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鹅肌肉组织中MC4R mRNA表达量与屠宰性能的相关性分析
被引量:
4
1
作者
隋玉健
孙永峰
+4 位作者
林海涛
朱海洋
张磊
吴伟
高光
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期672-676,共5页
采用单因子试验设计,选用160只体质量相近的0日龄吉林白鹅和农安籽鹅为试验动物,每个品种随机分为4组,饲喂以NRC标准为基础配制日粮,分0~4周龄和5~8周龄2个阶段饲养。通过屠宰试验和RT-PCR方法对鹅的MC4RmRNA在胸肌和腿肌组织中的表达...
采用单因子试验设计,选用160只体质量相近的0日龄吉林白鹅和农安籽鹅为试验动物,每个品种随机分为4组,饲喂以NRC标准为基础配制日粮,分0~4周龄和5~8周龄2个阶段饲养。通过屠宰试验和RT-PCR方法对鹅的MC4RmRNA在胸肌和腿肌组织中的表达量进行了检测,进而比较不同遗传基础鹅MC4RmRNA表达的差异。结果表明:MC4RmRNA表达量与屠宰性状有一定的相关性,吉林白鹅胸肌、腿肌MC4RmRNA表达量高于农安籽鹅,吉林白鹅活体重、胸肌重、腿肌重、日增重均高于农安籽鹅。
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关键词
鹅
mc4r
mrna
实时荧光定量
屠宰性状
下载PDF
职称材料
MC4R基因沉默对牛成纤维细胞内基因表达的影响
被引量:
3
2
作者
黄萌
贤明
+6 位作者
史明艳
陈燕
张路培
高会江
李俊雅
许尚忠
高雪
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期403-415,共13页
旨在研究黑素皮质激素4受体基因(Melanocortin-4receptor,MC4R)沉默对牛成纤维细胞内能量与脂肪代谢相关通路上基因表达的影响,进一步揭示MC4R基因与肉牛胴体品质以及能量平衡与脂肪代谢之间的关系。本试验使用MC4R被敲降的牛成纤维细胞...
旨在研究黑素皮质激素4受体基因(Melanocortin-4receptor,MC4R)沉默对牛成纤维细胞内能量与脂肪代谢相关通路上基因表达的影响,进一步揭示MC4R基因与肉牛胴体品质以及能量平衡与脂肪代谢之间的关系。本试验使用MC4R被敲降的牛成纤维细胞系,借助深度测序技术寻找试验组(MC4R敲降)和阴性对照组(MC4R未敲降)中表达量差异显著的基因。利用GO注释聚类分析和KEGG通路富集分析对涉及能量代谢、脂肪运输及相关调控通路的差异基因进行了深入的富集分析。随机选取差异表达基因中的10个基因,利用实时定量PCR对深度测序结果进行验证。此外,本研究借助牛SNP芯片对上述目标基因的单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,并对136头西门塔尔牛进行了基于目标基因各SNP的基因型检测。基于各SNP的分型数据,本研究进一步利用PLINK软件对SNP与牛各胴体性状的关联性进行分析。通过深度测序,在两组阳性MC4R被敲降的牛成纤维细胞系中共发现7 799个差异表达基因,其中上调基因1 703个,下调基因6 096个。显著性GO分类在两组不同干扰水平处理组间共选出与能量代谢调节、脂肪运输过程相关的差异表达基因265个,功能聚类分析进一步筛选出与能量代谢相关的基因29个。KEGG通路富集分析发现,与能量代谢、脂肪运输等过程相关的265个差异表达基因共涉及到40个不同的通路,其中与MC4R基因及能量代谢调控有密切关联的Leptin、AGRP、NPY和POMC等基因同属于脂联素信号通路。MC4R敲降引起该通路上22个基因的表达发生显著变化。实时定量PCR结果表明,所选择的10个基因(表达量上调基因:CFB、RSAD2、IFIT3、CHI3L1和BOLA-N;表达量下调基因:UPK1B、IER2、LASS3、TGFβ3和AXUD1)的mRNA表达水平与测序结果无显著差异,从而证实了深度测序数据的准确性和可重复性。此外,借助50K密度的牛SNP芯片,本研究共发现了16个SNPs位点,共涉及11个目标基因。SNPs与牛各胴体性状的关联分析结果表明,10号染色体上的TGFβ3对西门塔尔牛眼肌面积、胴体重、腰部肉厚、大腿肉厚和外脊重有显著影响(P<0.05),对眼肉重、里脊重有极显著影响(P<0.01);同样位于10号染色体的RHOJ基因对西门塔尔牛眼肌面积也有显著影响(P<0.05)。19号染色体上的KRT17基因和7号染色体上VCAN基因均显著影响西门塔尔牛肉剪切力(P<0.01,P<0.05)。1号染色体的MASP1基因对肉色有显著影响(P<0.05)。结果显示,MC4R基因沉默显著影响牛成纤维细胞内参与能量代谢、脂肪代谢和能量稳态平衡调控过程相关基因的表达,进一步证实了MC4R基因能调控肉牛能量平衡和脂肪代谢以及影响肉牛胴体品质。
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关键词
mc4r
基因
基因敲降
mrna
表达量
相关性分析
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职称材料
题名
鹅肌肉组织中MC4R mRNA表达量与屠宰性能的相关性分析
被引量:
4
1
作者
隋玉健
孙永峰
林海涛
朱海洋
张磊
吴伟
高光
机构
吉林农业大学动物科学技术学院
江西省畜牧技术推广站
出处
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期672-676,共5页
基金
吉林省教育厅吉林省高校优秀青年科研人才春苗培育计划项目(2012)
长春市科技局农业科技推广示范计划项目(11NS12)
