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赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析
被引量:
6
1
作者
沈铭辉
郑乐云
+1 位作者
杜佳莹
王军
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期103-108,共6页
采用RACE技术,成功克隆获得赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)非特异性免疫因子MHC IA基因的4个cDNA全序列,序列全长为1 680bp,含有3′UTR、启动子、多肽结合区(α1)、IGC区(α2)、跨膜区、胞质区和5′UTR区,编码区大小为1 074~1 080bp,...
采用RACE技术,成功克隆获得赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)非特异性免疫因子MHC IA基因的4个cDNA全序列,序列全长为1 680bp,含有3′UTR、启动子、多肽结合区(α1)、IGC区(α2)、跨膜区、胞质区和5′UTR区,编码区大小为1 074~1 080bp,共编码357~359个氨基酸,推测蛋白质分子质量约41.66ku.氨基酸序列分析发现赤点石斑鱼MHC IA分子具有经典MHC蛋白分子的空间结构,在多肽结合区则存在极其丰富的变异.利用Real time PCR和SSCP技术研究了赤点石斑鱼MHC IA的组织表达特异性和表达多态性,发现其在头肾、心、肝等12个组织器官中均能有效表达,在头肾,脾,胸腺等免疫组织表达量不仅高,表达多态性也异常丰富,而在与外界环境接触较多的鳃、肌肉、肠等组织表达较弱.此外,根据MHC IIB分子中相对保守的IGC区氨基酸序列构建了脊椎动物的系统进化树,也表明了该分子的IGC区氨基酸序列可以作为研究鱼类物种间进化关系的良好标记.
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关键词
赤点石斑鱼
mhc
ia
基因
多态性
下载PDF
职称材料
尼罗罗非鱼主要组织相容性复合体IA基因克隆与多态分析
被引量:
3
2
作者
李同明
周芬娜
+2 位作者
崔志峰
季相山
王慧
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期14-22,共9页
采用touchdown PCR和RACE技术,获得了两条尼罗罗非鱼MHC IA基因3’端的新序列,其长度均为957 bp,分别命名为orni-DAA*0101和orni-DAA*0102,其分别编码了两种新发现的等位基因亚型。两条新序列均包含666 bp的CDS区和291 bp的3’-UTR区,CD...
采用touchdown PCR和RACE技术,获得了两条尼罗罗非鱼MHC IA基因3’端的新序列,其长度均为957 bp,分别命名为orni-DAA*0101和orni-DAA*0102,其分别编码了两种新发现的等位基因亚型。两条新序列均包含666 bp的CDS区和291 bp的3’-UTR区,CDS区包含了部分多肽结合区、全部的IGC区以及跨膜区和胞质区。同源性比对显示,cDNA序列分别在388 bp和426 bp处发生了碱基转换,而其编码的氨基酸序列在第130位点存在谷氨酸与赖氨酸的差异。首次发现相对保守的IGC区也存在变异。研究结果对于揭示尼罗罗非鱼MHC IA基因的多态性及其与高抗病性的相关性有重要价值。
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关键词
尼罗罗非鱼
mhc
ia
基因克隆
多态性
RACE
原文传递
题名
赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析
被引量:
6
1
作者
沈铭辉
郑乐云
杜佳莹
王军
机构
厦门大学海洋与地球学院
福建省水产研究所
出处
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期103-108,共6页
基金
福建省种业创新与产业化工程项目(闽种石斑004号)
文摘
采用RACE技术,成功克隆获得赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)非特异性免疫因子MHC IA基因的4个cDNA全序列,序列全长为1 680bp,含有3′UTR、启动子、多肽结合区(α1)、IGC区(α2)、跨膜区、胞质区和5′UTR区,编码区大小为1 074~1 080bp,共编码357~359个氨基酸,推测蛋白质分子质量约41.66ku.氨基酸序列分析发现赤点石斑鱼MHC IA分子具有经典MHC蛋白分子的空间结构,在多肽结合区则存在极其丰富的变异.利用Real time PCR和SSCP技术研究了赤点石斑鱼MHC IA的组织表达特异性和表达多态性,发现其在头肾、心、肝等12个组织器官中均能有效表达,在头肾,脾,胸腺等免疫组织表达量不仅高,表达多态性也异常丰富,而在与外界环境接触较多的鳃、肌肉、肠等组织表达较弱.此外,根据MHC IIB分子中相对保守的IGC区氨基酸序列构建了脊椎动物的系统进化树,也表明了该分子的IGC区氨基酸序列可以作为研究鱼类物种间进化关系的良好标记.
关键词
赤点石斑鱼
mhc
ia
基因
多态性
Keywords
Epinephelus akaara
mhc ia gene
polymorphism
分类号
S965.334 [农业科学—水产养殖]
下载PDF
职称材料
题名
尼罗罗非鱼主要组织相容性复合体IA基因克隆与多态分析
被引量:
3
2
作者
李同明
周芬娜
崔志峰
季相山
王慧
机构
山东农业大学动物科技学院水产系
出处
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期14-22,共9页
基金
山东省博士后创新基金资助项目(200703044)
山东省自然科学基金资助项目(Y2008D32)
文摘
采用touchdown PCR和RACE技术,获得了两条尼罗罗非鱼MHC IA基因3’端的新序列,其长度均为957 bp,分别命名为orni-DAA*0101和orni-DAA*0102,其分别编码了两种新发现的等位基因亚型。两条新序列均包含666 bp的CDS区和291 bp的3’-UTR区,CDS区包含了部分多肽结合区、全部的IGC区以及跨膜区和胞质区。同源性比对显示,cDNA序列分别在388 bp和426 bp处发生了碱基转换,而其编码的氨基酸序列在第130位点存在谷氨酸与赖氨酸的差异。首次发现相对保守的IGC区也存在变异。研究结果对于揭示尼罗罗非鱼MHC IA基因的多态性及其与高抗病性的相关性有重要价值。
关键词
尼罗罗非鱼
mhc
ia
基因克隆
多态性
RACE
Keywords
Oreochromis niloticus
mhc ia gene
cloning
polymorphism
RACE
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析
沈铭辉
郑乐云
杜佳莹
王军
《厦门大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
6
下载PDF
职称材料
2
尼罗罗非鱼主要组织相容性复合体IA基因克隆与多态分析
李同明
周芬娜
崔志峰
季相山
王慧
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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