不同物种MHC-DQA1基因部分序列的生物信息分析

作者应用比较基因组学和生物信息学方法比较了绵羊、牛、鹿和狗MHC-DQA1基因部分序列,并对该基因的遗传多样性及分子系统发育进行了分析。结果表明,38个基因序列检测到107个多态位点,共生成38个单倍型。物种间及物种内MHC-DQA1存在较丰富的遗传多样性。

四个绵羊品种MHC-DQA1基因exonⅡ多态性分析

为了比较和揭示洼地绵羊、杜泊羊、小尾寒羊及特克赛尔绵羊4个绵羊品种MHC-DQA1基因的遗传多态性,采用PCR-RFLP技术对4个绵羊品种224个样本的MHC-DQA1基因exonⅡ的315 bp片段进行多态性分析;并对基因型频率和等位基因频率进行统计,运用Popgen32软件计算相应的遗传参数。结果表明,AluI-RELP检测的4个绵羊品种224只群体中,出现3种基因型MM、MN、NN,其中N为优势等位基因,且MM基因型只分布于洼地绵羊中。遗传参数分析表明,除小尾寒羊外,洼地绵羊、杜泊羊及特克赛尔羊AluI-RELP位点杂合度均高于纯合度;且洼地绵羊表现中度多态,其他绵羊品种表现低度多态。4个绵羊品种224只群体MHC-DQA1基因exonⅡ在AluI-RELP位点具有较低的遗传多样性。

用序列特异性引物的PCR方法分析慢性淋巴细胞性甲状腺炎患者…

慢性淋巴细胞性甲状腺炎（ＣＬＴ）是一种器官特异性自身免疫性疾病，其遗传易感性与ＨＬＡ－Ⅱ类基因具有相关性，本研究用序列特异性引物的ＰＣＲ（ＰＣＲ－ＳＳＰ）方法，分析２６名由病理证实的ＣＬＴ及正常对照２０例外周血白细胞基因组ＤＮＡ的ＭＨＣ－ＤＱＡ１位点的基因多态性分布，发现两组间有明显不同，其中ＤＱＡ１＊０３０１的等位基因频率显著高于对照组（Ｐｃ小于０．

中国美利奴细毛羊MHC Class Ⅱa区段的基因组成分析与表达

为了深入了解绵羊主要组织相容性复合体(MHC)ClassⅡa区段基因组结构,利用已构建的中国美利奴细毛羊细菌人工染色体(BAC)文库和MHC区段高密度物理图谱研究ClassⅡa的基因组成。ClassⅡa亚区包括BAC克隆225J15、283N15和271H22,基因组大小为333 962bp。对ClassⅡa已知的基因座DRB1、DRA、DQB1、DQB2、DQA1和DQA2设计特异性引物,克隆出这6个基因的全长序列。将这6个基因定位在ClassⅡa基因组上,6个基因的基因组长度分别为10.8、3.5、8.7、9.4、3.5和5.7kb。选取编码MHC-Ⅱ类分子α链的DQA1和编码MHC-Ⅱ类分子β链的DRB1进行原核表达,SDS-PAGE检测蛋白质大小分别为28ku和30ku。