <em>μ</em>g) were 49% and 33.9% respectively. ESBLs were detected among 40% (40/100) of <em>E. coli</em> and 54.13% (59/109) of <em>K. pneumoniae</em> isolates. Molecular characterization of ESBL encoding genes among <em>E. coli</em> isolates using multiplex-PCR showed 10% prevalence of SHV gene and 5% prevalence for CTX-M gene while TEM gene was not detected. In <em>K. pneumoniae</em> isolates, 5% prevalence was recorded for each of the three genes screened. The study revealed a co-occurrence of SHV and CTX-M in 75% of the <em>E. coli</em> and 70% of the <em>K. pneumoniae</em> isolates;the occurrence of all the three genes was seen in 10% and 5% of <em>K. pneumoniae</em> and <em>E. coli</em> respectively. Multiplex-PCR method provided an efficient and rapid detection of ESBL related genes, hence could be used in epidemiological studies among ESBL isolates. Monitoring dissemination and transmissions of ESBL producers are highly recommended for optimum patient care and preventing the spread of multidrug resistant (MDR) pathogens. 展开更多
关键词 ESBL Double Disk Synergy Test m-PCR TEm SHV CTX-m genes NIGERIA
下载PDF
Construction of Midgut Tissue-Specific cDNA Library of Bombyx mandarina M. and Isolation and Sequence Analysis of Serine Protease Gene Fragment
12
作者 王燕红 李兵 +4 位作者 王东 朱莎 赵华强 卫正国 沈卫德 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2008年第3期35-38,共4页
[Objective] The aim of the study is to construct cDNA library of midgut tissue of wild silkworm and isolate the serine protease gene. [Method] The midgut tissue-specific cDNA library of wild silkworm was constructed v... [Objective] The aim of the study is to construct cDNA library of midgut tissue of wild silkworm and isolate the serine protease gene. [Method] The midgut tissue-specific cDNA library of wild silkworm was constructed via cDNA Library Construction Kit (TaKaRa), then the serine protease gene was cloned via sequencing of the yielded cDNA library. [Result] The titer of cDNA library reached 6.2×105 pfu/ml, average insert size was about 1.2 kb. The serine protease gene cDNA fragment was obtained from colony sequencing (Accession No: EU672968). The nucleotide sequence of the cloned 854 bp fragment encodes 284 amino acid residues. Homology analyses showed some homology between putative amino acid sequence of the cloned fragment and amino acid sequences of serine proteases from other ten insects. [Conclusion] The results may avail to reveal the resistance of silkworm and wild silkworm to exotic intrusion. 展开更多
关键词 Bombyx mandarina m. mIDGUT tissue cDNA LIBRARY SERINE PROTEASE gene Sequence analysis
下载PDF
2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒S1、M和ORF3基因遗传进化分析 被引量:2
13
作者 熊谋康 梁太润 +5 位作者 刘献辉 王志朋 王爽云 刘燕玲 张乐宜 宋长绪 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第15期8-17,共10页