+1 种基金
吉林省现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(201231)
江苏省创新团队项目(2012)
文摘
采用单因子试验设计,选用160只体质量相近的0日龄吉林白鹅和农安籽鹅为试验动物,每个品种随机分为4组,饲喂以NRC标准为基础配制日粮,分0~4周龄和5~8周龄2个阶段饲养。通过屠宰试验和RT-PCR方法对鹅的MC4RmRNA在胸肌和腿肌组织中的表达量进行了检测,进而比较不同遗传基础鹅MC4RmRNA表达的差异。结果表明:MC4RmRNA表达量与屠宰性状有一定的相关性,吉林白鹅胸肌、腿肌MC4RmRNA表达量高于农安籽鹅,吉林白鹅活体重、胸肌重、腿肌重、日增重均高于农安籽鹅。
关键词
鹅
mc4r
mrna
实时荧光定量
屠宰性状
Keywords
goose
mc4r mrna
RT-PCR
slaughter trait
分类号
S835 [农业科学—畜牧学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
MC4R基因沉默对牛成纤维细胞内基因表达的影响
被引量:
3
2
作者
黄萌
贤明
史明艳
陈燕
张路培
高会江
李俊雅
许尚忠
高雪
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
洛阳师范学院生命科学学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期403-415,共13页
基金
转基因生物新品种培育重大专项(2013ZX08007-2
2014ZX08007-2)
中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS03)
文摘
旨在研究黑素皮质激素4受体基因(Melanocortin-4receptor,MC4R)沉默对牛成纤维细胞内能量与脂肪代谢相关通路上基因表达的影响,进一步揭示MC4R基因与肉牛胴体品质以及能量平衡与脂肪代谢之间的关系。本试验使用MC4R被敲降的牛成纤维细胞系,借助深度测序技术寻找试验组(MC4R敲降)和阴性对照组(MC4R未敲降)中表达量差异显著的基因。利用GO注释聚类分析和KEGG通路富集分析对涉及能量代谢、脂肪运输及相关调控通路的差异基因进行了深入的富集分析。随机选取差异表达基因中的10个基因,利用实时定量PCR对深度测序结果进行验证。此外,本研究借助牛SNP芯片对上述目标基因的单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,并对136头西门塔尔牛进行了基于目标基因各SNP的基因型检测。基于各SNP的分型数据,本研究进一步利用PLINK软件对SNP与牛各胴体性状的关联性进行分析。通过深度测序,在两组阳性MC4R被敲降的牛成纤维细胞系中共发现7 799个差异表达基因,其中上调基因1 703个,下调基因6 096个。显著性GO分类在两组不同干扰水平处理组间共选出与能量代谢调节、脂肪运输过程相关的差异表达基因265个,功能聚类分析进一步筛选出与能量代谢相关的基因29个。KEGG通路富集分析发现,与能量代谢、脂肪运输等过程相关的265个差异表达基因共涉及到40个不同的通路,其中与MC4R基因及能量代谢调控有密切关联的Leptin、AGRP、NPY和POMC等基因同属于脂联素信号通路。MC4R敲降引起该通路上22个基因的表达发生显著变化。实时定量PCR结果表明,所选择的10个基因(表达量上调基因:CFB、RSAD2、IFIT3、CHI3L1和BOLA-N;表达量下调基因:UPK1B、IER2、LASS3、TGFβ3和AXUD1)的mRNA表达水平与测序结果无显著差异,从而证实了深度测序数据的准确性和可重复性。此外,借助50K密度的牛SNP芯片,本研究共发现了16个SNPs位点,共涉及11个目标基因。SNPs与牛各胴体性状的关联分析结果表明,10号染色体上的TGFβ3对西门塔尔牛眼肌面积、胴体重、腰部肉厚、大腿肉厚和外脊重有显著影响(P<0.05),对眼肉重、里脊重有极显著影响(P<0.01);同样位于10号染色体的RHOJ基因对西门塔尔牛眼肌面积也有显著影响(P<0.05)。19号染色体上的KRT17基因和7号染色体上VCAN基因均显著影响西门塔尔牛肉剪切力(P<0.01,P<0.05)。1号染色体的MASP1基因对肉色有显著影响(P<0.05)。结果显示,MC4R基因沉默显著影响牛成纤维细胞内参与能量代谢、脂肪代谢和能量稳态平衡调控过程相关基因的表达,进一步证实了MC4R基因能调控肉牛能量平衡和脂肪代谢以及影响肉牛胴体品质。
关键词
mc4r
基因
基因敲降
mrna
表达量
相关性分析
Keywords
mc4r
gene
gene knockdown
mrna
expression
correlation analysis
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
S813.1 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鹅肌肉组织中MC4R mRNA表达量与屠宰性能的相关性分析
隋玉健
孙永峰
林海涛
朱海洋
张磊
吴伟
高光
《吉林农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
4
下载PDF
职称材料
2
MC4R基因沉默对牛成纤维细胞内基因表达的影响
黄萌
贤明
史明艳
陈燕
张路培
高会江
李俊雅
许尚忠
高雪
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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