陆地棉MIKC^C基因家族的全基因组分析

【目的】MIKC^C是1类保守的转录因子家族,参与调控植物的开花时间和花器官发育。通过对MIKC^C家族进行全基因组学分析,为深入研究MIKC^C在棉花开花及花器官发育的分子调控机理提供基础。【方法】利用HMMER 3.0及pfam种子文件鉴定棉花全基因组MIKC^C基因,结合其表达量进行偏向表达及聚类分析。【结果】在陆地棉基因组中共鉴定发现100个MIKC^C基因,分为11个亚类。表达聚类分析显示,棉花MIKC^C基因的表达模式大致可分为4个不同的类群,说明这类基因在棉花进化中出现了功能分化。100个MIKC^C基因中,有12个基因具有miRNA靶位点。【结论】研究结果显示MIKC^C家族基因在棉花纤维中存在功能分化,而且可能受到miRNA的调控,这为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考。