为了解2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株变异及遗传进化情况,试验从多个地区的51家猪场采集340份疑似感染PEDV的猪小肠组织、粪便和肛拭子,提取病毒核酸后采用RT-PCR方法扩增S1、M... 为了解2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株变异及遗传进化情况,试验从多个地区的51家猪场采集340份疑似感染PEDV的猪小肠组织、粪便和肛拭子,提取病毒核酸后采用RT-PCR方法扩增S1、M和ORF3基因并测序,与GenBank中PEDV参考毒株进行比对分析,利用生物信息学软件构建遗传进化树,分析核苷酸序列同源性及氨基酸序列。结果表明:共获得57份PEDV阳性样品,来源于14家猪场,猪场阳性率为27.5%,并对从阳性猪场获得的14株毒株进行命名。与经典毒株CV777相比,14株PEDV毒株的S1、M和ORF3基因均出现不同程度的氨基酸突变。在14株毒株的S1基因中,Heyuan2021-7毒株位于G1-2分支,其余13株位于G2分支,14株毒株与参考毒株GD-A核苷酸序列的相似性较高,为89.3%~99.9%,存在多处氨基酸的缺失和插入。在M基因中,14株毒株位于G2分支且与参考毒株FR-001核苷酸序列的相似性为98.1%~99.7%,只存在氨基酸突变。在ORF3基因中,FC2021-1、GDzq2020-12、GDmm^(2)021-1和GDjm-DG-2021-12毒株位于G1-2分支,其余10株位于G2分支,14株毒株与参考毒株VN-JFP1013核苷酸序列的相似性为95.4%~99.3%,同源性较高,只存在氨基酸突变。说明2020—2021年我国部分地区流行的PEDV毒株有G1型和G2型毒株,其S1基因较M和ORF3基因突变程度更大,PEDV的流行情况相对复杂。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 检测 S1基因 m基因 ORF3基因 基因测序 遗传变异
下载PDF
Novel SNP of EPAS1 gene associated with higher hemoglobin concentration revealed the hypoxia adaptation of yak(Bos grunniens) 被引量:8
14
作者 WU Xiao-yun DING Xue-zhi +4 位作者 CHU Min GUO Xian BAO Peng-jia LIANG Chun-nian YAN Ping 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期741-748,共8页
Endothelial PAS domain protein 1 gene (EPAS1) is a key transcription factor that activates the expression of oxygen-regu- lated genes. In this study, in order to better understand the effects of EPAS1 gene on hemato... Endothelial PAS domain protein 1 gene (EPAS1) is a key transcription factor that activates the expression of oxygen-regu- lated genes. In this study, in order to better understand the effects of EPAS1 gene on hematologic parameters in yak, we firstly quantified the tissue expression patterns for EPASl mRNA of yak, identified polymorphism in this gene and evaluated its association with hematologic parameters. Expression of EPAS1 mRNA was detected in all eight tissues (heart, liver, lung, spleen, pancreas, kidney, muscles and ovary). The expressions of EPAS1 in lung and pancreas were extremely higher than other tissues examined. Three novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) (g.83052 C〉T, g.83065 G〉A and g.83067 C〉A) within the EPAS1 were identified and genotyped in Pali (PL), Gannan (GN) and Tianzhu White (TZW) yak breeds. Significant higher frequencies of the AA and GA genotypes and A allele of the g.83065 G〉A were observed in the PL and GN breeds than that in the TZW breed (P〈0.01). Association analysis of the PL breed indicated that the g.83065 G〉A polymorphism was significantly associated with hemoglobin (HGB) concentration in yaks (P〈0.05). Individuals with genotype AA had significantly higher HGB concentration (P〈0.05) than those with genotype GA and GG. All these results will help our further understanding of biological functional of yak EPAS1 gene in responding to hypoxia and also indicate EPAS1 might contribute to the hypoxia adaptation of the yak. 展开更多
关键词 EPAS1 gene m RNA expression POLYmORPHISm hypoxia adaptation YAK
下载PDF
Cloning and Expression Analysis of Mlo Gene from Pericallis hybrida B. Nord.
15
作者 Wang Jin-gang Li Wei +3 位作者 Ren Hong-wei Lv Yuan-da Bai Ding Xu Jing 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2014年第1期10-15,共6页
The full-length Mlo gene was obtained by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and RACE. The result of sequence analysis indicated that M/o gene from Pericallis hybrida B. Nord. contained about 12... The full-length Mlo gene was obtained by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and RACE. The result of sequence analysis indicated that M/o gene from Pericallis hybrida B. Nord. contained about 1296bp open reading frame and encoded 431 amino acids. According to the comparison of the exogenous gene sequences by BLAST analysis and phylogenetic analysis, Mlo gene shared over 85% nucleotide homology and 98% amino acid homology. Finally, through semi-quantitative-PCR and fluorescence quantitative analysis, we found that Mlo gene showed the highest expression levels in leaves and the lowest in roots after inoculated with powdery mildew pathogen for different days. 展开更多
关键词 Pericallis hybrida B. Nord. m/o gene CLONING sequence expression analysis
下载PDF
基于TCGA数据库的肺腺癌G2/M检查点基因预后模型的建立与应用
16
作者 周而乐 佟美辰 +3 位作者 崔敏 苏娜娜 李红 曹璋 《滨州医学院学报》 2023年第2期88-94,共7页
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库建立肺腺癌(LUAD)的G2/M检查点相关基因风险预后模型。方法通过TCGA数据库获取并整合了LUAD基因表达数据及临床数据,根据Reactome定义的G2/M检查点相关基因集筛选出影响预后的G2/M检查点相关基因,通... 目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库建立肺腺癌(LUAD)的G2/M检查点相关基因风险预后模型。方法通过TCGA数据库获取并整合了LUAD基因表达数据及临床数据,根据Reactome定义的G2/M检查点相关基因集筛选出影响预后的G2/M检查点相关基因,通过单因素和多因素COX分析建立风险预后模型,对模型高、低风险组进行生物学标志基因集和KEGG通路富集的差异分析并进行免疫相关性分析。结果预后模型由7个基因组成,该模型生存预测性能的AUC值为0.726。高风险组的总体生存率明显低于低风险组(P<0.05)。细胞增殖的相关通路在高风险组中富集。风险评分的增高与多种免疫细胞的浸润比例存在一定相关性(P<0.05)。结论由7个基因组成的风险预测模型可作为独立预测因子来有效预测LUAD的预后。 展开更多
关键词 肺腺癌 G2/m检查点相关基因 预后 癌症基因组图谱
下载PDF
8株禽源H_(9)N_(2)亚型禽流感病毒分离鉴定及M基因的序列分析
17
作者 杨金波 李培东 +1 位作者 刘春国 范春艳 《现代畜牧兽医》 2023年第1期11-16,共6页
试验旨在了解中国目前H_(9)N_(2)亚型禽流感病毒(AIV) M基因的遗传变异情况,对2019—2022年分离到的8株H_(9)N_(2)亚型AIV M基因进行测序,并对核苷酸序列、氨基酸序列一致性和分子遗传进化进行分析。结果显示:8株分离株与参考株序列一... 试验旨在了解中国目前H_(9)N_(2)亚型禽流感病毒(AIV) M基因的遗传变异情况,对2019—2022年分离到的8株H_(9)N_(2)亚型AIV M基因进行测序,并对核苷酸序列、氨基酸序列一致性和分子遗传进化进行分析。结果显示:8株分离株与参考株序列一致性均在88.4%以上,8株分离株M之间的核苷酸一致性为88.0%~99.7%;XD1~XD7属于G1-like分支,XD8属于BJ94-like分支。与经典株相比,分离株产生多个增加病毒感染性的突变。XD1~XD7含有对金刚烷胺类药物抗性的31N突变,而XD8则对金刚烷胺类药物敏感。研究表明,试验结果可为AIV的M蛋白相关生物学机制提供一定参考。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H_(9)N_(2)亚型 m基因 序列分析
下载PDF
Virulence Gene Characterization and Serotyping of Major Bacterial Pathogens Isolated from Bovine Respiratory Disease in Ethiopia
18
作者 Mirtneh Akalu Takele Abayneh +4 位作者 Esayas Gelaye Getaw Derese Behailu Tefera Teferi Degefa Vemulapati Bhadra Murthy 《Advances in Microbiology》 2022年第1期10-24,共15页
Bovine Respiratory Disease (BRD) causes a severe form of pneumonia in all age of cattle. This study was designed to investigate the distribution of capsular types, serotypes, and virulence-associated genes of the majo... Bovine Respiratory Disease (BRD) causes a severe form of pneumonia in all age of cattle. This study was designed to investigate the distribution of capsular types, serotypes, and virulence-associated genes of the major bacterial pathogens from BRD outbreak samples in Ethiopia. In this study 166 samples were collected from clinically sick (<i>n</i> = 107) and pneumonic lung tissue (<i>n</i> = 59). Laboratory assay confirmed isolation of <i>M. haemolytica</i> 37 (22.29%), <i>P. multocida</i> 25 (15.06%), <i>B. trehalosi</i> 12 (7.23%), and <i>H. somni</i> 15 (9.04%). PCR assay of <i>P. multocida</i> capsular typing revealed 21 (84.0%) cap A (<i>hyaD-hyaC</i>) and 4 (16.0%) cap D (<i>dcbF</i>) strains. <i>M. haemolytica</i> serotypes belonged to A: 1, A: 2, and A: 6 from 26 (70.27%), 4 (10.81%), and 7 (18.92%) isolates, respectively. <i>P. multocida</i> biotyping showed isolation of A: 1, A: 2, and A: 3 from 3 (14.29%), 2 (9.52%), and 16 (76.19%) isolates, respectively. <i>M. haemolytica</i> harbored more than 60% <i>ssa</i> gene, and 90.91% <i>sodA</i> while <i>FbpA</i>, <i>TbpA</i>, and <i>lktC</i> genes were found in all isolates. Likewise, all <i>P. multocida</i> exhibited <i>toxA</i>, <i>FbpA</i>, <i>TbpA</i>, and <i>pmSLP</i> genes. The current finding showed that <i>M. haemolytica</i> serotype A: 1 is frequently associated with BRD followed by <i>P. multocida</i> biotype A: 3. These two isolates harbored diverse virulence-associated genes and presented the pathogenic potential of the current isolates. Thus, investigation of pathogenic strains of BRD, virulence genes distribution, and molecular epidemiology of the disease from wider areas of the country are essential. Hence, continuous outbreak surveillance and molecular approaches are indispensable in designing efficient prevention strategies. 展开更多
关键词 BRD m. haemolytica P. multocida SEROTYPES Virulence genes
下载PDF
鸡大肠杆菌TEM和CTX-M型超广谱β-内酰胺酶基因分型研究 被引量:21
19
作者 苑丽 刘建华 +4 位作者 胡功政 潘玉善 莫娟 魏永俊 裴亚玲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第20期4310-4316,共7页
【目的】检测鸡大肠杆菌超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的基因型和基因亚型,了解河南省产酶鸡大肠杆菌ESBLs基因型分布。【方法】对河南省7个地区不同鸡场临床分离28株产ESBLs鸡大肠杆菌分别用TEM、SHV和CTX-M等3种通用引物进行PCR扩增及测... 【目的】检测鸡大肠杆菌超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的基因型和基因亚型,了解河南省产酶鸡大肠杆菌ESBLs基因型分布。【方法】对河南省7个地区不同鸡场临床分离28株产ESBLs鸡大肠杆菌分别用TEM、SHV和CTX-M等3种通用引物进行PCR扩增及测序分析,确定其基因型和基因亚型。【结果】21株鸡大肠杆菌检出TEM型基因,2株检出CTX-M型基因,5株检出TEM型和CTX-M型两种基因,未检出SHV型。TEM基因亚型以TEM-1变异型为主,与AY293072(TEM-1)相比同源性为98%—99%,核苷酸序列除发生18T→C沉默突变外,尚有3株分别有另一处碱基发生变化:783G→A(C3菌,序列号为FJ405207)、21T→A(X2菌,序列号为FJ405208)和269G→A(F4菌,序列号为FJ405211),其中前两处为沉默突变,F4菌的碱基突变引起92甘氨酸变为天冬氨酸,为TEM-57型。CTX-M基因亚型包括两种:CTX-M-65亚型4株(C2、C3、C4和K1,序列号分别为FJ405191,FJ405192,FJ405212和FJ405214)和CTX-M-14亚型3株(F2、X3和B5,其中F2菌的相关序列已上传至GenBank,获序列号为FJ405213)。【结论】目前河南省产ESBL鸡大肠杆菌基因亚型以TEM-1变异型为主,CTX-M-65和CTX-M-14型次之。 展开更多
关键词 鸡大肠杆菌 超广谱Β-内酰胺酶 TEm基因 CTX-m基因
下载PDF
猪流行性腹泻病毒中国地方流行株LJB/03M基因的克隆与序列分析 被引量:38
20
作者 范京惠 郎景华 +2 位作者 吴凌 张海峰 李一经 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2005年第7期7-9,共3页
从黑龙江某猪场疑似猪流行性腹泻猪的粪便中提取总RNA,采用RT-RCR方法扩增,首次获得中国地方流行株PEDVM全基因序列,将其克隆到pMD18-T载体中进行测序,克隆的M基因核苷酸序列由681个核苷酸组成,含有一个完整的开放阅读框架,编码226个氨... 从黑龙江某猪场疑似猪流行性腹泻猪的粪便中提取总RNA,采用RT-RCR方法扩增,首次获得中国地方流行株PEDVM全基因序列,将其克隆到pMD18-T载体中进行测序,克隆的M基因核苷酸序列由681个核苷酸组成,含有一个完整的开放阅读框架,编码226个氨基酸。与国外已发表的其他毒株进行基因进化分析,GenBank中的6株PEDV形成的基因进化树具有3个分支。其中分离株LJB/03形成一个独立的分支,说明LJB/03的M基因序列与其他毒株相比,发生了一定的变异。 展开更多
关键词 流行性腹泻病毒 m基因 克隆 序列测定
下载PDF
上一页 1 2 26 下一页 到第
使用帮助 返回顶部